MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 15008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
2	NC_021881	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
3	NC_021881	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
4	NC_021881	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
5	NC_021881	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
6	NC_021881	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
7	NC_021881	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
8	NC_021881	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
9	NC_021881	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
10	NC_021881	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464098
11	NC_021881	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
12	NC_021881	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
13	NC_021881	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
14	NC_021881	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
15	NC_021881	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
16	NC_021881	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
17	NC_021881	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
18	NC_021881	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464098
19	NC_021881	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464098
20	NC_021881	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
21	NC_021881	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
22	NC_021881	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464098
23	NC_021881	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
24	NC_021881	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
25	NC_021881	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
26	NC_021881	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
27	NC_021881	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464098
28	NC_021881	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
29	NC_021881	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464098
30	NC_021881	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
31	NC_021881	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
32	NC_021881	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464098
33	NC_021881	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464098
34	NC_021881	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
35	NC_021881	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464098
36	NC_021881	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
37	NC_021881	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464098
38	NC_021881	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464098
39	NC_021881	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464099
40	NC_021881	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464099
41	NC_021881	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464099
42	NC_021881	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464099
43	NC_021881	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464099
44	NC_021881	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464099
45	NC_021881	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464099
46	NC_021881	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464099
47	NC_021881	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464099
48	NC_021881	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464099
49	NC_021881	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464099
50	NC_021881	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464099
51	NC_021881	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464099
52	NC_021881	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464100
53	NC_021881	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464100
54	NC_021881	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464100
55	NC_021881	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464100
56	NC_021881	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464100
57	NC_021881	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464100
58	NC_021881	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464101
59	NC_021881	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464101
60	NC_021881	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464101
61	NC_021881	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464101
62	NC_021881	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464101
63	NC_021881	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464101
64	NC_021881	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464724
65	NC_021881	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464724
66	NC_021881	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
67	NC_021881	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
68	NC_021881	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464724
69	NC_021881	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464724
70	NC_021881	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
71	NC_021881	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464725
72	NC_021881	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464725
73	NC_021881	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464725
74	NC_021881	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464725
75	NC_021881	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464725
76	NC_021881	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464725
77	NC_021881	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464725
78	NC_021881	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464725
79	NC_021881	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464725
80	NC_021881	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
81	NC_021881	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464725
82	NC_021881	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464102
83	NC_021881	GAA	3	9	7214	7222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464102
84	NC_021881	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464102
85	NC_021881	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464102
86	NC_021881	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464102
87	NC_021881	TGC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464102
88	NC_021881	TAG	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464102
89	NC_021881	GCG	2	6	7539	7544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464102
90	NC_021881	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464102
91	NC_021881	TAC	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
92	NC_021881	CCG	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464103
93	NC_021881	CCT	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464103
94	NC_021881	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464103
95	NC_021881	GAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464103
96	NC_021881	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464103
97	NC_021881	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
98	NC_021881	TGC	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464103
99	NC_021881	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464103
100	NC_021881	ACT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
101	NC_021881	TCC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464103
102	NC_021881	CTA	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
103	NC_021881	AGT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464103
104	NC_021881	ATC	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464103
105	NC_021881	TAA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464103
106	NC_021881	TGT	2	6	9046	9051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464103
107	NC_021881	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464104
108	NC_021881	TGT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464104
109	NC_021881	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464104
110	NC_021881	TAG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
111	NC_021881	GAA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464104
112	NC_021881	ATG	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
113	NC_021881	ATC	2	6	9539	9544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464104
114	NC_021881	ATG	2	6	9568	9573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
115	NC_021881	GCT	2	6	9580	9585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464104
116	NC_021881	TGA	2	6	9614	9619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464104
117	NC_021881	TTA	2	6	9691	9696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464104
118	NC_021881	CAT	2	6	9894	9899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464104
119	NC_021881	AGA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464104
120	NC_021881	ACT	2	6	10046	10051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464104
121	NC_021881	ATA	2	6	10248	10253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464104
122	NC_021881	AGA	2	6	10407	10412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464104
123	NC_021881	CAA	2	6	10414	10419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464104
124	NC_021881	CTT	2	6	11582	11587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464726
125	NC_021881	ATC	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464726
126	NC_021881	CAA	2	6	11641	11646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464726
127	NC_021881	TAT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464726
128	NC_021881	ACC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464726
129	NC_021881	ACA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464726
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133	NC_021881	CAT	2	6	12622	12627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464105
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224	NC_021881	TAT	2	6	19582	19587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464111
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241	NC_021881	TGA	2	6	21300	21305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464112
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248	NC_021881	CTG	2	6	21627	21632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464112
249	NC_021881	AAG	2	6	21633	21638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464112
250	NC_021881	GTG	2	6	21717	21722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464112
251	NC_021881	TTA	2	6	21768	21773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464112
252	NC_021881	TGT	2	6	21860	21865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464113
253	NC_021881	TAC	2	6	22002	22007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464113
254	NC_021881	TGC	2	6	22165	22170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464113
255	NC_021881	AGA	2	6	22174	22179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464113
256	NC_021881	TCT	2	6	22188	22193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464113
257	NC_021881	TAT	2	6	22224	22229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464113
258	NC_021881	TCA	2	6	22285	22290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464113
259	NC_021881	TGT	2	6	22627	22632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464114
260	NC_021881	GGA	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464114
261	NC_021881	GGA	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464114
262	NC_021881	TAC	2	6	22880	22885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464114
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266	NC_021881	TTA	2	6	23230	23235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464114
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269	NC_021881	CTC	2	6	23461	23466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464114
270	NC_021881	CAA	2	6	23757	23762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464728
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272	NC_021881	CAA	2	6	23893	23898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464728
273	NC_021881	TGA	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464728
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276	NC_021881	GTA	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464728
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285	NC_021881	ATT	2	6	24610	24615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464115
286	NC_021881	GAG	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464115
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292	NC_021881	TCT	2	6	25190	25195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464115
293	NC_021881	TAA	2	6	25220	25225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464115
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