MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 1872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017167	TGAAG	2	10	305	314	40 %	20 %	40 %	0 %	384133788
2	NC_017167	CACAT	2	10	2775	2784	40 %	20 %	0 %	40 %	384133791
3	NC_017167	CGCGG	2	10	2884	2893	0 %	0 %	60 %	40 %	384133791
4	NC_017167	GACGC	2	10	6734	6743	20 %	0 %	40 %	40 %	384133794
5	NC_017167	TGGCG	2	10	8440	8449	0 %	20 %	60 %	20 %	384133794
6	NC_017167	GCTTT	2	10	8722	8731	0 %	60 %	20 %	20 %	384133795
7	NC_017167	CGCGG	2	10	20669	20678	0 %	0 %	60 %	40 %	384133804
8	NC_017167	GCGCG	2	10	21271	21280	0 %	0 %	60 %	40 %	384133805
9	NC_017167	AGGAT	2	10	25285	25294	40 %	20 %	40 %	0 %	384133808
10	NC_017167	ACGAG	2	10	32131	32140	40 %	0 %	40 %	20 %	384133814
11	NC_017167	CGTCG	2	10	33665	33674	0 %	20 %	40 %	40 %	384133816
12	NC_017167	CGCGG	2	10	33700	33709	0 %	0 %	60 %	40 %	384133816
13	NC_017167	GCGCC	2	10	34391	34400	0 %	0 %	40 %	60 %	384133816
14	NC_017167	GTTCG	2	10	35278	35287	0 %	40 %	40 %	20 %	384133817
15	NC_017167	CCCGG	2	10	35604	35613	0 %	0 %	40 %	60 %	384133817
16	NC_017167	GAAGC	2	10	37372	37381	40 %	0 %	40 %	20 %	384133818
17	NC_017167	TACGC	2	10	38788	38797	20 %	20 %	20 %	40 %	384133821
18	NC_017167	CCGAG	2	10	40628	40637	20 %	0 %	40 %	40 %	384133824
19	NC_017167	GAAAT	2	10	41592	41601	60 %	20 %	20 %	0 %	384133825
20	NC_017167	AGCCA	2	10	41655	41664	40 %	0 %	20 %	40 %	384133826
21	NC_017167	AAGGC	2	10	42686	42695	40 %	0 %	40 %	20 %	384133826
22	NC_017167	GCGCC	2	10	43212	43221	0 %	0 %	40 %	60 %	384133827
23	NC_017167	CCGTC	2	10	45090	45099	0 %	20 %	20 %	60 %	384133829
24	NC_017167	GCGAT	2	10	45175	45184	20 %	20 %	40 %	20 %	384133829
25	NC_017167	GCCTT	2	10	45232	45241	0 %	40 %	20 %	40 %	384133829
26	NC_017167	GCCGC	2	10	45480	45489	0 %	0 %	40 %	60 %	384133829
27	NC_017167	CGCGC	2	10	52537	52546	0 %	0 %	40 %	60 %	384133836
28	NC_017167	GCGGA	2	10	52571	52580	20 %	0 %	60 %	20 %	384133836
29	NC_017167	GCTCG	2	10	53920	53929	0 %	20 %	40 %	40 %	384133837
30	NC_017167	GCGCC	2	10	54620	54629	0 %	0 %	40 %	60 %	384133838
31	NC_017167	GCGCA	2	10	56409	56418	20 %	0 %	40 %	40 %	384133839
32	NC_017167	AGGTG	2	10	56728	56737	20 %	20 %	60 %	0 %	384133840
33	NC_017167	GCCAG	2	10	57732	57741	20 %	0 %	40 %	40 %	384133841
34	NC_017167	TCGGC	2	10	61120	61129	0 %	20 %	40 %	40 %	384133844
35	NC_017167	GGTTT	2	10	63384	63393	0 %	60 %	40 %	0 %	384133847
36	NC_017167	GCCGC	2	10	63425	63434	0 %	0 %	40 %	60 %	384133847
37	NC_017167	GAGGC	2	10	66446	66455	20 %	0 %	60 %	20 %	384133848
38	NC_017167	ATGCA	2	10	67024	67033	40 %	20 %	20 %	20 %	384133849
39	NC_017167	CGGAG	2	10	67738	67747	20 %	0 %	60 %	20 %	384133849
40	NC_017167	ACGCC	2	10	68782	68791	20 %	0 %	20 %	60 %	384133851
41	NC_017167	TCGCG	2	10	69415	69424	0 %	20 %	40 %	40 %	384133851
42	NC_017167	GAGCA	2	10	69738	69747	40 %	0 %	40 %	20 %	384133851
43	NC_017167	GCGTG	2	10	70450	70459	0 %	20 %	60 %	20 %	384133852
44	NC_017167	CGGGC	2	10	73594	73603	0 %	0 %	60 %	40 %	384133854
45	NC_017167	GCGGA	2	10	74234	74243	20 %	0 %	60 %	20 %	384133855
