MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 2617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008570	GAGCT	2	10	7975	7984	20 %	20 %	40 %	20 %	117619417
2	NC_008570	GCCGC	2	10	8854	8863	0 %	0 %	40 %	60 %	117619762
3	NC_008570	CCCAG	2	10	9780	9789	20 %	0 %	20 %	60 %	117619762
4	NC_008570	GCGCG	2	10	14024	14033	0 %	0 %	60 %	40 %	117618215
5	NC_008570	CAGGG	2	10	17864	17873	20 %	0 %	60 %	20 %	117618415
6	NC_008570	GCCAG	2	10	18384	18393	20 %	0 %	40 %	40 %	117618415
7	NC_008570	TCGCT	2	10	18804	18813	0 %	40 %	20 %	40 %	117619718
8	NC_008570	TGACC	2	10	20919	20928	20 %	20 %	20 %	40 %	117619313
9	NC_008570	TGGCC	2	10	26610	26619	0 %	20 %	40 %	40 %	117620367
10	NC_008570	GTTCG	2	10	28701	28710	0 %	40 %	40 %	20 %	117621549
11	NC_008570	CAAGT	2	10	29043	29052	40 %	20 %	20 %	20 %	117621549
12	NC_008570	ATGTG	2	10	34567	34576	20 %	40 %	40 %	0 %	117617927
13	NC_008570	GCGGA	2	10	36042	36051	20 %	0 %	60 %	20 %	117617927
14	NC_008570	CAGCG	2	10	37249	37258	20 %	0 %	40 %	40 %	117618408
15	NC_008570	CACTG	2	10	41656	41665	20 %	20 %	20 %	40 %	117621457
16	NC_008570	CGGGG	2	10	43382	43391	0 %	0 %	80 %	20 %	117621008
17	NC_008570	CGCTC	2	10	45318	45327	0 %	20 %	20 %	60 %	117618161
18	NC_008570	CCGGT	2	10	45854	45863	0 %	20 %	40 %	40 %	117619639
19	NC_008570	AGACC	2	10	50427	50436	40 %	0 %	20 %	40 %	117620104
20	NC_008570	GAGAC	2	10	50735	50744	40 %	0 %	40 %	20 %	117620104
21	NC_008570	GCAGA	2	10	50953	50962	40 %	0 %	40 %	20 %	117620104
22	NC_008570	GGTCG	2	10	52930	52939	0 %	20 %	60 %	20 %	117620470
23	NC_008570	GCCGC	2	10	54308	54317	0 %	0 %	40 %	60 %	117619088
24	NC_008570	GGGCG	2	10	56574	56583	0 %	0 %	80 %	20 %	117618778
25	NC_008570	CCGGC	2	10	58844	58853	0 %	0 %	40 %	60 %	117621427
26	NC_008570	GCCTG	2	10	61899	61908	0 %	20 %	40 %	40 %	117621156
27	NC_008570	CATTC	2	10	62444	62453	20 %	40 %	0 %	40 %	117619547
28	NC_008570	CCTGC	2	10	62600	62609	0 %	20 %	20 %	60 %	117619547
29	NC_008570	TCACT	2	10	63245	63254	20 %	40 %	0 %	40 %	117619547
30	NC_008570	CCCAG	2	10	63561	63570	20 %	0 %	20 %	60 %	117619547
31	NC_008570	AGAGT	2	10	64958	64967	40 %	20 %	40 %	0 %	117618331
32	NC_008570	GCCTG	2	10	65911	65920	0 %	20 %	40 %	40 %	117618331
33	NC_008570	TGGCG	2	10	66666	66675	0 %	20 %	60 %	20 %	117620928
34	NC_008570	TGATC	2	10	68921	68930	20 %	40 %	20 %	20 %	117617713
35	NC_008570	TGCGC	2	10	70261	70270	0 %	20 %	40 %	40 %	117618556
36	NC_008570	CCCAT	2	10	70704	70713	20 %	20 %	0 %	60 %	117618556
37	NC_008570	CAGGC	2	10	71603	71612	20 %	0 %	40 %	40 %	117618556
