MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022784	CAGC	2	8	662362	662369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_022784	ATAG	2	8	663947	663954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022784	GTGA	2	8	664165	664172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022784	ATAG	2	8	664409	664416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022784	TTGG	2	8	664504	664511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022784	TGTA	2	8	664612	664619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022784	CCTA	2	8	675520	675527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_022784	TGCT	2	8	679735	679742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_022784	TTTC	2	8	689622	689629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_022784	AAAG	2	8	691109	691116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022784	TATC	2	8	694797	694804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_022784	AGAA	2	8	701455	701462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022784	AAGG	2	8	702614	702621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022784	GTGC	2	8	702640	702647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_022784	TTTG	2	8	702650	702657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022784	CAAT	2	8	704392	704399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_022784	TCCC	2	8	706915	706922	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
518	NC_022784	CCTG	2	8	706971	706978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_022784	ACAA	2	8	711262	711269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_022784	AGAC	2	8	713732	713739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_022784	AACA	2	8	713964	713971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_022784	CACC	2	8	715148	715155	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_022784	GCAA	2	8	715411	715418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_022784	CCAG	2	8	715613	715620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_022784	CAGA	2	8	717630	717637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_022784	TCAC	2	8	720844	720851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_022784	CCAA	2	8	726203	726210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_022784	GGAA	2	8	727542	727549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022784	AAGA	2	8	727981	727988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022784	CACG	2	8	735630	735637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_022784	CTGC	2	8	735748	735755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_022784	CCCA	2	8	737460	737467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
533	NC_022784	AGCA	2	8	737804	737811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_022784	CTTT	2	8	738166	738173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_022784	CCTT	2	8	738442	738449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_022784	GAGC	2	8	738614	738621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_022784	CCAT	2	8	738686	738693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_022784	AGTG	2	8	739504	739511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022784	CCAG	2	8	739606	739613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
540	NC_022784	CTAC	2	8	739725	739732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_022784	TGAG	2	8	741410	741417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022784	CCAA	2	8	741956	741963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_022784	TCTT	2	8	742650	742657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_022784	TCTT	2	8	743496	743503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_022784	CATG	2	8	747857	747864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_022784	CAGT	2	8	748292	748299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_022784	ACTT	2	8	749015	749022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_022784	ATGC	2	8	749178	749185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_022784	TCCT	2	8	749667	749674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_022784	CCAA	2	8	749799	749806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_022784	CCCT	2	8	750147	750154	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
552	NC_022784	AGAA	2	8	750230	750237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022784	GTCA	2	8	756542	756549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_022784	TTGC	2	8	759836	759843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_022784	CCTC	2	8	759920	759927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
556	NC_022784	CACC	2	8	760713	760720	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
557	NC_022784	CAGC	2	8	761001	761008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_022784	CATC	2	8	761131	761138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022784	CACC	2	8	762792	762799	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
560	NC_022784	ACTT	2	8	762973	762980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_022784	CACC	2	8	765084	765091	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
562	NC_022784	TAAG	2	8	766753	766760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022784	CAAC	2	8	773194	773201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_022784	TGTT	2	8	774063	774070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022784	AGGT	2	8	774168	774175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022784	CTAC	2	8	776232	776239	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_022784	CAGG	2	8	776957	776964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_022784	CACT	2	8	778966	778973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_022784	CTGC	2	8	783707	783714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_022784	GAAA	2	8	784125	784132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022784	TACA	2	8	784169	784176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_022784	CGAT	2	8	784678	784685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_022784	AACC	2	8	784729	784736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_022784	TGGG	2	8	786155	786162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022784	CCCA	2	8	786930	786937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
