MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011989	GATTT	2	10	2474452	2474461	20 %	60 %	20 %	0 %	222149187
1502	NC_011989	CGATA	2	10	2475643	2475652	40 %	20 %	20 %	20 %	222149188
1503	NC_011989	AAGCC	2	10	2475712	2475721	40 %	0 %	20 %	40 %	222149188
1504	NC_011989	ATCAA	2	10	2476180	2476189	60 %	20 %	0 %	20 %	222149189
1505	NC_011989	CCCTC	2	10	2476982	2476991	0 %	20 %	0 %	80 %	222149190
1506	NC_011989	GCCGC	2	10	2479890	2479899	0 %	0 %	40 %	60 %	222149192
1507	NC_011989	TCGCC	2	10	2480019	2480028	0 %	20 %	20 %	60 %	222149192
1508	NC_011989	GCTTG	2	10	2480538	2480547	0 %	40 %	40 %	20 %	222149192
1509	NC_011989	TGGCG	2	10	2480957	2480966	0 %	20 %	60 %	20 %	222149192
1510	NC_011989	CCGCC	2	10	2483004	2483013	0 %	0 %	20 %	80 %	222149193
1511	NC_011989	GGTCA	2	10	2484504	2484513	20 %	20 %	40 %	20 %	222149195
1512	NC_011989	CAGCA	2	10	2487404	2487413	40 %	0 %	20 %	40 %	222149198
1513	NC_011989	AAACC	2	10	2490505	2490514	60 %	0 %	0 %	40 %	222149201
1514	NC_011989	GCACC	2	10	2496622	2496631	20 %	0 %	20 %	60 %	222149205
1515	NC_011989	GGATT	2	10	2497779	2497788	20 %	40 %	40 %	0 %	222149205
1516	NC_011989	CGATG	2	10	2497883	2497892	20 %	20 %	40 %	20 %	222149205
1517	NC_011989	GCCGC	2	10	2498337	2498346	0 %	0 %	40 %	60 %	222149205
1518	NC_011989	CGCCA	2	10	2498528	2498537	20 %	0 %	20 %	60 %	222149205
1519	NC_011989	AGCCG	2	10	2500945	2500954	20 %	0 %	40 %	40 %	222149208
1520	NC_011989	CCAAG	2	10	2502307	2502316	40 %	0 %	20 %	40 %	222149208
1521	NC_011989	ACCGT	2	10	2505471	2505480	20 %	20 %	20 %	40 %	222149211
1522	NC_011989	GCCGT	2	10	2508338	2508347	0 %	20 %	40 %	40 %	222149216
1523	NC_011989	GGTTG	2	10	2510165	2510174	0 %	40 %	60 %	0 %	222149218
1524	NC_011989	CGATC	2	10	2510571	2510580	20 %	20 %	20 %	40 %	222149218
1525	NC_011989	CGAGC	2	10	2512043	2512052	20 %	0 %	40 %	40 %	222149219
1526	NC_011989	GATAC	2	10	2514240	2514249	40 %	20 %	20 %	20 %	222149221
1527	NC_011989	TGCTT	2	10	2516457	2516466	0 %	60 %	20 %	20 %	222149223
1528	NC_011989	GCGCG	2	10	2517060	2517069	0 %	0 %	60 %	40 %	222149225
1529	NC_011989	CCGAA	2	10	2519274	2519283	40 %	0 %	20 %	40 %	222149229
1530	NC_011989	TGCCG	2	10	2519335	2519344	0 %	20 %	40 %	40 %	222149229
1531	NC_011989	CGGAT	2	10	2519564	2519573	20 %	20 %	40 %	20 %	222149230
1532	NC_011989	GATCG	2	10	2519704	2519713	20 %	20 %	40 %	20 %	222149230
1533	NC_011989	CCGAG	2	10	2522406	2522415	20 %	0 %	40 %	40 %	222149233
