MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 57287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009633	TAT	2	6	437148	437153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388253
5002	NC_009633	GGA	2	6	437177	437182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388253
5003	NC_009633	AAG	2	6	437192	437197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388253
5004	NC_009633	AAT	2	6	437238	437243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388253
5005	NC_009633	AGA	2	6	437396	437401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388253
5006	NC_009633	ATG	3	9	437470	437478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388253
5007	NC_009633	AGC	2	6	437627	437632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388254
5008	NC_009633	TCA	2	6	437657	437662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388254
5009	NC_009633	AGT	2	6	437666	437671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388254
5010	NC_009633	GAT	2	6	437737	437742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388254
5011	NC_009633	ATT	2	6	438155	438160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388254
5012	NC_009633	CAA	2	6	438168	438173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388254
5013	NC_009633	AGA	2	6	438400	438405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388254
5014	NC_009633	CTG	2	6	438480	438485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388254
5015	NC_009633	AAG	2	6	438588	438593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388254
5016	NC_009633	TGC	2	6	438959	438964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388255
5017	NC_009633	ATT	2	6	438970	438975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388255
5018	NC_009633	TTA	2	6	438993	438998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388255
5019	NC_009633	TAG	2	6	439001	439006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388255
5020	NC_009633	AGA	2	6	439036	439041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388255
5021	NC_009633	ATA	2	6	439048	439053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388255
5022	NC_009633	ATG	2	6	439060	439065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388255
5023	NC_009633	TGA	2	6	439151	439156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388255
5024	NC_009633	ACA	2	6	439204	439209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388255
5025	NC_009633	CAG	2	6	439294	439299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388255
5026	NC_009633	CAA	2	6	439301	439306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388255
5027	NC_009633	ATA	2	6	439348	439353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388255
5028	NC_009633	AGG	2	6	439423	439428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388255
5029	NC_009633	TAA	2	6	439499	439504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388255
5030	NC_009633	ATG	2	6	439756	439761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5031	NC_009633	AAG	2	6	439763	439768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388256
5032	NC_009633	GCA	2	6	439798	439803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388256
5033	NC_009633	AGT	2	6	439887	439892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5034	NC_009633	AAC	2	6	439895	439900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388256
5035	NC_009633	GCG	2	6	440120	440125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388256
5036	NC_009633	AGA	2	6	440149	440154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388256
5037	NC_009633	TGA	2	6	440229	440234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5038	NC_009633	TGA	2	6	440265	440270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5039	NC_009633	CAA	2	6	440357	440362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388256
5040	NC_009633	TGA	2	6	440388	440393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5041	NC_009633	AAG	2	6	440452	440457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388256
5042	NC_009633	AGA	2	6	440465	440470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388256
5043	NC_009633	AGT	2	6	440538	440543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5044	NC_009633	ATT	2	6	440557	440562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388256
5045	NC_009633	AAG	2	6	440590	440595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388256
5046	NC_009633	TTG	2	6	440696	440701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388256
5047	NC_009633	CAA	2	6	440739	440744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388256
5048	NC_009633	ATG	2	6	440759	440764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388256
5049	NC_009633	AAT	2	6	440835	440840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388257
5050	NC_009633	GCT	2	6	440863	440868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5051	NC_009633	GAA	2	6	440879	440884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388257
5052	NC_009633	GCA	2	6	440923	440928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5053	NC_009633	CTG	2	6	441134	441139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5054	NC_009633	CTG	2	6	441143	441148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5055	NC_009633	GCT	2	6	441169	441174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5056	NC_009633	AGA	2	6	441180	441185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388257
5057	NC_009633	CTG	2	6	441197	441202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5058	NC_009633	GCT	2	6	441274	441279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388257
5059	NC_009633	TAC	2	6	441315	441320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388257
5060	NC_009633	AGT	2	6	441324	441329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388257
5061	NC_009633	GAA	3	9	441446	441454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388258
5062	NC_009633	TGA	2	6	441487	441492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388258
5063	NC_009633	AGA	2	6	441533	441538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388258
5064	NC_009633	GAT	2	6	441572	441577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388258
5065	NC_009633	AGT	2	6	441628	441633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388258
5066	NC_009633	AAG	2	6	441718	441723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388258
5067	NC_009633	ATT	2	6	441878	441883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388258
5068	NC_009633	TTA	2	6	441944	441949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388258
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5070	NC_009633	TTC	2	6	442087	442092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388258
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5077	NC_009633	GTG	2	6	442614	442619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388259
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5084	NC_009633	TGC	2	6	443088	443093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388261
5085	NC_009633	CTG	3	9	443156	443164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388261
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5087	NC_009633	GAT	2	6	443188	443193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388261
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5089	NC_009633	CAA	2	6	443496	443501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388261
5090	NC_009633	ATG	2	6	443571	443576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388261
5091	NC_009633	AAT	2	6	443588	443593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388262
5092	NC_009633	CAA	2	6	443622	443627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388262
5093	NC_009633	TAC	2	6	443747	443752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388262
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5100	NC_009633	CGG	2	6	444195	444200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388263
5101	NC_009633	AAG	2	6	444201	444206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388263
5102	NC_009633	CTA	2	6	444297	444302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388263
5103	NC_009633	TGA	2	6	444321	444326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388263
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5106	NC_009633	ATC	2	6	444542	444547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388264
5107	NC_009633	GAT	2	6	444601	444606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388264
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5109	NC_009633	TAC	2	6	444837	444842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388264
5110	NC_009633	ACA	2	6	444886	444891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388264
5111	NC_009633	ACA	2	6	445105	445110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388264
5112	NC_009633	TTC	2	6	445144	445149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388264
5113	NC_009633	GAA	3	9	445165	445173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388264
5114	NC_009633	GAT	4	12	445294	445305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388264
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