MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009633	CTTGTG	2	12	2882722	2882733	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150390630
1002	NC_009633	CCAATA	2	12	2885085	2885096	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390632
1003	NC_009633	TCCTGT	2	12	2886248	2886259	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150390633
1004	NC_009633	CCAAAT	2	12	2887807	2887818	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390635
1005	NC_009633	CCCTTC	2	12	2888524	2888535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150390636
1006	NC_009633	TAATCT	2	12	2890432	2890443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390638
1007	NC_009633	CCAATA	2	12	2892905	2892916	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390640
1008	NC_009633	TCGATC	2	12	2897212	2897223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390644
1009	NC_009633	AAACCA	2	12	2899493	2899504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150390645
1010	NC_009633	TTCTAC	2	12	2900910	2900921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390646
1011	NC_009633	TCTTCC	2	12	2908064	2908075	0 %	50 %	0 %	50 %	150390654
1012	NC_009633	ATATGT	2	12	2911240	2911251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150390658
1013	NC_009633	CTGCCA	2	12	2913665	2913676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150390660
1014	NC_009633	TCTAAA	2	12	2915553	2915564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150390663
1015	NC_009633	ATCTAC	2	12	2916800	2916811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150390665
1016	NC_009633	TAATCA	2	12	2918031	2918042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150390666
1017	NC_009633	GCAATG	2	12	2918162	2918173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150390666
1018	NC_009633	TTAAAA	2	12	2919450	2919461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150390667
1019	NC_009633	TTGATT	2	12	2921148	2921159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150390669
1020	NC_009633	GCCTAA	2	12	2925288	2925299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150390673
1021	NC_009633	TTCTCT	2	12	2925444	2925455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150390673
1022	NC_009633	TTAAAG	2	12	2927836	2927847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150390675
1023	NC_009633	TTTTAA	2	12	2928092	2928103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150390675
1024	NC_009633	GTTTAT	2	12	2930479	2930490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150390677
1025	NC_009633	TGCCTT	2	12	2935865	2935876	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150390681
1026	NC_009633	TCAATA	2	12	2936867	2936878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150390682
1027	NC_009633	GGGCAA	2	12	2942749	2942760	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150390686
1028	NC_009633	TAAGAA	2	12	2943604	2943615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150390686
1029	NC_009633	TATTTG	2	12	2953273	2953284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150390695
1030	NC_009633	TGCCTC	2	12	2953871	2953882	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150390695
1031	NC_009633	TATTTC	2	12	2954521	2954532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150390696
1032	NC_009633	ACCTCC	2	12	2954834	2954845	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	150390696
1033	NC_009633	CCGATT	2	12	2955625	2955636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390697
1034	NC_009633	GATACT	2	12	2956201	2956212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390697
1035	NC_009633	AACATG	2	12	2958219	2958230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150390699
1036	NC_009633	GTTGCA	2	12	2961797	2961808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150390702
1037	NC_009633	TTCATT	2	12	2971475	2971486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150390706
1038	NC_009633	CTATTA	2	12	2972390	2972401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390707
1039	NC_009633	ATAATC	2	12	2978349	2978360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150390711
1040	NC_009633	GATGGC	2	12	2992777	2992788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150390723
1041	NC_009633	TATCTA	2	12	2993148	2993159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390723
1042	NC_009633	TACTGC	2	12	2994351	2994362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390724
1043	NC_009633	CCCATT	2	12	2994631	2994642	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150390724
1044	NC_009633	CCTTAT	2	12	2996638	2996649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390725
1045	NC_009633	CTGTGG	2	12	2997345	2997356	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150390726
1046	NC_009633	TTCCCG	2	12	3009559	3009570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150390737
1047	NC_009633	CTTTTC	2	12	3009683	3009694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150390737
1048	NC_009633	GGATTA	2	12	3014222	3014233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150390741
1049	NC_009633	AATCCC	2	12	3019539	3019550	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150390743
