MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018690	TCGTCT	2	12	1255080	1255091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692724
502	NC_018690	TTAAAT	2	12	1255891	1255902	50 %	50 %	0 %	0 %	407692724
503	NC_018690	AGGCGA	2	12	1258063	1258074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407692727
504	NC_018690	GCCTGC	2	12	1260108	1260119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407692729
505	NC_018690	CCATCC	2	12	1277291	1277302	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407692743
506	NC_018690	CACAAA	2	12	1279115	1279126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407692744
507	NC_018690	ACCTAA	2	12	1279996	1280007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692746
508	NC_018690	CTTACA	2	12	1282960	1282971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692748
509	NC_018690	ATTAGG	2	12	1290551	1290562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407692756
510	NC_018690	AAGTTA	2	12	1293059	1293070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407692758
511	NC_018690	AAAAAT	2	12	1293456	1293467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407692758
512	NC_018690	ACCTAG	2	12	1294087	1294098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692759
513	NC_018690	CGGCTA	2	12	1296505	1296516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407692760
514	NC_018690	CTGTTG	2	12	1296875	1296886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692760
515	NC_018690	CCTGAA	2	12	1297087	1297098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692760
516	NC_018690	TTTTCT	2	12	1305010	1305021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692764
517	NC_018690	GAACAA	2	12	1307627	1307638	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692766
518	NC_018690	TTAGCA	2	12	1308114	1308125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692767
519	NC_018690	TTAATT	2	12	1308543	1308554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407692767
520	NC_018690	TCGTCC	2	12	1319628	1319639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407692779
521	NC_018690	GAAGTA	2	12	1321150	1321161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692781
522	NC_018690	CCCATT	2	12	1324659	1324670	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407692784
523	NC_018690	CAACGC	2	12	1326140	1326151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407692785
524	NC_018690	ACTAAT	2	12	1326308	1326319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692785
525	NC_018690	GCCATT	2	12	1335575	1335586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692795
526	NC_018690	GGTAAA	2	12	1340773	1340784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692800
527	NC_018690	ACCTTT	2	12	1344037	1344048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407692804
528	NC_018690	TTTTCG	2	12	1345589	1345600	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407692805
529	NC_018690	TAAACA	2	12	1346818	1346829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407692806
530	NC_018690	TAATTG	2	12	1351581	1351592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692813
531	NC_018690	CAATTA	2	12	1354820	1354831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692816
532	NC_018690	AGCACT	2	12	1355025	1355036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692816
533	NC_018690	TGTTTG	2	12	1359461	1359472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407692820
534	NC_018690	ACTAAT	2	12	1361304	1361315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692821
535	NC_018690	CTTTTT	2	12	1366701	1366712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692828
536	NC_018690	CCCAAG	2	12	1368790	1368801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407692831
537	NC_018690	TGCAAT	2	12	1374983	1374994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692838
538	NC_018690	GTTGCA	2	12	1375999	1376010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692839
539	NC_018690	TCTTTT	2	12	1376416	1376427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692839
540	NC_018690	GCTCCG	2	12	1376708	1376719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407692839
541	NC_018690	CACTAA	2	12	1378603	1378614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692841
542	NC_018690	GAACAA	2	12	1389117	1389128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692849
543	NC_018690	GCCACC	2	12	1395682	1395693	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407692855
544	NC_018690	CCGTTT	2	12	1403821	1403832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692863
545	NC_018690	ATCTTT	2	12	1405026	1405037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407692864
546	NC_018690	GCGATT	2	12	1409688	1409699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692867
547	NC_018690	GCAATT	2	12	1414351	1414362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692872
548	NC_018690	TTCGCA	2	12	1418737	1418748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692875
549	NC_018690	ACGGTG	2	12	1419742	1419753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407692877
550	NC_018690	CTAAGT	2	12	1420932	1420943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692877
551	NC_018690	CGGTAA	2	12	1422256	1422267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407692878
552	NC_018690	AAAGCA	2	12	1424408	1424419	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692881
553	NC_018690	TGAATT	2	12	1428832	1428843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692886
554	NC_018690	TGCTTC	2	12	1433872	1433883	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692892
555	NC_018690	AATTTA	2	12	1436083	1436094	50 %	50 %	0 %	0 %	407692893
556	NC_018690	GGTTTC	2	12	1437335	1437346	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692895
557	NC_018690	TCCGGA	2	12	1442060	1442071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407692901
558	NC_018690	ACCGCT	2	12	1443934	1443945	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407692904
559	NC_018690	TATCGG	2	12	1446533	1446544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692906
560	NC_018690	CGGCTT	2	12	1450112	1450123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407692907
561	NC_018690	TTCGCT	2	12	1454698	1454709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692910
562	NC_018690	GGCTAT	2	12	1460499	1460510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692915