38	NC_008570	CGGGT	2	10	74619	74628	0 %	20 %	60 %	20 %	117619897
39	NC_008570	CGGGG	2	10	77208	77217	0 %	0 %	80 %	20 %	117619549
40	NC_008570	GGTCG	2	10	78058	78067	0 %	20 %	60 %	20 %	117619549
41	NC_008570	AGCCG	2	10	78147	78156	20 %	0 %	40 %	40 %	117619549
42	NC_008570	AGGGG	2	10	78721	78730	20 %	0 %	80 %	0 %	117619504
43	NC_008570	TGAGC	2	10	83387	83396	20 %	20 %	40 %	20 %	117620688
44	NC_008570	CTGCT	2	10	99081	99090	0 %	40 %	20 %	40 %	117620960
45	NC_008570	GCAAG	2	10	100316	100325	40 %	0 %	40 %	20 %	117619647
46	NC_008570	ACCTG	2	10	100723	100732	20 %	20 %	20 %	40 %	117619647
47	NC_008570	TGCGC	2	10	103829	103838	0 %	20 %	40 %	40 %	117617732
48	NC_008570	CGCGG	2	10	104382	104391	0 %	0 %	60 %	40 %	117617673
49	NC_008570	TCGCT	2	10	107599	107608	0 %	40 %	20 %	40 %	117621186
50	NC_008570	CAGGC	2	10	108281	108290	20 %	0 %	40 %	40 %	117620754
51	NC_008570	GGTCT	2	10	113562	113571	0 %	40 %	40 %	20 %	117620729
52	NC_008570	TCGCC	2	10	113729	113738	0 %	20 %	20 %	60 %	117620729
53	NC_008570	GGCTC	2	10	113747	113756	0 %	20 %	40 %	40 %	117620729
54	NC_008570	TGGAC	2	10	114575	114584	20 %	20 %	40 %	20 %	117619055
55	NC_008570	GAGCT	2	10	115787	115796	20 %	20 %	40 %	20 %	117618922
56	NC_008570	CGGCC	2	10	118542	118551	0 %	0 %	40 %	60 %	117618367
57	NC_008570	CGGCC	2	10	118610	118619	0 %	0 %	40 %	60 %	117618367
58	NC_008570	TCGGC	2	10	118655	118664	0 %	20 %	40 %	40 %	117618367
59	NC_008570	CGGCG	2	10	121847	121856	0 %	0 %	60 %	40 %	117619621
60	NC_008570	GACCG	2	10	125495	125504	20 %	0 %	40 %	40 %	117619840
61	NC_008570	GGCCG	2	10	129295	129304	0 %	0 %	60 %	40 %	117620317
62	NC_008570	GCGCC	2	10	131000	131009	0 %	0 %	40 %	60 %	117618008
63	NC_008570	GGGCC	2	10	132084	132093	0 %	0 %	60 %	40 %	117617564
64	NC_008570	CGCCC	2	10	134003	134012	0 %	0 %	20 %	80 %	117617628
65	NC_008570	CCGGG	2	10	135701	135710	0 %	0 %	60 %	40 %	117619782
66	NC_008570	GGCCT	2	10	135994	136003	0 %	20 %	40 %	40 %	117620621
67	NC_008570	TCCTC	2	10	138310	138319	0 %	40 %	0 %	60 %	117620925
68	NC_008570	GCCAC	2	10	142726	142735	20 %	0 %	20 %	60 %	117618734
69	NC_008570	GGCCG	2	10	143220	143229	0 %	0 %	60 %	40 %	117618734
70	NC_008570	CAGAC	2	10	143822	143831	40 %	0 %	20 %	40 %	117618098
71	NC_008570	CCCAG	2	10	143981	143990	20 %	0 %	20 %	60 %	117618098
72	NC_008570	GTTGC	2	10	144595	144604	0 %	40 %	40 %	20 %	117617536
73	NC_008570	AAGGC	2	10	148141	148150	40 %	0 %	40 %	20 %	117620195
74	NC_008570	GGTTC	2	10	149347	149356	0 %	40 %	40 %	20 %	117618878
75	NC_008570	CAGGC	2	10	150934	150943	20 %	0 %	40 %	40 %	117620003
