MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011991	AAG	2	6	43108	43113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109151
502	NC_011991	CCA	2	6	43230	43235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109151
503	NC_011991	AGC	2	6	43268	43273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
504	NC_011991	GCC	2	6	43399	43404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
505	NC_011991	CCG	2	6	43425	43430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
506	NC_011991	GAC	2	6	43570	43575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
507	NC_011991	CGC	2	6	43633	43638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
508	NC_011991	GAT	2	6	43698	43703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
509	NC_011991	ACG	2	6	43721	43726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
510	NC_011991	TGA	2	6	43751	43756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
511	NC_011991	GGC	2	6	43816	43821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
512	NC_011991	GCT	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
513	NC_011991	CGC	2	6	43934	43939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
514	NC_011991	AAC	2	6	43988	43993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
515	NC_011991	CCT	2	6	44036	44041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109151
516	NC_011991	GAG	2	6	44077	44082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109151
517	NC_011991	CTT	2	6	44256	44261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109152
518	NC_011991	CAT	2	6	44333	44338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
519	NC_011991	GGC	2	6	44353	44358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109152
520	NC_011991	ATC	2	6	44570	44575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
521	NC_011991	AGG	2	6	44586	44591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109152
522	NC_011991	GCT	2	6	44654	44659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109152
523	NC_011991	CAT	2	6	44690	44695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
524	NC_011991	TGG	2	6	45190	45195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109153
525	NC_011991	TGG	2	6	45203	45208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109153
526	NC_011991	TCG	2	6	45253	45258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
527	NC_011991	ATG	2	6	45261	45266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109153
528	NC_011991	CGC	2	6	45268	45273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109153
529	NC_011991	TCG	2	6	45304	45309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
530	NC_011991	GTC	2	6	45369	45374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
531	NC_011991	TCC	2	6	45432	45437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109153
532	NC_011991	CGA	2	6	45575	45580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109153
533	NC_011991	GGC	2	6	45593	45598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109153
534	NC_011991	CCA	2	6	45599	45604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109153
535	NC_011991	GAC	2	6	45611	45616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109153
536	NC_011991	ACC	2	6	45672	45677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109154
537	NC_011991	TCA	2	6	45691	45696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109154
538	NC_011991	GAC	2	6	45702	45707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109154
539	NC_011991	GGT	2	6	45708	45713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109154
540	NC_011991	GCC	2	6	45852	45857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109154
541	NC_011991	TCT	2	6	46073	46078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109155
542	NC_011991	CAG	2	6	46143	46148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109155
543	NC_011991	GTC	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109155
544	NC_011991	GTC	2	6	46333	46338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109155
545	NC_011991	GCC	2	6	46431	46436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109155
546	NC_011991	CAC	2	6	46448	46453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109155
547	NC_011991	TTG	2	6	46689	46694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109156
548	NC_011991	GGC	2	6	46717	46722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109156
549	NC_011991	CTG	2	6	46780	46785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109156
550	NC_011991	CTT	2	6	46795	46800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109156
551	NC_011991	CCT	2	6	46982	46987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109157
552	NC_011991	CCG	2	6	47023	47028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109157
553	NC_011991	GCC	2	6	47101	47106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109157
554	NC_011991	ATC	2	6	47278	47283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109158
555	NC_011991	CAT	2	6	47329	47334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109158
556	NC_011991	GCC	2	6	47338	47343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
557	NC_011991	GGC	2	6	47366	47371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109158
558	NC_011991	CCG	2	6	47398	47403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
559	NC_011991	CGC	2	6	47419	47424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
560	NC_011991	CGA	2	6	47464	47469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109158
561	NC_011991	TCG	2	6	47553	47558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
562	NC_011991	GAG	2	6	47573	47578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109158
563	NC_011991	TGC	2	6	47643	47648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
564	NC_011991	AGC	3	9	47691	47699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109158
565	NC_011991	GAA	2	6	47761	47766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109158
566	NC_011991	TGG	2	6	47783	47788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109158
567	NC_011991	CGA	2	6	47902	47907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109158
568	NC_011991	ACG	2	6	47921	47926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109158
569	NC_011991	TCG	2	6	47994	47999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
570	NC_011991	GAT	3	9	48188	48196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109158
571	NC_011991	CTG	2	6	48428	48433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
572	NC_011991	AGG	2	6	48717	48722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109158
573	NC_011991	TGA	2	6	48802	48807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109158
574	NC_011991	TGG	2	6	48954	48959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109158
575	NC_011991	ACC	2	6	49168	49173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109159
576	NC_011991	AAG	3	9	49184	49192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109159
577	NC_011991	ACC	2	6	49253	49258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109159
578	NC_011991	ATC	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109159
579	NC_011991	CGG	2	6	49563	49568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109159
580	NC_011991	CTC	2	6	49607	49612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109160
581	NC_011991	GGC	2	6	49701	49706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109160
582	NC_011991	CAT	2	6	49770	49775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109160
583	NC_011991	GCT	2	6	49779	49784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109160
584	NC_011991	CCG	2	6	49851	49856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109160
585	NC_011991	GCG	2	6	49864	49869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109160
586	NC_011991	CGC	2	6	49929	49934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109160
587	NC_011991	GTT	2	6	49997	50002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109160
588	NC_011991	GAA	2	6	50177	50182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109161
589	NC_011991	GGC	2	6	50183	50188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109161
590	NC_011991	GTC	2	6	50219	50224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109161
591	NC_011991	GCG	2	6	50225	50230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109161
592	NC_011991	GCC	2	6	50240	50245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109161
593	NC_011991	TGC	2	6	50282	50287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109161
594	NC_011991	ATG	3	9	50347	50355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109161
595	NC_011991	CTG	2	6	50361	50366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109161
596	NC_011991	GCA	2	6	50652	50657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109162
597	NC_011991	GTG	2	6	50676	50681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109162
598	NC_011991	TGC	2	6	50809	50814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109162
599	NC_011991	CGG	2	6	50824	50829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109162
600	NC_011991	CGC	2	6	50853	50858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109162
601	NC_011991	GGC	2	6	50861	50866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109162
602	NC_011991	CCG	2	6	50981	50986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109162
603	NC_011991	GGA	2	6	51038	51043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109162
604	NC_011991	CGT	2	6	51102	51107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109163
605	NC_011991	GCC	2	6	51160	51165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109163
606	NC_011991	GTC	2	6	51202	51207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109163
607	NC_011991	ATC	2	6	51244	51249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109163
608	NC_011991	CCG	2	6	51254	51259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109163
609	NC_011991	TCG	2	6	51314	51319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109163
610	NC_011991	GCC	2	6	51400	51405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109163
611	NC_011991	GCA	2	6	51517	51522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109163
612	NC_011991	GTC	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109163
613	NC_011991	GCA	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109163
614	NC_011991	ACC	2	6	51781	51786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109164
615	NC_011991	CCT	2	6	51870	51875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109164
616	NC_011991	GAC	2	6	51970	51975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109164
617	NC_011991	TCG	2	6	51993	51998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109164
618	NC_011991	CCT	2	6	52032	52037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109164
619	NC_011991	GAG	2	6	52102	52107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109164
620	NC_011991	CGA	2	6	52188	52193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109164
621	NC_011991	TGC	2	6	52194	52199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109164
622	NC_011991	CGC	2	6	52232	52237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109164
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624	NC_011991	ACG	2	6	53481	53486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109165
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