MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	ATATTA	2	12	1165	1176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010336	TACAAA	2	12	6401	6412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626232
3	NC_010336	TATCAA	2	12	7402	7413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626233
4	NC_010336	CTACCA	2	12	7788	7799	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626233
5	NC_010336	ATTTTT	2	12	9327	9338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626234
6	NC_010336	TAGCTA	2	12	12235	12246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626237
7	NC_010336	CTTGGG	2	12	17585	17596	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167626242
8	NC_010336	TTGGTG	2	12	18945	18956	0 %	50 %	50 %	0 %	167626244
9	NC_010336	TTTGAA	2	12	21219	21230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626246
10	NC_010336	ATGTCA	2	12	21703	21714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626247
11	NC_010336	AAATAA	2	12	23192	23203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626248
12	NC_010336	CTTTAT	2	12	28450	28461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626253
13	NC_010336	TGAGCT	2	12	28719	28730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626253
14	NC_010336	TTATAT	2	12	31120	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010336	GAGATA	2	12	31292	31303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626256
16	NC_010336	GATTTA	2	12	31615	31626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626256
17	NC_010336	TATAGA	2	12	31923	31934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626256
18	NC_010336	CTTGAT	2	12	36462	36473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626260
19	NC_010336	ATCTAG	2	12	38024	38035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626261
20	NC_010336	TCATCC	2	12	38949	38960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626262
21	NC_010336	TCTAAA	2	12	39729	39740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626262
22	NC_010336	GTAATA	2	12	40339	40350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626263
23	NC_010336	TATTTT	2	12	42194	42205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626266
24	NC_010336	TATTGG	2	12	45278	45289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626269
25	NC_010336	TGATTT	2	12	50293	50304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626273
26	NC_010336	TAATTT	2	12	50916	50927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626273
27	NC_010336	CTCTAT	2	12	52057	52068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626275
28	NC_010336	TTCTGT	2	12	52555	52566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626276
29	NC_010336	AAATAA	2	12	53249	53260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626278
30	NC_010336	CTTTCT	2	12	56779	56790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626282
31	NC_010336	ACTACA	2	12	61606	61617	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626288
32	NC_010336	TTACTT	2	12	64253	64264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626290
33	NC_010336	AGCCAT	2	12	64529	64540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010336	CAAATA	2	12	64720	64731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010336	CAAAAT	2	12	65989	66000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626291
36	NC_010336	TAAGTT	2	12	66223	66234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626292
37	NC_010336	TGTAAT	2	12	66710	66721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626292
38	NC_010336	AACATA	2	12	70644	70655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626296
39	NC_010336	ACTATA	2	12	71361	71372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010336	CATAAA	2	12	74368	74379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626299
41	NC_010336	TTATCC	2	12	75613	75624	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626300
42	NC_010336	AATATT	2	12	77505	77516	50 %	50 %	0 %	0 %	167626302
43	NC_010336	GTAAAT	2	12	81031	81042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626304
44	NC_010336	ATTTGT	2	12	89593	89604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626312
45	NC_010336	TATATT	2	12	95267	95278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626317
46	NC_010336	TAAACA	2	12	95290	95301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626317
47	NC_010336	TTCAGC	2	12	95738	95749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626317
48	NC_010336	TTAGGA	2	12	96759	96770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626318
49	NC_010336	TATGTG	2	12	101164	101175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626322
50	NC_010336	ATGAGG	2	12	104126	104137	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	167626325
51	NC_010336	TAAAAA	2	12	105484	105495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010336	AAATAA	2	12	106193	106204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626327
53	NC_010336	TTAGAT	2	12	111234	111245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626333
54	NC_010336	TACCAT	2	12	114300	114311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626336
55	NC_010336	AGATTA	2	12	115672	115683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010336	TAGCAA	2	12	116600	116611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626339
57	NC_010336	GTTAAT	2	12	117424	117435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626339
58	NC_010336	CATTTA	2	12	123450	123461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626345
59	NC_010336	AATTAA	2	12	125303	125314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010336	AATCAA	2	12	137146	137157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626358
61	NC_010336	CAGCGT	2	12	141287	141298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167626363
62	NC_010336	GCTTTA	2	12	142276	142287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626364
63	NC_010336	TTTTCT	2	12	147993	148004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	167626371
64	NC_010336	TGCTTT	2	12	151296	151307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626374
65	NC_010336	CCATAC	2	12	151556	151567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626374
66	NC_010336	TGCTTT	2	12	153614	153625	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626375
