MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	CAGGG	2	10	853265	853274	20 %	0 %	60 %	20 %	260892731
502	NC_013385	GGAAG	2	10	856326	856335	40 %	0 %	60 %	0 %	260892735
503	NC_013385	ACGCG	2	10	857154	857163	20 %	0 %	40 %	40 %	260892735
504	NC_013385	GAAAG	2	10	858419	858428	60 %	0 %	40 %	0 %	260892737
505	NC_013385	CCGGA	2	10	858659	858668	20 %	0 %	40 %	40 %	260892738
506	NC_013385	CCGGG	2	10	859640	859649	0 %	0 %	60 %	40 %	260892738
507	NC_013385	CTGGC	2	10	867021	867030	0 %	20 %	40 %	40 %	260892747
508	NC_013385	GGAGC	2	10	867077	867086	20 %	0 %	60 %	20 %	260892747
509	NC_013385	CGGCG	2	10	867181	867190	0 %	0 %	60 %	40 %	260892747
510	NC_013385	AAGCC	2	10	871942	871951	40 %	0 %	20 %	40 %	260892749
511	NC_013385	CCCAC	2	10	873924	873933	20 %	0 %	0 %	80 %	260892752
512	NC_013385	CCTTT	2	10	875036	875045	0 %	60 %	0 %	40 %	260892753
513	NC_013385	AGGAG	2	10	877497	877506	40 %	0 %	60 %	0 %	260892756
514	NC_013385	CTTTG	2	10	877856	877865	0 %	60 %	20 %	20 %	260892757
515	NC_013385	TTTTC	2	10	877903	877912	0 %	80 %	0 %	20 %	260892757
516	NC_013385	GGGGA	2	10	884546	884555	20 %	0 %	80 %	0 %	260892762
517	NC_013385	CCGGT	2	10	885074	885083	0 %	20 %	40 %	40 %	260892762
518	NC_013385	CGGCG	2	10	885647	885656	0 %	0 %	60 %	40 %	260892763
519	NC_013385	TGGAA	2	10	886049	886058	40 %	20 %	40 %	0 %	260892763
520	NC_013385	CGGGC	2	10	886112	886121	0 %	0 %	60 %	40 %	260892763
521	NC_013385	GGCGG	2	10	886341	886350	0 %	0 %	80 %	20 %	260892763
522	NC_013385	GGGGA	2	10	887701	887710	20 %	0 %	80 %	0 %	260892765
523	NC_013385	GGAAC	2	10	887722	887731	40 %	0 %	40 %	20 %	260892765
524	NC_013385	GTGGC	2	10	887846	887855	0 %	20 %	60 %	20 %	260892765
525	NC_013385	CCCGC	2	10	890538	890547	0 %	0 %	20 %	80 %	260892767
526	NC_013385	GGGCT	2	10	890887	890896	0 %	20 %	60 %	20 %	260892768
527	NC_013385	GCCCG	2	10	890919	890928	0 %	0 %	40 %	60 %	260892768
528	NC_013385	CAGGC	2	10	891694	891703	20 %	0 %	40 %	40 %	260892768
529	NC_013385	CCCGT	2	10	892141	892150	0 %	20 %	20 %	60 %	260892768
530	NC_013385	CCCGC	2	10	892499	892508	0 %	0 %	20 %	80 %	260892768
531	NC_013385	TGCGG	2	10	892613	892622	0 %	20 %	60 %	20 %	260892768
532	NC_013385	CGTGG	2	10	894145	894154	0 %	20 %	60 %	20 %	260892771
533	NC_013385	TGCCG	2	10	896198	896207	0 %	20 %	40 %	40 %	260892773
534	NC_013385	CTTTG	2	10	896564	896573	0 %	60 %	20 %	20 %	260892773
535	NC_013385	GCGCC	2	10	897422	897431	0 %	0 %	40 %	60 %	260892774
536	NC_013385	GAGCG	2	10	897616	897625	20 %	0 %	60 %	20 %	260892774
537	NC_013385	CCTGG	2	10	906706	906715	0 %	20 %	40 %	40 %	260892784
538	NC_013385	CCCTC	2	10	908885	908894	0 %	20 %	0 %	80 %	260892786