1050	NC_009633	TATTTA	2	12	3023506	3023517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150390748
1051	NC_009633	GTTTTT	2	12	3023570	3023581	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150390748
1052	NC_009633	CGATCT	2	12	3026359	3026370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390750
1053	NC_009633	TGCTAA	2	12	3029370	3029381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390753
1054	NC_009633	TTTCAG	2	12	3031566	3031577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150390754
1055	NC_009633	AAATAA	2	12	3032753	3032764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150390755
1056	NC_009633	TTGCAT	2	12	3032861	3032872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150390755
1057	NC_009633	GCTGAA	2	12	3034335	3034346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150390756
1058	NC_009633	GTATCT	2	12	3034836	3034847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150390756
1059	NC_009633	TCTAGA	2	12	3035705	3035716	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390757
1060	NC_009633	ATTTTA	2	12	3036839	3036850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150390757
1061	NC_009633	GTAATA	2	12	3040535	3040546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150390760
1062	NC_009633	ACTAAA	2	12	3048694	3048705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150390766
1063	NC_009633	CATACT	2	12	3050180	3050191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150390767
1064	NC_009633	AGCGGC	2	12	3052697	3052708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	150390769
1065	NC_009633	TATCTC	2	12	3055481	3055492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390772
1066	NC_009633	CATCTC	2	12	3057488	3057499	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150390773
1067	NC_009633	ACCACT	2	12	3061069	3061080	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150390778
1068	NC_009633	CCTCTT	2	12	3061118	3061129	0 %	50 %	0 %	50 %	150390778
1069	NC_009633	GGCCAT	2	12	3064089	3064100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150390782
1070	NC_009633	ACTTCT	5	30	3064918	3064947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390782
1071	NC_009633	TTCAAT	2	12	3066412	3066423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390784
1072	NC_009633	TAATTC	2	12	3067725	3067736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390785
1073	NC_009633	CTTCAA	2	12	3069697	3069708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150390788
1074	NC_009633	TCTTGT	2	12	3072961	3072972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150390790
1075	NC_009633	TCAGCT	2	12	3074224	3074235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390790
1076	NC_009633	CCACAA	2	12	3076988	3076999	50 %	0 %	0 %	50 %	150390794
1077	NC_009633	AGTTCC	2	12	3078454	3078465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390796
1078	NC_009633	CTTTCC	2	12	3079631	3079642	0 %	50 %	0 %	50 %	150390797
1079	NC_009633	CTTTTC	2	12	3082583	3082594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150390799
1080	NC_009633	CTAGTT	2	12	3084685	3084696	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150390801
1081	NC_009633	TTTTTC	2	12	3087687	3087698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150390803
1082	NC_009633	AGATAA	2	12	3092276	3092287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150390808
1083	NC_009633	TACCCA	2	12	3092382	3092393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150390808
1084	NC_009633	ACAAAA	2	12	3093069	3093080	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150390808
1085	NC_009633	TATTTT	2	12	3101579	3101590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150390816
1086	NC_009633	ATATTC	2	12	3101639	3101650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390816
1087	NC_009633	AGAAAA	2	12	3101987	3101998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150390817
1088	NC_009633	AAAGAT	2	12	3102076	3102087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150390817
1089	NC_009633	TATAGC	2	12	3110674	3110685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390824
1090	NC_009633	GAGGCT	2	12	3115053	3115064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150390828
1091	NC_009633	AGCACC	2	12	3122552	3122563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	150390834
1092	NC_009633	CCATAA	2	12	3124616	3124627	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390836
1093	NC_009633	ATCTAT	2	12	3125748	3125759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390836
1094	NC_009633	CTTGAA	2	12	3126454	3126465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390837
1095	NC_009633	ACCTAA	2	12	3126590	3126601	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390837
1096	NC_009633	ATCAAC	2	12	3129892	3129903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390841
1097	NC_009633	TTTTTG	2	12	3130132	3130143	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150390841
1098	NC_009633	AAGAGG	2	12	3132772	3132783	50 %	0 %	50 %	0 %	150390845
1099	NC_009633	AGCAGG	2	12	3133108	3133119	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150390845
1100	NC_009633	TTACCT	2	12	3134507	3134518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390846
