MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	GAGGAT	2	12	278	289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795694
2	NC_015518	AAAGAT	2	12	1063	1074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795694
3	NC_015518	TTCTCC	2	12	1981	1992	0 %	50 %	0 %	50 %	332795697
4	NC_015518	CCTTTA	2	12	2046	2057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332795697
5	NC_015518	AAACCT	2	12	2621	2632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795697
6	NC_015518	AAATAA	2	12	5512	5523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795701
7	NC_015518	TATAGT	2	12	10165	10176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795706
8	NC_015518	TTAAGT	2	12	11654	11665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795706
9	NC_015518	AACAGA	2	12	12991	13002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332795708
10	NC_015518	TAAGAT	2	12	14212	14223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795709
11	NC_015518	TTTCTC	2	12	18013	18024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795714
12	NC_015518	GCAGAA	2	12	28434	28445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795721
13	NC_015518	TGACTA	2	12	40432	40443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795737
14	NC_015518	CTGTTT	2	12	43537	43548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332795741
15	NC_015518	ACTTAC	2	12	43636	43647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795741
16	NC_015518	TCTCGC	2	12	45712	45723	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332795743
17	NC_015518	AAGGTA	2	12	46804	46815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795744
18	NC_015518	TCATAA	2	12	51291	51302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795750
19	NC_015518	AAGGAA	2	12	52234	52245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795751
20	NC_015518	TTTCAG	2	12	55821	55832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795754
21	NC_015518	CTATTA	2	12	65729	65740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795763
22	NC_015518	AAATAT	2	12	67198	67209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795764
23	NC_015518	TCCTTC	2	12	68176	68187	0 %	50 %	0 %	50 %	332795765
24	NC_015518	ATTCAT	2	12	71453	71464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795768
25	NC_015518	CTATTA	2	12	73281	73292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795770
26	NC_015518	AGAAAG	2	12	73686	73697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795771
27	NC_015518	TGATAC	2	12	74131	74142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795771
28	NC_015518	TTGTGT	2	12	77740	77751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795776
29	NC_015518	AGATAT	2	12	89529	89540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795787
30	NC_015518	AGCTAA	2	12	91461	91472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795789
31	NC_015518	TCCTTT	2	12	96115	96126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795793
32	NC_015518	TATTGC	2	12	97888	97899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795794
33	NC_015518	TTATAT	2	12	98826	98837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795794
34	NC_015518	GAAATG	2	12	100403	100414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795795
35	NC_015518	TCATTA	2	12	102304	102315	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795798
36	NC_015518	GAACGA	2	12	104320	104331	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795801
37	NC_015518	TAGCCT	2	12	109860	109871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332795807
38	NC_015518	TTTAGG	2	12	114756	114767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795812
39	NC_015518	AATAAA	2	12	118607	118618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795814
40	NC_015518	ATCTCC	2	12	119839	119850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332795815
41	NC_015518	AAGCAA	2	12	124212	124223	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332795818
42	NC_015518	TCCTTT	2	12	126183	126194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795821
43	NC_015518	GAATAA	2	12	131539	131550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795826
44	NC_015518	ATAATC	2	12	136717	136728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795832
45	NC_015518	TATTGG	2	12	137187	137198	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795833
46	NC_015518	AGCAAT	2	12	140170	140181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795835
47	NC_015518	GCATTT	2	12	140724	140735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795835
48	NC_015518	AGAAGG	2	12	143192	143203	50 %	0 %	50 %	0 %	332795837
49	NC_015518	ACTATT	2	12	145693	145704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795839
50	NC_015518	AAAAAT	2	12	148544	148555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795840
51	NC_015518	TCCGCC	2	12	157482	157493	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	332795850
52	NC_015518	ATTGTT	2	12	157730	157741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332795851
53	NC_015518	TTTTCC	2	12	159414	159425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795852
54	NC_015518	AGATGG	2	12	160672	160683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795853
55	NC_015518	ATAACA	2	12	165251	165262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332795855
56	NC_015518	GGAAAA	2	12	166979	166990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795857
57	NC_015518	AAATAA	2	12	167316	167327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795857
58	NC_015518	ATTCCT	2	12	171029	171040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332795860
59	NC_015518	TCATTG	2	12	171243	171254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795860
60	NC_015518	ATAGGT	2	12	172215	172226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795860
61	NC_015518	ATTTAA	2	12	174194	174205	50 %	50 %	0 %	0 %	332795861
62	NC_015518	TCAATT	2	12	174857	174868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795862
63	NC_015518	GGCATA	2	12	177120	177131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795863
64	NC_015518	AGGAAA	2	12	178001	178012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795864
65	NC_015518	GGCATT	2	12	178658	178669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332795865
66	NC_015518	ATTTAG	2	12	183054	183065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795871
67	NC_015518	GTCAAG	2	12	184000	184011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795872
68	NC_015518	ATTGTA	2	12	190523	190534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795878
69	NC_015518	AAATAC	2	12	191231	191242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332795878
70	NC_015518	AAATAT	2	12	195028	195039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795881
71	NC_015518	ATTCAA	2	12	196452	196463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795882
72	NC_015518	TGCTTT	2	12	198059	198070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332795885
73	NC_015518	TAGGAG	2	12	201480	201491	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795888
