MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 5942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011989	GCG	2	6	347815	347820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011989	TCA	2	6	347821	347826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011989	CTA	2	6	347891	347896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011989	GCG	2	6	350290	350295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011989	GCA	2	6	350327	350332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011989	ATG	2	6	350372	350377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011989	CGG	2	6	350547	350552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_011989	ATG	2	6	351027	351032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011989	GTG	2	6	351042	351047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011989	TGA	2	6	351093	351098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011989	GCT	2	6	351522	351527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011989	CGT	2	6	351719	351724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011989	TCG	2	6	351765	351770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011989	GCA	2	6	354517	354522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011989	GTG	2	6	354550	354555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011989	TCA	2	6	354601	354606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011989	TGG	2	6	354685	354690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011989	TGG	2	6	354716	354721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011989	TCC	2	6	354775	354780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011989	TAT	3	9	356476	356484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011989	CCG	2	6	356516	356521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011989	GTC	2	6	358934	358939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011989	ATC	2	6	358991	358996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011989	CCG	2	6	359028	359033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011989	GCC	2	6	361849	361854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_011989	CTG	2	6	366800	366805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011989	TGA	3	9	367884	367892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011989	TCA	2	6	367913	367918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011989	CGA	2	6	367951	367956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011989	GCG	2	6	369197	369202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011989	TGG	2	6	369977	369982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011989	CTG	2	6	370015	370020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011989	CAT	2	6	370657	370662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011989	GAT	2	6	371959	371964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011989	GGC	2	6	376183	376188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011989	GCC	2	6	376206	376211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011989	GCG	2	6	378560	378565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011989	GGC	2	6	381161	381166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011989	ACA	2	6	381167	381172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011989	CTG	2	6	381196	381201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011989	TCC	2	6	381231	381236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_011989	GAC	2	6	381733	381738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011989	GGT	2	6	381781	381786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011989	TTA	2	6	383703	383708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011989	ACA	2	6	383712	383717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011989	GCC	2	6	383755	383760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_011989	CAT	2	6	384827	384832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011989	GCC	2	6	386715	386720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_011989	TCA	2	6	386758	386763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011989	CGT	2	6	387175	387180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_011989	GAA	2	6	387280	387285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011989	GGT	2	6	388815	388820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011989	CAT	2	6	388856	388861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011989	CAA	2	6	388908	388913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011989	TCC	2	6	389105	389110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011989	AAG	2	6	389202	389207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011989	CGT	2	6	389273	389278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011989	TCG	2	6	389332	389337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011989	CGG	2	6	392486	392491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011989	CCG	2	6	392506	392511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011989	GCA	2	6	393218	393223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011989	CAG	2	6	393239	393244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011989	ATT	2	6	394741	394746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011989	TGC	2	6	396663	396668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011989	TGA	2	6	397993	397998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011989	CCA	2	6	398033	398038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_011989	ACA	2	6	398395	398400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011989	GCA	2	6	399709	399714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011989	GTC	2	6	399893	399898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011989	CTG	2	6	400812	400817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011989	CGG	3	9	400849	400857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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574	NC_011989	TGC	2	6	404609	404614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011989	GGT	2	6	404672	404677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011989	GCC	2	6	404697	404702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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578	NC_011989	ATT	2	6	406927	406932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011989	GCA	2	6	407072	407077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011989	GAT	2	6	409519	409524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_011989	TAC	2	6	409574	409579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_011989	CAA	2	6	409603	409608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011989	GAT	2	6	409647	409652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_011989	TCA	2	6	415937	415942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_011989	CGA	2	6	420984	420989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_011989	CAT	2	6	421087	421092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011989	TCT	2	6	421169	421174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011989	GGT	2	6	422332	422337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011989	CAT	2	6	422344	422349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011989	ATG	2	6	422355	422360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_011989	CAT	2	6	428875	428880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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611	NC_011989	TGT	2	6	429313	429318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_011989	AAT	2	6	433455	433460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011989	TAT	2	6	433490	433495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_011989	GAG	2	6	435788	435793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011989	ATT	2	6	435853	435858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011989	TCC	2	6	435893	435898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_011989	ACC	2	6	439751	439756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_011989	GGA	2	6	439829	439834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011989	ATG	2	6	442142	442147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011989	ATG	2	6	442193	442198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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