MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010336	TCTAAA	2	12	1009448	1009459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627159
502	NC_010336	TTTATG	2	12	1011078	1011089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627160
503	NC_010336	TAGATA	2	12	1011116	1011127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627160
504	NC_010336	TTTCAG	2	12	1012348	1012359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627163
505	NC_010336	TATTGG	2	12	1015849	1015860	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627165
506	NC_010336	TTTTGA	2	12	1021215	1021226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627170
507	NC_010336	TGAGAA	2	12	1024580	1024591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627172
508	NC_010336	ATGGAA	2	12	1025627	1025638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627173
509	NC_010336	TAAAGA	2	12	1028311	1028322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167627175
510	NC_010336	AAATGT	2	12	1028883	1028894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627176
511	NC_010336	TATGGC	2	12	1033699	1033710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627182
512	NC_010336	AGCTAG	2	12	1038568	1038579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627187
513	NC_010336	TATAAT	2	12	1038826	1038837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010336	TGATAG	2	12	1041038	1041049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627188
515	NC_010336	AATAAA	2	12	1042788	1042799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010336	ATTTAT	2	12	1058146	1058157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010336	TCTTTG	2	12	1059264	1059275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167627206
518	NC_010336	TTTGTA	2	12	1059674	1059685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627206
519	NC_010336	AGCAAA	2	12	1060472	1060483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627207
520	NC_010336	GCTTTG	2	12	1061143	1061154	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627207
521	NC_010336	AGATTT	2	12	1061893	1061904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627208
522	NC_010336	AAATGA	2	12	1062300	1062311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010336	CTTTCT	2	12	1062922	1062933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010336	CTTTCT	2	12	1065142	1065153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167627213
525	NC_010336	TACTTT	2	12	1066886	1066897	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627215
526	NC_010336	ACCAAT	2	12	1068321	1068332	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167627217
527	NC_010336	TGAAGC	2	12	1071243	1071254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627220
528	NC_010336	ATTCGT	2	12	1072732	1072743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627220
529	NC_010336	GATGTT	2	12	1073173	1073184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627220
530	NC_010336	ACCTGT	2	12	1079670	1079681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627227
531	NC_010336	TTTATC	2	12	1080450	1080461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627227
532	NC_010336	TAAAAA	2	12	1087759	1087770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627232
533	NC_010336	TTGTAC	2	12	1088544	1088555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627232
534	NC_010336	CTTATG	2	12	1092200	1092211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627236
535	NC_010336	TTTGCA	2	12	1093070	1093081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627236
536	NC_010336	TTATAG	2	12	1102737	1102748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627244
537	NC_010336	TAGTGC	2	12	1112168	1112179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627250
538	NC_010336	ATTTTT	2	12	1112825	1112836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627251
539	NC_010336	TCTGGT	2	12	1113429	1113440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
540	NC_010336	TCAATA	2	12	1119181	1119192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627256
541	NC_010336	ATTTTG	2	12	1120353	1120364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627257
542	NC_010336	GTTTTA	2	12	1122149	1122160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627258
543	NC_010336	AATTTT	2	12	1123192	1123203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627260
544	NC_010336	CAGGTA	2	12	1123787	1123798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627261
545	NC_010336	GACGAT	2	12	1127258	1127269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627263
546	NC_010336	TTGCTG	2	12	1129988	1129999	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627268
547	NC_010336	TGGTCT	2	12	1130112	1130123	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627268
548	NC_010336	TGAAGC	2	12	1130187	1130198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627268
549	NC_010336	AGAAAA	2	12	1130997	1131008	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167627269
550	NC_010336	TATATG	2	12	1134120	1134131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627269
551	NC_010336	TACAGG	2	12	1138576	1138587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627270
552	NC_010336	TTTTAG	2	12	1139806	1139817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627272
553	NC_010336	CACTTT	2	12	1142095	1142106	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010336	TGCCTA	2	12	1145204	1145215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627277
555	NC_010336	GATTTG	2	12	1148430	1148441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627283
556	NC_010336	ATACTT	2	12	1148496	1148507	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627283
557	NC_010336	GAATAA	2	12	1149320	1149331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010336	ATTGAT	2	12	1150167	1150178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627285
559	NC_010336	TCAGCA	2	12	1158077	1158088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167627291
560	NC_010336	AAAGCA	2	12	1160406	1160417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627292
561	NC_010336	AGAGTT	2	12	1160935	1160946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627293
562	NC_010336	TGAGTA	2	12	1161929	1161940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627293
563	NC_010336	ATTACC	2	12	1162234	1162245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167627293
564	NC_010336	AGAAAA	2	12	1164196	1164207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167627295
565	NC_010336	TTATCT	2	12	1165664	1165675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627297
566	NC_010336	AATTTT	2	12	1167212	1167223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627299
567	NC_010336	TGCACT	2	12	1168182	1168193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627300
568	NC_010336	CCAATA	2	12	1171375	1171386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167627302
569	NC_010336	TTCAAA	2	12	1178207	1178218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627312
570	NC_010336	TAATTG	2	12	1179270	1179281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010336	GGTATG	2	12	1181898	1181909	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627317