1101	NC_009633	CAGAAG	2	12	3135204	3135215	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150390846
1102	NC_009633	TGGCTT	2	12	3137533	3137544	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150390846
1103	NC_009633	ATTCTC	2	12	3138152	3138163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150390848
1104	NC_009633	TTGGTT	2	12	3145256	3145267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150390856
1105	NC_009633	TTCATT	2	12	3146299	3146310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150390856
1106	NC_009633	CATCGG	2	12	3148248	3148259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150390857
1107	NC_009633	CCATAC	2	12	3157140	3157151	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150390864
1108	NC_009633	AAATCT	2	12	3157219	3157230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150390864
1109	NC_009633	CCAAAT	2	12	3158434	3158445	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150390864
1110	NC_009633	TCCATG	2	12	3161449	3161460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150390866
1111	NC_009633	TATCTA	2	12	3162658	3162669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390868
1112	NC_009633	TGTTTA	2	12	3162738	3162749	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150390868
1113	NC_009633	GTACAT	2	12	3163816	3163827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390869
1114	NC_009633	TCTGCT	2	12	3171780	3171791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150390875
1115	NC_009633	TTAACT	2	12	3172372	3172383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150390875
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1124	NC_009633	CTTCTC	2	12	3193689	3193700	0 %	50 %	0 %	50 %	150390898
1125	NC_009633	TTTCTA	2	12	3195218	3195229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150390900
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1129	NC_009633	TCCGTT	2	12	3200808	3200819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150390906
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1131	NC_009633	CTTGAT	2	12	3208370	3208381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150390911
1132	NC_009633	TATCGA	2	12	3209960	3209971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150390913
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1139	NC_009633	TTTCAT	2	12	3231422	3231433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150390929
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1216	NC_009633	TGGTCT	2	12	3490632	3490643	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150391159
1217	NC_009633	GCTTCT	2	12	3490942	3490953	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150391159
1218	NC_009633	TATCAC	2	12	3502036	3502047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150391167
1219	NC_009633	TGTACC	2	12	3509639	3509650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150391175
1220	NC_009633	TAAAGT	2	12	3509848	3509859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150391175
1221	NC_009633	TTAAAT	2	12	3511450	3511461	50 %	50 %	0 %	0 %	150391176
1222	NC_009633	TCCTGG	2	12	3512678	3512689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150391177
1223	NC_009633	AAATTG	2	12	3512998	3513009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150391177
1224	NC_009633	ATTTTT	2	12	3513869	3513880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150391179
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1226	NC_009633	ATCCAG	2	12	3515406	3515417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150391180
1227	NC_009633	CATTTC	2	12	3520914	3520925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150391186
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1317	NC_009633	CAAGTC	2	12	3766532	3766543	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150391399
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1319	NC_009633	TTCCTT	2	12	3770299	3770310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150391401
1320	NC_009633	CATCTG	2	12	3770882	3770893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150391402
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1322	NC_009633	TAATCC	2	12	3776573	3776584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150391408
1323	NC_009633	CTGCTC	2	12	3781878	3781889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150391414
1324	NC_009633	ATTAAG	2	12	3792063	3792074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150391425
1325	NC_009633	TTTTCA	2	12	3792283	3792294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150391425
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1431	NC_009633	TGTTCT	2	12	4164048	4164059	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150391764
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1437	NC_009633	TCTTGG	2	12	4194620	4194631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150391791
1438	NC_009633	GACAAT	2	12	4195352	4195363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150391791
1439	NC_009633	CCTATT	2	12	4198008	4198019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150391794
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