MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 3636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013851	CGG	2	6	3349459	3349464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013851	GCG	2	6	3349470	3349475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013851	CGC	2	6	3353805	3353810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013851	CGG	2	6	3353966	3353971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013851	GAC	2	6	3354024	3354029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013851	CAA	2	6	3354147	3354152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013851	ACA	2	6	3354194	3354199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013851	TGC	2	6	3354265	3354270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013851	GCG	2	6	3354351	3354356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013851	ACC	2	6	3354987	3354992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_013851	TAG	2	6	3355016	3355021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013851	CGC	2	6	3358275	3358280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_013851	CGC	2	6	3358365	3358370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_013851	GGT	2	6	3361913	3361918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013851	GCT	2	6	3363258	3363263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013851	GTC	2	6	3363295	3363300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013851	TTG	2	6	3364417	3364422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013851	CGG	2	6	3369683	3369688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013851	GCG	2	6	3369710	3369715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013851	GTA	2	6	3369756	3369761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013851	TCG	2	6	3374119	3374124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013851	CGC	2	6	3378121	3378126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_013851	CTC	2	6	3380202	3380207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_013851	AAC	2	6	3380225	3380230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013851	CGG	2	6	3384534	3384539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013851	ATG	2	6	3386639	3386644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013851	GTC	2	6	3386657	3386662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013851	GCG	2	6	3386750	3386755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013851	CGG	2	6	3388220	3388225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013851	GTC	2	6	3394869	3394874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013851	TCG	2	6	3399357	3399362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013851	GGC	2	6	3399377	3399382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013851	GGT	2	6	3399445	3399450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013851	CGC	2	6	3399481	3399486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_013851	GCG	2	6	3399530	3399535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013851	GCG	2	6	3399537	3399542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013851	GGC	2	6	3399566	3399571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013851	CCG	2	6	3399589	3399594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_013851	ATG	2	6	3399597	3399602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013851	CGG	2	6	3399604	3399609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_013851	ACC	2	6	3399621	3399626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_013851	CGA	2	6	3400170	3400175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013851	CAG	2	6	3401494	3401499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013851	GAT	2	6	3401557	3401562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013851	CAA	2	6	3401596	3401601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013851	CGG	2	6	3401625	3401630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013851	GCA	2	6	3401724	3401729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013851	GCT	2	6	3401804	3401809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013851	TAT	2	6	3401818	3401823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013851	GCG	2	6	3410792	3410797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013851	TCG	2	6	3412769	3412774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013851	GCC	2	6	3414659	3414664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_013851	GTC	2	6	3417488	3417493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013851	TCG	2	6	3417530	3417535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013851	GGC	2	6	3417540	3417545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013851	CCG	2	6	3417548	3417553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_013851	CAA	2	6	3420609	3420614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013851	CGC	2	6	3420624	3420629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_013851	GCC	2	6	3420714	3420719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_013851	GAC	2	6	3421537	3421542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013851	CAA	2	6	3422426	3422431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013851	GGC	2	6	3422528	3422533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013851	CCG	2	6	3424369	3424374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_013851	CGA	2	6	3424379	3424384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013851	GTT	2	6	3427422	3427427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013851	TAT	2	6	3429547	3429552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013851	AGC	2	6	3429662	3429667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013851	TTA	2	6	3429861	3429866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013851	GCG	2	6	3429872	3429877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013851	GGA	2	6	3432098	3432103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013851	CGA	2	6	3432108	3432113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013851	AAT	2	6	3432128	3432133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013851	TGC	2	6	3434644	3434649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_013851	TCG	2	6	3434946	3434951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013851	CGA	2	6	3435012	3435017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013851	CGC	2	6	3435091	3435096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_013851	CGA	2	6	3435104	3435109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013851	TCG	2	6	3435177	3435182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013851	ACG	2	6	3436584	3436589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013851	CCT	2	6	3438565	3438570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_013851	GCC	2	6	3438656	3438661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_013851	CCT	2	6	3438770	3438775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013851	GCC	2	6	3445750	3445755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_013851	TCG	2	6	3445810	3445815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013851	GGC	2	6	3446986	3446991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013851	TAT	2	6	3447059	3447064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013851	CCG	2	6	3447107	3447112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_013851	TCC	2	6	3450473	3450478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_013851	CCG	2	6	3450489	3450494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_013851	GCA	2	6	3454770	3454775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_013851	GAC	2	6	3458938	3458943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013851	GCC	2	6	3458985	3458990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_013851	GGT	2	6	3460224	3460229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013851	CGA	2	6	3462096	3462101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013851	TCA	2	6	3462228	3462233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_013851	GCT	3	9	3462318	3462326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_013851	GCC	2	6	3464313	3464318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013851	CGC	2	6	3464344	3464349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_013851	CGG	2	6	3465408	3465413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013851	CGC	2	6	3470622	3470627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_013851	TGT	2	6	3470631	3470636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013851	GTC	2	6	3470664	3470669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013851	ATC	2	6	3476854	3476859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013851	GCC	2	6	3477913	3477918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_013851	GCG	2	6	3477987	3477992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013851	CGG	2	6	3478040	3478045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013851	CGG	2	6	3478118	3478123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013851	GCC	2	6	3478132	3478137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_013851	GTG	2	6	3479238	3479243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013851	CTA	2	6	3479270	3479275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013851	GGC	2	6	3479330	3479335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013851	CAT	2	6	3479379	3479384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013851	CGG	2	6	3480057	3480062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_013851	TCG	2	6	3484283	3484288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_013851	ACG	2	6	3484335	3484340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_013851	ACC	3	9	3489468	3489476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_013851	ATC	2	6	3489490	3489495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013851	GCA	2	6	3489637	3489642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_013851	GAC	2	6	3489670	3489675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013851	TCG	2	6	3495904	3495909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013851	GTC	2	6	3497784	3497789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013851	GAT	2	6	3507290	3507295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013851	CCG	2	6	3508617	3508622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_013851	TCA	2	6	3510215	3510220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013851	CGC	2	6	3512667	3512672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_013851	GCC	2	6	3512712	3512717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_013851	CAG	2	6	3512735	3512740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_013851	GAT	2	6	3516595	3516600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013851	CGC	2	6	3516712	3516717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_013851	GAT	2	6	3522315	3522320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013851	TCG	2	6	3522364	3522369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_013851	TCA	2	6	3522419	3522424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_013851	GCG	2	6	3524441	3524446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_013851	CGC	2	6	3524447	3524452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3635	NC_013851	GGT	2	6	3526872	3526877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_013851	TGA	2	6	3526889	3526894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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