539	NC_013385	TGGCC	2	10	909098	909107	0 %	20 %	40 %	40 %	260892786
540	NC_013385	CTTCC	2	10	909159	909168	0 %	40 %	0 %	60 %	260892786
541	NC_013385	CCGGG	2	10	913380	913389	0 %	0 %	60 %	40 %	260892789
542	NC_013385	GCTTG	2	10	915876	915885	0 %	40 %	40 %	20 %	260892791
543	NC_013385	GCCGG	2	10	916145	916154	0 %	0 %	60 %	40 %	260892791
544	NC_013385	CGGGA	2	10	918531	918540	20 %	0 %	60 %	20 %	260892794
545	NC_013385	GGGCT	2	10	922316	922325	0 %	20 %	60 %	20 %	260892798
546	NC_013385	CCTTC	2	10	922898	922907	0 %	40 %	0 %	60 %	260892798
547	NC_013385	AGGTA	2	10	924647	924656	40 %	20 %	40 %	0 %	260892800
548	NC_013385	GCGCC	2	10	931517	931526	0 %	0 %	40 %	60 %	260892802
549	NC_013385	AACCA	2	10	932258	932267	60 %	0 %	0 %	40 %	260892803
550	NC_013385	CCAAT	2	10	933375	933384	40 %	20 %	0 %	40 %	260892803
551	NC_013385	GCCAG	2	10	933937	933946	20 %	0 %	40 %	40 %	260892803
552	NC_013385	CTCGT	2	10	934173	934182	0 %	40 %	20 %	40 %	260892803
553	NC_013385	ACCGG	2	10	935528	935537	20 %	0 %	40 %	40 %	260892804
554	NC_013385	GGCCA	2	10	937553	937562	20 %	0 %	40 %	40 %	260892807
555	NC_013385	TGGTT	2	10	938403	938412	0 %	60 %	40 %	0 %	260892807
556	NC_013385	CTCTT	2	10	939619	939628	0 %	60 %	0 %	40 %	260892808
557	NC_013385	GGGGA	2	10	940504	940513	20 %	0 %	80 %	0 %	260892809
558	NC_013385	GGGAA	2	10	941665	941674	40 %	0 %	60 %	0 %	260892809
559	NC_013385	AGCTC	2	10	942426	942435	20 %	20 %	20 %	40 %	260892811
560	NC_013385	ACGGG	2	10	944076	944085	20 %	0 %	60 %	20 %	260892813
561	NC_013385	CTCTG	2	10	946019	946028	0 %	40 %	20 %	40 %	260892815
562	NC_013385	GGGAA	2	10	946233	946242	40 %	0 %	60 %	0 %	260892815
563	NC_013385	CTTGT	2	10	947890	947899	0 %	60 %	20 %	20 %	260892818
564	NC_013385	CTGGC	2	10	948312	948321	0 %	20 %	40 %	40 %	260892818
565	NC_013385	GAGGT	2	10	948515	948524	20 %	20 %	60 %	0 %	260892818
566	NC_013385	CGGCG	2	10	948741	948750	0 %	0 %	60 %	40 %	260892819
567	NC_013385	GAAGG	2	10	951276	951285	40 %	0 %	60 %	0 %	260892821
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569	NC_013385	GGGGC	2	10	952422	952431	0 %	0 %	80 %	20 %	260892823
570	NC_013385	GGCCC	2	10	955981	955990	0 %	0 %	40 %	60 %	260892827
571	NC_013385	GAGCT	2	10	960711	960720	20 %	20 %	40 %	20 %	260892835
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573	NC_013385	CACCG	2	10	963382	963391	20 %	0 %	20 %	60 %	260892838
574	NC_013385	TCTTG	2	10	963799	963808	0 %	60 %	20 %	20 %	260892839
575	NC_013385	AGGAG	2	10	966552	966561	40 %	0 %	60 %	0 %	260892842
576	NC_013385	AGCTC	2	10	967393	967402	20 %	20 %	20 %	40 %	260892842
577	NC_013385	TGGAG	2	10	970713	970722	20 %	20 %	60 %	0 %	260892845