46	NC_017167	GATGG	2	10	76394	76403	20 %	20 %	60 %	0 %	384133856
47	NC_017167	CGACG	2	10	76692	76701	20 %	0 %	40 %	40 %	384133857
48	NC_017167	TCTGT	2	10	81564	81573	0 %	60 %	20 %	20 %	384133860
49	NC_017167	GGGCA	2	10	82323	82332	20 %	0 %	60 %	20 %	384133861
50	NC_017167	CTCGT	2	10	84895	84904	0 %	40 %	20 %	40 %	384133863
51	NC_017167	GATAG	2	10	86091	86100	40 %	20 %	40 %	0 %	384133863
52	NC_017167	ACGGC	2	10	86114	86123	20 %	0 %	40 %	40 %	384133863
53	NC_017167	CGATG	2	10	86926	86935	20 %	20 %	40 %	20 %	384133865
54	NC_017167	GCGAG	2	10	87979	87988	20 %	0 %	60 %	20 %	384133865
55	NC_017167	GCCGA	2	10	88041	88050	20 %	0 %	40 %	40 %	384133865
56	NC_017167	CGAGC	2	10	90493	90502	20 %	0 %	40 %	40 %	384133868
57	NC_017167	CTGTG	2	10	90970	90979	0 %	40 %	40 %	20 %	384133868
58	NC_017167	CCACG	2	10	91193	91202	20 %	0 %	20 %	60 %	384133868
59	NC_017167	GTCGA	2	10	92339	92348	20 %	20 %	40 %	20 %	384133870
60	NC_017167	GGGCG	2	10	93178	93187	0 %	0 %	80 %	20 %	384133870
61	NC_017167	CGAAT	2	10	93576	93585	40 %	20 %	20 %	20 %	384133870
62	NC_017167	GTCCA	2	10	94031	94040	20 %	20 %	20 %	40 %	384133870
63	NC_017167	GACGA	2	10	94913	94922	40 %	0 %	40 %	20 %	384133871
64	NC_017167	GCGCG	2	10	95407	95416	0 %	0 %	60 %	40 %	384133872
65	NC_017167	CCGGG	2	10	99538	99547	0 %	0 %	60 %	40 %	384133876
66	NC_017167	GCCGA	2	10	99741	99750	20 %	0 %	40 %	40 %	384133876
67	NC_017167	CTTCG	2	10	105151	105160	0 %	40 %	20 %	40 %	384133881
68	NC_017167	CGGCG	2	10	105826	105835	0 %	0 %	60 %	40 %	384133882
69	NC_017167	CGCGC	2	10	107100	107109	0 %	0 %	40 %	60 %	384133882
70	NC_017167	CCGGC	2	10	107861	107870	0 %	0 %	40 %	60 %	384133883
71	NC_017167	CGCTT	2	10	112716	112725	0 %	40 %	20 %	40 %	384133886
72	NC_017167	GACGC	2	10	112865	112874	20 %	0 %	40 %	40 %	384133886
73	NC_017167	GCGCG	2	10	115023	115032	0 %	0 %	60 %	40 %	384133888
74	NC_017167	CGTGG	2	10	115835	115844	0 %	20 %	60 %	20 %	384133889
75	NC_017167	CCTCG	2	10	116213	116222	0 %	20 %	20 %	60 %	384133889
76	NC_017167	CCGCG	2	10	118348	118357	0 %	0 %	40 %	60 %	384133895
77	NC_017167	CGGCG	2	10	119988	119997	0 %	0 %	60 %	40 %	384133895
78	NC_017167	ACGCC	2	10	123691	123700	20 %	0 %	20 %	60 %	384133901
79	NC_017167	TCGGC	2	10	125471	125480	0 %	20 %	40 %	40 %	384133903
80	NC_017167	TCGAG	2	10	127770	127779	20 %	20 %	40 %	20 %	384133907
81	NC_017167	ACGAG	2	10	128253	128262	40 %	0 %	40 %	20 %	384133907
82	NC_017167	CGATT	2	10	132403	132412	20 %	40 %	20 %	20 %	384133912
83	NC_017167	AGGCG	2	10	134401	134410	20 %	0 %	60 %	20 %	384133914
84	NC_017167	GGGCG	2	10	134698	134707	0 %	0 %	80 %	20 %	384133915
85	NC_017167	ATAGG	2	10	140578	140587	40 %	20 %	40 %	0 %	384133922
86	NC_017167	GAGAT	2	10	143621	143630	40 %	20 %	40 %	0 %	384133925
87	NC_017167	GAAAC	2	10	144076	144085	60 %	0 %	20 %	20 %	384133925
88	NC_017167	TCGAG	2	10	147509	147518	20 %	20 %	40 %	20 %	384133929
89	NC_017167	CAAGG	2	10	147771	147780	40 %	0 %	40 %	20 %	384133929
90	NC_017167	TTCGA	2	10	150400	150409	20 %	40 %	20 %	20 %	384133931
