MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 47618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011989	CTT	2	6	235046	235051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147222
3002	NC_011989	CAC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147222
3003	NC_011989	CAT	2	6	235100	235105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147222
3004	NC_011989	GGA	2	6	235127	235132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147222
3005	NC_011989	GAA	2	6	235236	235241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147222
3006	NC_011989	CCA	2	6	235297	235302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147222
3007	NC_011989	GTC	2	6	235458	235463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3008	NC_011989	ATC	2	6	235480	235485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147222
3009	NC_011989	CGA	2	6	235562	235567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3010	NC_011989	CGC	2	6	235617	235622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147222
3011	NC_011989	CAG	2	6	235659	235664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3012	NC_011989	GCC	2	6	235671	235676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147222
3013	NC_011989	GAC	2	6	235813	235818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147223
3014	NC_011989	TGT	2	6	235821	235826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147223
3015	NC_011989	ACC	2	6	235853	235858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147223
3016	NC_011989	GCG	2	6	235924	235929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147223
3017	NC_011989	CCG	2	6	235971	235976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147223
3018	NC_011989	GCC	2	6	236099	236104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147223
3019	NC_011989	GAC	2	6	236114	236119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147223
3020	NC_011989	CGG	2	6	236137	236142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147223
3021	NC_011989	CGG	2	6	236215	236220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147223
3022	NC_011989	TGG	2	6	236268	236273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147223
3023	NC_011989	TCG	2	6	236295	236300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147223
3024	NC_011989	GAT	2	6	236341	236346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147223
3025	NC_011989	TGA	2	6	236349	236354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147223
3026	NC_011989	TTC	2	6	236442	236447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147223
3027	NC_011989	GGT	2	6	236542	236547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147224
3028	NC_011989	GGT	2	6	236692	236697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147224
3029	NC_011989	CCG	2	6	236737	236742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147224
3030	NC_011989	CGA	2	6	236842	236847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147224
3031	NC_011989	CTG	2	6	236870	236875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147224
3032	NC_011989	GCC	2	6	236911	236916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147224
3033	NC_011989	CGG	2	6	236929	236934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147224
3034	NC_011989	AGC	3	9	236937	236945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147224
3035	NC_011989	TCA	2	6	236967	236972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147224
3036	NC_011989	CTG	2	6	236987	236992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147224
3037	NC_011989	ACG	2	6	237096	237101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147224
3038	NC_011989	CCA	2	6	237432	237437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147225
3039	NC_011989	CGC	2	6	237457	237462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147225
3040	NC_011989	ATC	2	6	237486	237491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147225
3041	NC_011989	CAT	2	6	237512	237517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147225
3042	NC_011989	ATT	2	6	237537	237542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147225
3043	NC_011989	TTC	2	6	237569	237574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147225
3044	NC_011989	GGC	2	6	237579	237584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147225
3045	NC_011989	GTG	2	6	237596	237601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147225
3046	NC_011989	ATG	2	6	237609	237614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147225
3047	NC_011989	GTC	2	6	237671	237676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147225
3048	NC_011989	CGG	2	6	237724	237729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147225
3049	NC_011989	TGG	2	6	237797	237802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147225
3050	NC_011989	GCA	2	6	237808	237813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147225
3051	NC_011989	CCG	2	6	237855	237860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147225
3052	NC_011989	AAG	2	6	238051	238056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147226
3053	NC_011989	TGC	2	6	238142	238147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147226
3054	NC_011989	AGG	2	6	238202	238207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147226
3055	NC_011989	GAT	2	6	238257	238262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147226
3056	NC_011989	CAG	2	6	238267	238272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147226
3057	NC_011989	ATC	2	6	238328	238333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147226
3058	NC_011989	GGT	2	6	238453	238458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147226
3059	NC_011989	CAG	3	9	238459	238467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147226
3060	NC_011989	TGC	2	6	238508	238513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147226
3061	NC_011989	CGA	2	6	238518	238523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147226
3062	NC_011989	ATC	2	6	238657	238662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147226
3063	NC_011989	GGC	2	6	238668	238673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147226
3064	NC_011989	GGT	2	6	238680	238685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147226
3065	NC_011989	GCC	2	6	238695	238700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147226
3066	NC_011989	TGG	2	6	238829	238834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147226
3067	NC_011989	GAA	2	6	239013	239018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147227
3068	NC_011989	GCT	2	6	239062	239067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147227
3069	NC_011989	GGC	2	6	239104	239109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147227
3070	NC_011989	GAA	2	6	239160	239165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147227
3071	NC_011989	TCT	2	6	239229	239234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147227
