MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 1621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013124	CGACC	2	10	1282115	1282124	20 %	0 %	20 %	60 %	256372006
1002	NC_013124	CTCGC	2	10	1282627	1282636	0 %	20 %	20 %	60 %	256372006
1003	NC_013124	CACGC	2	10	1282772	1282781	20 %	0 %	20 %	60 %	256372006
1004	NC_013124	TGCCG	2	10	1285189	1285198	0 %	20 %	40 %	40 %	256372008
1005	NC_013124	GACCA	2	10	1288877	1288886	40 %	0 %	20 %	40 %	256372011
1006	NC_013124	GCCGA	2	10	1288910	1288919	20 %	0 %	40 %	40 %	256372011
1007	NC_013124	CGACG	2	10	1289583	1289592	20 %	0 %	40 %	40 %	256372012
1008	NC_013124	GTGGC	2	10	1289593	1289602	0 %	20 %	60 %	20 %	256372012
1009	NC_013124	GCGCC	2	10	1291123	1291132	0 %	0 %	40 %	60 %	256372014
1010	NC_013124	CCGGA	2	10	1292204	1292213	20 %	0 %	40 %	40 %	256372015
1011	NC_013124	GCGAC	2	10	1296000	1296009	20 %	0 %	40 %	40 %	256372021
1012	NC_013124	GCGTC	2	10	1296010	1296019	0 %	20 %	40 %	40 %	256372021
1013	NC_013124	GACCG	2	10	1298372	1298381	20 %	0 %	40 %	40 %	256372023
1014	NC_013124	GTCAC	2	10	1298696	1298705	20 %	20 %	20 %	40 %	256372024
1015	NC_013124	GCGCG	2	10	1300864	1300873	0 %	0 %	60 %	40 %	256372025
1016	NC_013124	CGTGA	2	10	1301757	1301766	20 %	20 %	40 %	20 %	256372026
1017	NC_013124	CCCAT	2	10	1301983	1301992	20 %	20 %	0 %	60 %	256372026
1018	NC_013124	TCCGC	2	10	1302447	1302456	0 %	20 %	20 %	60 %	256372027
1019	NC_013124	CACGA	2	10	1302511	1302520	40 %	0 %	20 %	40 %	256372027
1020	NC_013124	CTCCC	2	10	1305991	1306000	0 %	20 %	0 %	80 %	256372029
1021	NC_013124	CAGCG	2	10	1306135	1306144	20 %	0 %	40 %	40 %	256372030
1022	NC_013124	AGCGC	2	10	1308228	1308237	20 %	0 %	40 %	40 %	256372031
1023	NC_013124	GCCCC	2	10	1308425	1308434	0 %	0 %	20 %	80 %	256372032
1024	NC_013124	ACCGC	2	10	1310351	1310360	20 %	0 %	20 %	60 %	256372034
1025	NC_013124	CACCG	2	10	1315907	1315916	20 %	0 %	20 %	60 %	256372039
1026	NC_013124	GCGAT	2	10	1317508	1317517	20 %	20 %	40 %	20 %	256372041
1027	NC_013124	GGTCG	2	10	1317612	1317621	0 %	20 %	60 %	20 %	256372041
1028	NC_013124	GCCGC	2	10	1317755	1317764	0 %	0 %	40 %	60 %	256372041
1029	NC_013124	AGCGA	2	10	1318128	1318137	40 %	0 %	40 %	20 %	256372041
1030	NC_013124	CGACC	2	10	1318370	1318379	20 %	0 %	20 %	60 %	256372041
1031	NC_013124	TGACC	2	10	1318391	1318400	20 %	20 %	20 %	40 %	256372041
1032	NC_013124	GACCG	2	10	1322695	1322704	20 %	0 %	40 %	40 %	256372043
1033	NC_013124	TCAGC	2	10	1324409	1324418	20 %	20 %	20 %	40 %	256372046
1034	NC_013124	TCGCC	2	10	1327107	1327116	0 %	20 %	20 %	60 %	256372049
1035	NC_013124	GAGCG	2	10	1328287	1328296	20 %	0 %	60 %	20 %	256372051
1036	NC_013124	GCCTC	2	10	1330196	1330205	0 %	20 %	20 %	60 %	256372054
1037	NC_013124	CCGCA	2	10	1330263	1330272	20 %	0 %	20 %	60 %	256372054
1038	NC_013124	CCGTC	2	10	1330361	1330370	0 %	20 %	20 %	60 %	256372054
1039	NC_013124	TCGGC	2	10	1331133	1331142	0 %	20 %	40 %	40 %	256372055
1040	NC_013124	CCGTC	2	10	1331740	1331749	0 %	20 %	20 %	60 %	256372055
1041	NC_013124	CCAGG	2	10	1333151	1333160	20 %	0 %	40 %	40 %	256372057
1042	NC_013124	GCCCT	2	10	1333586	1333595	0 %	20 %	20 %	60 %	256372057
