MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 1621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013124	ATCTC	2	10	1138	1147	20 %	40 %	0 %	40 %	256370825
2	NC_013124	TCGGG	2	10	1969	1978	0 %	20 %	60 %	20 %	256370826
3	NC_013124	CACCG	2	10	3770	3779	20 %	0 %	20 %	60 %	256370827
4	NC_013124	CTCGA	2	10	5655	5664	20 %	20 %	20 %	40 %	256370829
5	NC_013124	GCTTG	2	10	7271	7280	0 %	40 %	40 %	20 %	256370830
6	NC_013124	TCAGC	2	10	11553	11562	20 %	20 %	20 %	40 %	256370833
7	NC_013124	GACGC	2	10	12403	12412	20 %	0 %	40 %	40 %	256370836
8	NC_013124	GATCG	2	10	14603	14612	20 %	20 %	40 %	20 %	256370838
9	NC_013124	CGGTC	2	10	15294	15303	0 %	20 %	40 %	40 %	256370839
10	NC_013124	GCGTC	2	10	16463	16472	0 %	20 %	40 %	40 %	256370841
11	NC_013124	TCGGC	2	10	16539	16548	0 %	20 %	40 %	40 %	256370841
12	NC_013124	GTCGA	2	10	17051	17060	20 %	20 %	40 %	20 %	256370842
13	NC_013124	TTGGT	2	10	17902	17911	0 %	60 %	40 %	0 %	256370843
14	NC_013124	TCGCG	2	10	17992	18001	0 %	20 %	40 %	40 %	256370843
15	NC_013124	GTCGG	2	10	18563	18572	0 %	20 %	60 %	20 %	256370843
16	NC_013124	CCACG	2	10	19415	19424	20 %	0 %	20 %	60 %	256370844
17	NC_013124	CTCGC	2	10	21537	21546	0 %	20 %	20 %	60 %	256370845
18	NC_013124	CGCGT	2	10	21898	21907	0 %	20 %	40 %	40 %	256370845
19	NC_013124	CCGTC	2	10	22836	22845	0 %	20 %	20 %	60 %	256370846
20	NC_013124	CCAGC	2	10	23128	23137	20 %	0 %	20 %	60 %	256370846
21	NC_013124	CCTCG	2	10	23751	23760	0 %	20 %	20 %	60 %	256370847
22	NC_013124	GTCGC	2	10	23983	23992	0 %	20 %	40 %	40 %	256370847
23	NC_013124	GGGTC	2	10	24680	24689	0 %	20 %	60 %	20 %	256370847
24	NC_013124	GCCTC	2	10	24802	24811	0 %	20 %	20 %	60 %	256370847
25	NC_013124	GCGTC	2	10	24929	24938	0 %	20 %	40 %	40 %	256370847
26	NC_013124	CGCGA	2	10	26778	26787	20 %	0 %	40 %	40 %	256370849
27	NC_013124	GGCTT	2	10	26888	26897	0 %	40 %	40 %	20 %	256370849
28	NC_013124	GGTGC	2	10	27167	27176	0 %	20 %	60 %	20 %	256370850
29	NC_013124	GCGCT	2	10	27539	27548	0 %	20 %	40 %	40 %	256370850
30	NC_013124	GGGAG	2	10	31236	31245	20 %	0 %	80 %	0 %	256370853
31	NC_013124	CGTGG	2	10	31497	31506	0 %	20 %	60 %	20 %	256370853
32	NC_013124	GGGTC	2	10	31604	31613	0 %	20 %	60 %	20 %	256370854
33	NC_013124	CGTCG	2	10	32207	32216	0 %	20 %	40 %	40 %	256370854
34	NC_013124	GTCGA	2	10	33262	33271	20 %	20 %	40 %	20 %	256370856
35	NC_013124	GTGCG	2	10	33727	33736	0 %	20 %	60 %	20 %	256370856
36	NC_013124	GCTGG	2	10	37234	37243	0 %	20 %	60 %	20 %	256370860
37	NC_013124	CGGTG	2	10	38002	38011	0 %	20 %	60 %	20 %	256370860
38	NC_013124	GCGCG	2	10	39438	39447	0 %	0 %	60 %	40 %	256370862
39	NC_013124	CACCG	2	10	39656	39665	20 %	0 %	20 %	60 %	256370862
