MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 36066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_009922	TCC	2	6	45650	45655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319100
503	NC_009922	ATA	2	6	45657	45662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319100
504	NC_009922	AAT	2	6	45689	45694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319100
505	NC_009922	CAG	2	6	45793	45798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319100
506	NC_009922	GTG	2	6	45868	45873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319100
507	NC_009922	TGT	2	6	46021	46026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319100
508	NC_009922	ATC	2	6	46332	46337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319100
509	NC_009922	GTG	2	6	46802	46807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319101
510	NC_009922	CAG	2	6	46808	46813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319101
511	NC_009922	ATT	2	6	46899	46904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319101
512	NC_009922	ATT	2	6	46931	46936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319101
513	NC_009922	ATA	2	6	46983	46988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319101
514	NC_009922	GGA	2	6	47017	47022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319101
515	NC_009922	GAA	2	6	47116	47121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319101
516	NC_009922	AGA	2	6	47245	47250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319101
517	NC_009922	TAC	2	6	47269	47274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319101
518	NC_009922	GGA	3	9	47296	47304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319101
519	NC_009922	TCC	2	6	47328	47333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319101
520	NC_009922	GTA	2	6	47345	47350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319101
521	NC_009922	GCA	2	6	47389	47394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319101
522	NC_009922	AAG	2	6	47504	47509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319101
523	NC_009922	GTA	2	6	47686	47691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319102
524	NC_009922	AGA	2	6	47790	47795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319102
525	NC_009922	AGA	2	6	47853	47858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319102
526	NC_009922	TTG	2	6	47888	47893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319102
527	NC_009922	AGA	2	6	47934	47939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319102
528	NC_009922	GAA	2	6	47950	47955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319102
529	NC_009922	GTT	2	6	47956	47961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319102
530	NC_009922	GAA	2	6	48031	48036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319102
531	NC_009922	TAA	2	6	48091	48096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319102
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533	NC_009922	AGT	2	6	48285	48290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319103
534	NC_009922	CAG	2	6	48294	48299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319103
535	NC_009922	TAT	2	6	48350	48355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319103
536	NC_009922	GGA	2	6	48394	48399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319103
537	NC_009922	GTA	2	6	48437	48442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319103
538	NC_009922	ATT	2	6	48520	48525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319103
539	NC_009922	AGA	2	6	48531	48536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319103
540	NC_009922	CTA	2	6	48632	48637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319103
541	NC_009922	AGA	2	6	48708	48713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319103
542	NC_009922	CTT	2	6	48731	48736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319103
543	NC_009922	ATA	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319104
544	NC_009922	GGA	2	6	49167	49172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319104
545	NC_009922	AAG	2	6	49340	49345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319104
546	NC_009922	CAG	3	9	49359	49367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319104
547	NC_009922	ACA	2	6	49399	49404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319104
548	NC_009922	ATG	2	6	49501	49506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319104
549	NC_009922	TAT	2	6	49514	49519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319104
550	NC_009922	CAA	2	6	49539	49544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319104
551	NC_009922	ATC	2	6	55578	55583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319105
552	NC_009922	TTA	2	6	55588	55593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319105
553	NC_009922	TAT	2	6	55691	55696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319105
554	NC_009922	CTT	2	6	55805	55810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319105
555	NC_009922	TGA	2	6	55901	55906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319105
556	NC_009922	GCA	2	6	56820	56825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319106
557	NC_009922	TTG	2	6	56995	57000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319106
558	NC_009922	TGC	2	6	57023	57028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319106
559	NC_009922	GAA	2	6	57049	57054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319106
560	NC_009922	ACC	2	6	57071	57076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319106
561	NC_009922	TTG	2	6	57097	57102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319106
562	NC_009922	ATA	2	6	57244	57249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319106
563	NC_009922	TGA	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319107
564	NC_009922	ACT	2	6	57683	57688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319107
565	NC_009922	TGA	2	6	57713	57718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319107
566	NC_009922	GGT	2	6	57814	57819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319107
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569	NC_009922	ATG	2	6	57986	57991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319107
570	NC_009922	TGA	2	6	58001	58006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319107
571	NC_009922	ACT	2	6	58050	58055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319107
572	NC_009922	GAA	2	6	58069	58074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319107
573	NC_009922	TAA	2	6	58155	58160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319107
574	NC_009922	AGA	2	6	58277	58282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319107
575	NC_009922	TGA	2	6	58332	58337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319107
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578	NC_009922	ATA	2	6	58403	58408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319107
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581	NC_009922	AAG	2	6	58479	58484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319107
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591	NC_009922	TGG	2	6	59844	59849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319108
592	NC_009922	CTG	2	6	59864	59869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319108
593	NC_009922	ACA	2	6	59880	59885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319108
594	NC_009922	TTG	2	6	60065	60070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319108
595	NC_009922	AGA	2	6	60084	60089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319108
596	NC_009922	ATT	2	6	60189	60194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319108
597	NC_009922	AAG	2	6	60287	60292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319108
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599	NC_009922	AAT	2	6	60457	60462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319108
600	NC_009922	TTC	2	6	60463	60468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319108
601	NC_009922	GTT	2	6	60556	60561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319108
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603	NC_009922	TTC	2	6	60604	60609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319108
604	NC_009922	TGA	2	6	60635	60640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319108
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608	NC_009922	AAG	2	6	60947	60952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319108
609	NC_009922	TGT	2	6	61002	61007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319108
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611	NC_009922	TTA	3	9	61082	61090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319108
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613	NC_009922	ATC	2	6	61486	61491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319109
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615	NC_009922	AAC	2	6	61625	61630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319109
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619	NC_009922	TAA	2	6	61836	61841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319109
620	NC_009922	TGG	2	6	62337	62342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319110
621	NC_009922	AAG	2	6	62360	62365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319110
622	NC_009922	CAT	2	6	62548	62553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319110
623	NC_009922	AAG	2	6	62574	62579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319110
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1000	NC_009922	AAG	2	6	106288	106293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319139

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