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Hexa-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003552	TTGAAC	2	12	2622579	2622590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20090961
1002	NC_003552	CGGTGT	2	12	2628548	2628559	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20090965
1003	NC_003552	CCACAA	2	12	2628995	2629006	50 %	0 %	0 %	50 %	20090965
1004	NC_003552	GCCTTT	2	12	2640552	2640563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20090980
1005	NC_003552	AGTTGA	2	12	2642617	2642628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20090981
1006	NC_003552	TTCACT	2	12	2648420	2648431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	20090985
1007	NC_003552	GAAGCA	2	12	2656325	2656336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20090988
1008	NC_003552	GGAGTG	2	12	2660435	2660446	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	20090992
1009	NC_003552	CTTGAC	2	12	2661933	2661944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090994
1010	NC_003552	TCACGG	2	12	2662788	2662799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20090995
1011	NC_003552	TAACAG	2	12	2663771	2663782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20090996
1012	NC_003552	AAGTTA	2	12	2666271	2666282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003552	AAGCCA	2	12	2667347	2667358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	20090999
1014	NC_003552	TTCCTT	2	12	2668170	2668181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20091000
1015	NC_003552	ATCCAG	2	12	2669663	2669674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091003
1016	NC_003552	GCTCAA	2	12	2670335	2670346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_003552	AAAACA	2	12	2670557	2670568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_003552	TGAATA	2	12	2672569	2672580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20091006
1019	NC_003552	TTGTAG	2	12	2674707	2674718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20091009
1020	NC_003552	ACAAAA	2	12	2683223	2683234	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	20091019
1021	NC_003552	ATAAAA	2	12	2688528	2688539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20091022
1022	NC_003552	AATGGA	2	12	2693193	2693204	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20091026
1023	NC_003552	TCTTGT	2	12	2696730	2696741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20091029
1024	NC_003552	TTGTAG	2	12	2699305	2699316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20091032
1025	NC_003552	GAAAAA	2	12	2700841	2700852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20091034
1026	NC_003552	TAGCTT	2	12	2702489	2702500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20091037
1027	NC_003552	TGATTT	2	12	2702753	2702764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003552	TTTCAT	2	12	2720018	2720029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091050
1029	NC_003552	GAGAAA	2	12	2722744	2722755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003552	CGCGGA	2	12	2723414	2723425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_003552	TGTAAT	2	12	2724287	2724298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003552	CTTTGC	2	12	2727820	2727831	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20091058
1033	NC_003552	CCGGGA	2	12	2730163	2730174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_003552	TGTGCC	2	12	2733763	2733774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_003552	TGAAAT	2	12	2734028	2734039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20091063
1036	NC_003552	GGAAGA	2	12	2735804	2735815	50 %	0 %	50 %	0 %	20091064
1037	NC_003552	CCAGGA	2	12	2736941	2736952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_003552	AGGACT	2	12	2739431	2739442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091070
1039	NC_003552	TTTAAT	2	12	2742765	2742776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20091072
1040	NC_003552	CTGCAA	2	12	2745280	2745291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091074
1041	NC_003552	TAAGGT	2	12	2745702	2745713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003552	ACCTTA	2	12	2745919	2745930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_003552	GAAAAA	2	12	2750682	2750693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003552	GGGTTG	2	12	2751676	2751687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003552	ACAGCT	2	12	2756873	2756884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_003552	TGTTTA	2	12	2762188	2762199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20091085
1047	NC_003552	TTCATT	2	12	2764191	2764202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1048	NC_003552	AAAGTA	2	12	2764274	2764285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003552	GAGGAA	2	12	2765096	2765107	50 %	0 %	50 %	0 %	20091087
1050	NC_003552	GCCGGA	2	12	2766815	2766826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	20091089
1051	NC_003552	AAACCG	2	12	2769709	2769720	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	20091092
1052	NC_003552	CTTTTT	2	12	2774183	2774194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1053	NC_003552	ATAAGA	2	12	2774522	2774533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003552	TTCTGG	2	12	2775272	2775283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20091095
1055	NC_003552	GGCCTT	2	12	2776813	2776824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20091095
1056	NC_003552	TTTTCA	2	12	2782980	2782991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091100
1057	NC_003552	TTAATT	2	12	2783939	2783950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003552	TCCAAC	2	12	2784316	2784327	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20091102
1059	NC_003552	TCCCTT	2	12	2794733	2794744	0 %	50 %	0 %	50 %	20091110
1060	NC_003552	TCCGTT	2	12	2795207	2795218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20091110
1061	NC_003552	ATATAA	2	12	2798097	2798108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003552	AATAAA	2	12	2800117	2800128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20091116
1063	NC_003552	GAATAA	2	12	2802776	2802787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20091118
1064	NC_003552	GACAAA	2	12	2803858	2803869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20091120
1065	NC_003552	CCTGAA	2	12	2804712	2804723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091120
1066	NC_003552	CGAATT	2	12	2805259	2805270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091121