40	NC_013124	TGCGT	2	10	40163	40172	0 %	40 %	40 %	20 %	256370863
41	NC_013124	CGGAG	2	10	42278	42287	20 %	0 %	60 %	20 %	256370865
42	NC_013124	GCGAC	2	10	42311	42320	20 %	0 %	40 %	40 %	256370865
43	NC_013124	CGGTG	2	10	44045	44054	0 %	20 %	60 %	20 %	256370868
44	NC_013124	CGGTG	2	10	44600	44609	0 %	20 %	60 %	20 %	256370869
45	NC_013124	TCACC	2	10	44983	44992	20 %	20 %	0 %	60 %	256370870
46	NC_013124	CCGGT	2	10	46125	46134	0 %	20 %	40 %	40 %	256370872
47	NC_013124	GACAG	2	10	49511	49520	40 %	0 %	40 %	20 %	256370875
48	NC_013124	GCCAC	2	10	50128	50137	20 %	0 %	20 %	60 %	256370875
49	NC_013124	CACGC	2	10	57433	57442	20 %	0 %	20 %	60 %	256370883
50	NC_013124	CGTCG	2	10	60922	60931	0 %	20 %	40 %	40 %	256370888
51	NC_013124	ACCAC	2	10	61765	61774	40 %	0 %	0 %	60 %	256370889
52	NC_013124	GGCCA	2	10	66685	66694	20 %	0 %	40 %	40 %	256370891
53	NC_013124	GCGCA	2	10	69013	69022	20 %	0 %	40 %	40 %	256370892
54	NC_013124	GGCGC	2	10	69216	69225	0 %	0 %	60 %	40 %	256370892
55	NC_013124	GTCGA	2	10	69437	69446	20 %	20 %	40 %	20 %	256370892
56	NC_013124	ACGAC	2	10	70792	70801	40 %	0 %	20 %	40 %	256370892
57	NC_013124	GAGTG	2	10	71091	71100	20 %	20 %	60 %	0 %	256370892
58	NC_013124	TCGCC	2	10	71494	71503	0 %	20 %	20 %	60 %	256370892
59	NC_013124	CGGTC	2	10	72148	72157	0 %	20 %	40 %	40 %	256370892
60	NC_013124	GTCGG	2	10	74969	74978	0 %	20 %	60 %	20 %	256370894
61	NC_013124	GCGCT	2	10	76158	76167	0 %	20 %	40 %	40 %	256370896
62	NC_013124	GCACG	2	10	76856	76865	20 %	0 %	40 %	40 %	256370896
63	NC_013124	TGGGA	2	10	76993	77002	20 %	20 %	60 %	0 %	256370896
64	NC_013124	CACGC	2	10	78751	78760	20 %	0 %	20 %	60 %	256370898
65	NC_013124	CTTCG	2	10	78961	78970	0 %	40 %	20 %	40 %	256370898
66	NC_013124	GCGAG	2	10	79970	79979	20 %	0 %	60 %	20 %	256370900
67	NC_013124	AGCCG	2	10	81357	81366	20 %	0 %	40 %	40 %	256370901
68	NC_013124	CTGCG	2	10	82087	82096	0 %	20 %	40 %	40 %	256370901
69	NC_013124	AGCCC	2	10	83976	83985	20 %	0 %	20 %	60 %	256370902
70	NC_013124	CTCGC	2	10	84198	84207	0 %	20 %	20 %	60 %	256370902
71	NC_013124	TCCGT	2	10	84788	84797	0 %	40 %	20 %	40 %	256370903
72	NC_013124	ATCGA	2	10	85638	85647	40 %	20 %	20 %	20 %	256370904
73	NC_013124	TCGCG	2	10	85980	85989	0 %	20 %	40 %	40 %	256370904
74	NC_013124	CCTCG	2	10	87256	87265	0 %	20 %	20 %	60 %	256370905
75	NC_013124	GTCGA	2	10	87518	87527	20 %	20 %	40 %	20 %	256370905
76	NC_013124	CCGGG	2	10	88509	88518	0 %	0 %	60 %	40 %	256370906
77	NC_013124	CGACC	2	10	88753	88762	20 %	0 %	20 %	60 %	256370906
78	NC_013124	TCGAC	2	10	89259	89268	20 %	20 %	20 %	40 %	256370907
79	NC_013124	CTGCG	2	10	89929	89938	0 %	20 %	40 %	40 %	256370907
