MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 5942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011989	AAT	2	6	3059759	3059764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011989	CAT	2	6	3059793	3059798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_011989	TAT	2	6	3061032	3061037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011989	CTG	2	6	3061563	3061568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_011989	GCC	2	6	3063721	3063726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_011989	AAC	2	6	3063886	3063891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_011989	AAC	2	6	3063932	3063937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011989	CGC	2	6	3064031	3064036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_011989	GCG	2	6	3064053	3064058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_011989	CCT	2	6	3065433	3065438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_011989	ACC	2	6	3065440	3065445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_011989	CAT	2	6	3065482	3065487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011989	CAA	2	6	3065602	3065607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011989	TCT	2	6	3065756	3065761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_011989	CGT	2	6	3065846	3065851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011989	TCC	2	6	3066006	3066011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_011989	TGT	2	6	3066116	3066121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011989	CAA	2	6	3070001	3070006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011989	TGG	2	6	3070039	3070044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011989	ATT	2	6	3070111	3070116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011989	ATT	2	6	3070185	3070190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011989	TTG	2	6	3071347	3071352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011989	GCC	2	6	3071362	3071367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_011989	CGG	3	9	3071429	3071437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_011989	CGG	2	6	3073065	3073070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_011989	AGC	2	6	3073133	3073138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_011989	GCG	2	6	3073139	3073144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011989	AAC	2	6	3073150	3073155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011989	AAC	3	9	3073182	3073190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_011989	GGC	2	6	3073381	3073386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_011989	TCT	2	6	3075974	3075979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011989	CAG	2	6	3075996	3076001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_011989	ACA	2	6	3078453	3078458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011989	AAT	2	6	3078581	3078586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011989	GGA	3	9	3078639	3078647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011989	GCG	2	6	3080701	3080706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_011989	TCC	2	6	3081995	3082000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_011989	ACG	2	6	3082044	3082049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011989	GGT	2	6	3083929	3083934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011989	CAA	2	6	3084063	3084068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011989	GCC	2	6	3085124	3085129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_011989	CGT	2	6	3085629	3085634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011989	CTC	2	6	3085652	3085657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_011989	CTT	2	6	3085715	3085720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_011989	GAA	2	6	3085729	3085734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011989	GCG	2	6	3085758	3085763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_011989	GAC	2	6	3086894	3086899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011989	AAT	2	6	3086951	3086956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011989	GCA	2	6	3086986	3086991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_011989	CGC	2	6	3086993	3086998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_011989	AGA	2	6	3087011	3087016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011989	CGC	2	6	3088563	3088568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_011989	CCT	2	6	3089509	3089514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_011989	TTG	2	6	3089618	3089623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011989	ACA	2	6	3089730	3089735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_011989	AAT	2	6	3092316	3092321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011989	CGC	2	6	3092322	3092327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_011989	TCT	2	6	3092492	3092497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_011989	GCT	2	6	3094610	3094615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_011989	CAA	2	6	3094873	3094878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_011989	GAT	2	6	3096436	3096441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011989	ATG	2	6	3096518	3096523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011989	AAT	2	6	3102486	3102491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011989	CGG	2	6	3102531	3102536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011989	TAC	2	6	3102680	3102685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_011989	GGC	2	6	3103815	3103820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_011989	GCC	2	6	3103826	3103831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_011989	CTT	2	6	3103832	3103837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_011989	TCC	2	6	3104330	3104335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_011989	TGA	2	6	3104396	3104401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011989	CAA	2	6	3104423	3104428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_011989	TGA	2	6	3104511	3104516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011989	GAA	2	6	3104586	3104591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011989	GCC	2	6	3104620	3104625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_011989	GAT	2	6	3105790	3105795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011989	AAT	2	6	3105885	3105890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011989	GAG	2	6	3105956	3105961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_011989	GAC	2	6	3107937	3107942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_011989	ATA	2	6	3107998	3108003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011989	CCT	2	6	3108090	3108095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_011989	TCC	2	6	3108104	3108109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_011989	CTT	2	6	3109109	3109114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_011989	GCA	2	6	3109219	3109224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_011989	GCA	2	6	3109230	3109235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_011989	GCC	2	6	3109265	3109270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_011989	CTG	2	6	3109330	3109335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_011989	TCC	2	6	3109806	3109811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_011989	CAT	2	6	3109832	3109837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_011989	ATG	2	6	3109864	3109869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011989	CGG	2	6	3109998	3110003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_011989	CCA	2	6	3110100	3110105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_011989	TTC	2	6	3110113	3110118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_011989	CTG	2	6	3110202	3110207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_011989	ATT	2	6	3111565	3111570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011989	TGA	2	6	3111581	3111586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011989	CAA	2	6	3111614	3111619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_011989	GGC	2	6	3113177	3113182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_011989	CAA	2	6	3113285	3113290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_011989	CAA	2	6	3113333	3113338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_011989	AAG	2	6	3113345	3113350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011989	GAC	2	6	3116871	3116876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_011989	GAC	2	6	3116928	3116933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_011989	CAA	2	6	3116940	3116945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_011989	CAG	2	6	3120426	3120431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011989	CCT	2	6	3121881	3121886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_011989	TGA	2	6	3122204	3122209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011989	AAT	2	6	3122249	3122254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011989	AAT	2	6	3122261	3122266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011989	GGT	2	6	3122367	3122372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_011989	TCC	2	6	3122412	3122417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_011989	GAG	2	6	3127217	3127222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011989	GCC	2	6	3133766	3133771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_011989	CCA	2	6	3133807	3133812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_011989	ACG	2	6	3135599	3135604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_011989	GCC	2	6	3135642	3135647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_011989	CTG	2	6	3135754	3135759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_011989	AGC	2	6	3135885	3135890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_011989	TAT	2	6	3137490	3137495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011989	GGC	2	6	3138095	3138100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_011989	TCA	2	6	3138178	3138183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_011989	ATG	2	6	3138189	3138194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011989	GCT	2	6	3138595	3138600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_011989	AGC	2	6	3139413	3139418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_011989	CAA	2	6	3139579	3139584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_011989	CAT	2	6	3139684	3139689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_011989	CAT	2	6	3139853	3139858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_011989	CCG	2	6	3140224	3140229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5254	NC_011989	TCA	2	6	3242425	3242430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_011989	GCA	2	6	3242454	3242459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_011989	AAT	2	6	3250161	3250166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_011989	AAG	2	6	3250182	3250187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_011989	GAG	2	6	3250254	3250259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5274	NC_011989	GCT	2	6	3263380	3263385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_011989	GCG	2	6	3268595	3268600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5282	NC_011989	CGG	2	6	3269671	3269676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5283	NC_011989	AAT	2	6	3269692	3269697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_011989	AGA	2	6	3269698	3269703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_011989	CGG	2	6	3269707	3269712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5360	NC_011989	CGG	2	6	3321160	3321165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5361	NC_011989	GAT	2	6	3321213	3321218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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