MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	CGGA	2	8	7032	7039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022784	ACGT	2	8	7076	7083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022784	TCCG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022784	ACAA	2	8	10856	10863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022784	CATG	2	8	10869	10876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022784	TCCG	2	8	11301	11308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022784	TTTG	2	8	11375	11382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022784	TCGT	2	8	11991	11998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022784	CATA	2	8	12228	12235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022784	TCCA	2	8	12288	12295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022784	CCAC	2	8	12377	12384	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_022784	GCAA	2	8	13060	13067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022784	CCCG	2	8	13329	13336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_022784	TCGA	2	8	18936	18943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022784	CAGG	2	8	19802	19809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022784	TGCG	2	8	20368	20375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022784	AAAC	2	8	20866	20873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022784	GGCA	2	8	20916	20923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022784	AAGG	2	8	20933	20940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022784	GTAT	2	8	21530	21537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022784	GGAT	2	8	25069	25076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022784	TGGC	2	8	27797	27804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022784	ACTG	2	8	27805	27812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022784	GTTG	2	8	31185	31192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022784	TCGC	2	8	31265	31272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022784	CGGC	2	8	32698	32705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022784	CAGT	2	8	32872	32879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022784	AATT	2	8	35506	35513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022784	CAGC	2	8	35670	35677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022784	AAGC	2	8	38372	38379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022784	TAGG	2	8	44083	44090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022784	CGCA	2	8	45497	45504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022784	TACT	2	8	47628	47635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022784	CTAG	2	8	47784	47791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022784	CCTA	2	8	47999	48006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022784	GTGA	2	8	49247	49254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022784	GTAC	2	8	55536	55543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022784	AACC	2	8	55857	55864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022784	ACAG	2	8	56596	56603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022784	GCAC	2	8	57081	57088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022784	CGCA	2	8	57500	57507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022784	CCAT	2	8	57555	57562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022784	TGGG	2	8	57872	57879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022784	TGGC	2	8	58835	58842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022784	ACAG	2	8	59467	59474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022784	ATGA	2	8	59668	59675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022784	AGTG	2	8	62618	62625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022784	GGTA	2	8	62661	62668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022784	CTAG	2	8	63171	63178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022784	GTTG	2	8	63273	63280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022784	GACT	2	8	64219	64226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022784	ACCC	2	8	64476	64483	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_022784	CACC	2	8	64755	64762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_022784	CCAA	2	8	64994	65001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022784	CACT	2	8	65033	65040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022784	CTAT	2	8	65839	65846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022784	TACT	2	8	66986	66993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022784	GTGA	2	8	68816	68823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022784	AAGA	2	8	69028	69035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022784	GAAA	2	8	70186	70193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022784	GCAT	2	8	71822	71829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022784	GGAG	2	8	73426	73433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022784	GAAG	2	8	73617	73624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022784	GTAA	2	8	73804	73811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022784	AATT	2	8	75248	75255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022784	TGGT	2	8	77280	77287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022784	GGTG	2	8	79026	79033	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022784	GTAT	2	8	80752	80759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022784	GAAT	2	8	81372	81379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022784	AAGA	2	8	81384	81391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022784	GATG	2	8	81398	81405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022784	AAAG	2	8	82474	82481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022784	TGGG	2	8	83009	83016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022784	GCCT	2	8	83610	83617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022784	TGCT	2	8	84191	84198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022784	GTTT	2	8	84392	84399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022784	GGTG	2	8	84428	84435	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022784	GAAG	2	8	84621	84628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022784	GCCT	2	8	90649	90656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022784	GAAT	2	8	92320	92327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022784	TGCT	2	8	92407	92414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022784	CCAC	2	8	92481	92488	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_022784	GGGT	2	8	97361	97368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022784	CTGT	2	8	97435	97442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022784	GTCA	2	8	98346	98353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022784	GCAT	2	8	99008	99015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022784	TGAC	2	8	99321	99328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022784	TGAT	2	8	99479	99486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022784	GATT	2	8	99635	99642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022784	GCAT	2	8	99964	99971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022784	GTTT	2	8	99978	99985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022784	TAAC	2	8	100037	100044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022784	TTCA	2	8	100315	100322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022784	GATG	2	8	100539	100546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022784	ACCT	2	8	100687	100694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022784	TGAC	2	8	101268	101275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022784	TGAT	2	8	101426	101433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022784	GATT	2	8	101582	101589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022784	CTGC	2	8	101748	101755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022784	GCTC	2	8	102060	102067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022784	TCAT	2	8	102950	102957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022784	AAAT	2	8	103059	103066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022784	TGGG	2	8	103176	103183	