3072	NC_011989	TGG	2	6	239366	239371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147227
3073	NC_011989	AAG	2	6	239416	239421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147227
3074	NC_011989	CGG	2	6	239490	239495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147227
3075	NC_011989	GGC	3	9	239533	239541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147227
3076	NC_011989	CAC	2	6	239589	239594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147227
3077	NC_011989	GAC	2	6	239680	239685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147227
3078	NC_011989	TGG	2	6	239687	239692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147227
3079	NC_011989	CGC	2	6	239705	239710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147227
3080	NC_011989	CTC	2	6	239739	239744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147227
3081	NC_011989	ATG	2	6	239782	239787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147227
3082	NC_011989	CGC	2	6	239805	239810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147227
3083	NC_011989	GGC	2	6	239830	239835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147227
3084	NC_011989	CGG	2	6	239907	239912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147227
3085	NC_011989	CGC	2	6	240074	240079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147228
3086	NC_011989	GTT	2	6	240106	240111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147228
3087	NC_011989	TCG	2	6	240195	240200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147228
3088	NC_011989	ATG	3	9	240264	240272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147228
3089	NC_011989	CTA	2	6	240304	240309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147228
3090	NC_011989	GAT	2	6	240349	240354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147228
3091	NC_011989	CTG	2	6	240386	240391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147228
3092	NC_011989	GGC	2	6	240392	240397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147228
3093	NC_011989	GGC	2	6	240424	240429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147228
3094	NC_011989	ATG	2	6	240437	240442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147228
3095	NC_011989	GTG	2	6	240506	240511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147228
3096	NC_011989	GAT	2	6	240559	240564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147228
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3098	NC_011989	GGC	2	6	240662	240667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147228
3099	NC_011989	TCA	2	6	240720	240725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147228
3100	NC_011989	CTG	2	6	240734	240739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147228
3101	NC_011989	CGG	2	6	240784	240789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147228
3102	NC_011989	GGC	2	6	240791	240796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147228
3103	NC_011989	CTG	3	9	240863	240871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147228
3104	NC_011989	CGC	2	6	241000	241005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147229
3105	NC_011989	CCG	2	6	241024	241029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147229
3106	NC_011989	TGG	2	6	241097	241102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147229
3107	NC_011989	ATG	2	6	241295	241300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147229
3108	NC_011989	GCA	2	6	241376	241381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3109	NC_011989	GCT	2	6	241480	241485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3110	NC_011989	GTG	2	6	241502	241507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147229
3111	NC_011989	GGC	2	6	241610	241615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147229
3112	NC_011989	GCA	2	6	241846	241851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3113	NC_011989	TTC	2	6	241997	242002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147229
3114	NC_011989	TTC	2	6	242093	242098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147229
3115	NC_011989	GAC	2	6	242150	242155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3116	NC_011989	AGC	2	6	242157	242162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3117	NC_011989	CGC	2	6	242190	242195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147229
3118	NC_011989	CCA	2	6	242286	242291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147229
3119	NC_011989	GGT	2	6	242312	242317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147229
3120	NC_011989	TGG	2	6	242397	242402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147229
3121	NC_011989	CTG	2	6	242429	242434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147229
3122	NC_011989	CGG	2	6	242449	242454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147229
3123	NC_011989	CCG	2	6	242725	242730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147230
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3125	NC_011989	CTG	2	6	242805	242810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147230
3126	NC_011989	CTG	2	6	243036	243041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147230
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3129	NC_011989	CGG	2	6	243412	243417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147231
3130	NC_011989	ATC	2	6	243456	243461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147231
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3132	NC_011989	ATG	2	6	243525	243530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147231
3133	NC_011989	GTC	2	6	243536	243541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147231
3134	NC_011989	ACC	2	6	243554	243559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147231
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3142	NC_011989	CGG	2	6	244114	244119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147231
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3189	NC_011989	TGA	2	6	247850	247855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147235
3190	NC_011989	CTG	2	6	248053	248058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147235
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3230	NC_011989	CAT	2	6	252459	252464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147239
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3473	NC_011989	CGC	2	6	270228	270233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147254
3474	NC_011989	GCC	2	6	270256	270261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147254
3475	NC_011989	GGC	2	6	270431	270436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147254
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3477	NC_011989	CTG	2	6	270830	270835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147255
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