1067	NC_003552	AAAGAA	2	12	2809466	2809477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20091122
1068	NC_003552	AAAAAT	2	12	2810573	2810584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003552	TTGTAT	2	12	2814649	2814660	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003552	ATCTTT	2	12	2819475	2819486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1071	NC_003552	TAAAGC	2	12	2820259	2820270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20091130
1072	NC_003552	GTCAAC	2	12	2822866	2822877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091132
1073	NC_003552	CCGGGT	2	12	2826995	2827006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	20091137
1074	NC_003552	CTTTTT	2	12	2827134	2827145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1075	NC_003552	AAAAAG	2	12	2831254	2831265	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003552	ATTTCA	2	12	2834744	2834755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20091141
1077	NC_003552	TTTTAA	2	12	2836500	2836511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20091142
1078	NC_003552	GAAAAA	2	12	2837365	2837376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20091143
1079	NC_003552	CTAATT	2	12	2837429	2837440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20091143
1080	NC_003552	ACAAAG	2	12	2839014	2839025	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20091145
1081	NC_003552	TACCGG	2	12	2839735	2839746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20091145
1082	NC_003552	AGATCC	2	12	2841448	2841459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091146
1083	NC_003552	ATTGCT	2	12	2841752	2841763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20091147
1084	NC_003552	CTTTTT	2	12	2845525	2845536	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1085	NC_003552	TTCTAT	2	12	2847154	2847165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091150
1086	NC_003552	GTATGA	2	12	2848482	2848493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20091151
1087	NC_003552	ATTATC	2	12	2850766	2850777	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1088	NC_003552	AGTTCG	2	12	2853474	2853485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20091155
1089	NC_003552	CTTTTA	2	12	2860719	2860730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1090	NC_003552	ACATCA	2	12	2861412	2861423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	20091161
1091	NC_003552	CAGGGT	2	12	2863961	2863972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1092	NC_003552	TCGATC	2	12	2865554	2865565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20091162
1093	NC_003552	ATTTAT	2	12	2870102	2870113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003552	TTGCAA	2	12	2870249	2870260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091168
1095	NC_003552	GATGTG	2	12	2871378	2871389	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003552	CAGTAG	2	12	2874322	2874333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091170
1097	NC_003552	CCCGAA	2	12	2874860	2874871	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	20091170
1098	NC_003552	GTATAA	2	12	2878074	2878085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003552	ATTGAT	2	12	2882224	2882235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003552	AAAAGG	2	12	2882307	2882318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003552	AAATAT	2	12	2883322	2883333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003552	ACTGCT	2	12	2886227	2886238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_003552	TTGGCA	2	12	2887106	2887117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20091180
1104	NC_003552	CAAGCT	2	12	2892906	2892917	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091183
1105	NC_003552	TTATCT	2	12	2898567	2898578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091186
1106	NC_003552	CAAAAA	2	12	2900883	2900894	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1107	NC_003552	TCTTTT	2	12	2901224	2901235	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1108	NC_003552	AGAAAA	2	12	2903825	2903836	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003552	TTATCA	2	12	2905010	2905021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20091189
1110	NC_003552	TCAATT	2	12	2905091	2905102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20091189
1111	NC_003552	CTATTT	2	12	2908369	2908380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1112	NC_003552	CAGGTA	2	12	2908735	2908746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091191
1113	NC_003552	TTATGA	2	12	2911861	2911872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20091192
1114	NC_003552	TTCAAG	2	12	2915073	2915084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091195
1115	NC_003552	TTCCAG	2	12	2916690	2916701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20091195
1116	NC_003552	TATCAG	2	12	2918922	2918933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091196
1117	NC_003552	TCTTTT	2	12	2919490	2919501	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20091197
1118	NC_003552	ATAGTA	2	12	2922702	2922713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20091198
1119	NC_003552	TTAGCA	2	12	2930505	2930516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091202
1120	NC_003552	TTAAAT	2	12	2931255	2931266	50 %	50 %	0 %	0 %	20091203
1121	NC_003552	TCCAAT	2	12	2931751	2931762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20091203
1122	NC_003552	TCAATC	2	12	2931959	2931970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20091204
1123	NC_003552	TCGGGT	2	12	2935034	2935045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20091204
1124	NC_003552	CGTGGA	2	12	2940881	2940892	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20091207
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1126	NC_003552	ACAGCT	2	12	2942254	2942265	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091209
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1129	NC_003552	TCAAGG	2	12	2946337	2946348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091213
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1132	NC_003552	TTCCGG	2	12	2949080	2949091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20091214
1133	NC_003552	ACGTCC	2	12	2951820	2951831	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20091215
