MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013385	TTTTG	2	10	2931	2940	0 %	80 %	20 %	0 %	260891933
2	NC_013385	CTTCT	2	10	3076	3085	0 %	60 %	0 %	40 %	260891933
3	NC_013385	AGAGG	2	10	3185	3194	40 %	0 %	60 %	0 %	260891933
4	NC_013385	AGCCC	2	10	5760	5769	20 %	0 %	20 %	60 %	260891935
5	NC_013385	GAAAG	2	10	5792	5801	60 %	0 %	40 %	0 %	260891935
6	NC_013385	CCGCA	2	10	6272	6281	20 %	0 %	20 %	60 %	260891936
7	NC_013385	GGCTC	2	10	6892	6901	0 %	20 %	40 %	40 %	260891936
8	NC_013385	GGCCC	2	10	10196	10205	0 %	0 %	40 %	60 %	260891939
9	NC_013385	GCCGC	2	10	13286	13295	0 %	0 %	40 %	60 %	260891941
10	NC_013385	CCCCA	2	10	14007	14016	20 %	0 %	0 %	80 %	260891941
11	NC_013385	CTGGC	2	10	14053	14062	0 %	20 %	40 %	40 %	260891941
12	NC_013385	ACGGC	2	10	16780	16789	20 %	0 %	40 %	40 %	260891945
13	NC_013385	AGTGG	2	10	17110	17119	20 %	20 %	60 %	0 %	260891947
14	NC_013385	CTGGC	2	10	18734	18743	0 %	20 %	40 %	40 %	260891949
15	NC_013385	CTCTT	2	10	19566	19575	0 %	60 %	0 %	40 %	260891952
16	NC_013385	CCGTC	2	10	19655	19664	0 %	20 %	20 %	60 %	260891952
17	NC_013385	CTTCC	2	10	21367	21376	0 %	40 %	0 %	60 %	260891953
18	NC_013385	CAACC	2	10	22220	22229	40 %	0 %	0 %	60 %	260891955
19	NC_013385	ATGCG	2	10	22255	22264	20 %	20 %	40 %	20 %	260891955
20	NC_013385	AAGGA	2	10	24080	24089	60 %	0 %	40 %	0 %	260891959
21	NC_013385	GGGAA	2	10	25020	25029	40 %	0 %	60 %	0 %	260891959
22	NC_013385	CCTTT	2	10	25730	25739	0 %	60 %	0 %	40 %	260891960
23	NC_013385	GGAAG	2	10	27088	27097	40 %	0 %	60 %	0 %	260891961
24	NC_013385	CCCTT	2	10	27986	27995	0 %	40 %	0 %	60 %	260891963
25	NC_013385	GGGCT	2	10	31842	31851	0 %	20 %	60 %	20 %	260891966
26	NC_013385	AGCCC	2	10	33477	33486	20 %	0 %	20 %	60 %	260891969
27	NC_013385	CCCGT	2	10	39934	39943	0 %	20 %	20 %	60 %	260891974
28	NC_013385	CTTCC	2	10	42891	42900	0 %	40 %	0 %	60 %	260891977
29	NC_013385	GGAGG	2	10	45635	45644	20 %	0 %	80 %	0 %	260891979
30	NC_013385	CGCGG	2	10	51846	51855	0 %	0 %	60 %	40 %	260891986
31	NC_013385	CTGGT	2	10	53284	53293	0 %	40 %	40 %	20 %	260891987
32	NC_013385	TGGCG	2	10	53699	53708	0 %	20 %	60 %	20 %	260891988
33	NC_013385	CCTTA	2	10	55208	55217	20 %	40 %	0 %	40 %	260891991
34	NC_013385	CTTTG	2	10	58328	58337	0 %	60 %	20 %	20 %	260891994
35	NC_013385	AACTC	2	10	59440	59449	40 %	20 %	0 %	40 %	260891995
36	NC_013385	AGAGG	2	10	61588	61597	40 %	0 %	60 %	0 %	260891996
37	NC_013385	GTCTG	2	10	62237	62246	0 %	40 %	40 %	20 %	260891997
38	NC_013385	GCGCA	2	10	70993	71002	20 %	0 %	40 %	40 %	260892010