572	NC_010336	GATAGA	2	12	1182363	1182374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627317
573	NC_010336	ATCAAT	2	12	1186372	1186383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627320
574	NC_010336	AAGTAA	2	12	1188350	1188361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167627323
575	NC_010336	TCATTT	2	12	1194707	1194718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627329
576	NC_010336	AAGCCC	2	12	1194963	1194974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167627330
577	NC_010336	GCACCG	2	12	1196075	1196086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167627330
578	NC_010336	TGATAT	2	12	1200640	1200651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627334
579	NC_010336	ATTATA	2	12	1202506	1202517	50 %	50 %	0 %	0 %	167627335
580	NC_010336	CATTAG	2	12	1202721	1202732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167627336
581	NC_010336	TTTATT	2	12	1205972	1205983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627340
582	NC_010336	AAAGGT	2	12	1207412	1207423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627342
583	NC_010336	AAAGGT	2	12	1207646	1207657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627342
584	NC_010336	TAAAAA	2	12	1213899	1213910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627349
585	NC_010336	ATTTAT	2	12	1219452	1219463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627355
586	NC_010336	TTTATA	2	12	1223065	1223076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627358
587	NC_010336	ATTTGA	2	12	1224376	1224387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010336	CAAAAG	2	12	1227063	1227074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627362
589	NC_010336	ATTTTA	2	12	1228062	1228073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627362
590	NC_010336	GATAAT	2	12	1228286	1228297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627362
591	NC_010336	AGTAAG	2	12	1228364	1228375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627362
592	NC_010336	CTATTA	2	12	1234446	1234457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627368
593	NC_010336	TTGCCT	2	12	1238214	1238225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167627371
594	NC_010336	ATTACA	2	12	1238522	1238533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627371
595	NC_010336	TTTTGG	2	12	1238609	1238620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167627371
596	NC_010336	TTGATC	2	12	1242922	1242933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627371
597	NC_010336	CATTTT	2	12	1247924	1247935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627375
598	NC_010336	AAATAT	2	12	1250190	1250201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167627377
599	NC_010336	CTAAAA	2	12	1252024	1252035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167627379
600	NC_010336	TAATCA	2	12	1255266	1255277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627381
601	NC_010336	GTCAAA	2	12	1258535	1258546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167627384
602	NC_010336	ATATAG	2	12	1263541	1263552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627387
603	NC_010336	TTTAGA	2	12	1264063	1264074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627387
604	NC_010336	GGCGAA	2	12	1264150	1264161	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167627387
605	NC_010336	GATTGT	2	12	1267747	1267758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627387
606	NC_010336	CTATGG	2	12	1277120	1277131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627397
607	NC_010336	GATTAG	2	12	1282555	1282566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627402
608	NC_010336	AAATAT	2	12	1283075	1283086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010336	AATTAA	2	12	1283246	1283257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167627403
610	NC_010336	TATGCT	2	12	1283452	1283463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627403
611	NC_010336	TTTGAG	3	18	1283840	1283857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627403
612	NC_010336	TAATCA	2	12	1285171	1285182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_010336	GATATT	2	12	1286838	1286849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627406
614	NC_010336	CTGGTG	2	12	1290863	1290874	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167627411
615	NC_010336	TGGTGA	2	12	1291227	1291238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627411
616	NC_010336	ATGGTA	2	12	1291349	1291360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627411
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710	NC_010336	TTATGT	2	12	1524580	1524591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627618
711	NC_010336	CTTTCT	2	12	1525207	1525218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167627620
712	NC_010336	ATTAAT	2	12	1526909	1526920	50 %	50 %	0 %	0 %	167627622
713	NC_010336	AGAGCT	2	12	1531505	1531516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627628
714	NC_010336	TAAAAT	2	12	1531968	1531979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
715	NC_010336	GCAGTT	2	12	1533110	1533121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627629
716	NC_010336	CAAGCT	2	12	1533818	1533829	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167627629
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719	NC_010336	ATCTTG	2	12	1536314	1536325	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627632
720	NC_010336	TTGAAT	2	12	1537716	1537727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627633
721	NC_010336	GCATTT	2	12	1538808	1538819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627634
722	NC_010336	TAAAAT	2	12	1545772	1545783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167627639
723	NC_010336	CATTAT	2	12	1546698	1546709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627641
724	NC_010336	TAATAT	2	12	1546860	1546871	50 %	50 %	0 %	0 %	167627641
725	NC_010336	ATTTAC	2	12	1548935	1548946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627644
726	NC_010336	GATAGT	2	12	1556109	1556120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627649
727	NC_010336	CAACAT	2	12	1556984	1556995	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167627650
728	NC_010336	CATGTT	2	12	1557563	1557574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627650
729	NC_010336	TATATT	2	12	1558669	1558680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627652
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797	NC_010336	GGGCTA	2	12	1703020	1703031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167627797
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833	NC_010336	TATAAT	2	12	1754452	1754463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
834	NC_010336	CTATAT	2	12	1757820	1757831	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627850
835	NC_010336	CTAATA	2	12	1759977	1759988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627853
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950	NC_010336	TGATTA	2	12	2026731	2026742	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167628120
951	NC_010336	ATAGCA	2	12	2028581	2028592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167628121
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