76	NC_008570	CGGCG	2	10	152607	152616	0 %	0 %	60 %	40 %	117620062
77	NC_008570	TCGCT	2	10	156504	156513	0 %	40 %	20 %	40 %	117619676
78	NC_008570	GTGCA	2	10	157014	157023	20 %	20 %	40 %	20 %	117618217
79	NC_008570	TGGGC	2	10	157357	157366	0 %	20 %	60 %	20 %	117618217
80	NC_008570	GAGCT	2	10	157542	157551	20 %	20 %	40 %	20 %	117618217
81	NC_008570	GTGCC	2	10	162102	162111	0 %	20 %	40 %	40 %	117618503
82	NC_008570	AAGCC	2	10	168711	168720	40 %	0 %	20 %	40 %	117618048
83	NC_008570	GCTGG	2	10	171959	171968	0 %	20 %	60 %	20 %	117619975
84	NC_008570	GGTGC	2	10	172879	172888	0 %	20 %	60 %	20 %	117617910
85	NC_008570	CTGCT	2	10	174323	174332	0 %	40 %	20 %	40 %	117620403
86	NC_008570	GATGA	2	10	179853	179862	40 %	20 %	40 %	0 %	117618333
87	NC_008570	CGGAT	2	10	181741	181750	20 %	20 %	40 %	20 %	117619575
88	NC_008570	TCGGT	2	10	184432	184441	0 %	40 %	40 %	20 %	117620448
89	NC_008570	TGGTG	2	10	187870	187879	0 %	40 %	60 %	0 %	117618211
90	NC_008570	CGGCC	2	10	188319	188328	0 %	0 %	40 %	60 %	117618211
91	NC_008570	CGGGT	2	10	192567	192576	0 %	20 %	60 %	20 %	117619234
92	NC_008570	GCCGG	2	10	195239	195248	0 %	0 %	60 %	40 %	117618616
93	NC_008570	GCTGG	2	10	196378	196387	0 %	20 %	60 %	20 %	117619282
94	NC_008570	GGCGG	2	10	203696	203705	0 %	0 %	80 %	20 %	117618927
95	NC_008570	GCTGG	2	10	203714	203723	0 %	20 %	60 %	20 %	117618927
96	NC_008570	ACTGC	2	10	204033	204042	20 %	20 %	20 %	40 %	117618548
97	NC_008570	GCGCG	2	10	208366	208375	0 %	0 %	60 %	40 %	117621390
98	NC_008570	GGCCC	2	10	209031	209040	0 %	0 %	40 %	60 %	117621390
99	NC_008570	TGGTG	2	10	221113	221122	0 %	40 %	60 %	0 %	117617638
100	NC_008570	TTCCC	2	10	222090	222099	0 %	40 %	0 %	60 %	117618876
101	NC_008570	GTCTG	2	10	222543	222552	0 %	40 %	40 %	20 %	117618876
102	NC_008570	CCGAC	2	10	223208	223217	20 %	0 %	20 %	60 %	117618876
103	NC_008570	GGGCC	2	10	223571	223580	0 %	0 %	60 %	40 %	117618876
104	NC_008570	GCGCC	2	10	224078	224087	0 %	0 %	40 %	60 %	117618876
105	NC_008570	GGGCT	2	10	224714	224723	0 %	20 %	60 %	20 %	117618876
106	NC_008570	GCCCA	2	10	228006	228015	20 %	0 %	20 %	60 %	117621143
107	NC_008570	GCTGG	2	10	229830	229839	0 %	20 %	60 %	20 %	117621016
108	NC_008570	GGCAG	2	10	233364	233373	20 %	0 %	60 %	20 %	117617980
109	NC_008570	GCTTG	2	10	238195	238204	0 %	40 %	40 %	20 %	117618930
110	NC_008570	CAGAC	2	10	238308	238317	40 %	0 %	20 %	40 %	117618930
111	NC_008570	GGCGC	2	10	242553	242562	0 %	0 %	60 %	40 %	117619159
112	NC_008570	AGCCG	2	10	243669	243678	20 %	0 %	40 %	40 %	117619159
