MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	CTCGTC	2	12	1193	1204	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407691595
2	NC_018690	AATTTT	2	12	2635	2646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
3	NC_018690	TCTTTT	2	12	4001	4012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407691598
4	NC_018690	TTATAA	2	12	6205	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	407691600
5	NC_018690	GATGTA	2	12	8859	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691602
6	NC_018690	AAAAGA	2	12	9116	9127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407691602
7	NC_018690	AAACCA	2	12	10484	10495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691604
8	NC_018690	ACCTTT	2	12	12175	12186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407691605
9	NC_018690	CATTCA	2	12	14757	14768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691608
10	NC_018690	TGGTAG	2	12	15556	15567	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407691609
11	NC_018690	GCATTA	2	12	16338	16349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407691610
12	NC_018690	GCATAT	2	12	16554	16565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407691610
13	NC_018690	GCAACA	2	12	18742	18753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407691614
14	NC_018690	TATCCG	2	12	23101	23112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407691619
15	NC_018690	GTACCG	2	12	24782	24793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407691620
16	NC_018690	ATGTTG	2	12	32711	32722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691628
17	NC_018690	GGTTTA	2	12	33856	33867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691629
18	NC_018690	AAGACG	2	12	33962	33973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407691629
19	NC_018690	AAATTA	2	12	36437	36448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691632
20	NC_018690	GAATAC	2	12	37301	37312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407691633
21	NC_018690	ATTGCC	2	12	44134	44145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407691637
22	NC_018690	TCCATA	2	12	45855	45866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691640
23	NC_018690	AATAAA	2	12	45966	45977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407691640
24	NC_018690	ATGTTG	2	12	51957	51968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691645
25	NC_018690	CATCTT	2	12	52353	52364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407691646
26	NC_018690	TTTATT	2	12	55126	55137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407691648
27	NC_018690	TTTTGC	2	12	61133	61144	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407691654
28	NC_018690	ATTCAA	2	12	70313	70324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407691666
29	NC_018690	TTAAAA	2	12	70337	70348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691666
30	NC_018690	ATTGCG	2	12	71575	71586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407691667
31	NC_018690	TTGTTT	2	12	71935	71946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407691668
32	NC_018690	CTTGCT	2	12	75632	75643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407691672
33	NC_018690	CCTAAA	2	12	80291	80302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407691679
34	NC_018690	CTTGGA	2	12	85455	85466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407691683
35	NC_018690	AGTGAA	2	12	86731	86742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407691683
36	NC_018690	CCACGA	2	12	89695	89706	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407691686
37	NC_018690	GTGAAA	2	12	91726	91737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407691689
38	NC_018690	AACCGA	2	12	96649	96660	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407691692
39	NC_018690	GGTGCT	2	12	98384	98395	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407691696
40	NC_018690	TAAAGA	2	12	99310	99321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407691696
41	NC_018690	ATGGCA	2	12	107921	107932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407691704
42	NC_018690	TTGAAA	2	12	114118	114129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407691708
43	NC_018690	ATTTTG	2	12	118362	118373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407691714
44	NC_018690	TCATAT	2	12	120578	120589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407691716
45	NC_018690	TTTTTG	2	12	123254	123265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407691718
46	NC_018690	TTTTTG	2	12	125245	125256	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407691719
47	NC_018690	TTTGCA	2	12	129424	129435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691722
48	NC_018690	CAAATT	2	12	132943	132954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407691725
49	NC_018690	TACCGG	2	12	136613	136624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407691727
50	NC_018690	GTTTAA	2	12	139108	139119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407691729
51	NC_018690	ATCCAT	2	12	140079	140090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691730
52	NC_018690	TTCGAT	2	12	145457	145468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691736
53	NC_018690	AAGTAA	2	12	148686	148697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407691741
54	NC_018690	CGATAC	2	12	150085	150096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407691741
55	NC_018690	TGCGCT	2	12	151538	151549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691743
56	NC_018690	TTATGG	2	12	152056	152067	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691743
57	NC_018690	GCTTTA	2	12	152110	152121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691743
58	NC_018690	AGCGGC	2	12	152613	152624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407691743
59	NC_018690	ATTGCG	2	12	152725	152736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407691743
60	NC_018690	TAGAAC	2	12	155705	155716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407691747
61	NC_018690	GGCATT	2	12	158257	158268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407691749
62	NC_018690	AAATTT	2	12	160859	160870	50 %	50 %	0 %	0 %	407691753
63	NC_018690	CTGCCG	2	12	162826	162837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407691754
64	NC_018690	GGCATT	2	12	163040	163051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407691754
65	NC_018690	AACTGT	2	12	172248	172259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407691764
66	NC_018690	ATCGCA	2	12	174300	174311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407691767
67	NC_018690	GCCTTT	2	12	175608	175619	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407691769
68	NC_018690	GCCGGG	2	12	176924	176935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691770
69	NC_018690	CAATTC	2	12	177609	177620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691771
