MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 1872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017167	AGTTC	2	10	1644650	1644659	20 %	40 %	20 %	20 %	384135428
1002	NC_017167	GCCGC	2	10	1646120	1646129	0 %	0 %	40 %	60 %	384135431
1003	NC_017167	CCGGC	2	10	1646687	1646696	0 %	0 %	40 %	60 %	384135431
1004	NC_017167	GGCTT	2	10	1650272	1650281	0 %	40 %	40 %	20 %	384135434
1005	NC_017167	CAGCC	2	10	1653174	1653183	20 %	0 %	20 %	60 %	384135436
1006	NC_017167	AGCGC	2	10	1653972	1653981	20 %	0 %	40 %	40 %	384135437
1007	NC_017167	AGGAC	2	10	1654114	1654123	40 %	0 %	40 %	20 %	384135437
1008	NC_017167	CTCCA	2	10	1655677	1655686	20 %	20 %	0 %	60 %	384135441
1009	NC_017167	CCTCG	2	10	1656637	1656646	0 %	20 %	20 %	60 %	384135443
1010	NC_017167	CGTTG	2	10	1657389	1657398	0 %	40 %	40 %	20 %	384135443
1011	NC_017167	GACCC	2	10	1657477	1657486	20 %	0 %	20 %	60 %	384135443
1012	NC_017167	GATTT	2	10	1659224	1659233	20 %	60 %	20 %	0 %	384135445
1013	NC_017167	GATCT	2	10	1661506	1661515	20 %	40 %	20 %	20 %	384135449
1014	NC_017167	ACCGC	2	10	1662700	1662709	20 %	0 %	20 %	60 %	384135450
1015	NC_017167	GGTCG	2	10	1667223	1667232	0 %	20 %	60 %	20 %	384135455
1016	NC_017167	TGACC	2	10	1671217	1671226	20 %	20 %	20 %	40 %	384135460
1017	NC_017167	GCCGT	2	10	1671618	1671627	0 %	20 %	40 %	40 %	384135460
1018	NC_017167	AGGCG	2	10	1671756	1671765	20 %	0 %	60 %	20 %	384135460
1019	NC_017167	TGACA	2	10	1675975	1675984	40 %	20 %	20 %	20 %	384135466
1020	NC_017167	AACCA	2	10	1679748	1679757	60 %	0 %	0 %	40 %	384135472
1021	NC_017167	CTTTG	2	10	1679784	1679793	0 %	60 %	20 %	20 %	384135472
1022	NC_017167	AATGT	2	10	1680966	1680975	40 %	40 %	20 %	0 %	384135474
1023	NC_017167	TCCAC	2	10	1682467	1682476	20 %	20 %	0 %	60 %	384135476
1024	NC_017167	TCCCG	2	10	1685061	1685070	0 %	20 %	20 %	60 %	384135480
1025	NC_017167	AGCCC	2	10	1685437	1685446	20 %	0 %	20 %	60 %	384135481
1026	NC_017167	CTGCG	2	10	1686090	1686099	0 %	20 %	40 %	40 %	384135482
1027	NC_017167	CTCTT	2	10	1687979	1687988	0 %	60 %	0 %	40 %	384135483
1028	NC_017167	CGCTC	2	10	1688581	1688590	0 %	20 %	20 %	60 %	384135484
1029	NC_017167	GACGC	2	10	1688857	1688866	20 %	0 %	40 %	40 %	384135484
1030	NC_017167	CCGCT	2	10	1691471	1691480	0 %	20 %	20 %	60 %	384135485
1031	NC_017167	TCGAA	2	10	1691715	1691724	40 %	20 %	20 %	20 %	384135485
1032	NC_017167	ATCAG	2	10	1693420	1693429	40 %	20 %	20 %	20 %	384135486
1033	NC_017167	GTTGT	2	10	1694490	1694499	0 %	60 %	40 %	0 %	384135488
1034	NC_017167	CGGGT	2	10	1699059	1699068	0 %	20 %	60 %	20 %	384135490
1035	NC_017167	ACAGA	2	10	1699591	1699600	60 %	0 %	20 %	20 %	384135491
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1037	NC_017167	TCTCC	2	10	1705947	1705956	0 %	40 %	0 %	60 %	384135498
1038	NC_017167	CCGCC	2	10	1712422	1712431	0 %	0 %	20 %	80 %	384135501
1039	NC_017167	AACTC	2	10	1715914	1715923	40 %	20 %	0 %	40 %	384135506