1043	NC_013124	CGGCT	2	10	1334836	1334845	0 %	20 %	40 %	40 %	256372059
1044	NC_013124	ACGCG	2	10	1335398	1335407	20 %	0 %	40 %	40 %	256372059
1045	NC_013124	ACCCG	2	10	1339438	1339447	20 %	0 %	20 %	60 %	256372064
1046	NC_013124	TGCAC	2	10	1339455	1339464	20 %	20 %	20 %	40 %	256372064
1047	NC_013124	ATCGC	2	10	1339599	1339608	20 %	20 %	20 %	40 %	256372064
1048	NC_013124	GGAAA	2	10	1342069	1342078	60 %	0 %	40 %	0 %	256372066
1049	NC_013124	CGCGA	2	10	1343224	1343233	20 %	0 %	40 %	40 %	256372068
1050	NC_013124	ACGAA	2	10	1343754	1343763	60 %	0 %	20 %	20 %	256372069
1051	NC_013124	GCCGC	2	10	1346260	1346269	0 %	0 %	40 %	60 %	256372072
1052	NC_013124	CCTCG	2	10	1346430	1346439	0 %	20 %	20 %	60 %	256372072
1053	NC_013124	CCTCG	2	10	1346472	1346481	0 %	20 %	20 %	60 %	256372072
1054	NC_013124	GCGCT	2	10	1348217	1348226	0 %	20 %	40 %	40 %	256372074
1055	NC_013124	CGGGC	2	10	1349416	1349425	0 %	0 %	60 %	40 %	256372075
1056	NC_013124	GCCGA	2	10	1349864	1349873	20 %	0 %	40 %	40 %	256372075
1057	NC_013124	CCAGC	2	10	1350800	1350809	20 %	0 %	20 %	60 %	256372076
1058	NC_013124	GCCCC	2	10	1350891	1350900	0 %	0 %	20 %	80 %	256372076
1059	NC_013124	GACGC	2	10	1351676	1351685	20 %	0 %	40 %	40 %	256372077
1060	NC_013124	TGGCT	2	10	1352087	1352096	0 %	40 %	40 %	20 %	256372078
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1062	NC_013124	TCGCG	2	10	1353264	1353273	0 %	20 %	40 %	40 %	256372080
1063	NC_013124	CACGG	2	10	1353975	1353984	20 %	0 %	40 %	40 %	256372080
1064	NC_013124	CGCGA	2	10	1354218	1354227	20 %	0 %	40 %	40 %	256372080
1065	NC_013124	ACCGC	2	10	1355010	1355019	20 %	0 %	20 %	60 %	256372081
1066	NC_013124	GACCC	2	10	1355352	1355361	20 %	0 %	20 %	60 %	256372081
1067	NC_013124	TCGGC	2	10	1359668	1359677	0 %	20 %	40 %	40 %	256372086
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1070	NC_013124	GACGA	2	10	1360398	1360407	40 %	0 %	40 %	20 %	256372087
1071	NC_013124	CGACC	2	10	1361269	1361278	20 %	0 %	20 %	60 %	256372088
1072	NC_013124	CGAGG	2	10	1367839	1367848	20 %	0 %	60 %	20 %	256372093
1073	NC_013124	GGACG	2	10	1371729	1371738	20 %	0 %	60 %	20 %	256372096
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1077	NC_013124	CGGTC	2	10	1381900	1381909	0 %	20 %	40 %	40 %	256372103
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1082	NC_013124	CGCGG	2	10	1386845	1386854	0 %	0 %	60 %	40 %	256372107
1083	NC_013124	ACGCG	2	10	1388662	1388671	20 %	0 %	40 %	40 %	256372108
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1085	NC_013124	CCCAA	2	10	1389953	1389962	40 %	0 %	0 %	60 %	256372109
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1087	NC_013124	CCCCG	2	10	1392309	1392318	0 %	0 %	20 %	80 %	256372111
1088	NC_013124	CCCCA	2	10	1392987	1392996	20 %	0 %	0 %	80 %	256372112
1089	NC_013124	GCCCC	2	10	1394937	1394946	0 %	0 %	20 %	80 %	256372114
1090	NC_013124	TCGCT	2	10	1395529	1395538	0 %	40 %	20 %	40 %	256372114
1091	NC_013124	CGCAC	2	10	1396652	1396661	20 %	0 %	20 %	60 %	256372115
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1093	NC_013124	CCTCG	2	10	1399101	1399110	0 %	20 %	20 %	60 %	256372118