578	NC_013385	GGTCA	2	10	971562	971571	20 %	20 %	40 %	20 %	260892846
579	NC_013385	GGCTT	2	10	973895	973904	0 %	40 %	40 %	20 %	260892849
580	NC_013385	ACGGC	2	10	974699	974708	20 %	0 %	40 %	40 %	260892850
581	NC_013385	TACGG	2	10	976147	976156	20 %	20 %	40 %	20 %	260892852
582	NC_013385	TGGCA	2	10	979128	979137	20 %	20 %	40 %	20 %	260892855
583	NC_013385	CTGGC	2	10	981803	981812	0 %	20 %	40 %	40 %	260892857
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587	NC_013385	GGGAG	2	10	986157	986166	20 %	0 %	80 %	0 %	260892860
588	NC_013385	TGAAA	2	10	986766	986775	60 %	20 %	20 %	0 %	260892860
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591	NC_013385	CCCTT	2	10	989685	989694	0 %	40 %	0 %	60 %	260892863
592	NC_013385	TGATC	2	10	996566	996575	20 %	40 %	20 %	20 %	260892867
593	NC_013385	GAAAA	2	10	996885	996894	80 %	0 %	20 %	0 %	260892867
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596	NC_013385	CAAGG	2	10	999237	999246	40 %	0 %	40 %	20 %	260892868
597	NC_013385	AGAGG	2	10	999965	999974	40 %	0 %	60 %	0 %	260892869
598	NC_013385	GCTTT	2	10	1000254	1000263	0 %	60 %	20 %	20 %	260892869
599	NC_013385	GGCGC	2	10	1000343	1000352	0 %	0 %	60 %	40 %	260892870
600	NC_013385	AGCCC	2	10	1002041	1002050	20 %	0 %	20 %	60 %	260892872
601	NC_013385	GAAGG	2	10	1007002	1007011	40 %	0 %	60 %	0 %	260892879
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611	NC_013385	CGGCG	2	10	1033276	1033285	0 %	0 %	60 %	40 %	260892905
612	NC_013385	GAGAG	2	10	1033384	1033393	40 %	0 %	60 %	0 %	260892905
613	NC_013385	AAAGG	2	10	1034274	1034283	60 %	0 %	40 %	0 %	260892906
614	NC_013385	GCCCT	2	10	1035420	1035429	0 %	20 %	20 %	60 %	260892906
615	NC_013385	GGCGG	2	10	1040531	1040540	0 %	0 %	80 %	20 %	260892910
616	NC_013385	GAGGC	2	10	1042335	1042344	20 %	0 %	60 %	20 %	260892911
617	NC_013385	AGAGA	2	10	1045218	1045227	60 %	0 %	40 %	0 %	260892912
618	NC_013385	GTGGG	2	10	1045291	1045300	0 %	20 %	80 %	0 %	260892912
619	NC_013385	GGCCA	2	10	1045628	1045637	20 %	0 %	40 %	40 %	260892913
620	NC_013385	CCAGA	2	10	1047081	1047090	40 %	0 %	20 %	40 %	260892914
621	NC_013385	CTTGG	2	10	1048628	1048637	0 %	40 %	40 %	20 %	260892915
622	NC_013385	GAGAA	2	10	1050605	1050614	60 %	0 %	40 %	0 %	260892918
623	NC_013385	GGGGA	2	10	1053515	1053524	20 %	0 %	80 %	0 %	260892922
624	NC_013385	TTTGC	2	10	1053734	1053743	0 %	60 %	20 %	20 %	260892922
625	NC_013385	TCTCT	2	10	1055095	1055104	0 %	60 %	0 %	40 %	260892925
626	NC_013385	CCTGG	2	10	1058377	1058386	0 %	20 %	40 %	40 %	260892928
627	NC_013385	CCTTT	2	10	1058699	1058708	0 %	60 %	0 %	40 %	260892928
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