MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 47618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011989	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147016
2	NC_011989	GCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147016
3	NC_011989	CCG	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147016
4	NC_011989	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147016
5	NC_011989	ATT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147016
6	NC_011989	GAT	2	6	608	613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147016
7	NC_011989	CGT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147016
8	NC_011989	GAA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147016
9	NC_011989	GCG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147016
10	NC_011989	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147017
11	NC_011989	CGC	2	6	1195	1200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147017
12	NC_011989	CGG	2	6	1274	1279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147017
13	NC_011989	GGC	2	6	1423	1428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147017
14	NC_011989	TGG	2	6	1523	1528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147017
15	NC_011989	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147017
16	NC_011989	TCG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147017
17	NC_011989	TCG	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147017
18	NC_011989	TTG	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
19	NC_011989	TTC	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147018
20	NC_011989	GGT	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
21	NC_011989	GGC	2	6	1875	1880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
22	NC_011989	TGG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
23	NC_011989	GGC	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
24	NC_011989	CCA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147018
25	NC_011989	GTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147018
26	NC_011989	GCA	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147018
27	NC_011989	TGT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
28	NC_011989	AGG	2	6	2204	2209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147018
29	NC_011989	CGC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147018
30	NC_011989	TTG	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
31	NC_011989	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147018
32	NC_011989	GAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147018
33	NC_011989	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147018
34	NC_011989	AGC	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147018
35	NC_011989	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147018
36	NC_011989	ACG	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147019
37	NC_011989	ATG	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147019
38	NC_011989	GCG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147019
39	NC_011989	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147019
40	NC_011989	GTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147019
41	NC_011989	GCT	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147019
42	NC_011989	CGG	2	6	2852	2857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147019
43	NC_011989	GTC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147019
44	NC_011989	GAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147019
45	NC_011989	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147020
46	NC_011989	ACC	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147020
47	NC_011989	TCG	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147020
48	NC_011989	GTC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147020
49	NC_011989	GCC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147020
50	NC_011989	GCC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147020
51	NC_011989	GCG	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
52	NC_011989	GAT	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147021
53	NC_011989	CGC	2	6	4180	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147021
54	NC_011989	TCA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147021
55	NC_011989	CGG	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
56	NC_011989	GCG	2	6	4342	4347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147021
57	NC_011989	GAG	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147022
58	NC_011989	GAT	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
59	NC_011989	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
60	NC_011989	TGA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
61	NC_011989	AGC	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147022
62	NC_011989	TGA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147022
63	NC_011989	CCG	2	6	4817	4822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147022
64	NC_011989	GGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147022
65	NC_011989	AGG	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147022
66	NC_011989	TGG	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147023
67	NC_011989	CAG	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147023
68	NC_011989	GTC	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147023
69	NC_011989	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147023
70	NC_011989	AGC	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147023
71	NC_011989	GCG	2	6	5625	5630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147023
72	NC_011989	TGA	2	6	5634	5639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147023
73	NC_011989	GTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147024
74	NC_011989	CGA	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147024
75	NC_011989	GAT	2	6	5947	5952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147024
76	NC_011989	CAC	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147024
77	NC_011989	GCT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147024
78	NC_011989	CTG	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147024
79	NC_011989	ATC	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147024
80	NC_011989	CCG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147024
81	NC_011989	GCG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147024
82	NC_011989	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147024
83	NC_011989	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147024
84	NC_011989	CGC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147024
85	NC_011989	TGG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147024
86	NC_011989	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147024
87	NC_011989	ACC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147025
88	NC_011989	GCC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147025
89	NC_011989	CCG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147025
90	NC_011989	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147025
91	NC_011989	CCA	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147025
92	NC_011989	ATC	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147025
93	NC_011989	TTC	2	6	7499	7504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147025
94	NC_011989	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147025
95	NC_011989	CGG	2	6	7529	7534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147025
96	NC_011989	CAT	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147026
97	NC_011989	GAT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147026
98	NC_011989	AGA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147026
99	NC_011989	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147026
100	NC_011989	AAC	2	6	8127	8132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147027
101	NC_011989	GCC	2	6	8146	8151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
102	NC_011989	GAT	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147027
103	NC_011989	CAT	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147027
104	NC_011989	GTC	2	6	8275	8280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
105	NC_011989	TCA	2	6	8426	8431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147027
106	NC_011989	CGG	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147027
107	NC_011989	CCG	2	6	8550	8555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
108	NC_011989	CTG	2	6	8758	8763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
109	NC_011989	GAA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147027
110	NC_011989	ATG	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147027
111	NC_011989	TGG	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147027
112	NC_011989	CAA	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147027
113	NC_011989	GGC	2	6	8986	8991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147027
114	NC_011989	CCT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147027
115	NC_011989	AAG	2	6	9064	9069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147027
116	NC_011989	TCG	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
117	NC_011989	TCG	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
118	NC_011989	TGG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147027
119	NC_011989	GGT	2	6	9276	9281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147027
120	NC_011989	GCC	2	6	9304	9309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
121	NC_011989	CGC	2	6	9331	9336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
122	NC_011989	TCG	2	6	9419	9424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
123	NC_011989	TGG	2	6	9438	9443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147027
124	NC_011989	TGT	2	6	9536	9541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147027
125	NC_011989	ATC	3	9	9631	9639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147027
126	NC_011989	CTT	3	9	9690	9698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147027
127	NC_011989	GCC	2	6	9747	9752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
128	NC_011989	GAA	2	6	9811	9816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147027
129	NC_011989	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147027
130	NC_011989	GTG	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147027
131	NC_011989	GCC	2	6	9976	9981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147027
132	NC_011989	GTC	2	6	9982	9987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147027
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142	NC_011989	CGG	2	6	10855	10860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147028
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253	NC_011989	CGA	2	6	20454	20459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147037
254	NC_011989	GCC	2	6	20531	20536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147037
255	NC_011989	GCG	2	6	20570	20575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147037
256	NC_011989	CAT	2	6	20583	20588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147037
257	NC_011989	ACG	2	6	20628	20633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147037
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259	NC_011989	TGA	2	6	20705	20710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147037
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375	NC_011989	CAC	2	6	29713	29718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147048
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