MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015518	TAGAGT	2	12	1472206	1472217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797304
502	NC_015518	AGAAGG	2	12	1476590	1476601	50 %	0 %	50 %	0 %	332797309
503	NC_015518	TAGGTT	2	12	1481117	1481128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332797313
504	NC_015518	TGTCTT	2	12	1482043	1482054	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332797314
505	NC_015518	GAAAAT	2	12	1486217	1486228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332797320
506	NC_015518	GTTTAT	2	12	1488656	1488667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332797323
507	NC_015518	ATTAAT	2	12	1494013	1494024	50 %	50 %	0 %	0 %	332797329
508	NC_015518	CCTATT	2	12	1495505	1495516	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797330
509	NC_015518	CATATC	2	12	1501285	1501296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332797338
510	NC_015518	TACTTG	2	12	1505948	1505959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332797343
511	NC_015518	AAATGA	2	12	1506909	1506920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332797344
512	NC_015518	ATCCAG	2	12	1516109	1516120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332797353
513	NC_015518	TCCCTC	2	12	1522866	1522877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332797362
514	NC_015518	GAAATT	2	12	1523447	1523458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797363
515	NC_015518	AAGTAC	2	12	1526205	1526216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332797367
516	NC_015518	CCTTTT	2	12	1526358	1526369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332797367
517	NC_015518	CATATT	2	12	1527841	1527852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797369
518	NC_015518	CGAAGT	2	12	1532185	1532196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797375
519	NC_015518	ATTCAA	2	12	1534929	1534940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332797379
520	NC_015518	CGTCAA	2	12	1535075	1535086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332797379
521	NC_015518	TCCTCT	2	12	1551081	1551092	0 %	50 %	0 %	50 %	332797394
522	NC_015518	ACGTAA	2	12	1551933	1551944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332797395
523	NC_015518	TTACCT	2	12	1553300	1553311	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797396
524	NC_015518	AAAGTG	2	12	1554363	1554374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332797396
525	NC_015518	TAGGAG	2	12	1554882	1554893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332797397
526	NC_015518	ATACTT	2	12	1554912	1554923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797397
527	NC_015518	TAGAGG	2	12	1554946	1554957	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332797397
528	NC_015518	CATTAT	2	12	1559024	1559035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797400
529	NC_015518	AGAAGG	2	12	1561642	1561653	50 %	0 %	50 %	0 %	332797402
530	NC_015518	TACCCC	2	12	1576722	1576733	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	332797415
531	NC_015518	CCTAAA	2	12	1576736	1576747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332797415
532	NC_015518	TTATTT	2	12	1583347	1583358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332797422
533	NC_015518	GGAATT	2	12	1592859	1592870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797432
534	NC_015518	ACCTTA	2	12	1599686	1599697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332797439
535	NC_015518	GCAAAG	2	12	1608075	1608086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332797449
536	NC_015518	GCTATA	2	12	1609392	1609403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332797451
537	NC_015518	GTTAAG	2	12	1621794	1621805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797465
538	NC_015518	TCCAGT	2	12	1631369	1631380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332797474
539	NC_015518	GTTAAG	2	12	1632287	1632298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797475
540	NC_015518	AGGAAG	2	12	1634083	1634094	50 %	0 %	50 %	0 %	332797478
541	NC_015518	ATTGCC	2	12	1635356	1635367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332797481
542	NC_015518	TATTTC	2	12	1635577	1635588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332797481
543	NC_015518	TCAACC	2	12	1637013	1637024	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332797483
544	NC_015518	GTAATA	2	12	1640491	1640502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797488
545	NC_015518	GGAAGG	2	12	1646290	1646301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332797493
546	NC_015518	TCCCTC	2	12	1647536	1647547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332797494
547	NC_015518	TCAATT	2	12	1650695	1650706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797498
548	NC_015518	CAAGAG	2	12	1652658	1652669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332797500
549	NC_015518	ATACTT	2	12	1654066	1654077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797502
550	NC_015518	TAGATA	2	12	1654183	1654194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797502
551	NC_015518	ACTCCA	2	12	1655460	1655471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332797504
552	NC_015518	TTTCCT	2	12	1674500	1674511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332797526
553	NC_015518	TAATAG	2	12	1678436	1678447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797528
554	NC_015518	ATTCCT	2	12	1679466	1679477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797530
555	NC_015518	TAATAC	2	12	1699537	1699548	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332797545
556	NC_015518	AACGGT	2	12	1707963	1707974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797554
557	NC_015518	CCCAGA	2	12	1709201	1709212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332797554