39	NC_013385	TTCGC	2	10	71849	71858	0 %	40 %	20 %	40 %	260892011
40	NC_013385	ACGGT	2	10	73307	73316	20 %	20 %	40 %	20 %	260892012
41	NC_013385	TGGCT	2	10	75699	75708	0 %	40 %	40 %	20 %	260892016
42	NC_013385	CAACG	2	10	77806	77815	40 %	0 %	20 %	40 %	260892016
43	NC_013385	GGAAG	2	10	79259	79268	40 %	0 %	60 %	0 %	260892016
44	NC_013385	ACCTT	2	10	79647	79656	20 %	40 %	0 %	40 %	260892017
45	NC_013385	TCCCC	2	10	80288	80297	0 %	20 %	0 %	80 %	260892018
46	NC_013385	CGGCG	2	10	81446	81455	0 %	0 %	60 %	40 %	260892019
47	NC_013385	CGGTC	2	10	81787	81796	0 %	20 %	40 %	40 %	260892020
48	NC_013385	CCCGA	2	10	82424	82433	20 %	0 %	20 %	60 %	260892021
49	NC_013385	TGAGG	2	10	83290	83299	20 %	20 %	60 %	0 %	260892023
50	NC_013385	CTTGG	2	10	83398	83407	0 %	40 %	40 %	20 %	260892023
51	NC_013385	GACGA	2	10	83627	83636	40 %	0 %	40 %	20 %	260892023
52	NC_013385	GGCCG	2	10	85792	85801	0 %	0 %	60 %	40 %	260892026
53	NC_013385	TTCCG	2	10	87504	87513	0 %	40 %	20 %	40 %	260892028
54	NC_013385	GGGGC	2	10	87667	87676	0 %	0 %	80 %	20 %	260892028
55	NC_013385	ACTCA	2	10	89324	89333	40 %	20 %	0 %	40 %	260892029
56	NC_013385	GGCTC	2	10	90757	90766	0 %	20 %	40 %	40 %	260892031
57	NC_013385	AGGGA	2	10	90854	90863	40 %	0 %	60 %	0 %	260892031
58	NC_013385	TCACT	2	10	91116	91125	20 %	40 %	0 %	40 %	260892031
59	NC_013385	AAGAA	2	10	97574	97583	80 %	0 %	20 %	0 %	260892035
60	NC_013385	CAGTC	2	10	98242	98251	20 %	20 %	20 %	40 %	260892035
61	NC_013385	TCTAC	2	10	100981	100990	20 %	40 %	0 %	40 %	260892039
62	NC_013385	CCCTT	2	10	104203	104212	0 %	40 %	0 %	60 %	260892041
63	NC_013385	CGGCG	2	10	104739	104748	0 %	0 %	60 %	40 %	260892042
64	NC_013385	TCCCG	2	10	105898	105907	0 %	20 %	20 %	60 %	260892044
65	NC_013385	CTAGG	2	10	106431	106440	20 %	20 %	40 %	20 %	260892045
66	NC_013385	CCGAA	2	10	106553	106562	40 %	0 %	20 %	40 %	260892045
67	NC_013385	GCGAT	2	10	107362	107371	20 %	20 %	40 %	20 %	260892047
68	NC_013385	GCCAG	2	10	108859	108868	20 %	0 %	40 %	40 %	260892047
69	NC_013385	CCTGA	2	10	114713	114722	20 %	20 %	20 %	40 %	260892050
70	NC_013385	GAAGG	2	10	115156	115165	40 %	0 %	60 %	0 %	260892050
71	NC_013385	CGTGC	2	10	119085	119094	0 %	20 %	40 %	40 %	260892053
72	NC_013385	GAGGC	2	10	122561	122570	20 %	0 %	60 %	20 %	260892054
73	NC_013385	CCTGA	2	10	125002	125011	20 %	20 %	20 %	40 %	260892058
74	NC_013385	GAAGG	2	10	125445	125454	40 %	0 %	60 %	0 %	260892058
75	NC_013385	TTTCC	2	10	126235	126244	0 %	60 %	0 %	40 %	260892059
76	NC_013385	TGCCG	2	10	129116	129125	0 %	20 %	40 %	40 %	260892061
77	NC_013385	GGCTG	2	10	129404	129413	0 %	20 %	60 %	20 %	260892061