1534	NC_011989	GGCGA	2	10	2524871	2524880	20 %	0 %	60 %	20 %	222149235
1535	NC_011989	CAGGA	2	10	2525655	2525664	40 %	0 %	40 %	20 %	222149235
1536	NC_011989	GCCGC	2	10	2532702	2532711	0 %	0 %	40 %	60 %	222149242
1537	NC_011989	CAAAA	2	10	2532894	2532903	80 %	0 %	0 %	20 %	222149242
1538	NC_011989	ATGGC	2	10	2534930	2534939	20 %	20 %	40 %	20 %	222149244
1539	NC_011989	TGCCG	2	10	2534988	2534997	0 %	20 %	40 %	40 %	222149244
1540	NC_011989	CGGGC	2	10	2535198	2535207	0 %	0 %	60 %	40 %	222149244
1541	NC_011989	TCGGA	2	10	2537805	2537814	20 %	20 %	40 %	20 %	222149245
1542	NC_011989	TAACG	2	10	2541790	2541799	40 %	20 %	20 %	20 %	222149250
1543	NC_011989	CATGC	2	10	2546163	2546172	20 %	20 %	20 %	40 %	222149256
1544	NC_011989	CTGGA	2	10	2551193	2551202	20 %	20 %	40 %	20 %	222149260
1545	NC_011989	CAAAC	2	10	2552933	2552942	60 %	0 %	0 %	40 %	222149263
1546	NC_011989	GACTC	2	10	2554689	2554698	20 %	20 %	20 %	40 %	222149264
1547	NC_011989	CTTTT	2	10	2556733	2556742	0 %	80 %	0 %	20 %	222149265
1548	NC_011989	TTCGA	2	10	2562863	2562872	20 %	40 %	20 %	20 %	222149269
1549	NC_011989	GCAAA	2	10	2564749	2564758	60 %	0 %	20 %	20 %	222149270
1550	NC_011989	GGTCG	2	10	2565798	2565807	0 %	20 %	60 %	20 %	222149271
1551	NC_011989	CGCCA	2	10	2566417	2566426	20 %	0 %	20 %	60 %	222149271
1552	NC_011989	TGCGC	2	10	2566499	2566508	0 %	20 %	40 %	40 %	222149271
1553	NC_011989	GCGCC	2	10	2566917	2566926	0 %	0 %	40 %	60 %	222149271
1554	NC_011989	CCCCG	2	10	2568277	2568286	0 %	0 %	20 %	80 %	222149272
1555	NC_011989	CGCGG	2	10	2569534	2569543	0 %	0 %	60 %	40 %	222149273
1556	NC_011989	CCATG	2	10	2570328	2570337	20 %	20 %	20 %	40 %	222149274
1557	NC_011989	GCCCG	2	10	2570990	2570999	0 %	0 %	40 %	60 %	222149275
1558	NC_011989	CGATC	2	10	2572112	2572121	20 %	20 %	20 %	40 %	222149275
1559	NC_011989	CGGCA	2	10	2572945	2572954	20 %	0 %	40 %	40 %	222149277
1560	NC_011989	CAGCC	2	10	2573033	2573042	20 %	0 %	20 %	60 %	222149277
1561	NC_011989	CGCTG	2	10	2574083	2574092	0 %	20 %	40 %	40 %	222149278
1562	NC_011989	CGGCA	2	10	2574642	2574651	20 %	0 %	40 %	40 %	222149279
1563	NC_011989	CGGCG	2	10	2574659	2574668	0 %	0 %	60 %	40 %	222149279
1564	NC_011989	AAGGC	2	10	2574839	2574848	40 %	0 %	40 %	20 %	222149279
1565	NC_011989	TTGGC	2	10	2575304	2575313	0 %	40 %	40 %	20 %	222149279
1566	NC_011989	CAGGC	2	10	2579069	2579078	20 %	0 %	40 %	40 %	222149282
1567	NC_011989	GGCTG	2	10	2581190	2581199	0 %	20 %	60 %	20 %	222149283