80	NC_013124	CGTCG	2	10	90289	90298	0 %	20 %	40 %	40 %	256370907
81	NC_013124	CGTCG	2	10	91847	91856	0 %	20 %	40 %	40 %	256370908
82	NC_013124	CGTCG	2	10	92629	92638	0 %	20 %	40 %	40 %	256370908
83	NC_013124	CACCT	2	10	95309	95318	20 %	20 %	0 %	60 %	256370910
84	NC_013124	TCGAC	2	10	96565	96574	20 %	20 %	20 %	40 %	256370912
85	NC_013124	CCACC	2	10	96610	96619	20 %	0 %	0 %	80 %	256370912
86	NC_013124	TCGCG	2	10	99421	99430	0 %	20 %	40 %	40 %	256370914
87	NC_013124	CGAGC	2	10	102644	102653	20 %	0 %	40 %	40 %	256370917
88	NC_013124	GTGAC	2	10	102714	102723	20 %	20 %	40 %	20 %	256370917
89	NC_013124	CGATC	2	10	102879	102888	20 %	20 %	20 %	40 %	256370917
90	NC_013124	GGCTG	2	10	104446	104455	0 %	20 %	60 %	20 %	256370919
91	NC_013124	GCGCT	2	10	104802	104811	0 %	20 %	40 %	40 %	256370919
92	NC_013124	CGTGT	2	10	105238	105247	0 %	40 %	40 %	20 %	256370919
93	NC_013124	CCTCG	2	10	105975	105984	0 %	20 %	20 %	60 %	256370920
94	NC_013124	GAGCT	2	10	106369	106378	20 %	20 %	40 %	20 %	256370920
95	NC_013124	TGGCC	2	10	106380	106389	0 %	20 %	40 %	40 %	256370920
96	NC_013124	CGCAG	2	10	107246	107255	20 %	0 %	40 %	40 %	256370921
97	NC_013124	TGGCG	2	10	107343	107352	0 %	20 %	60 %	20 %	256370921
98	NC_013124	CGGCC	2	10	111314	111323	0 %	0 %	40 %	60 %	256370923
99	NC_013124	GCCGA	2	10	111606	111615	20 %	0 %	40 %	40 %	256370923
100	NC_013124	GCCGC	2	10	111812	111821	0 %	0 %	40 %	60 %	256370923
101	NC_013124	TCCGA	2	10	113258	113267	20 %	20 %	20 %	40 %	256370925
102	NC_013124	CGAGG	2	10	114389	114398	20 %	0 %	60 %	20 %	256370926
103	NC_013124	GGCGG	2	10	115375	115384	0 %	0 %	80 %	20 %	256370927
104	NC_013124	GCGCG	2	10	117476	117485	0 %	0 %	60 %	40 %	256370927
105	NC_013124	CGCGC	2	10	119416	119425	0 %	0 %	40 %	60 %	256370929
106	NC_013124	CGGCT	2	10	121398	121407	0 %	20 %	40 %	40 %	256370930
107	NC_013124	GGTCG	2	10	122181	122190	0 %	20 %	60 %	20 %	256370931
108	NC_013124	CGCGC	2	10	122382	122391	0 %	0 %	40 %	60 %	256370931
109	NC_013124	CGTCG	2	10	122566	122575	0 %	20 %	40 %	40 %	256370931
110	NC_013124	CAGCT	2	10	124907	124916	20 %	20 %	20 %	40 %	256370933
111	NC_013124	GCTCG	2	10	126711	126720	0 %	20 %	40 %	40 %	256370933
112	NC_013124	TGACG	2	10	134609	134618	20 %	20 %	40 %	20 %	256370940
113	NC_013124	GATCC	2	10	137013	137022	20 %	20 %	20 %	40 %	256370945
114	NC_013124	GTGGG	2	10	137268	137277	0 %	20 %	80 %	0 %	256370946
115	NC_013124	ATCGC	2	10	139021	139030	20 %	20 %	20 %	40 %	256370949
116	NC_013124	CGAGC	2	10	139974	139983	20 %	0 %	40 %	40 %	256370950
117	NC_013124	TCGGG	2	10	141014	141023	0 %	20 %	60 %	20 %	256370950
118	NC_013124	CGACG	2	10	143894	143903	20 %	0 %	40 %	40 %	256370951
