MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 57287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	GTA	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
2	NC_009633	AGA	2	6	335	340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387854
3	NC_009633	TGA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
4	NC_009633	TGA	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387854
5	NC_009633	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387854
6	NC_009633	TAA	2	6	769	774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387854
7	NC_009633	AGA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387854
8	NC_009633	CCT	2	6	875	880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150387854
9	NC_009633	TTG	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387854
10	NC_009633	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387854
11	NC_009633	TAA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387854
12	NC_009633	GGT	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150387854
13	NC_009633	CGA	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387854
14	NC_009633	TTG	4	12	1825	1836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
15	NC_009633	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387855
16	NC_009633	TAG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
17	NC_009633	ATT	2	6	2024	2029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387855
18	NC_009633	GAT	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
19	NC_009633	GTT	3	9	2199	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
20	NC_009633	GAA	3	9	2253	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387855
21	NC_009633	AAT	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387855
22	NC_009633	CTG	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387855
23	NC_009633	TTA	2	6	2439	2444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387855
24	NC_009633	TGT	2	6	2477	2482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387855
25	NC_009633	ATG	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
26	NC_009633	GAT	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387855
27	NC_009633	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387855
28	NC_009633	AAG	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387856
29	NC_009633	TAG	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387856
30	NC_009633	TTG	2	6	2991	2996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387856
31	NC_009633	ATT	2	6	2998	3003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387856
32	NC_009633	TGA	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387856
33	NC_009633	ATA	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
34	NC_009633	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
35	NC_009633	ATA	2	6	3356	3361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
36	NC_009633	AGA	2	6	3389	3394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387857
37	NC_009633	CTT	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387857
38	NC_009633	ATT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
39	NC_009633	ATA	2	6	3575	3580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
40	NC_009633	ATT	2	6	3682	3687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387857
41	NC_009633	GAA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387857
42	NC_009633	TGA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387857
43	NC_009633	CAG	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387857
44	NC_009633	TAA	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387857
45	NC_009633	TGA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387857
46	NC_009633	ACA	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387857
47	NC_009633	TTC	2	6	4314	4319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387858
48	NC_009633	AGG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387858
49	NC_009633	GAA	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387858
50	NC_009633	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387859
51	NC_009633	GTT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
52	NC_009633	GGA	4	12	4970	4981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387859
53	NC_009633	TGT	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
54	NC_009633	AAG	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
55	NC_009633	AGA	3	9	5281	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
56	NC_009633	ATG	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387859
57	NC_009633	GTT	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
58	NC_009633	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387859
59	NC_009633	TTG	2	6	5703	5708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387859
60	NC_009633	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387859
61	NC_009633	AGA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
62	NC_009633	CTG	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387859
63	NC_009633	ATT	3	9	6181	6189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387859
64	NC_009633	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150387859
65	NC_009633	AAC	2	6	6387	6392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387859
66	NC_009633	GAT	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387859
67	NC_009633	AAG	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387859
68	NC_009633	GAT	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
69	NC_009633	ATA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
70	NC_009633	ATT	2	6	6643	6648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
71	NC_009633	AGA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
72	NC_009633	TCG	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387860
73	NC_009633	CTG	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387860
74	NC_009633	ATG	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
75	NC_009633	TAG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
76	NC_009633	GCT	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387860
77	NC_009633	GAT	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
78	NC_009633	CGA	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387860
79	NC_009633	CTG	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150387860
80	NC_009633	CTA	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387860
81	NC_009633	TGT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387860
82	NC_009633	TGA	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
83	NC_009633	AGA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
84	NC_009633	TGG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150387860
85	NC_009633	TAT	2	6	7238	7243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
86	NC_009633	ACA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387860
87	NC_009633	AGA	2	6	7319	7324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
88	NC_009633	ACA	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387860
89	NC_009633	ATT	2	6	7347	7352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
90	NC_009633	TGT	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387860
91	NC_009633	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
92	NC_009633	AGA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
93	NC_009633	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
94	NC_009633	ATC	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387860
95	NC_009633	AGA	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
96	NC_009633	TTA	2	6	7750	7755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
97	NC_009633	ATA	2	6	7774	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
98	NC_009633	GAA	3	9	7893	7901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
99	NC_009633	TAA	2	6	7912	7917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
100	NC_009633	ATT	2	6	7920	7925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
101	NC_009633	CTT	2	6	7962	7967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387860
102	NC_009633	ATT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
103	NC_009633	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
104	NC_009633	AGA	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
105	NC_009633	TGA	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
106	NC_009633	TGT	2	6	8084	8089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387860
107	NC_009633	AAC	2	6	8180	8185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387860
108	NC_009633	TTG	2	6	8200	8205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387860
109	NC_009633	CTT	2	6	8238	8243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387860
110	NC_009633	TTC	2	6	8244	8249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387860
111	NC_009633	AGA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
112	NC_009633	TTG	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387860
113	NC_009633	ATT	2	6	8430	8435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387860
114	NC_009633	ATA	2	6	8461	8466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
115	NC_009633	GAT	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
116	NC_009633	CAA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387860
117	NC_009633	AGA	2	6	8591	8596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
118	NC_009633	AGA	2	6	8684	8689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
119	NC_009633	TAA	2	6	8690	8695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
120	NC_009633	GGT	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150387860
121	NC_009633	TAC	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387860
122	NC_009633	TGA	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387860
123	NC_009633	GAA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
124	NC_009633	TAA	2	6	9004	9009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387860
125	NC_009633	GAA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
126	NC_009633	GAA	2	6	9036	9041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
127	NC_009633	GAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
128	NC_009633	GAA	2	6	9060	9065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387860
129	NC_009633	TAA	2	6	9347	9352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387861
130	NC_009633	ATG	2	6	9361	9366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387861
131	NC_009633	TTA	2	6	9439	9444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387861
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