1568	NC_011989	GCCGG	2	10	2581317	2581326	0 %	0 %	60 %	40 %	222149283
1569	NC_011989	CTTCT	2	10	2583003	2583012	0 %	60 %	0 %	40 %	222149284
1570	NC_011989	GCCCG	2	10	2586573	2586582	0 %	0 %	40 %	60 %	222149287
1571	NC_011989	GCCCG	2	10	2589790	2589799	0 %	0 %	40 %	60 %	222149290
1572	NC_011989	AGATC	2	10	2589980	2589989	40 %	20 %	20 %	20 %	222149290
1573	NC_011989	ATCGT	2	10	2590555	2590564	20 %	40 %	20 %	20 %	222149291
1574	NC_011989	CGCGC	2	10	2590974	2590983	0 %	0 %	40 %	60 %	222149291
1575	NC_011989	GTCCG	2	10	2591652	2591661	0 %	20 %	40 %	40 %	222149292
1576	NC_011989	CCATG	2	10	2594337	2594346	20 %	20 %	20 %	40 %	222149294
1577	NC_011989	GCTGG	2	10	2594520	2594529	0 %	20 %	60 %	20 %	222149294
1578	NC_011989	CGCGT	2	10	2598428	2598437	0 %	20 %	40 %	40 %	222149295
1579	NC_011989	CGGAT	2	10	2604333	2604342	20 %	20 %	40 %	20 %	222149301
1580	NC_011989	CACAC	2	10	2606418	2606427	40 %	0 %	0 %	60 %	222149304
1581	NC_011989	GGAAA	2	10	2606440	2606449	60 %	0 %	40 %	0 %	222149304
1582	NC_011989	CCGAT	2	10	2606620	2606629	20 %	20 %	20 %	40 %	222149304
1583	NC_011989	CAGCG	2	10	2609866	2609875	20 %	0 %	40 %	40 %	222149307
1584	NC_011989	CATCG	2	10	2611299	2611308	20 %	20 %	20 %	40 %	222149308
1585	NC_011989	GCCGC	2	10	2613828	2613837	0 %	0 %	40 %	60 %	222149311
1586	NC_011989	GCATC	2	10	2613945	2613954	20 %	20 %	20 %	40 %	222149311
1587	NC_011989	GGTGT	2	10	2613977	2613986	0 %	40 %	60 %	0 %	222149311
1588	NC_011989	GCCTC	2	10	2614932	2614941	0 %	20 %	20 %	60 %	222149312
1589	NC_011989	TCACG	2	10	2616984	2616993	20 %	20 %	20 %	40 %	222149313
1590	NC_011989	TGCAG	2	10	2617326	2617335	20 %	20 %	40 %	20 %	222149314
1591	NC_011989	ATTTC	2	10	2621103	2621112	20 %	60 %	0 %	20 %	222149318
1592	NC_011989	TGACC	2	10	2621517	2621526	20 %	20 %	20 %	40 %	222149319
1593	NC_011989	GGCCT	2	10	2621659	2621668	0 %	20 %	40 %	40 %	222149319
1594	NC_011989	TGATG	2	10	2621685	2621694	20 %	40 %	40 %	0 %	222149319
1595	NC_011989	CCACT	2	10	2624443	2624452	20 %	20 %	0 %	60 %	222149322
1596	NC_011989	TCGGC	2	10	2625077	2625086	0 %	20 %	40 %	40 %	222149323
1597	NC_011989	TCTGG	2	10	2626735	2626744	0 %	40 %	40 %	20 %	222149325
1598	NC_011989	GGCGG	2	10	2628106	2628115	0 %	0 %	80 %	20 %	222149326
1599	NC_011989	TCGCC	2	10	2630279	2630288	0 %	20 %	20 %	60 %	222149328
1600	NC_011989	CCGGA	2	10	2631362	2631371	20 %	0 %	40 %	40 %	222149329