558	NC_015518	GCCAGA	2	12	1713696	1713707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332797558
559	NC_015518	AATCCT	2	12	1713929	1713940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332797559
560	NC_015518	GGAAGA	2	12	1718891	1718902	50 %	0 %	50 %	0 %	332797563
561	NC_015518	GAAAAG	2	12	1718910	1718921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332797563
562	NC_015518	CTAAAC	2	12	1719549	1719560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332797564
563	NC_015518	TTACAT	2	12	1721120	1721131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797565
564	NC_015518	AGAAAT	2	12	1721267	1721278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332797565
565	NC_015518	ATTAAG	2	12	1722860	1722871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797567
566	NC_015518	ACCTAT	2	12	1723513	1723524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332797567
567	NC_015518	AGTTGC	2	12	1730388	1730399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332797578
568	NC_015518	TCCAAA	2	12	1731408	1731419	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332797579
569	NC_015518	GATGCA	2	12	1742849	1742860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797591
570	NC_015518	CAAGTG	2	12	1748104	1748115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797600
571	NC_015518	CTAATG	2	12	1748318	1748329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332797600
572	NC_015518	TATATC	2	12	1754205	1754216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797605
573	NC_015518	TTTCCT	2	12	1766362	1766373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332797617
574	NC_015518	AGCCAA	2	12	1772824	1772835	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332797624
575	NC_015518	ATTTTA	2	12	1778409	1778420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332797628
576	NC_015518	AAAAGG	2	12	1780318	1780329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332797630
577	NC_015518	ACGGAG	2	12	1785911	1785922	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332797638
578	NC_015518	ATAAAA	2	12	1795100	1795111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332797648
579	NC_015518	CCTATG	2	12	1796503	1796514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332797651
580	NC_015518	AACTTC	2	12	1802614	1802625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332797655
581	NC_015518	TTTAAA	2	12	1802806	1802817	50 %	50 %	0 %	0 %	332797655
582	NC_015518	ACTGGA	2	12	1804839	1804850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797658
583	NC_015518	GAATTA	2	12	1805520	1805531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332797659
584	NC_015518	AATATA	2	12	1806831	1806842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332797660
585	NC_015518	GTTAAG	2	12	1809233	1809244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797661
586	NC_015518	ATATCA	2	12	1809587	1809598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332797662
587	NC_015518	AGCTAA	2	12	1811754	1811765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332797666
588	NC_015518	ATCTTG	2	12	1815666	1815677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332797671
589	NC_015518	CTGAGG	2	12	1816836	1816847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332797672
590	NC_015518	GCTGCA	2	12	1819474	1819485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332797675
591	NC_015518	ACATTA	2	12	1819967	1819978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332797676
592	NC_015518	AACTTT	2	12	1820957	1820968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797677
593	NC_015518	CATTAT	2	12	1823247	1823258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797680
594	NC_015518	ATCTTT	2	12	1823602	1823613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332797680
595	NC_015518	CTCCTA	2	12	1826537	1826548	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332797682
596	NC_015518	AATATC	2	12	1827240	1827251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332797683
597	NC_015518	ACTGGA	2	12	1828160	1828171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332797685
598	NC_015518	TATATT	2	12	1843504	1843515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332797699
599	NC_015518	ACGTTT	2	12	1845693	1845704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332797701
600	NC_015518	TTTAGC	2	12	1851183	1851194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332797705
601	NC_015518	TGCTGA	2	12	1854192	1854203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332797709
602	NC_015518	ATTTAA	2	12	1857031	1857042	50 %	50 %	0 %	0 %	332797711
603	NC_015518	TATGAG	2	12	1859598	1859609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332797713
604	NC_015518	TTAACT	2	12	1861598	1861609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332797716
605	NC_015518	TCTTCG	2	12	1862131	1862142	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332797717
606	NC_015518	TTGAGT	2	12	1866449	1866460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332797723
607	NC_015518	TCCAAC	2	12	1869102	1869113	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332797724
608	NC_015518	CTCACA	2	12	1870020	1870031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332797725
609	NC_015518	GAAAAT	2	12	1873376	1873387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332797729
610	NC_015518	AAATGA	2	12	1873973	1873984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332797729
611	NC_015518	ATATAA	2	12	1874411	1874422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332797730
612	NC_015518	CCTTTA	2	12	1875946	1875957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332797732
613	NC_015518	GTTCTT	2	12	1876612	1876623	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332797732
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