1094	NC_013124	ACGCT	2	10	1400398	1400407	20 %	20 %	20 %	40 %	256372119
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1096	NC_013124	CATCG	2	10	1408098	1408107	20 %	20 %	20 %	40 %	256372127
1097	NC_013124	GCCCA	2	10	1408626	1408635	20 %	0 %	20 %	60 %	256372128
1098	NC_013124	GAGCC	2	10	1411677	1411686	20 %	0 %	40 %	40 %	256372132
1099	NC_013124	ACGCC	2	10	1412159	1412168	20 %	0 %	20 %	60 %	256372133
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1101	NC_013124	TCCGC	2	10	1414974	1414983	0 %	20 %	20 %	60 %	256372136
1102	NC_013124	GAAGG	2	10	1416972	1416981	40 %	0 %	60 %	0 %	256372137
1103	NC_013124	CGACG	2	10	1417336	1417345	20 %	0 %	40 %	40 %	256372138
1104	NC_013124	GCCCC	2	10	1418160	1418169	0 %	0 %	20 %	80 %	256372139
1105	NC_013124	GCTCG	2	10	1418584	1418593	0 %	20 %	40 %	40 %	256372139
1106	NC_013124	CGAGG	2	10	1419143	1419152	20 %	0 %	60 %	20 %	256372139
1107	NC_013124	TCGAC	2	10	1423667	1423676	20 %	20 %	20 %	40 %	256372145
1108	NC_013124	CGATC	2	10	1426399	1426408	20 %	20 %	20 %	40 %	256372149
1109	NC_013124	ATCGC	2	10	1427174	1427183	20 %	20 %	20 %	40 %	256372150
1110	NC_013124	CGCTC	2	10	1427313	1427322	0 %	20 %	20 %	60 %	256372150
1111	NC_013124	GTGCC	2	10	1428655	1428664	0 %	20 %	40 %	40 %	256372152
1112	NC_013124	CGCCC	2	10	1437547	1437556	0 %	0 %	20 %	80 %	256372158
1113	NC_013124	CGTGG	2	10	1438140	1438149	0 %	20 %	60 %	20 %	256372158
1114	NC_013124	CGAAC	2	10	1438496	1438505	40 %	0 %	20 %	40 %	256372159
1115	NC_013124	CGCTC	2	10	1439114	1439123	0 %	20 %	20 %	60 %	256372159
1116	NC_013124	CGCTG	2	10	1439444	1439453	0 %	20 %	40 %	40 %	256372159
1117	NC_013124	AGCGC	2	10	1439624	1439633	20 %	0 %	40 %	40 %	256372159
1118	NC_013124	CCCGA	2	10	1441321	1441330	20 %	0 %	20 %	60 %	256372160
1119	NC_013124	CGAGG	2	10	1441546	1441555	20 %	0 %	60 %	20 %	256372160
1120	NC_013124	AGCGA	2	10	1443476	1443485	40 %	0 %	40 %	20 %	256372161
1121	NC_013124	CGTCT	2	10	1447981	1447990	0 %	40 %	20 %	40 %	256372164
1122	NC_013124	GGTTC	2	10	1452700	1452709	0 %	40 %	40 %	20 %	256372166
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1124	NC_013124	TTCGC	2	10	1455817	1455826	0 %	40 %	20 %	40 %	256372169
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1489	NC_013124	ATCGC	2	10	1947170	1947179	20 %	20 %	20 %	40 %	256372622
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1492	NC_013124	GCGCC	2	10	1949339	1949348	0 %	0 %	40 %	60 %	256372624
1493	NC_013124	GGTCC	2	10	1950800	1950809	0 %	20 %	40 %	40 %	256372626
1494	NC_013124	CGTGG	2	10	1950845	1950854	0 %	20 %	60 %	20 %	256372626
1495	NC_013124	CTCGT	2	10	1951341	1951350	0 %	40 %	20 %	40 %	256372626
1496	NC_013124	GATGA	2	10	1955289	1955298	40 %	20 %	40 %	0 %	256372630
1497	NC_013124	TCGGA	2	10	1956836	1956845	20 %	20 %	40 %	20 %	256372631
1498	NC_013124	GCCGC	2	10	1958057	1958066	0 %	0 %	40 %	60 %	256372631
1499	NC_013124	TGCGC	2	10	1961252	1961261	0 %	20 %	40 %	40 %	256372632
1500	NC_013124	CGGAG	2	10	1962222	1962231	20 %	0 %	60 %	20 %	256372633

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