1601	NC_011989	CCGAC	2	10	2639901	2639910	20 %	0 %	20 %	60 %	222149336
1602	NC_011989	CTTTC	2	10	2640029	2640038	0 %	60 %	0 %	40 %	222149336
1603	NC_011989	ACCGA	2	10	2642359	2642368	40 %	0 %	20 %	40 %	222149337
1604	NC_011989	GCGCT	2	10	2643156	2643165	0 %	20 %	40 %	40 %	222149338
1605	NC_011989	CCGCC	2	10	2650925	2650934	0 %	0 %	20 %	80 %	222149348
1606	NC_011989	CGGCG	2	10	2651012	2651021	0 %	0 %	60 %	40 %	222149348
1607	NC_011989	TGCCC	2	10	2653701	2653710	0 %	20 %	20 %	60 %	222149351
1608	NC_011989	GGCCA	2	10	2653961	2653970	20 %	0 %	40 %	40 %	222149351
1609	NC_011989	CCAGT	2	10	2657450	2657459	20 %	20 %	20 %	40 %	222149353
1610	NC_011989	GCCCG	2	10	2667328	2667337	0 %	0 %	40 %	60 %	222149362
1611	NC_011989	CCGGC	2	10	2668863	2668872	0 %	0 %	40 %	60 %	222149364
1612	NC_011989	CGCGC	2	10	2670128	2670137	0 %	0 %	40 %	60 %	222149365
1613	NC_011989	GCCCG	2	10	2670219	2670228	0 %	0 %	40 %	60 %	222149365
1614	NC_011989	CGTGA	2	10	2670435	2670444	20 %	20 %	40 %	20 %	222149365
1615	NC_011989	GCTGG	2	10	2671355	2671364	0 %	20 %	60 %	20 %	222149366
1616	NC_011989	GCCGA	2	10	2672855	2672864	20 %	0 %	40 %	40 %	222149367
1617	NC_011989	GACCG	2	10	2678902	2678911	20 %	0 %	40 %	40 %	222149373
1618	NC_011989	TACGA	2	10	2679665	2679674	40 %	20 %	20 %	20 %	222149374
1619	NC_011989	GGCGC	2	10	2680704	2680713	0 %	0 %	60 %	40 %	222149375
1620	NC_011989	GCGGT	2	10	2680763	2680772	0 %	20 %	60 %	20 %	222149375
1621	NC_011989	CATGA	2	10	2682482	2682491	40 %	20 %	20 %	20 %	222149377
1622	NC_011989	CCCGC	2	10	2683375	2683384	0 %	0 %	20 %	80 %	222149378
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1624	NC_011989	ACCTG	2	10	2688490	2688499	20 %	20 %	20 %	40 %	222149382
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1992	NC_011989	CTGCG	2	10	3242945	3242954	0 %	20 %	40 %	40 %	222149854
1993	NC_011989	GACCA	2	10	3244328	3244337	40 %	0 %	20 %	40 %	222149855
1994	NC_011989	TTGTG	2	10	3247232	3247241	0 %	60 %	40 %	0 %	222149858
1995	NC_011989	CCCGG	2	10	3249477	3249486	0 %	0 %	40 %	60 %	222149860
1996	NC_011989	CGCCA	2	10	3254343	3254352	20 %	0 %	20 %	60 %	222149865
1997	NC_011989	GGCCA	2	10	3255206	3255215	20 %	0 %	40 %	40 %	222149866
1998	NC_011989	GCTGC	2	10	3256739	3256748	0 %	20 %	40 %	40 %	222149867
1999	NC_011989	CAGCC	2	10	3263564	3263573	20 %	0 %	20 %	60 %	222149872
2000	NC_011989	TGCCA	2	10	3264689	3264698	20 %	20 %	20 %	40 %	222149873

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