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1136	NC_003552	TATACA	2	12	2960715	2960726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1139	NC_003552	ATGGAG	2	12	2966480	2966491	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20091226
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1142	NC_003552	TTCTGA	2	12	2970538	2970549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1143	NC_003552	TCATGA	2	12	2974069	2974080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091233
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1146	NC_003552	TTTAAA	2	12	2982008	2982019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_003552	CCCGCA	2	12	2984810	2984821	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	20091241
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1151	NC_003552	GAAGCC	2	12	2996954	2996965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20091249
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1159	NC_003552	TTCATT	2	12	3008456	3008467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091258
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1165	NC_003552	AGCCCC	2	12	3013753	3013764	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1166	NC_003552	AAATCC	2	12	3013772	3013783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_003552	ACGGCT	2	12	3018872	3018883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20091262
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1204	NC_003552	GTAATC	2	12	3098379	3098390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20091330
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1212	NC_003552	AAAAAG	2	12	3134369	3134380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20091351
1213	NC_003552	ATTTAA	2	12	3137702	3137713	50 %	50 %	0 %	0 %	20091353
1214	NC_003552	AAATGA	2	12	3141682	3141693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1215	NC_003552	TATAAA	2	12	3141993	3142004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1216	NC_003552	ACTGGC	2	12	3146180	3146191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20091357
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1218	NC_003552	CGATTC	2	12	3152419	3152430	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20091363
1219	NC_003552	CGGAAT	2	12	3152529	3152540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091363
1220	NC_003552	TCAACC	2	12	3153884	3153895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20091364
1221	NC_003552	TAGCTG	2	12	3156831	3156842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1222	NC_003552	GTAATG	2	12	3160014	3160025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20091368
1223	NC_003552	CAGGGC	2	12	3161253	3161264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	20091369
1224	NC_003552	GGTCTG	2	12	3162359	3162370	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20091370
1225	NC_003552	CCTGCA	2	12	3165510	3165521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20091372
1226	NC_003552	AAAGGA	2	12	3166854	3166865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20091373
1227	NC_003552	AGCGGA	2	12	3170065	3170076	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20091375
1228	NC_003552	GACCTG	2	12	3170548	3170559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20091375
1229	NC_003552	AACTGG	2	12	3174706	3174717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20091379
1230	NC_003552	TCTTTT	2	12	3176766	3176777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	20091380
1231	NC_003552	TTATCT	2	12	3177930	3177941	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1232	NC_003552	ATCAAA	2	12	3178179	3178190	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1233	NC_003552	ACAATA	2	12	3178303	3178314	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1234	NC_003552	GATTCC	2	12	3179743	3179754	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20091382
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1237	NC_003552	TTTTTA	2	12	3182931	3182942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1240	NC_003552	TAAGAA	2	12	3186974	3186985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_003552	TAAGAA	2	12	3187013	3187024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_003552	TAAGAA	2	12	3187053	3187064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1340	NC_003552	GACACC	2	12	3426403	3426414	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	20091568
1341	NC_003552	CTTTTA	2	12	3426736	3426747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1342	NC_003552	CTATAA	2	12	3427592	3427603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1343	NC_003552	GCTGAA	2	12	3427674	3427685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1344	NC_003552	GGTTTT	2	12	3430080	3430091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20091571
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1347	NC_003552	ACAGCT	2	12	3440684	3440695	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1348	NC_003552	TGGATT	2	12	3442225	3442236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20091582
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1350	NC_003552	CATTTT	2	12	3449689	3449700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20091588
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1352	NC_003552	AAAAAG	2	12	3458889	3458900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20091596
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1443	NC_003552	TGCTGA	2	12	3643669	3643680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20091736
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1445	NC_003552	CCCTGA	2	12	3649550	3649561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20091743
1446	NC_003552	ATTTTT	2	12	3650068	3650079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_003552	CTGCAA	2	12	3652666	3652677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20091745
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1451	NC_003552	TTCTGT	2	12	3653798	3653809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20091745
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1453	NC_003552	CTGTTT	2	12	3653980	3653991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20091745
1454	NC_003552	ACAGCT	2	12	3656021	3656032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_003552	GTCCCT	2	12	3657990	3658001	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	20091748
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1459	NC_003552	CTGAAG	2	12	3667344	3667355	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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