67	NC_010336	AATATA	2	12	154050	154061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010336	CTTGAT	2	12	156165	156176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626377
69	NC_010336	ATCAAT	2	12	156269	156280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626377
70	NC_010336	ATCAGA	2	12	157160	157171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626377
71	NC_010336	TCTACA	2	12	158383	158394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626378
72	NC_010336	GAGCTT	2	12	163020	163031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626382
73	NC_010336	AGCTAT	2	12	163075	163086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626382
74	NC_010336	CTTCAT	2	12	164077	164088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626383
75	NC_010336	AAGACC	2	12	164600	164611	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167626383
76	NC_010336	ATTAAA	2	12	164869	164880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010336	CAATGA	2	12	166759	166770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626385
78	NC_010336	TTGCTC	2	12	167190	167201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167626386
79	NC_010336	ATGTTT	2	12	170441	170452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626389
80	NC_010336	TTGCAT	2	12	170533	170544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626389
81	NC_010336	AATATA	2	12	171650	171661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626391
82	NC_010336	AGTGAT	2	12	174158	174169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626393
83	NC_010336	ATGCTG	2	12	177036	177047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626394
84	NC_010336	CTGAAA	2	12	177402	177413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626394
85	NC_010336	TGATTG	2	12	182398	182409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626400
86	NC_010336	TTAGCT	2	12	184192	184203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626401
87	NC_010336	GCTAAT	2	12	190673	190684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626404
88	NC_010336	ATTCTT	2	12	192101	192112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010336	TAAAAC	2	12	192465	192476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626406
90	NC_010336	ATTTTC	2	12	193879	193890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626408
91	NC_010336	TACCCT	2	12	195707	195718	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626409
92	NC_010336	TTGCTA	2	12	196281	196292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010336	ACGCCC	2	12	199250	199261	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167626413
94	NC_010336	ATTACC	2	12	199367	199378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626413
95	NC_010336	GCAACT	2	12	200109	200120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626413
96	NC_010336	TAACCA	2	12	200812	200823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626414
97	NC_010336	TAGTCA	2	12	200824	200835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626414
98	NC_010336	CTTTCT	2	12	201832	201843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626415
99	NC_010336	TAACAA	2	12	209460	209471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626422
100	NC_010336	TAAACT	2	12	214760	214771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626427
101	NC_010336	GCCTAC	2	12	215063	215074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167626427
102	NC_010336	ATCTGA	2	12	216947	216958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626427
103	NC_010336	ATAACT	2	12	217384	217395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010336	TAAACT	2	12	217432	217443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626428
105	NC_010336	TCCTAC	2	12	217675	217686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626428
106	NC_010336	CCTACT	2	12	217694	217705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626428
107	NC_010336	CTATTA	2	12	218169	218180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626428
108	NC_010336	ACTCTA	2	12	218553	218564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626428
109	NC_010336	CTTTCT	2	12	220413	220424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626429
110	NC_010336	ATAACT	2	12	221061	221072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010336	TAAACT	2	12	221109	221120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010336	TCCTAC	2	12	221352	221363	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010336	CCTACT	2	12	221371	221382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010336	CTATTA	2	12	221847	221858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010336	ACTCTA	2	12	222231	222242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010336	TTATCA	2	12	225513	225524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626432
117	NC_010336	GTATCA	2	12	225537	225548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626432
118	NC_010336	TGGTTT	2	12	225804	225815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626432
119	NC_010336	ATTAAA	2	12	229700	229711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626434
120	NC_010336	ATTATC	2	12	232446	232457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626436
121	NC_010336	AGCCAT	2	12	233213	233224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626438
122	NC_010336	CTTTTG	2	12	237335	237346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626441
123	NC_010336	AACCAC	2	12	242407	242418	50 %	0 %	0 %	50 %	167626448
124	NC_010336	TAGAAC	2	12	243501	243512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626449
125	NC_010336	CCAAAG	2	12	245821	245832	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167626451
126	NC_010336	CACTAC	2	12	249271	249282	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626454
127	NC_010336	CATCTT	2	12	253523	253534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626458
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129	NC_010336	AACATC	2	12	258672	258683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626462
130	NC_010336	AGTAGA	2	12	260848	260859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626463
131	NC_010336	ATTTTA	2	12	268066	268077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626470