576	NC_022784	ACGT	2	8	786955	786962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_022784	AAGC	2	8	788292	788299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_022784	CACT	2	8	788772	788779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_022784	GATC	2	8	788781	788788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_022784	AGAA	2	8	789517	789524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022784	CTGT	2	8	790452	790459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_022784	AGGG	2	8	790486	790493	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022784	GAAG	2	8	793430	793437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022784	CAAA	2	8	795352	795359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_022784	ACCA	2	8	795466	795473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_022784	GTAA	2	8	795569	795576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022784	GCTC	2	8	795701	795708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_022784	CTTT	2	8	800755	800762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_022784	ACCA	2	8	801560	801567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_022784	CCTC	2	8	801644	801651	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
591	NC_022784	CTGC	2	8	801779	801786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_022784	AGTG	2	8	805699	805706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022784	TCCT	2	8	809450	809457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_022784	AGCG	2	8	809902	809909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_022784	AGCG	2	8	811314	811321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
596	NC_022784	TCCT	2	8	812213	812220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_022784	TCCT	2	8	812252	812259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_022784	TCCT	2	8	812302	812309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_022784	GATT	2	8	812548	812555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022784	CATT	2	8	813927	813934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_022784	CAAA	2	8	840926	840933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_022784	CGTT	2	8	843435	843442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_022784	GTTT	2	8	844146	844153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022784	ATAA	2	8	845321	845328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022784	GTCG	2	8	850424	850431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_022784	CCAA	2	8	851331	851338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_022784	TCTA	2	8	852191	852198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_022784	TGGG	2	8	852728	852735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022784	GCAG	2	8	852786	852793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_022784	TGGG	2	8	852981	852988	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022784	GACC	2	8	854268	854275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
612	NC_022784	CAGT	2	8	857937	857944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_022784	CCGG	2	8	858165	858172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_022784	AGCA	2	8	858253	858260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_022784	CACC	2	8	858270	858277	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
616	NC_022784	GGCT	2	8	858504	858511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_022784	CACC	2	8	858628	858635	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
618	NC_022784	GTAC	2	8	868416	868423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_022784	TGGC	2	8	876262	876269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_022784	GTTG	2	8	877076	877083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022784	GGAG	2	8	877133	877140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022784	CCAG	2	8	879454	879461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_022784	GCAC	2	8	879767	879774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_022784	GCCA	2	8	880196	880203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_022784	CCTG	2	8	880452	880459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_022784	ACGT	2	8	888697	888704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_022784	AGCA	2	8	888747	888754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_022784	GACG	2	8	888762	888769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_022784	AGAT	2	8	888913	888920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022784	AGGT	2	8	889549	889556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022784	TCCC	2	8	889786	889793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
632	NC_022784	AAAC	2	8	890002	890009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_022784	GCAG	2	8	890378	890385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_022784	CATG	2	8	891657	891664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
635	NC_022784	ACAA	2	8	891670	891677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
636	NC_022784	ATGC	2	8	892689	892696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_022784	TGGA	2	8	895180	895187	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022784	TACC	2	8	899558	899565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_022784	ACCC	2	8	900875	900882	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
640	NC_022784	TACC	2	8	901551	901558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_022784	TTTG	2	8	904535	904542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022784	TAAC	2	8	915083	915090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
643	NC_022784	AGAT	2	8	915125	915132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022784	GAGC	2	8	916982	916989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
645	NC_022784	AGGC	2	8	918872	918879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
646	NC_022784	TGCA	2	8	924489	924496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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793	NC_022784	ATAA	2	8	1148515	1148522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
794	NC_022784	TTTA	2	8	1148545	1148552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
795	NC_022784	TCTT	2	8	1148982	1148989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
796	NC_022784	GGCA	2	8	1154156	1154163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
797	NC_022784	TGAG	2	8	1155256	1155263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
798	NC_022784	GCAA	2	8	1160971	1160978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
799	NC_022784	AGTA	2	8	1161009	1161016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
800	NC_022784	GGAA	2	8	1162490	1162497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
801	NC_022784	TGTC	2	8	1163019	1163026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
802	NC_022784	GACA	2	8	1164501	1164508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
803	NC_022784	CGTG	2	8	1167341	1167348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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811	NC_022784	TGCA	2	8	1188239	1188246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
812	NC_022784	ACTG	2	8	1188957	1188964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
813	NC_022784	GCGG	2	8	1193468	1193475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
814	NC_022784	AAGG	2	8	1193477	1193484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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