MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009633	TCGATG	2	12	1373934	1373945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150389133
502	NC_009633	GATATG	2	12	1374219	1374230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150389133
503	NC_009633	TTTCTT	2	12	1379095	1379106	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150389138
504	NC_009633	TTTACT	2	12	1380083	1380094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150389139
505	NC_009633	ATTAAG	2	12	1380986	1380997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389140
506	NC_009633	TGCCAG	2	12	1382930	1382941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150389142
507	NC_009633	GATATT	2	12	1383543	1383554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389142
508	NC_009633	GAATTT	2	12	1386699	1386710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389145
509	NC_009633	TAAAAA	2	12	1388983	1388994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150389147
510	NC_009633	CCCCTG	2	12	1394028	1394039	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	150389152
511	NC_009633	AGGTAG	2	12	1394466	1394477	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150389152
512	NC_009633	TGGGAA	2	12	1394964	1394975	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150389152
513	NC_009633	CTACAG	2	12	1396218	1396229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150389152
514	NC_009633	AATTAG	2	12	1407120	1407131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389162
515	NC_009633	AGAAAA	2	12	1408650	1408661	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389163
516	NC_009633	GATTTG	2	12	1411023	1411034	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389164
517	NC_009633	GTCATG	2	12	1415446	1415457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150389168
518	NC_009633	ATTTCA	2	12	1423828	1423839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150389175
519	NC_009633	GCTTTA	2	12	1426167	1426178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150389176
520	NC_009633	AGGAAA	2	12	1429465	1429476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150389179
521	NC_009633	CGGATG	2	12	1432996	1433007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150389183
522	NC_009633	TGATTG	2	12	1434562	1434573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389185
523	NC_009633	GGCAGA	2	12	1437853	1437864	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150389187
524	NC_009633	CCTCAT	2	12	1442480	1442491	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150389192
525	NC_009633	GGAGGG	2	12	1442791	1442802	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	150389192
526	NC_009633	AGTCAG	2	12	1442864	1442875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389192
527	NC_009633	TTTCAA	2	12	1443777	1443788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150389193
528	NC_009633	GCTTAA	2	12	1444936	1444947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150389193
529	NC_009633	TTTGAA	2	12	1445125	1445136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389193
530	NC_009633	TCCGGA	2	12	1445376	1445387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150389194
531	NC_009633	CATTAC	2	12	1448097	1448108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150389197
532	NC_009633	CACAAC	2	12	1450026	1450037	50 %	0 %	0 %	50 %	150389200
533	NC_009633	CAATAG	2	12	1450390	1450401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150389201
534	NC_009633	AGCTGA	2	12	1454095	1454106	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389204
535	NC_009633	TAGACA	2	12	1458903	1458914	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150389208
536	NC_009633	AGAAAA	2	12	1463455	1463466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389212
537	NC_009633	AGAAAA	2	12	1463557	1463568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389212
538	NC_009633	AGAATT	2	12	1464091	1464102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389213
539	NC_009633	ATTATC	2	12	1465937	1465948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150389214
540	NC_009633	AGTGGA	2	12	1466130	1466141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150389214
541	NC_009633	CTAAAA	2	12	1466746	1466757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150389215
542	NC_009633	CGATAG	2	12	1467125	1467136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389215
543	NC_009633	CAAAGA	2	12	1471769	1471780	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150389220
544	NC_009633	TAAAAA	2	12	1476391	1476402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150389223
545	NC_009633	TTAAAT	2	12	1484790	1484801	50 %	50 %	0 %	0 %	150389233
546	NC_009633	AATTAT	2	12	1486725	1486736	50 %	50 %	0 %	0 %	150389235
547	NC_009633	AGGTGG	2	12	1494429	1494440	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	150389246
548	NC_009633	TGGATT	2	12	1496214	1496225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389248
549	NC_009633	AATATA	2	12	1498389	1498400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150389251
550	NC_009633	AAGGAT	2	12	1499962	1499973	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150389252
551	NC_009633	GAACAA	2	12	1500540	1500551	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150389253
552	NC_009633	ATGAAA	2	12	1502280	1502291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150389254
553	NC_009633	ATGGAA	2	12	1503283	1503294	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150389255
554	NC_009633	ATTATG	2	12	1509601	1509612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389258
555	NC_009633	CAAGTG	2	12	1510676	1510687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389258
556	NC_009633	AACATC	2	12	1526209	1526220	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150389276
557	NC_009633	GATTTT	2	12	1526712	1526723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150389277