119	NC_013124	TCGGC	2	10	144623	144632	0 %	20 %	40 %	40 %	256370951
120	NC_013124	GTCGA	2	10	144687	144696	20 %	20 %	40 %	20 %	256370951
121	NC_013124	CTCCA	2	10	145122	145131	20 %	20 %	0 %	60 %	256370951
122	NC_013124	ACGGC	2	10	145886	145895	20 %	0 %	40 %	40 %	256370951
123	NC_013124	ATCCA	2	10	146971	146980	40 %	20 %	0 %	40 %	256370954
124	NC_013124	GGTCA	2	10	148176	148185	20 %	20 %	40 %	20 %	256370955
125	NC_013124	CGAGG	2	10	149839	149848	20 %	0 %	60 %	20 %	256370957
126	NC_013124	TGTGG	2	10	150780	150789	0 %	40 %	60 %	0 %	256370958
127	NC_013124	TCCGA	2	10	151578	151587	20 %	20 %	20 %	40 %	256370958
128	NC_013124	CTCGA	2	10	151920	151929	20 %	20 %	20 %	40 %	256370959
129	NC_013124	CGTAC	2	10	152388	152397	20 %	20 %	20 %	40 %	256370960
130	NC_013124	GGCGA	2	10	153371	153380	20 %	0 %	60 %	20 %	256370961
131	NC_013124	GGTGC	2	10	153482	153491	0 %	20 %	60 %	20 %	256370961
132	NC_013124	GCACG	2	10	153934	153943	20 %	0 %	40 %	40 %	256370961
133	NC_013124	GATGG	2	10	155533	155542	20 %	20 %	60 %	0 %	256370963
134	NC_013124	CGCTC	2	10	155575	155584	0 %	20 %	20 %	60 %	256370963
135	NC_013124	GGCAC	2	10	155993	156002	20 %	0 %	40 %	40 %	256370963
136	NC_013124	GCGCT	2	10	156935	156944	0 %	20 %	40 %	40 %	256370965
137	NC_013124	TCGCC	2	10	160225	160234	0 %	20 %	20 %	60 %	256370970
138	NC_013124	CTCGC	2	10	160269	160278	0 %	20 %	20 %	60 %	256370970
139	NC_013124	CGAGG	2	10	160942	160951	20 %	0 %	60 %	20 %	256370972
140	NC_013124	CTCGT	2	10	163664	163673	0 %	40 %	20 %	40 %	256370976
141	NC_013124	GTCGC	2	10	165194	165203	0 %	20 %	40 %	40 %	256370977
142	NC_013124	GCTCG	2	10	167197	167206	0 %	20 %	40 %	40 %	256370978
143	NC_013124	CGAGC	2	10	170130	170139	20 %	0 %	40 %	40 %	256370982
144	NC_013124	ATCGC	2	10	171616	171625	20 %	20 %	20 %	40 %	256370983
145	NC_013124	CCGTG	2	10	173542	173551	0 %	20 %	40 %	40 %	256370984
146	NC_013124	GCCAC	2	10	174293	174302	20 %	0 %	20 %	60 %	256370984
147	NC_013124	CTTCG	2	10	174558	174567	0 %	40 %	20 %	40 %	256370984
148	NC_013124	AGACG	2	10	175396	175405	40 %	0 %	40 %	20 %	256370985
149	NC_013124	CAGCG	2	10	176430	176439	20 %	0 %	40 %	40 %	256370986
150	NC_013124	GCCGA	2	10	177509	177518	20 %	0 %	40 %	40 %	256370987
151	NC_013124	CGCAG	2	10	178348	178357	20 %	0 %	40 %	40 %	256370988
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153	NC_013124	GCTGG	2	10	182126	182135	0 %	20 %	60 %	20 %	256370990
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155	NC_013124	AGGTG	2	10	184218	184227	20 %	20 %	60 %	0 %	256370992
156	NC_013124	TCGCC	2	10	186489	186498	0 %	20 %	20 %	60 %	256370995
