MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTTAT	2	10	4814	4823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009922	AAATC	2	10	9424	9433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009922	AGGAG	2	10	11992	12001	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009922	CCTTC	2	10	12352	12361	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_009922	TCGTG	2	10	12401	12410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009922	AAGAT	2	10	15913	15922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009922	AAAAG	2	10	20684	20693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009922	AAAAT	3	15	26305	26319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009922	ATGAT	2	10	29779	29788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009922	CACAG	2	10	33162	33171	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009922	TAAAA	2	10	48861	48870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009922	AGGAG	2	10	50543	50552	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009922	CCTTC	2	10	50903	50912	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009922	TCGTG	2	10	50952	50961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009922	AAGAT	2	10	54464	54473	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009922	ATTTT	2	10	54869	54878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009922	TATTC	2	10	55005	55014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009922	AAATA	2	10	56047	56056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009922	TAAGA	2	10	62119	62128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009922	AGGAG	2	10	63798	63807	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009922	CCTTC	2	10	64158	64167	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009922	TCGTG	2	10	64207	64216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009922	AAGAT	2	10	67804	67813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009922	TCAAA	2	10	68502	68511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009922	GGTAT	2	10	70349	70358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009922	AAAAC	2	10	76472	76481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009922	AAATA	2	10	77568	77577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009922	CCTTT	2	10	79809	79818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009922	TAAAA	2	10	80055	80064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009922	AATTG	2	10	93501	93510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009922	ACTAT	2	10	98745	98754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009922	TAAAA	2	10	104026	104035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009922	ATTTT	2	10	104774	104783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009922	TAGTA	2	10	108936	108945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009922	AAATT	2	10	111434	111443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009922	CAAAT	2	10	113108	113117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009922	TTATT	2	10	117969	117978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009922	TTATT	2	10	117995	118004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009922	AGTTG	2	10	128533	128542	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009922	ATTAA	3	15	128634	128648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009922	TAAAA	2	10	130019	130028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009922	GTTGC	2	10	132791	132800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009922	TAAAA	2	10	133745	133754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009922	AGATG	2	10	134819	134828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009922	AAATG	2	10	134847	134856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009922	ATTAA	2	10	135023	135032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009922	CAAAA	2	10	135907	135916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009922	ACTGC	2	10	136951	136960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009922	AAAGA	2	10	139498	139507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009922	ATACT	2	10	142565	142574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009922	AAATC	2	10	144401	144410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009922	AAAAT	2	10	146177	146186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009922	GAAGA	2	10	149885	149894	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009922	ATTTT	2	10	155059	155068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009922	GATAT	2	10	160356	160365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009922	AAGTA	2	10	173959	173968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009922	AAAAT	3	15	177068	177082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009922	TACTT	2	10	181738	181747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009922	TAATC	2	10	182072	182081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009922	TATAT	2	10	182758	182767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009922	TGAAA	2	10	183955	183964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009922	ATTTT	2	10	190626	190635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009922	TTTAT	2	10	199505	199514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009922	ATTTG	2	10	204250	204259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009922	TAAAT	2	10	213470	213479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009922	TATAA	2	10	222965	222974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009922	TAAAA	2	10	232203	232212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009922	GGCGA	2	10	232395	232404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009922	ATTAT	2	10	233515	233524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009922	TAAAT	2	10	244451	244460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009922	TTACA	2	10	246688	246697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009922	GATCG	2	10	246835	246844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009922	TATAT	2	10	259470	259479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009922	TAAAA	2	10	263498	263507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009922	CATTG	2	10	268117	268126	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009922	TTATT	2	10	268363	268372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009922	AAGTC	2	10	268424	268433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009922	ATAAA	2	10	268653	268662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009922	TTATG	2	10	269730	269739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009922	TTTAC	2	10	274605	274614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009922	GGTGT	2	10	274626	274635	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009922	ATAGT	2	10	274858	274867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009922	TTTTG	2	10	282341	282350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009922	ATAAA	2	10	283165	283174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009922	TTTAA	2	10	283495	283504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009922	AATAT	2	10	285662	285671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009922	AGGAG	2	10	290478	290487	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009922	ATGAA	2	10	292229	292238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009922	ATTTA	2	10	297798	297807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009922	TGAGG	2	10	297811	297820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009922	ATTTT	2	10	304061	304070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009922	ATATT	2	10	307299	307308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009922	TAGAT	2	10	307376	307385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009922	AATTA	2	10	321153	321162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009922	AAGTT	2	10	321195	321204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009922	ATAAA	2	10	323077	323086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009922	TTATA	2	10	333493	333502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009922	ATAGA	2	10	335189	335198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009922	TGATA	2	10	335362	335371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009922	CTTTT	2	10	340386	340395	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009922	TATAT	2	10	340496	340505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009922	AATAA	2	10	350620	350629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009922	AAAGA	2	10	357225	357234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009922	AATAC	2	10	357525	357534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009922	TAAAA	2	10	361401	361410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009922	AAATA	2	10	381781	381790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009922	AAGAA	2	10	384021	384030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009922	ATTAA	2	10	384191	384200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009922	TAAAA	2	10	385313	385322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009922	TTATC	2	10	385387	385396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009922	AAAAT	2	10	386343	386352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009922	ATAGT	2	10	389844	389853	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009922	GTATA	2	10	389921	389930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009922	TGTAG	2	10	391269	391278	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009922	ATGGA	2	10	402327	402336	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009922	AAGGA	2	10	404080	404089	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009922	AAGCT	2	10	409662	409671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009922	AGGAT	2	10	409748	409757	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009922	TATTT	2	10	409785	409794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009922	TTTCT	2	10	414160	414169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009922	GGTAG	2	10	424361	424370	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009922	ATTTT	2	10	427447	427456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009922	TTTAA	2	10	434329	434338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009922	ATTTT	2	10	445619	445628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009922	ATAGT	2	10	447717	447726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009922	GAATA	2	10	452857	452866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009922	AAAGA	2	10	452900	452909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009922	TTTTA	2	10	460451	460460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009922	AAAAT	2	10	460468	460477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009922	TAAAA	2	10	461040	461049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009922	TGCAA	2	10	479671	479680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009922	TATAA	2	10	479776	479785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009922	ATAGA	2	10	488857	488866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009922	ATGGT	2	10	501448	501457	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009922	TATAT	2	10	502922	502931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009922	ATTTT	2	10	505145	505154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009922	ATAGT	2	10	507453	507462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009922	AGGAG	2	10	508339	508348	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009922	CCTTC	2	10	508699	508708	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_009922	TCGTG	2	10	508748	508757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009922	ATTTA	2	10	509416	509425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009922	AAGAT	2	10	512260	512269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009922	TAATA	2	10	512654	512663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009922	ATTTT	2	10	513667	513676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009922	AAACA	2	10	526056	526065	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009922	ATTTA	2	10	526997	527006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009922	AATTA	2	10	528189	528198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009922	AATAA	2	10	530478	530487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_009922	TAGCA	2	10	1132832	1132841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_009922	ATTGA	2	10	1139516	1139525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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