563	NC_018690	TTTCAC	2	12	1468691	1468702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407692916
564	NC_018690	GCCTTC	2	12	1469040	1469051	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407692916
565	NC_018690	TTGCAA	2	12	1470440	1470451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692917
566	NC_018690	AAACCA	2	12	1472284	1472295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407692917
567	NC_018690	ACCATT	2	12	1478898	1478909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692917
568	NC_018690	CTAAAG	2	12	1482011	1482022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692917
569	NC_018690	TTTGCT	2	12	1482028	1482039	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407692917
570	NC_018690	TGAAAA	2	12	1498401	1498412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407692933
571	NC_018690	CAAGAT	2	12	1499813	1499824	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692934
572	NC_018690	ATTGCG	2	12	1500583	1500594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692935
573	NC_018690	GCCTTT	2	12	1504217	1504228	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692940
574	NC_018690	ACCGGT	2	12	1504421	1504432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407692940
575	NC_018690	CCTAAA	2	12	1509547	1509558	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692948
576	NC_018690	CCAAAA	2	12	1509577	1509588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407692948
577	NC_018690	AAAGAA	2	12	1509604	1509615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407692948
578	NC_018690	GTGGCA	2	12	1509812	1509823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407692948
579	NC_018690	AGCTAA	2	12	1513115	1513126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692953
580	NC_018690	ATTCAT	2	12	1513522	1513533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407692954
581	NC_018690	CAACCC	2	12	1513768	1513779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407692954
582	NC_018690	CGCAAT	2	12	1516509	1516520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692957
583	NC_018690	ATTAAG	2	12	1517628	1517639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407692958
584	NC_018690	GGCTTT	2	12	1518744	1518755	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692959
585	NC_018690	GCGTTA	2	12	1531714	1531725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692964
586	NC_018690	ATAAAA	2	12	1535864	1535875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407692967
587	NC_018690	TACGAT	2	12	1538210	1538221	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692970
588	NC_018690	ACCGAT	2	12	1542095	1542106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692973
589	NC_018690	AAAAGC	2	12	1544112	1544123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692975
590	NC_018690	ATGCTG	2	12	1544814	1544825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692976
591	NC_018690	GCTAAT	2	12	1544837	1544848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692976
592	NC_018690	TGCGGA	2	12	1546057	1546068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407692978
593	NC_018690	TCAGTA	2	12	1547532	1547543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692979
594	NC_018690	TCAAAC	2	12	1548844	1548855	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692980
595	NC_018690	AGCGGA	2	12	1549736	1549747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407692981
596	NC_018690	TAAACG	2	12	1556556	1556567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692986
597	NC_018690	CTACCG	2	12	1565037	1565048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407692996
598	NC_018690	TACCTG	2	12	1565946	1565957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692996
599	NC_018690	TACCTG	2	12	1565991	1566002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692996
600	NC_018690	CCGTTG	2	12	1567695	1567706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407692996
601	NC_018690	AATTTA	2	12	1568468	1568479	50 %	50 %	0 %	0 %	407692997
602	NC_018690	AATGGG	2	12	1571212	1571223	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407692999
603	NC_018690	TAACGT	2	12	1575697	1575708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407693002
604	NC_018690	ACCGCC	2	12	1576956	1576967	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407693003
605	NC_018690	CCTTTT	2	12	1582520	1582531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407693008
606	NC_018690	ATCGCA	2	12	1582935	1582946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407693009
607	NC_018690	AGGAAC	2	12	1583439	1583450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407693009
608	NC_018690	AACCAC	2	12	1583813	1583824	50 %	0 %	0 %	50 %	407693009
609	NC_018690	AAACCT	2	12	1585767	1585778	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407693011
610	NC_018690	TTAAAA	2	12	1586625	1586636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407693012
611	NC_018690	CTAAAT	2	12	1586843	1586854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407693012
612	NC_018690	ACCGCC	2	12	1586965	1586976	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407693012
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719	NC_018690	ATCGGT	2	12	1827554	1827565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407693217
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721	NC_018690	TTTAAT	2	12	1832800	1832811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407693223
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723	NC_018690	AGCGGC	2	12	1834017	1834028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407693223
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828	NC_018690	GATAAT	2	12	2145211	2145222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407693539
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831	NC_018690	CTGTGG	2	12	2151532	2151543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407693545
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939	NC_018690	ATTTTA	2	12	2434952	2434963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407693805
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943	NC_018690	AGCCTT	2	12	2442648	2442659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407693811
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