132	NC_010336	TTCTTA	2	12	269056	269067	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626470
133	NC_010336	GTGCTT	2	12	270058	270069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167626471
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136	NC_010336	AATCTC	2	12	276718	276729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626478
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141	NC_010336	TATTAG	2	12	280833	280844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626482
142	NC_010336	TATTAA	2	12	285376	285387	50 %	50 %	0 %	0 %	167626485
143	NC_010336	GGACGT	2	12	286060	286071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167626486
144	NC_010336	GGTAGT	2	12	286896	286907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167626487
145	NC_010336	AATCAA	2	12	287319	287330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626487
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147	NC_010336	TAAAAT	2	12	288263	288274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626488
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149	NC_010336	CCCAAA	2	12	291471	291482	50 %	0 %	0 %	50 %	167626492
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156	NC_010336	CAGCTA	2	12	305409	305420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626504
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173	NC_010336	TCCTCT	2	12	345818	345829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_010336	ATCAAA	2	12	354871	354882	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626544
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209	NC_010336	TTTACT	2	12	423531	423542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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223	NC_010336	TCAACA	2	12	445260	445271	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626613
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225	NC_010336	GCTGAA	2	12	448720	448731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167626615
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227	NC_010336	GATAAC	2	12	450658	450669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626615
228	NC_010336	TCAAGG	2	12	452516	452527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167626618
229	NC_010336	TTAATA	2	12	453730	453741	50 %	50 %	0 %	0 %	167626619
230	NC_010336	CTTCAG	2	12	457421	457432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626624
231	NC_010336	AGATGA	2	12	459461	459472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626625
232	NC_010336	ACTAAT	2	12	460453	460464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626625
233	NC_010336	CAAGAT	2	12	464580	464591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626631
234	NC_010336	CAAGCC	2	12	465207	465218	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167626632
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241	NC_010336	ATTAAT	2	12	475322	475333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_010336	GAAAAT	2	12	659567	659578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167626844
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342	NC_010336	AAATGA	2	12	665232	665243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167626852
343	NC_010336	AGCTGC	2	12	665295	665306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167626852
344	NC_010336	AAAGAT	2	12	669211	669222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167626854
345	NC_010336	ATACTA	2	12	674420	674431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626859
346	NC_010336	ATTAAT	2	12	680201	680212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_010336	ATTTTA	2	12	682441	682452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_010336	TATCTG	2	12	682509	682520	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626868
349	NC_010336	CTGACT	2	12	683169	683180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626868
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351	NC_010336	TAGCTA	2	12	689354	689365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626873
352	NC_010336	GATTGA	2	12	694515	694526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626879
353	NC_010336	TGATAT	2	12	695160	695171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626879
354	NC_010336	ACAGCC	9	54	695415	695468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167626879
355	NC_010336	ACCCAT	2	12	697427	697438	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626881
356	NC_010336	TGGAAA	2	12	701682	701693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626886
357	NC_010336	AATCTA	2	12	703392	703403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
358	NC_010336	ACTTTA	2	12	705039	705050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626889
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360	NC_010336	TACAGT	2	12	709850	709861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626893
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365	NC_010336	AAAATA	2	12	721975	721986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
366	NC_010336	ACCAGC	2	12	722542	722553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167626906
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369	NC_010336	TTACAT	2	12	723685	723696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626907
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405	NC_010336	GGTACA	2	12	795433	795444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167626975
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467	NC_010336	ATAGTT	2	12	927437	927448	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627094
468	NC_010336	AAAAAG	2	12	927718	927729	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
469	NC_010336	AACAGC	2	12	928470	928481	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167627096
470	NC_010336	TGGTAA	2	12	933305	933316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627102
471	NC_010336	ATGTAG	2	12	933409	933420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627102
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475	NC_010336	ATATTT	2	12	943392	943403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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