MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 3636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	GCC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013851	ATC	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013851	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013851	CCG	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013851	GAC	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013851	GGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013851	GTG	2	6	9982	9987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013851	CAA	3	9	9999	10007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013851	ACC	2	6	10009	10014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013851	GCC	2	6	10022	10027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013851	CAG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013851	ATG	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013851	CCT	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013851	CGG	2	6	10219	10224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013851	GTT	2	6	10244	10249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013851	ACT	2	6	10848	10853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013851	TCG	2	6	23058	23063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013851	TCC	2	6	23153	23158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013851	CGG	2	6	23187	23192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013851	GGA	2	6	23598	23603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013851	CGG	2	6	26707	26712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013851	CTC	2	6	28826	28831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013851	CCG	2	6	28855	28860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013851	CCA	2	6	28930	28935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013851	GAG	2	6	28945	28950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013851	GCC	2	6	29786	29791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013851	GGC	2	6	34050	34055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013851	GCC	2	6	34062	34067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013851	GCG	2	6	40481	40486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013851	CGC	2	6	44566	44571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013851	GCC	2	6	45953	45958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013851	GCC	2	6	48942	48947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013851	GCC	2	6	48956	48961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013851	CCT	2	6	48964	48969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013851	CGG	2	6	48979	48984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013851	GTG	2	6	48991	48996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013851	CCT	2	6	49016	49021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013851	ACC	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013851	TGA	2	6	51919	51924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013851	CCG	2	6	55408	55413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013851	GCC	2	6	55447	55452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013851	CCG	3	9	59734	59742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_013851	GCC	2	6	59796	59801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013851	TCC	2	6	60326	60331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013851	TCC	2	6	61467	61472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013851	CGG	3	9	65626	65634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013851	ATG	2	6	65867	65872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013851	CGA	2	6	68743	68748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013851	GAC	2	6	68794	68799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013851	GCC	2	6	68805	68810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013851	CGG	2	6	68821	68826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013851	CTG	2	6	69937	69942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013851	CTC	2	6	71046	71051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013851	GTG	2	6	71059	71064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013851	CAA	2	6	71099	71104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013851	CGT	2	6	72374	72379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013851	CCG	2	6	72380	72385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013851	CGG	2	6	72397	72402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013851	CCT	2	6	72409	72414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013851	TGC	2	6	73042	73047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013851	GTA	2	6	73552	73557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013851	CGA	2	6	73574	73579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013851	AAT	2	6	73597	73602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013851	GGA	2	6	73616	73621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013851	TCC	2	6	74433	74438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013851	GGT	2	6	75308	75313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013851	CGG	3	9	78067	78075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013851	CCG	2	6	78088	78093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013851	TGG	2	6	79247	79252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013851	GGC	2	6	80053	80058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013851	GAT	2	6	80113	80118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013851	CGA	2	6	80151	80156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013851	TGC	2	6	80157	80162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013851	ATG	2	6	80202	80207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013851	ATG	2	6	82437	82442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013851	CGC	2	6	83618	83623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013851	CCG	2	6	88135	88140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013851	GAC	2	6	90062	90067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013851	GGA	2	6	92225	92230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013851	TGA	2	6	92871	92876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013851	CGC	2	6	92883	92888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013851	CTA	2	6	93069	93074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013851	GAG	2	6	94019	94024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013851	GAT	2	6	94056	94061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013851	CGC	2	6	94214	94219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013851	CAG	2	6	94261	94266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013851	CGT	2	6	94358	94363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013851	GAG	2	6	94395	94400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013851	TGG	2	6	98850	98855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013851	GAT	2	6	99789	99794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013851	TCG	2	6	99831	99836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013851	TAT	2	6	100036	100041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013851	ACC	2	6	100115	100120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013851	ATC	2	6	102533	102538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013851	CGA	2	6	102631	102636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013851	CCA	2	6	102640	102645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013851	CAC	2	6	102740	102745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013851	CCG	2	6	102778	102783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013851	GCC	2	6	102839	102844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013851	TGA	2	6	102871	102876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013851	GTC	2	6	102878	102883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013851	TAG	2	6	102945	102950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013851	GGC	2	6	103020	103025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013851	TCG	3	9	103070	103078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013851	CGT	2	6	103089	103094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013851	GGC	2	6	103159	103164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013851	CCA	2	6	103189	103194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013851	TGG	2	6	103449	103454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013851	CAG	2	6	103465	103470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013851	ACC	2	6	103499	103504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013851	GGC	2	6	103519	103524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013851	AGA	2	6	103527	103532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013851	CGT	2	6	103548	103553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013851	CCG	2	6	103592	103597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013851	CAC	2	6	103606	103611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013851	GTG	2	6	103628	103633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013851	CGG	2	6	103686	103691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013851	CAG	2	6	103819	103824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013851	CGT	2	6	103893	103898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013851	CCG	2	6	103931	103936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013851	ACC	2	6	103940	103945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013851	CCA	2	6	103983	103988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013851	GAT	2	6	104014	104019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013851	TGA	2	6	104100	104105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013851	GAT	2	6	104137	104142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013851	CGC	2	6	104154	104159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013851	GTC	2	6	104245	104250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013851	CGG	2	6	104289	104294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013851	TGG	2	6	104370	104375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013851	ATC	2	6	107308	107313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013851	CGC	2	6	107556	107561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013851	CGT	2	6	107599	107604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013851	TCC	2	6	109701	109706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013851	CCT	2	6	110743	110748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013851	GCG	2	6	110763	110768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013851	GAA	2	6	112290	112295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013851	GGC	2	6	112482	112487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013851	CCA	2	6	112697	112702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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