113	NC_008570	TTTTA	2	10	244433	244442	20 %	80 %	0 %	0 %	117620768
114	NC_008570	TTTAT	2	10	245343	245352	20 %	80 %	0 %	0 %	117620768
115	NC_008570	CTGAC	2	10	246859	246868	20 %	20 %	20 %	40 %	117617802
116	NC_008570	GCCAT	2	10	247045	247054	20 %	20 %	20 %	40 %	117617802
117	NC_008570	CGGCT	2	10	248792	248801	0 %	20 %	40 %	40 %	117618967
118	NC_008570	GCTCC	2	10	248855	248864	0 %	20 %	20 %	60 %	117618967
119	NC_008570	CCGGC	2	10	251627	251636	0 %	0 %	40 %	60 %	117621305
120	NC_008570	GCGGG	2	10	253593	253602	0 %	0 %	80 %	20 %	117621002
121	NC_008570	CGCCA	2	10	254592	254601	20 %	0 %	20 %	60 %	117620549
122	NC_008570	GCCGG	2	10	254787	254796	0 %	0 %	60 %	40 %	117620549
123	NC_008570	CATGG	2	10	255248	255257	20 %	20 %	40 %	20 %	117617597
124	NC_008570	GATGC	2	10	255738	255747	20 %	20 %	40 %	20 %	117617597
125	NC_008570	GTGGA	2	10	255943	255952	20 %	20 %	60 %	0 %	117617597
126	NC_008570	AGCAG	2	10	257191	257200	40 %	0 %	40 %	20 %	117619220
127	NC_008570	CTGGC	2	10	261826	261835	0 %	20 %	40 %	40 %	117620884
128	NC_008570	AGCAG	2	10	265295	265304	40 %	0 %	40 %	20 %	117620446
129	NC_008570	CAGGG	2	10	265528	265537	20 %	0 %	60 %	20 %	117620446
130	NC_008570	GGTCA	2	10	267889	267898	20 %	20 %	40 %	20 %	117621370
131	NC_008570	CTGGC	2	10	269274	269283	0 %	20 %	40 %	40 %	117618208
132	NC_008570	GCCGC	2	10	269932	269941	0 %	0 %	40 %	60 %	117618208
133	NC_008570	GAGGC	2	10	272771	272780	20 %	0 %	60 %	20 %	117618068
134	NC_008570	GGCGG	2	10	273063	273072	0 %	0 %	80 %	20 %	117618068
135	NC_008570	CGGCC	2	10	273288	273297	0 %	0 %	40 %	60 %	117618068
136	NC_008570	AAGGC	2	10	274483	274492	40 %	0 %	40 %	20 %	117620713
137	NC_008570	GCGCC	2	10	275356	275365	0 %	0 %	40 %	60 %	117619511
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140	NC_008570	GCGCT	2	10	279765	279774	0 %	20 %	40 %	40 %	117621018
141	NC_008570	GCGCT	2	10	281832	281841	0 %	20 %	40 %	40 %	117618823
142	NC_008570	TTCAA	2	10	282261	282270	40 %	40 %	0 %	20 %	117619312
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148	NC_008570	GGGCA	2	10	297383	297392	20 %	0 %	60 %	20 %	117619081
149	NC_008570	CGGCG	2	10	298321	298330	0 %	0 %	60 %	40 %	117619081
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151	NC_008570	TCGGC	2	10	307576	307585	0 %	20 %	40 %	40 %	117620046
152	NC_008570	GCGCC	2	10	316246	316255	0 %	0 %	40 %	60 %	117620185
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154	NC_008570	CGGCC	2	10	316504	316513	0 %	0 %	40 %	60 %	117620185
155	NC_008570	GCGAG	2	10	319329	319338	20 %	0 %	60 %	20 %	117620527