91	NC_017167	ATGCA	2	10	150790	150799	40 %	20 %	20 %	20 %	384133931
92	NC_017167	CTGCG	2	10	154322	154331	0 %	20 %	40 %	40 %	384133934
93	NC_017167	AATCG	2	10	155344	155353	40 %	20 %	20 %	20 %	384133935
94	NC_017167	GTTTG	2	10	155972	155981	0 %	60 %	40 %	0 %	384133936
95	NC_017167	AGACG	2	10	157135	157144	40 %	0 %	40 %	20 %	384133939
96	NC_017167	TGCCT	2	10	159900	159909	0 %	40 %	20 %	40 %	384133942
97	NC_017167	CCGAT	2	10	160113	160122	20 %	20 %	20 %	40 %	384133942
98	NC_017167	CGAGC	2	10	161717	161726	20 %	0 %	40 %	40 %	384133945
99	NC_017167	GCCTC	2	10	162102	162111	0 %	20 %	20 %	60 %	384133945
100	NC_017167	GGACG	2	10	166439	166448	20 %	0 %	60 %	20 %	384133951
101	NC_017167	CACCG	2	10	166515	166524	20 %	0 %	20 %	60 %	384133951
102	NC_017167	CCGCG	2	10	167688	167697	0 %	0 %	40 %	60 %	384133952
103	NC_017167	CCCGG	2	10	167814	167823	0 %	0 %	40 %	60 %	384133952
104	NC_017167	TCCGC	2	10	172633	172642	0 %	20 %	20 %	60 %	384133958
105	NC_017167	GTGGC	2	10	173144	173153	0 %	20 %	60 %	20 %	384133958
106	NC_017167	GTGGC	2	10	173355	173364	0 %	20 %	60 %	20 %	384133959
107	NC_017167	AACGG	2	10	174242	174251	40 %	0 %	40 %	20 %	384133960
108	NC_017167	TGACC	2	10	174883	174892	20 %	20 %	20 %	40 %	384133961
109	NC_017167	TGGCG	2	10	175508	175517	0 %	20 %	60 %	20 %	384133962
110	NC_017167	CGGCG	2	10	176092	176101	0 %	0 %	60 %	40 %	384133962
111	NC_017167	AGCGC	2	10	176108	176117	20 %	0 %	40 %	40 %	384133962
112	NC_017167	GGAAG	2	10	177451	177460	40 %	0 %	60 %	0 %	384133963
113	NC_017167	CGGCG	2	10	177763	177772	0 %	0 %	60 %	40 %	384133963
114	NC_017167	GGCGT	2	10	177773	177782	0 %	20 %	60 %	20 %	384133963
115	NC_017167	ATCCC	2	10	178041	178050	20 %	20 %	0 %	60 %	384133963
116	NC_017167	ACGGC	2	10	178823	178832	20 %	0 %	40 %	40 %	384133964
117	NC_017167	GGCGT	2	10	180990	180999	0 %	20 %	60 %	20 %	384133966
118	NC_017167	CGGAG	2	10	181451	181460	20 %	0 %	60 %	20 %	384133966
119	NC_017167	ATCGC	2	10	183207	183216	20 %	20 %	20 %	40 %	384133968
120	NC_017167	CGGCG	2	10	185347	185356	0 %	0 %	60 %	40 %	384133970
121	NC_017167	GCACC	2	10	187509	187518	20 %	0 %	20 %	60 %	384133972
122	NC_017167	GGGCA	2	10	188027	188036	20 %	0 %	60 %	20 %	384133973
123	NC_017167	CCGGG	2	10	191344	191353	0 %	0 %	60 %	40 %	384133976
124	NC_017167	TCGCG	2	10	192008	192017	0 %	20 %	40 %	40 %	384133976
125	NC_017167	ATCCG	2	10	192270	192279	20 %	20 %	20 %	40 %	384133977
126	NC_017167	CGTGG	2	10	196120	196129	0 %	20 %	60 %	20 %	384133980
127	NC_017167	CGGCG	2	10	199284	199293	0 %	0 %	60 %	40 %	384133984
128	NC_017167	GGGGC	2	10	201612	201621	0 %	0 %	80 %	20 %	384133986
129	NC_017167	CTTAT	2	10	202289	202298	20 %	60 %	0 %	20 %	384133988
130	NC_017167	GTCCT	2	10	203175	203184	0 %	40 %	20 %	40 %	384133989
131	NC_017167	TGAAC	2	10	203389	203398	40 %	20 %	20 %	20 %	384133989
132	NC_017167	TTCGA	2	10	209200	209209	20 %	40 %	20 %	20 %	384134000
133	NC_017167	GGAGT	2	10	209356	209365	20 %	20 %	60 %	0 %	384134000
134	NC_017167	CGAAT	2	10	209646	209655	40 %	20 %	20 %	20 %	384134001
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