70	NC_018690	ATATGA	2	12	177892	177903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407691771
71	NC_018690	TCTTCA	2	12	177934	177945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407691771
72	NC_018690	ATTCGT	2	12	181367	181378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691774
73	NC_018690	GTTTTG	2	12	184701	184712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691778
74	NC_018690	TTATTT	2	12	188125	188136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407691779
75	NC_018690	CAAGTG	2	12	188878	188889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407691780
76	NC_018690	AAAGCG	2	12	193143	193154	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407691782
77	NC_018690	AATCGC	2	12	197152	197163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407691784
78	NC_018690	AGTTAA	2	12	197904	197915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407691785
79	NC_018690	AATTAA	2	12	198645	198656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691786
80	NC_018690	ATAAAA	2	12	201782	201793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407691789
81	NC_018690	TTTCTT	2	12	202498	202509	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407691790
82	NC_018690	TCAAGC	2	12	204336	204347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407691791
83	NC_018690	CCGTTT	2	12	205729	205740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407691793
84	NC_018690	TTGCTT	2	12	208347	208358	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407691796
85	NC_018690	CGAAAG	2	12	211425	211436	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407691798
86	NC_018690	ATTGAT	2	12	212064	212075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407691799
87	NC_018690	ATTTAT	2	12	214155	214166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691801
88	NC_018690	ATAAGC	2	12	216651	216662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407691802
89	NC_018690	TGCCGG	2	12	220070	220081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407691804
90	NC_018690	GAAGCG	2	12	221475	221486	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407691804
91	NC_018690	TTTTTG	2	12	223666	223677	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407691806
92	NC_018690	TCAAAA	2	12	224336	224347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407691807
93	NC_018690	GTGAAG	2	12	226543	226554	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407691810
94	NC_018690	CTTCAC	2	12	230445	230456	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407691812
95	NC_018690	GCTTCC	2	12	231514	231525	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407691813
96	NC_018690	TACGTT	2	12	236682	236693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691816
97	NC_018690	ATCTTT	2	12	237174	237185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407691816
98	NC_018690	CATAAT	2	12	239192	239203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407691817
99	NC_018690	AATCTT	2	12	246238	246249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407691823
100	NC_018690	GTTTTT	2	12	246759	246770	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407691824
101	NC_018690	TATTGA	2	12	253935	253946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407691830
102	NC_018690	CGGTGA	2	12	254719	254730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407691831
103	NC_018690	TTATTT	2	12	255984	255995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407691832
104	NC_018690	TTGCAT	2	12	262498	262509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691839
105	NC_018690	TAAACA	2	12	266140	266151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407691842
106	NC_018690	AAAGGT	2	12	266926	266937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407691843
107	NC_018690	GGAAGT	2	12	267240	267251	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407691843
108	NC_018690	AGGGCG	2	12	268031	268042	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407691844
109	NC_018690	AAAGCC	2	12	268921	268932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407691845
110	NC_018690	AAAAGC	2	12	270657	270668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407691846
111	NC_018690	GAAACC	2	12	274422	274433	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407691847
112	NC_018690	AATGCA	2	12	279876	279887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407691851
113	NC_018690	GGTAGC	2	12	281595	281606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407691852
114	NC_018690	GTTTGA	2	12	295707	295718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691861
115	NC_018690	AATTCT	2	12	299868	299879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407691865
116	NC_018690	AAACTA	2	12	301861	301872	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407691867
117	NC_018690	ATAAAA	2	12	303755	303766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407691869
118	NC_018690	TAGCCA	2	12	307233	307244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407691872
119	NC_018690	GGTAAT	2	12	312366	312377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691876
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457	NC_018690	TTTTTC	2	12	1127426	1127437	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692606
458	NC_018690	TTCACA	2	12	1129721	1129732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692608
459	NC_018690	ATTTTG	2	12	1130358	1130369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407692608
460	NC_018690	CTTTAT	2	12	1133629	1133640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407692610
461	NC_018690	AGGTAA	2	12	1137130	1137141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692612
462	NC_018690	ATTCAC	2	12	1137841	1137852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692613
463	NC_018690	GCAGAT	2	12	1142255	1142266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407692615
464	NC_018690	ACGTAA	2	12	1145632	1145643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692617
465	NC_018690	GTACTT	2	12	1145832	1145843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407692618
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469	NC_018690	CAATCG	2	12	1158989	1159000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692630
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478	NC_018690	GAAAAA	2	12	1180870	1180881	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407692648
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484	NC_018690	GCTAAA	2	12	1192564	1192575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692664
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486	NC_018690	GCAACT	2	12	1204373	1204384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692675
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489	NC_018690	TGCGTT	2	12	1223786	1223797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692692
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