156	NC_008570	CTGCG	2	10	319343	319352	0 %	20 %	40 %	40 %	117620527
157	NC_008570	TCGCC	2	10	319943	319952	0 %	20 %	20 %	60 %	117621497
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172	NC_008570	GAGCA	2	10	372354	372363	40 %	0 %	40 %	20 %	117620834
173	NC_008570	GGCAG	2	10	374079	374088	20 %	0 %	60 %	20 %	117617497
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245	NC_008570	GCGCA	2	10	496227	496236	20 %	0 %	40 %	40 %	117621176
246	NC_008570	CTGGC	2	10	498652	498661	0 %	20 %	40 %	40 %	117619183
247	NC_008570	CATCT	2	10	504231	504240	20 %	40 %	0 %	40 %	117620267
248	NC_008570	TGAAT	2	10	504689	504698	40 %	40 %	20 %	0 %	117620267
249	NC_008570	ATCGC	2	10	505671	505680	20 %	20 %	20 %	40 %	117620561
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251	NC_008570	CGGCA	2	10	508218	508227	20 %	0 %	40 %	40 %	117619401
252	NC_008570	GGGCT	2	10	508417	508426	0 %	20 %	60 %	20 %	117619401
253	NC_008570	GGGCT	2	10	509471	509480	0 %	20 %	60 %	20 %	117619014
254	NC_008570	TCGAT	2	10	514060	514069	20 %	40 %	20 %	20 %	117620892
255	NC_008570	GCCGG	2	10	517494	517503	0 %	0 %	60 %	40 %	117619746
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257	NC_008570	CGACC	2	10	521885	521894	20 %	0 %	20 %	60 %	117621033
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259	NC_008570	GCGAT	2	10	523824	523833	20 %	20 %	40 %	20 %	117619657
260	NC_008570	GCAGC	2	10	526783	526792	20 %	0 %	40 %	40 %	117619823
261	NC_008570	CCTGG	2	10	527227	527236	0 %	20 %	40 %	40 %	117619823
262	NC_008570	GCTGG	2	10	527587	527596	0 %	20 %	60 %	20 %	117619823
263	NC_008570	GGGCT	2	10	527840	527849	0 %	20 %	60 %	20 %	117619823
264	NC_008570	GCGCG	2	10	528816	528825	0 %	0 %	60 %	40 %	117620478
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381	NC_008570	GGCGC	2	10	757635	757644	0 %	0 %	60 %	40 %	117619097
382	NC_008570	CTGAG	2	10	760708	760717	20 %	20 %	40 %	20 %	117621443
383	NC_008570	GCCGA	2	10	764967	764976	20 %	0 %	40 %	40 %	117620388
384	NC_008570	GCTCA	2	10	765906	765915	20 %	20 %	20 %	40 %	117620388
385	NC_008570	GTGAC	2	10	766294	766303	20 %	20 %	40 %	20 %	117620388
386	NC_008570	CTGGT	2	10	768156	768165	0 %	40 %	40 %	20 %	117619815
387	NC_008570	CCTGG	2	10	771162	771171	0 %	20 %	40 %	40 %	117618031
388	NC_008570	GCTGG	2	10	771525	771534	0 %	20 %	60 %	20 %	117618031
389	NC_008570	GCGCC	2	10	775044	775053	0 %	0 %	40 %	60 %	117621394
390	NC_008570	GTGCG	2	10	777598	777607	0 %	20 %	60 %	20 %	117620507
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