74	NC_015518	TAACAT	2	12	204101	204112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795892
75	NC_015518	CCTTCT	2	12	207785	207796	0 %	50 %	0 %	50 %	332795897
76	NC_015518	TTAATT	2	12	210212	210223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795901
77	NC_015518	TTTACT	2	12	215034	215045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332795904
78	NC_015518	ATTAAT	2	12	224444	224455	50 %	50 %	0 %	0 %	332795914
79	NC_015518	CAAGAG	2	12	226099	226110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795916
80	NC_015518	TATTGG	2	12	232182	232193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795924
81	NC_015518	TTAGGA	2	12	233697	233708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795925
82	NC_015518	TGGATA	2	12	234581	234592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795925
83	NC_015518	TGGAGG	2	12	237227	237238	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332795926
84	NC_015518	TAGCTT	2	12	238732	238743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795929
85	NC_015518	GGTATT	2	12	243728	243739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795937
86	NC_015518	TAAGAT	2	12	245028	245039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795940
87	NC_015518	TAATGT	2	12	245252	245263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795940
88	NC_015518	AAATGA	2	12	245438	245449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795940
89	NC_015518	GGGCAA	2	12	251064	251075	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332795944
90	NC_015518	CTTTCT	2	12	251353	251364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795944
91	NC_015518	CTCTAG	2	12	253670	253681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332795947
92	NC_015518	TCCTTT	2	12	260199	260210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795955
93	NC_015518	AGCTAA	2	12	270414	270425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795966
94	NC_015518	AATGCG	2	12	274037	274048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795971
95	NC_015518	CTTCTC	2	12	282503	282514	0 %	50 %	0 %	50 %	332795980
96	NC_015518	GAAGTA	2	12	283066	283077	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795980
97	NC_015518	AATCCA	2	12	284223	284234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795981
98	NC_015518	TCCAAA	2	12	285581	285592	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795982
99	NC_015518	TATAGA	2	12	294707	294718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795989
100	NC_015518	TGGAGA	2	12	295131	295142	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795990
101	NC_015518	GCCTAA	2	12	295290	295301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332795990
102	NC_015518	CTACTC	2	12	299251	299262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332795994
103	NC_015518	TTACAG	2	12	300034	300045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795994
104	NC_015518	GATAAA	2	12	300475	300486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795995
105	NC_015518	TTCCTT	2	12	306893	306904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332796003
106	NC_015518	CAGATA	2	12	309484	309495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332796005
107	NC_015518	GATTTA	2	12	312488	312499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332796008
108	NC_015518	TTTGAG	2	12	313723	313734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332796009
109	NC_015518	TATAGA	2	12	318821	318832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332796014
110	NC_015518	TTATTC	2	12	322710	322721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332796017
111	NC_015518	GCTCTT	2	12	325027	325038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332796019
112	NC_015518	TAAAAT	2	12	331328	331339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332796022
113	NC_015518	TCCTTT	2	12	332197	332208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332796024
114	NC_015518	ACCGTA	2	12	333538	333549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332796024
115	NC_015518	GTTATT	2	12	334675	334686	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332796024
116	NC_015518	GCCTAT	2	12	339441	339452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332796031
117	NC_015518	ATTTAA	2	12	344558	344569	50 %	50 %	0 %	0 %	332796034
118	NC_015518	TATTAA	2	12	347997	348008	50 %	50 %	0 %	0 %	332796036
119	NC_015518	ATTTCA	2	12	359940	359951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332796048
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343	NC_015518	GGCTTT	2	12	1009626	1009637	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332796792
344	NC_015518	ATCCTT	2	12	1013050	1013061	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332796795
345	NC_015518	CAAAAC	2	12	1013273	1013284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332796795
346	NC_015518	CAATAG	2	12	1014217	1014228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332796796
347	NC_015518	TTGAAA	2	12	1015296	1015307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332796797
348	NC_015518	ACTGCT	2	12	1016384	1016395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332796797
349	NC_015518	AGAAAA	2	12	1019634	1019645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332796801
350	NC_015518	AAAGAT	2	12	1021151	1021162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332796803
351	NC_015518	AAAGGA	2	12	1021536	1021547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332796804
352	NC_015518	AACTAT	2	12	1025945	1025956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332796810
353	NC_015518	TTACGT	2	12	1028161	1028172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332796813
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356	NC_015518	TGGATA	2	12	1031561	1031572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332796819
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461	NC_015518	TCTATT	2	12	1326513	1326524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332797145
462	NC_015518	TTTCAT	2	12	1327437	1327448	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332797146
463	NC_015518	AGTTGA	2	12	1327897	1327908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797147
464	NC_015518	ATTCCT	2	12	1333754	1333765	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797153
465	NC_015518	AATATG	2	12	1333922	1333933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797153
466	NC_015518	TAGATA	2	12	1343983	1343994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797163
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470	NC_015518	CCTATT	2	12	1355044	1355055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797179
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480	NC_015518	CTTATT	2	12	1381023	1381034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332797214
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483	NC_015518	TTGTTA	2	12	1397847	1397858	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332797231
484	NC_015518	TCTGAG	2	12	1400764	1400775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332797234
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