78	NC_013385	TTACT	2	10	130346	130355	20 %	60 %	0 %	20 %	260892062
79	NC_013385	GGGAT	2	10	137430	137439	20 %	20 %	60 %	0 %	260892069
80	NC_013385	CAGGG	2	10	137969	137978	20 %	0 %	60 %	20 %	260892070
81	NC_013385	AGGCG	2	10	138618	138627	20 %	0 %	60 %	20 %	260892070
82	NC_013385	CTCTT	2	10	140342	140351	0 %	60 %	0 %	40 %	260892073
83	NC_013385	GATTT	2	10	141797	141806	20 %	60 %	20 %	0 %	260892075
84	NC_013385	GGGGA	2	10	143028	143037	20 %	0 %	80 %	0 %	260892077
85	NC_013385	TTCTG	2	10	144109	144118	0 %	60 %	20 %	20 %	260892078
86	NC_013385	AGGGC	2	10	148429	148438	20 %	0 %	60 %	20 %	260892081
87	NC_013385	TCCTC	2	10	149044	149053	0 %	40 %	0 %	60 %	260892081
88	NC_013385	TTTTC	2	10	150769	150778	0 %	80 %	0 %	20 %	260892082
89	NC_013385	AGGCC	2	10	153208	153217	20 %	0 %	40 %	40 %	260892084
90	NC_013385	GCAGG	2	10	153223	153232	20 %	0 %	60 %	20 %	260892084
91	NC_013385	GTTCG	2	10	154491	154500	0 %	40 %	40 %	20 %	260892086
92	NC_013385	CTGGC	2	10	156301	156310	0 %	20 %	40 %	40 %	260892087
93	NC_013385	AAGGA	2	10	156637	156646	60 %	0 %	40 %	0 %	260892087
94	NC_013385	CGGCG	2	10	157030	157039	0 %	0 %	60 %	40 %	260892088
95	NC_013385	CCTTC	2	10	157194	157203	0 %	40 %	0 %	60 %	260892088
96	NC_013385	CTTCC	2	10	158028	158037	0 %	40 %	0 %	60 %	260892088
97	NC_013385	GCGGG	2	10	160215	160224	0 %	0 %	80 %	20 %	260892090
98	NC_013385	GGAGG	2	10	160317	160326	20 %	0 %	80 %	0 %	260892090
99	NC_013385	CCTTC	2	10	160871	160880	0 %	40 %	0 %	60 %	260892091
100	NC_013385	CCGGG	2	10	161306	161315	0 %	0 %	60 %	40 %	260892091
101	NC_013385	GAAGG	2	10	161952	161961	40 %	0 %	60 %	0 %	260892091
102	NC_013385	CTCGC	2	10	162062	162071	0 %	20 %	20 %	60 %	260892092
103	NC_013385	ACGGC	2	10	163605	163614	20 %	0 %	40 %	40 %	260892094
104	NC_013385	CAAAA	2	10	165276	165285	80 %	0 %	0 %	20 %	260892095
105	NC_013385	TGGGC	2	10	165685	165694	0 %	20 %	60 %	20 %	260892096
106	NC_013385	TTTTC	2	10	167312	167321	0 %	80 %	0 %	20 %	260892097
107	NC_013385	GCTTT	2	10	171169	171178	0 %	60 %	20 %	20 %	260892100
108	NC_013385	GTGGA	2	10	171712	171721	20 %	20 %	60 %	0 %	260892100
109	NC_013385	GCGGT	2	10	172018	172027	0 %	20 %	60 %	20 %	260892100
110	NC_013385	GGAAA	2	10	175634	175643	60 %	0 %	40 %	0 %	260892104
111	NC_013385	CCTGA	2	10	177197	177206	20 %	20 %	20 %	40 %	260892106
112	NC_013385	GAAGA	2	10	178731	178740	60 %	0 %	40 %	0 %	260892107
113	NC_013385	CCTGG	2	10	180046	180055	0 %	20 %	40 %	40 %	260892108
114	NC_013385	GCCCG	2	10	182138	182147	0 %	0 %	40 %	60 %	260892110