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167	NC_013124	GCTCG	2	10	195824	195833	0 %	20 %	40 %	40 %	256371008
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178	NC_013124	GCTCG	2	10	208595	208604	0 %	20 %	40 %	40 %	256371022
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246	NC_013124	GTGCG	2	10	287034	287043	0 %	20 %	60 %	20 %	256371098
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248	NC_013124	CGTGT	2	10	289313	289322	0 %	40 %	40 %	20 %	256371099
249	NC_013124	CGTCG	2	10	289467	289476	0 %	20 %	40 %	40 %	256371099
250	NC_013124	GGGAT	2	10	290399	290408	20 %	20 %	60 %	0 %	256371100
251	NC_013124	TCGTG	2	10	291256	291265	0 %	40 %	40 %	20 %	256371101
252	NC_013124	CCCGT	2	10	291322	291331	0 %	20 %	20 %	60 %	256371101
253	NC_013124	GCAGT	2	10	292818	292827	20 %	20 %	40 %	20 %	256371102
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255	NC_013124	CGGAT	2	10	295975	295984	20 %	20 %	40 %	20 %	256371104
256	NC_013124	ACGCG	2	10	297043	297052	20 %	0 %	40 %	40 %	256371105
257	NC_013124	CGACC	2	10	298670	298679	20 %	0 %	20 %	60 %	256371107
258	NC_013124	GCAGA	2	10	301197	301206	40 %	0 %	40 %	20 %	256371109
259	NC_013124	TCGCC	2	10	301553	301562	0 %	20 %	20 %	60 %	256371109
260	NC_013124	GCCCT	2	10	301822	301831	0 %	20 %	20 %	60 %	256371109
261	NC_013124	TCGCG	2	10	302315	302324	0 %	20 %	40 %	40 %	256371110
262	NC_013124	GGCCG	2	10	302631	302640	0 %	0 %	60 %	40 %	256371110
263	NC_013124	CCGAG	2	10	302688	302697	20 %	0 %	40 %	40 %	256371110
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375	NC_013124	CGTCG	2	10	445308	445317	0 %	20 %	40 %	40 %	256371264
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377	NC_013124	CGGCA	2	10	448738	448747	20 %	0 %	40 %	40 %	256371267
378	NC_013124	GCCAT	2	10	449256	449265	20 %	20 %	20 %	40 %	256371267
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380	NC_013124	CGTGG	2	10	450821	450830	0 %	20 %	60 %	20 %	256371268
381	NC_013124	CTCGG	2	10	452118	452127	0 %	20 %	40 %	40 %	256371269
382	NC_013124	GGTCG	2	10	453078	453087	0 %	20 %	60 %	20 %	256371270
383	NC_013124	GATCG	2	10	454139	454148	20 %	20 %	40 %	20 %	256371271
384	NC_013124	CCGAT	2	10	455232	455241	20 %	20 %	20 %	40 %	256371273
385	NC_013124	GCCGA	2	10	457085	457094	20 %	0 %	40 %	40 %	256371276
386	NC_013124	GGGTG	2	10	458601	458610	0 %	20 %	80 %	0 %	256371277
387	NC_013124	GTTCC	2	10	458724	458733	0 %	40 %	20 %	40 %	256371277
388	NC_013124	GGCTC	2	10	459916	459925	0 %	20 %	40 %	40 %	256371278
389	NC_013124	CGCGA	2	10	460069	460078	20 %	0 %	40 %	40 %	256371278
390	NC_013124	TGAGC	2	10	461618	461627	20 %	20 %	40 %	20 %	256371278
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