MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009922	TCCAT	2	10	2197388	2197397	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
502	NC_009922	TATAT	2	10	2202337	2202346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009922	TATAT	2	10	2203576	2203585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009922	ATTAT	2	10	2205856	2205865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009922	AAATT	2	10	2207404	2207413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009922	CAAAA	2	10	2210634	2210643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
507	NC_009922	TATTT	2	10	2212742	2212751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009922	ATTTT	2	10	2212822	2212831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009922	CCAAG	2	10	2227587	2227596	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
510	NC_009922	TTAAC	2	10	2236913	2236922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
511	NC_009922	TTTAC	2	10	2240320	2240329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_009922	AAAAC	2	10	2247415	2247424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
513	NC_009922	ACACT	2	10	2249133	2249142	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
514	NC_009922	ATATT	2	10	2249271	2249280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009922	TGATA	2	10	2253989	2253998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009922	GAATA	2	10	2259171	2259180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009922	TAATT	2	10	2264241	2264250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009922	TTCGT	2	10	2269600	2269609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_009922	TAAAA	2	10	2271423	2271432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009922	TATAA	2	10	2277702	2277711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009922	AAAAC	2	10	2282524	2282533	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
522	NC_009922	TATAG	2	10	2307613	2307622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009922	ACTAT	2	10	2310543	2310552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
524	NC_009922	ACTAC	2	10	2311287	2311296	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
525	NC_009922	ATTTT	2	10	2326207	2326216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009922	CTTTG	2	10	2331271	2331280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
527	NC_009922	ATAAA	2	10	2343847	2343856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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530	NC_009922	AGGTG	2	10	2356089	2356098	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009922	CTTCC	2	10	2361863	2361872	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
532	NC_009922	AATTT	2	10	2362083	2362092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009922	ATTCT	2	10	2371238	2371247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_009922	TATTT	2	10	2375176	2375185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009922	ATATT	2	10	2379486	2379495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_009922	ATTTT	2	10	2394494	2394503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009922	CCCTT	2	10	2396701	2396710	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
542	NC_009922	ACTTA	2	10	2404286	2404295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
543	NC_009922	ATTAT	2	10	2412803	2412812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009922	ATTTT	2	10	2414364	2414373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009922	TATCA	2	10	2431386	2431395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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549	NC_009922	CCTCC	2	10	2455028	2455037	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
550	NC_009922	ATATA	2	10	2459803	2459812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009922	ATGAA	2	10	2460099	2460108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009922	AAAAT	2	10	2462601	2462610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009922	AAATT	2	10	2462785	2462794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009922	TAACA	2	10	2466351	2466360	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_009922	TTTTA	2	10	2467192	2467201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009922	ATGGA	2	10	2469091	2469100	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009922	TTTTC	2	10	2480275	2480284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
558	NC_009922	TACGC	2	10	2480376	2480385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
559	NC_009922	TCTTA	2	10	2485392	2485401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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563	NC_009922	CTTTT	2	10	2493742	2493751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_009922	AAAGC	2	10	2505021	2505030	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_009922	CTATT	2	10	2505189	2505198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
566	NC_009922	CACGT	2	10	2508375	2508384	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_009922	ATTTT	2	10	2513172	2513181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009922	ATTTT	2	10	2513251	2513260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009922	CTATA	2	10	2521044	2521053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
570	NC_009922	TAAAA	2	10	2525599	2525608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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574	NC_009922	TATTT	2	10	2547981	2547990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_009922	TCTAT	2	10	2597623	2597632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_009922	ATCTT	2	10	2598737	2598746	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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599	NC_009922	TTTAC	2	10	2624816	2624825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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601	NC_009922	CTATT	2	10	2635551	2635560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_009922	TAAAA	2	10	2636913	2636922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009922	TACTA	2	10	2642198	2642207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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609	NC_009922	TATCA	2	10	2661983	2661992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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626	NC_009922	TTATA	2	10	2738927	2738936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009922	TATAG	2	10	2751447	2751456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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