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022784	TTCT	2	8	103297	103304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022784	GCGT	2	8	104016	104023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022784	TGTA	2	8	104525	104532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022784	AGCA	2	8	104641	104648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022784	CTGC	2	8	104694	104701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022784	TTGG	2	8	104967	104974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022784	AGAC	2	8	105079	105086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022784	TACG	2	8	105175	105182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022784	AACC	2	8	105493	105500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022784	GACG	2	8	105650	105657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022784	ATCT	2	8	108579	108586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022784	CAGT	2	8	108897	108904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022784	TTGG	2	8	109171	109178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022784	ACCA	2	8	112466	112473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022784	TTAT	2	8	117513	117520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022784	TTCA	2	8	120301	120308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022784	AATT	2	8	120790	120797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022784	GCCT	2	8	121961	121968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022784	GTCT	2	8	135272	135279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022784	TGGT	2	8	143448	143455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022784	GCGG	2	8	143557	143564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022784	CTGT	2	8	147301	147308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022784	CTAC	2	8	150873	150880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022784	CCAG	2	8	151994	152001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022784	GTAG	2	8	154567	154574	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022784	CATC	2	8	154718	154725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022784	ATGA	2	8	154946	154953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022784	GTTA	2	8	155225	155232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022784	CAAT	2	8	155627	155634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022784	ATCA	2	8	155784	155791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022784	AGTC	2	8	155887	155894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022784	ATGC	2	8	156258	156265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022784	GCAG	2	8	156670	156677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022784	TTCG	2	8	157087	157094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022784	AAAG	2	8	158616	158623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022784	GGCG	2	8	159263	159270	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022784	CGAG	2	8	160455	160462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022784	GCAA	2	8	164168	164175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022784	ATTA	2	8	170419	170426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022784	ATGG	2	8	170460	170467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022784	ACTC	2	8	170508	170515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022784	ATTT	2	8	170548	170555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022784	GTTG	2	8	176310	176317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022784	GTTG	2	8	177707	177714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022784	GGCC	2	8	177846	177853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022784	TGGG	2	8	179355	179362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022784	GATT	2	8	179379	179386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022784	TGGA	2	8	179460	179467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022784	GGTA	2	8	180455	180462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022784	GGAC	2	8	180670	180677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_022784	AATG	2	8	180775	180782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022784	TTTA	2	8	181053	181060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022784	TTGC	2	8	184796	184803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_022784	GTTG	2	8	197341	197348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_022784	TAGC	2	8	625005	625012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
449	NC_022784	AATG	2	8	625135	625142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
450	NC_022784	GTAT	2	8	625398	625405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_022784	ACGA	2	8	625534	625541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_022784	TGCT	2	8	629680	629687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_022784	ATTT	2	8	630323	630330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022784	ATGC	2	8	631476	631483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_022784	TCTA	2	8	631958	631965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_022784	GGTA	2	8	637234	637241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
458	NC_022784	GTAT	2	8	638701	638708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
459	NC_022784	TAAT	2	8	640639	640646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_022784	GATT	2	8	642366	642373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_022784	TGAC	2	8	642447	642454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_022784	AGCT	2	8	643422	643429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_022784	TAGC	2	8	643461	643468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_022784	GCAG	2	8	643599	643606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_022784	GCGA	2	8	644722	644729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
470	NC_022784	ATCA	2	8	644839	644846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_022784	CTAC	2	8	645094	645101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_022784	GGAG	2	8	645320	645327	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022784	ACAA	2	8	647645	647652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_022784	ATAG	2	8	648127	648134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_022784	AGCA	2	8	648308	648315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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478	NC_022784	CAGA	2	8	648842	648849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
479	NC_022784	TACG	2	8	649128	649135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_022784	TAGC	2	8	650180	650187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_022784	CAGG	2	8	650804	650811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_022784	AGCT	2	8	651350	651357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_022784	CGTG	2	8	651603	651610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_022784	GTTT	2	8	652582	652589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022784	TGAA	2	8	652674	652681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_022784	GCAC	2	8	653987	653994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_022784	GATG	2	8	654832	654839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_022784	ACTA	2	8	655063	655070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_022784	GCCA	2	8	655265	655272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_022784	AAAT	2	8	655528	655535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_022784	TGGA	3	12	655704	655715	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_022784	CCGG	2	8	657165	657172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_022784	GCCG	2	8	657622	657629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_022784	CCTC	2	8	658537	658544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_022784	CAAC	2	8	659851	659858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_022784	GAAG	2	8	660411	660418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_022784	GTAA	2	8	660598	660605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_022784	AATT	2	8	662189	662196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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