MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 15008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021881	TGA	2	6	232068	232073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464809
2502	NC_021881	TAC	2	6	232156	232161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464809
2503	NC_021881	TTC	2	6	232343	232348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464809
2504	NC_021881	TAG	2	6	232385	232390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464809
2505	NC_021881	TTA	2	6	232456	232461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464809
2506	NC_021881	AGG	2	6	232561	232566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464809
2507	NC_021881	CAT	2	6	232610	232615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464809
2508	NC_021881	TAA	2	6	232730	232735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464809
2509	NC_021881	CTA	2	6	232817	232822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464809
2510	NC_021881	TAG	2	6	232862	232867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464809
2511	NC_021881	TGC	2	6	232885	232890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464809
2512	NC_021881	TAA	2	6	232902	232907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464809
2513	NC_021881	TGT	2	6	233064	233069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464809
2514	NC_021881	TGT	2	6	233073	233078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464809
2515	NC_021881	AGC	2	6	233160	233165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464809
2516	NC_021881	GTT	2	6	233322	233327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464809
2517	NC_021881	TGC	2	6	233331	233336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464809
2518	NC_021881	AGA	2	6	233490	233495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464809
2519	NC_021881	GAT	2	6	233533	233538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464809
2520	NC_021881	GCG	2	6	233617	233622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464809
2521	NC_021881	ATT	2	6	233727	233732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464230
2522	NC_021881	TTC	2	6	233733	233738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2523	NC_021881	CAT	2	6	233852	233857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464230
2524	NC_021881	TCA	2	6	234004	234009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464230
2525	NC_021881	GCA	2	6	234044	234049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2526	NC_021881	TAC	2	6	234069	234074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464230
2527	NC_021881	TCC	2	6	234088	234093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464230
2528	NC_021881	AGG	2	6	234327	234332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464230
2529	NC_021881	AAG	2	6	234475	234480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464230
2530	NC_021881	GCT	2	6	234544	234549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2531	NC_021881	TCT	2	6	234575	234580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2532	NC_021881	CTT	2	6	234587	234592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2533	NC_021881	GAG	2	6	234699	234704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464230
2534	NC_021881	TTC	2	6	234717	234722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2535	NC_021881	TTC	2	6	234727	234732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2536	NC_021881	CAG	2	6	234902	234907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2537	NC_021881	GCT	2	6	234953	234958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2538	NC_021881	TAT	2	6	235035	235040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464230
2539	NC_021881	TGC	3	9	235149	235157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2540	NC_021881	GTG	2	6	235188	235193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464230
2541	NC_021881	GTT	2	6	235327	235332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464230
2542	NC_021881	CAC	2	6	235511	235516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464230
2543	NC_021881	ATA	2	6	235556	235561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464230
2544	NC_021881	TCA	2	6	235714	235719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464230
2545	NC_021881	TTA	2	6	235889	235894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464230
2546	NC_021881	AAC	2	6	235936	235941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464230
2547	NC_021881	CAG	2	6	235946	235951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464230
2548	NC_021881	TTC	2	6	235992	235997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464230
2549	NC_021881	ACT	2	6	236053	236058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464230
2550	NC_021881	TGT	2	6	236074	236079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464230
2551	NC_021881	TGC	2	6	236603	236608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464231
2552	NC_021881	GGT	2	6	236685	236690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464231
2553	NC_021881	GCC	2	6	236793	236798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464231
2554	NC_021881	CAG	2	6	236923	236928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464231
2555	NC_021881	CTA	2	6	236959	236964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464231
2556	NC_021881	GCT	2	6	236969	236974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464231
2557	NC_021881	ACT	2	6	236977	236982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464231
2558	NC_021881	AGA	2	6	237158	237163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464231
2559	NC_021881	CAG	2	6	237469	237474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464810
2560	NC_021881	CTT	2	6	237495	237500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464810
2561	NC_021881	TGC	2	6	237508	237513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464810
2562	NC_021881	GCA	2	6	237758	237763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464811
2563	NC_021881	GCC	2	6	237784	237789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464811
2564	NC_021881	ACC	2	6	238445	238450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2565	NC_021881	GCC	2	6	238454	238459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464232
2566	NC_021881	ACC	2	6	238463	238468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2567	NC_021881	CGT	2	6	238486	238491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2568	NC_021881	CAA	2	6	238507	238512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464232
2569	NC_021881	TAC	2	6	238574	238579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464232
2570	NC_021881	CAA	2	6	238667	238672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464232
2571	NC_021881	CTT	2	6	238693	238698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2572	NC_021881	TGA	2	6	238714	238719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2573	NC_021881	AGC	2	6	238739	238744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2574	NC_021881	TCG	2	6	238773	238778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2575	NC_021881	CAC	2	6	238834	238839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2576	NC_021881	TAC	2	6	238844	238849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464232
2577	NC_021881	CAG	2	6	238861	238866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2578	NC_021881	TAG	2	6	238870	238875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2579	NC_021881	TCT	2	6	238887	238892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2580	NC_021881	CCA	2	6	238932	238937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2581	NC_021881	TAG	2	6	239089	239094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2582	NC_021881	TAC	2	6	239180	239185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464232
2583	NC_021881	CTA	2	6	239197	239202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464232
2584	NC_021881	TCT	2	6	239231	239236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2585	NC_021881	CAG	2	6	239260	239265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2586	NC_021881	CCA	2	6	239277	239282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2587	NC_021881	ATG	2	6	239337	239342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2588	NC_021881	TCT	2	6	239407	239412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2589	NC_021881	CCA	2	6	239446	239451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464232
2590	NC_021881	TTC	2	6	239552	239557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2591	NC_021881	CTT	2	6	239584	239589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2592	NC_021881	TCT	3	9	239664	239672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2593	NC_021881	CAG	2	6	239758	239763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2594	NC_021881	CTT	2	6	239779	239784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2595	NC_021881	GTA	2	6	239814	239819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2596	NC_021881	ATG	2	6	239865	239870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464232
2597	NC_021881	TTC	2	6	239894	239899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2598	NC_021881	CAG	2	6	239992	239997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464232
2599	NC_021881	TCT	2	6	240012	240017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464232
2600	NC_021881	TAC	2	6	240026	240031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464232
2601	NC_021881	TAT	2	6	240150	240155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464233
2602	NC_021881	TCA	2	6	240167	240172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464233
2603	NC_021881	CTT	2	6	240180	240185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464233
2604	NC_021881	GTA	2	6	240222	240227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464233
2605	NC_021881	AAC	2	6	240300	240305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464233
2606	NC_021881	CTT	2	6	240321	240326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464233
2607	NC_021881	TCC	2	6	240370	240375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464233
2608	NC_021881	CTA	2	6	240383	240388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464233
2609	NC_021881	CAG	2	6	240700	240705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464234
2610	NC_021881	CCA	2	6	241049	241054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464234
2611	NC_021881	CTC	2	6	241139	241144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464234
2612	NC_021881	TAA	2	6	241160	241165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464234
2613	NC_021881	ATC	2	6	241211	241216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464234
2614	NC_021881	GTG	2	6	241220	241225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464234
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2616	NC_021881	CTG	2	6	241582	241587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464235
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2618	NC_021881	GTA	2	6	241689	241694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464235
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2973	NC_021881	TCT	2	6	271325	271330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464252
2974	NC_021881	AAC	2	6	271404	271409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464252
2975	NC_021881	AAT	2	6	271476	271481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464252
2976	NC_021881	TGA	2	6	271635	271640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464252
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