558	NC_009633	TTTTCA	2	12	1533964	1533975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150389282
559	NC_009633	TGATTG	2	12	1540232	1540243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389286
560	NC_009633	AATGCC	2	12	1540377	1540388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150389286
561	NC_009633	GATTTT	2	12	1543866	1543877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150389290
562	NC_009633	ATGGGT	2	12	1550658	1550669	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150389297
563	NC_009633	CAAAAA	2	12	1554806	1554817	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150389300
564	NC_009633	GAAAGA	2	12	1555242	1555253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150389300
565	NC_009633	GCCATT	2	12	1557634	1557645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150389302
566	NC_009633	TTCCAA	2	12	1560737	1560748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150389304
567	NC_009633	ATCCAA	2	12	1561523	1561534	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150389304
568	NC_009633	GTTATG	2	12	1564368	1564379	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389307
569	NC_009633	GAGCTA	2	12	1566555	1566566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389310
570	NC_009633	GGCATT	2	12	1568521	1568532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150389311
571	NC_009633	ATATTG	2	12	1570411	1570422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389314
572	NC_009633	AAAGAA	2	12	1572108	1572119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389316
573	NC_009633	GAAATT	2	12	1572444	1572455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389316
574	NC_009633	CAAAGG	2	12	1574279	1574290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150389317
575	NC_009633	TAAATG	2	12	1577918	1577929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389320
576	NC_009633	ATGAAA	2	12	1578074	1578085	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150389320
577	NC_009633	GATATA	2	12	1580920	1580931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389322
578	NC_009633	GTTCTG	2	12	1580966	1580977	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	150389322
579	NC_009633	CAGGTA	2	12	1581823	1581834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389322
580	NC_009633	GTAAGT	2	12	1582820	1582831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150389323
581	NC_009633	GGATAT	2	12	1585233	1585244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150389325
582	NC_009633	CCTTGA	2	12	1586363	1586374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150389325
583	NC_009633	CATCAG	2	12	1586970	1586981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150389325
584	NC_009633	AGGCGC	2	12	1587914	1587925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	150389325
585	NC_009633	AAAGGA	2	12	1592216	1592227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150389327
586	NC_009633	TCCTTA	2	12	1598768	1598779	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150389332
587	NC_009633	AGGTGA	2	12	1602704	1602715	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150389334
588	NC_009633	GTCACC	2	12	1603848	1603859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150389334
589	NC_009633	AATGGC	2	12	1605006	1605017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389334
590	NC_009633	AACAGT	2	12	1607318	1607329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150389334
591	NC_009633	ACCTAC	2	12	1608065	1608076	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150389334
592	NC_009633	TGAAAT	2	12	1608464	1608475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389334
593	NC_009633	TTTAGG	2	12	1611206	1611217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389335
594	NC_009633	ATTGGT	2	12	1623553	1623564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150389345
595	NC_009633	CTTCAT	2	12	1624134	1624145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150389345
596	NC_009633	TATCAT	2	12	1632146	1632157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150389351
597	NC_009633	AGAAAA	2	12	1635142	1635153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389355
598	NC_009633	TTATAG	2	12	1640403	1640414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389358
599	NC_009633	AGAAAA	2	12	1648548	1648559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150389363
600	NC_009633	ATGAAG	2	12	1650025	1650036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150389364
601	NC_009633	CCAGTG	2	12	1651144	1651155	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150389364
602	NC_009633	ACCTAA	2	12	1657373	1657384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150389371
603	NC_009633	GATGGC	2	12	1659604	1659615	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150389373
604	NC_009633	TTTGAT	2	12	1660824	1660835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150389374
605	NC_009633	TTTAGT	2	12	1664312	1664323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150389378
606	NC_009633	GGAATC	2	12	1664393	1664404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150389378
607	NC_009633	CTTTGA	2	12	1665482	1665493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150389379
608	NC_009633	TTAAAG	2	12	1667574	1667585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150389382
609	NC_009633	GGATAA	2	12	1668229	1668240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150389383
610	NC_009633	TGATAT	2	12	1668454	1668465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150389383
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612	NC_009633	TATTTA	2	12	1670527	1670538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150389384
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721	NC_009633	TTGTTT	2	12	2068337	2068348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150389765
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