115	NC_013385	GGAGA	2	10	182961	182970	40 %	0 %	60 %	0 %	260892111
116	NC_013385	GAAGG	2	10	183174	183183	40 %	0 %	60 %	0 %	260892111
117	NC_013385	TTTCC	2	10	185352	185361	0 %	60 %	0 %	40 %	260892114
118	NC_013385	GCGGT	2	10	185839	185848	0 %	20 %	60 %	20 %	260892115
119	NC_013385	GAGGC	2	10	189279	189288	20 %	0 %	60 %	20 %	260892119
120	NC_013385	GCGGG	2	10	192222	192231	0 %	0 %	80 %	20 %	260892121
121	NC_013385	GGCGG	2	10	193631	193640	0 %	0 %	80 %	20 %	260892122
122	NC_013385	TTTTG	2	10	194366	194375	0 %	80 %	20 %	0 %	260892123
123	NC_013385	ATCCC	2	10	195472	195481	20 %	20 %	0 %	60 %	260892124
124	NC_013385	TCCTC	2	10	196553	196562	0 %	40 %	0 %	60 %	260892125
125	NC_013385	GACTT	2	10	196939	196948	20 %	40 %	20 %	20 %	260892125
126	NC_013385	GCTCA	2	10	197616	197625	20 %	20 %	20 %	40 %	260892125
127	NC_013385	TTTCC	2	10	198050	198059	0 %	60 %	0 %	40 %	260892125
128	NC_013385	GGAGG	2	10	199350	199359	20 %	0 %	80 %	0 %	260892126
129	NC_013385	GCTAC	2	10	201245	201254	20 %	20 %	20 %	40 %	260892127
130	NC_013385	CCTCT	2	10	202101	202110	0 %	40 %	0 %	60 %	260892127
131	NC_013385	TACCT	2	10	204332	204341	20 %	40 %	0 %	40 %	260892130
132	NC_013385	CCACG	2	10	204961	204970	20 %	0 %	20 %	60 %	260892131
133	NC_013385	GGGAG	2	10	208725	208734	20 %	0 %	80 %	0 %	260892134
134	NC_013385	GGCAC	2	10	209215	209224	20 %	0 %	40 %	40 %	260892134
135	NC_013385	GGCCT	2	10	209474	209483	0 %	20 %	40 %	40 %	260892134
136	NC_013385	CACTT	2	10	209498	209507	20 %	40 %	0 %	40 %	260892134
137	NC_013385	CCCTA	2	10	213361	213370	20 %	20 %	0 %	60 %	260892140
138	NC_013385	TCCTT	2	10	214960	214969	0 %	60 %	0 %	40 %	260892142
139	NC_013385	GGAAG	2	10	215788	215797	40 %	0 %	60 %	0 %	260892143
140	NC_013385	CGCTA	2	10	221096	221105	20 %	20 %	20 %	40 %	260892145
141	NC_013385	TCCGG	2	10	221395	221404	0 %	20 %	40 %	40 %	260892146
142	NC_013385	CCGGG	2	10	223893	223902	0 %	0 %	60 %	40 %	260892148
143	NC_013385	ACCGG	2	10	226536	226545	20 %	0 %	40 %	40 %	260892150
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150	NC_013385	ACGGA	2	10	244779	244788	40 %	0 %	40 %	20 %	260892167
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154	NC_013385	GCTTG	2	10	251192	251201	0 %	40 %	40 %	20 %	260892174
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161	NC_013385	AGGTT	2	10	256792	256801	20 %	40 %	40 %	0 %	260892179
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263	NC_013385	CCGCT	2	10	428061	428070	0 %	20 %	20 %	60 %	260892325
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