1040	NC_017167	CGATT	2	10	1716283	1716292	20 %	40 %	20 %	20 %	384135506
1041	NC_017167	ATCTA	2	10	1716682	1716691	40 %	40 %	0 %	20 %	384135506
1042	NC_017167	CGCGG	2	10	1716907	1716916	0 %	0 %	60 %	40 %	384135506
1043	NC_017167	CTGCA	2	10	1718989	1718998	20 %	20 %	20 %	40 %	384135508
1044	NC_017167	TTGAT	2	10	1719748	1719757	20 %	60 %	20 %	0 %	384135509
1045	NC_017167	AATCA	2	10	1720207	1720216	60 %	20 %	0 %	20 %	384135510
1046	NC_017167	CGTAA	2	10	1722088	1722097	40 %	20 %	20 %	20 %	384135510
1047	NC_017167	GGCGT	2	10	1723185	1723194	0 %	20 %	60 %	20 %	384135510
1048	NC_017167	ACGCC	2	10	1723281	1723290	20 %	0 %	20 %	60 %	384135510
1049	NC_017167	CGTCG	2	10	1723540	1723549	0 %	20 %	40 %	40 %	384135510
1050	NC_017167	TTGGA	2	10	1724003	1724012	20 %	40 %	40 %	0 %	384135510
1051	NC_017167	TCGCC	2	10	1727092	1727101	0 %	20 %	20 %	60 %	384135515
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1054	NC_017167	GCGTC	2	10	1736665	1736674	0 %	20 %	40 %	40 %	384135528
1055	NC_017167	TGAGG	2	10	1737413	1737422	20 %	20 %	60 %	0 %	384135529
1056	NC_017167	CCGCT	2	10	1737910	1737919	0 %	20 %	20 %	60 %	384135529
1057	NC_017167	CGTAC	2	10	1740611	1740620	20 %	20 %	20 %	40 %	384135532
1058	NC_017167	ATTTT	2	10	1743122	1743131	20 %	80 %	0 %	0 %	384135534
1059	NC_017167	TACTA	2	10	1743544	1743553	40 %	40 %	0 %	20 %	384135534
1060	NC_017167	GCCAT	2	10	1749094	1749103	20 %	20 %	20 %	40 %	384135536
1061	NC_017167	ACGAA	2	10	1751316	1751325	60 %	0 %	20 %	20 %	384135537
1062	NC_017167	TCGAT	2	10	1751723	1751732	20 %	40 %	20 %	20 %	384135538
1063	NC_017167	ATGCT	2	10	1753791	1753800	20 %	40 %	20 %	20 %	384135540
1064	NC_017167	ATCCT	2	10	1754303	1754312	20 %	40 %	0 %	40 %	384135540
1065	NC_017167	TTGGA	2	10	1757324	1757333	20 %	40 %	40 %	0 %	384135545
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1067	NC_017167	CGCTT	2	10	1760041	1760050	0 %	40 %	20 %	40 %	384135548
1068	NC_017167	CTTCC	2	10	1760766	1760775	0 %	40 %	0 %	60 %	384135548
1069	NC_017167	AACGC	2	10	1761543	1761552	40 %	0 %	20 %	40 %	384135549
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1071	NC_017167	TCTGT	2	10	1767183	1767192	0 %	60 %	20 %	20 %	384135554
1072	NC_017167	CTTGC	2	10	1767976	1767985	0 %	40 %	20 %	40 %	384135555
1073	NC_017167	CGACA	2	10	1768099	1768108	40 %	0 %	20 %	40 %	384135555
1074	NC_017167	AGGGC	2	10	1768145	1768154	20 %	0 %	60 %	20 %	384135555
1075	NC_017167	CGTAC	2	10	1771405	1771414	20 %	20 %	20 %	40 %	384135559
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1077	NC_017167	ATGCT	2	10	1775037	1775046	20 %	40 %	20 %	20 %	384135563
1078	NC_017167	ATCCT	2	10	1775549	1775558	20 %	40 %	0 %	40 %	384135564
1079	NC_017167	GCCAC	2	10	1778244	1778253	20 %	0 %	20 %	60 %	384135569
1080	NC_017167	CGTCG	2	10	1778999	1779008	0 %	20 %	40 %	40 %	384135570
1081	NC_017167	CGGCG	2	10	1781550	1781559	0 %	0 %	60 %	40 %	384135573
1082	NC_017167	GCTCG	2	10	1782161	1782170	0 %	20 %	40 %	40 %	384135575
