MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 9195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011312	TGA	2	6	1525752	1525757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011312	TCA	2	6	1525758	1525763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_011312	GGC	2	6	1525886	1525891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011312	GGC	2	6	1525964	1525969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_011312	TGC	2	6	1525975	1525980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_011312	CTT	2	6	1526020	1526025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_011312	GTT	2	6	1526110	1526115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011312	ATT	2	6	1526180	1526185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011312	TGC	2	6	1526191	1526196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011312	TTG	2	6	1526307	1526312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011312	CAA	2	6	1526424	1526429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_011312	AAT	2	6	1527403	1527408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011312	TGG	2	6	1527532	1527537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011312	TTC	2	6	1527544	1527549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_011312	ATG	2	6	1527577	1527582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011312	GCA	2	6	1527614	1527619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011312	TTA	2	6	1527632	1527637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011312	ATC	2	6	1527646	1527651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_011312	CGA	2	6	1527662	1527667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011312	GGT	2	6	1527688	1527693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011312	AAG	2	6	1527746	1527751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011312	TAT	2	6	1527767	1527772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011312	GAC	2	6	1527831	1527836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_011312	TTG	2	6	1527842	1527847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011312	ATG	2	6	1527940	1527945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011312	GTT	2	6	1527949	1527954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011312	TAT	2	6	1527962	1527967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011312	TGG	2	6	1527981	1527986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011312	AGC	2	6	1528089	1528094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_011312	ATT	2	6	1528216	1528221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011312	TAT	2	6	1528233	1528238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011312	ATG	2	6	1528278	1528283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011312	TTC	2	6	1528864	1528869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_011312	ACT	2	6	1529333	1529338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_011312	TTC	2	6	1529929	1529934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_011312	TTA	2	6	1529965	1529970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011312	CCA	2	6	1529979	1529984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_011312	TGT	2	6	1530029	1530034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011312	TGG	2	6	1530081	1530086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011312	AGG	2	6	1530853	1530858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011312	TAT	2	6	1530877	1530882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011312	GGT	2	6	1532462	1532467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011312	CTG	2	6	1532472	1532477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_011312	TTG	2	6	1532508	1532513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011312	CCA	2	6	1532533	1532538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_011312	TAT	2	6	1532610	1532615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011312	CTA	2	6	1532664	1532669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_011312	AAG	2	6	1532784	1532789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011312	CAG	2	6	1532894	1532899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_011312	GTA	2	6	1533035	1533040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011312	GCA	2	6	1533108	1533113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_011312	GAA	2	6	1533142	1533147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011312	CAA	2	6	1533183	1533188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_011312	CGT	2	6	1533222	1533227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011312	CAG	2	6	1533303	1533308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_011312	TGT	2	6	1533352	1533357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011312	CTT	2	6	1533363	1533368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_011312	TTC	2	6	1533418	1533423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_011312	AAG	2	6	1533587	1533592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011312	GCC	2	6	1533614	1533619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_011312	TTG	2	6	1533687	1533692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011312	CGA	2	6	1533714	1533719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_011312	ACA	2	6	1533815	1533820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_011312	TGC	2	6	1533871	1533876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_011312	TAA	2	6	1533944	1533949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011312	ATT	2	6	1534050	1534055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011312	ATA	2	6	1534077	1534082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011312	AAG	2	6	1534576	1534581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011312	GAT	2	6	1536975	1536980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011312	AAT	2	6	1537023	1537028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011312	ATC	2	6	1537087	1537092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_011312	GGT	2	6	1537155	1537160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011312	TGC	2	6	1537282	1537287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_011312	ATT	2	6	1537289	1537294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011312	AGT	2	6	1537453	1537458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_011312	TGG	2	6	1537459	1537464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011312	ACT	2	6	1539150	1539155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_011312	ATT	2	6	1539458	1539463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011312	AAT	2	6	1539470	1539475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011312	TGT	2	6	1539481	1539486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011312	TCT	2	6	1539518	1539523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_011312	ATG	2	6	1539554	1539559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011312	TAT	2	6	1539579	1539584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011312	AAC	2	6	1539604	1539609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011312	TAT	2	6	1539635	1539640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011312	TAA	2	6	1539700	1539705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011312	TTA	2	6	1539801	1539806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011312	ATT	2	6	1539887	1539892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011312	GTT	2	6	1539937	1539942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011312	CGT	2	6	1539984	1539989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_011312	TAT	2	6	1540785	1540790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011312	TTA	2	6	1540899	1540904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011312	ATT	2	6	1540950	1540955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011312	TGG	2	6	1540962	1540967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011312	TGA	2	6	1541070	1541075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011312	GTT	2	6	1541137	1541142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011312	CAT	2	6	1541211	1541216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_011312	ACG	2	6	1541293	1541298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_011312	CGA	2	6	1541373	1541378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_011312	TGA	2	6	1541535	1541540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011312	CAA	2	6	1543006	1543011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011312	TGG	2	6	1543126	1543131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011312	CAA	2	6	1543226	1543231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_011312	TGT	2	6	1543325	1543330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011312	AAG	2	6	1543339	1543344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011312	GAA	2	6	1543392	1543397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011312	ACT	2	6	1543529	1543534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_011312	CTT	2	6	1543611	1543616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_011312	AAG	2	6	1543717	1543722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011312	TCT	2	6	1543900	1543905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_011312	ACG	2	6	1543960	1543965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011312	AGA	2	6	1543982	1543987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011312	AAT	2	6	1544013	1544018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011312	ACT	2	6	1544072	1544077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011312	ACA	2	6	1544082	1544087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_011312	AAG	2	6	1544113	1544118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011312	TCG	2	6	1544180	1544185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_011312	ATC	2	6	1544218	1544223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_011312	TGA	3	9	1544230	1544238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011312	CAA	2	6	1544259	1544264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_011312	GGC	2	6	1544376	1544381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_011312	TGA	2	6	1544450	1544455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011312	TTC	2	6	1544457	1544462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_011312	TGG	3	9	1544480	1544488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4126	NC_011312	GTT	2	6	1544570	1544575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_011312	GCA	2	6	1583131	1583136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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