1083	NC_017167	CGGCG	2	10	1789758	1789767	0 %	0 %	60 %	40 %	384135593
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1087	NC_017167	TTTCG	2	10	1797370	1797379	0 %	60 %	20 %	20 %	384135601
1088	NC_017167	TGCGT	2	10	1797467	1797476	0 %	40 %	40 %	20 %	384135601
1089	NC_017167	CTTGC	2	10	1798282	1798291	0 %	40 %	20 %	40 %	384135601
1090	NC_017167	CCAAC	2	10	1798454	1798463	40 %	0 %	0 %	60 %	384135601
1091	NC_017167	ATGTC	2	10	1800429	1800438	20 %	40 %	20 %	20 %	384135603
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1096	NC_017167	CGACA	2	10	1817852	1817861	40 %	0 %	20 %	40 %	384135631
1097	NC_017167	TCCGA	2	10	1818268	1818277	20 %	20 %	20 %	40 %	384135632
1098	NC_017167	ATTTC	2	10	1821160	1821169	20 %	60 %	0 %	20 %	384135636
1099	NC_017167	CCGCC	2	10	1824440	1824449	0 %	0 %	20 %	80 %	384135640
1100	NC_017167	AAAAG	2	10	1828351	1828360	80 %	0 %	20 %	0 %	384135643
1101	NC_017167	TCGGC	2	10	1828728	1828737	0 %	20 %	40 %	40 %	384135644
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1105	NC_017167	TCCGC	2	10	1840989	1840998	0 %	20 %	20 %	60 %	384135655
1106	NC_017167	TTCGG	2	10	1841062	1841071	0 %	40 %	40 %	20 %	384135655
1107	NC_017167	TGAGG	2	10	1842742	1842751	20 %	20 %	60 %	0 %	384135657
1108	NC_017167	CCGCA	2	10	1843565	1843574	20 %	0 %	20 %	60 %	384135657
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1110	NC_017167	GCCTC	2	10	1844654	1844663	0 %	20 %	20 %	60 %	384135659
1111	NC_017167	CTCTT	2	10	1844894	1844903	0 %	60 %	0 %	40 %	384135659
1112	NC_017167	GATCT	2	10	1845277	1845286	20 %	40 %	20 %	20 %	384135659
1113	NC_017167	CGGAC	2	10	1847202	1847211	20 %	0 %	40 %	40 %	384135660
1114	NC_017167	GGGCG	2	10	1847816	1847825	0 %	0 %	80 %	20 %	384135660
1115	NC_017167	CGATC	2	10	1850783	1850792	20 %	20 %	20 %	40 %	384135662
1116	NC_017167	GGCGC	2	10	1854187	1854196	0 %	0 %	60 %	40 %	384135666
1117	NC_017167	ATCGA	2	10	1854221	1854230	40 %	20 %	20 %	20 %	384135666
1118	NC_017167	AGCGA	2	10	1859561	1859570	40 %	0 %	40 %	20 %	384135672
1119	NC_017167	AAGCC	2	10	1860592	1860601	40 %	0 %	20 %	40 %	384135673
1120	NC_017167	GGCCA	2	10	1862632	1862641	20 %	0 %	40 %	40 %	384135675
1121	NC_017167	CGCTC	2	10	1862988	1862997	0 %	20 %	20 %	60 %	384135675
1122	NC_017167	CTGGT	2	10	1863236	1863245	0 %	40 %	40 %	20 %	384135675
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1494	NC_017167	GCCCA	2	10	2481050	2481059	20 %	0 %	20 %	60 %	384136321
1495	NC_017167	TTCGT	2	10	2481588	2481597	0 %	60 %	20 %	20 %	384136322
1496	NC_017167	ACGCC	2	10	2482770	2482779	20 %	0 %	20 %	60 %	384136323
1497	NC_017167	CGAGC	2	10	2483705	2483714	20 %	0 %	40 %	40 %	384136324
1498	NC_017167	TGCCC	2	10	2484362	2484371	0 %	20 %	20 %	60 %	384136324
1499	NC_017167	GATCC	2	10	2490894	2490903	20 %	20 %	20 %	40 %	384136331
1500	NC_017167	GCCTT	2	10	2490983	2490992	0 %	40 %	20 %	40 %	384136331

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