MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 2617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008570	ATCCG	2	10	1821570	1821579	20 %	20 %	20 %	40 %	117618791
1002	NC_008570	TGGCT	2	10	1823059	1823068	0 %	40 %	40 %	20 %	117621047
1003	NC_008570	CCGGT	2	10	1823150	1823159	0 %	20 %	40 %	40 %	117621047
1004	NC_008570	CCCGG	2	10	1826177	1826186	0 %	0 %	40 %	60 %	117619740
1005	NC_008570	GCCCG	2	10	1829237	1829246	0 %	0 %	40 %	60 %	117620612
1006	NC_008570	GCTGC	2	10	1835769	1835778	0 %	20 %	40 %	40 %	117621180
1007	NC_008570	CCGAG	2	10	1838501	1838510	20 %	0 %	40 %	40 %	117617755
1008	NC_008570	TTTGA	2	10	1839361	1839370	20 %	60 %	20 %	0 %	117619256
1009	NC_008570	CCAGC	2	10	1841263	1841272	20 %	0 %	20 %	60 %	117619888
1010	NC_008570	TGCAG	2	10	1843384	1843393	20 %	20 %	40 %	20 %	117620983
1011	NC_008570	GCGCA	2	10	1845224	1845233	20 %	0 %	40 %	40 %	117620983
1012	NC_008570	GCCGA	2	10	1846526	1846535	20 %	0 %	40 %	40 %	117618080
1013	NC_008570	TCGGC	2	10	1846862	1846871	0 %	20 %	40 %	40 %	117618080
1014	NC_008570	GGCGC	2	10	1848454	1848463	0 %	0 %	60 %	40 %	117617541
1015	NC_008570	AGCTG	2	10	1850766	1850775	20 %	20 %	40 %	20 %	117617541
1016	NC_008570	GAGGG	2	10	1853246	1853255	20 %	0 %	80 %	0 %	117619285
1017	NC_008570	CCGCC	2	10	1853515	1853524	0 %	0 %	20 %	80 %	117619285
1018	NC_008570	AGGGG	2	10	1854424	1854433	20 %	0 %	80 %	0 %	117619285
1019	NC_008570	TGACC	2	10	1854795	1854804	20 %	20 %	20 %	40 %	117619300
1020	NC_008570	AGGGC	2	10	1857455	1857464	20 %	0 %	60 %	20 %	117618642
1021	NC_008570	GTGAT	2	10	1857817	1857826	20 %	40 %	40 %	0 %	117618642
1022	NC_008570	GGTGC	2	10	1859691	1859700	0 %	20 %	60 %	20 %	117619531
1023	NC_008570	GGTGC	2	10	1861178	1861187	0 %	20 %	60 %	20 %	117618426
1024	NC_008570	TCGAC	2	10	1861197	1861206	20 %	20 %	20 %	40 %	117618426
1025	NC_008570	AGGGC	2	10	1867331	1867340	20 %	0 %	60 %	20 %	117621445
1026	NC_008570	TCATG	2	10	1869546	1869555	20 %	40 %	20 %	20 %	117617669
1027	NC_008570	CGGAT	2	10	1873482	1873491	20 %	20 %	40 %	20 %	117618381
1028	NC_008570	CTCAT	2	10	1878421	1878430	20 %	40 %	0 %	40 %	117621208
1029	NC_008570	ATCTG	2	10	1878437	1878446	20 %	40 %	20 %	20 %	117621208
1030	NC_008570	GCCCG	2	10	1880130	1880139	0 %	0 %	40 %	60 %	117618973
1031	NC_008570	GCCGC	2	10	1882246	1882255	0 %	0 %	40 %	60 %	117619425
1032	NC_008570	TCGGC	2	10	1885555	1885564	0 %	20 %	40 %	40 %	117620071
1033	NC_008570	ATGAC	2	10	1886923	1886932	40 %	20 %	20 %	20 %	117620214
1034	NC_008570	AAATA	2	10	1887182	1887191	80 %	20 %	0 %	0 %	117620214
1035	NC_008570	TGGTC	2	10	1887642	1887651	0 %	40 %	40 %	20 %	117620666
1036	NC_008570	TTTCA	2	10	1887994	1888003	20 %	60 %	0 %	20 %	117617788
1037	NC_008570	GGGTG	2	10	1888783	1888792	0 %	20 %	80 %	0 %	117618702
1038	NC_008570	GGGTG	2	10	1889749	1889758	0 %	20 %	80 %	0 %	117618702
1039	NC_008570	GCGCC	2	10	1890289	1890298	0 %	0 %	40 %	60 %	117618702
1040	NC_008570	CTGCT	2	10	1893722	1893731	0 %	40 %	20 %	40 %	117619810
1041	NC_008570	CGGAT	2	10	1894747	1894756	20 %	20 %	40 %	20 %	117619810
1042	NC_008570	GGTCG	2	10	1896784	1896793	0 %	20 %	60 %	20 %	117618506
1043	NC_008570	GCATC	2	10	1900218	1900227	20 %	20 %	20 %	40 %	117619612
1044	NC_008570	GCCGG	2	10	1901593	1901602	0 %	0 %	60 %	40 %	117619109
1045	NC_008570	CCTGG	2	10	1902899	1902908	0 %	20 %	40 %	40 %	117619109
1046	NC_008570	GCCGA	2	10	1912352	1912361	20 %	0 %	40 %	40 %	117619557
1047	NC_008570	CGAGC	2	10	1914737	1914746	20 %	0 %	40 %	40 %	117618989
1048	NC_008570	GCCAG	2	10	1914811	1914820	20 %	0 %	40 %	40 %	117618989
1049	NC_008570	TCGAG	2	10	1915208	1915217	20 %	20 %	40 %	20 %	117620094
1050	NC_008570	CCGGA	2	10	1916852	1916861	20 %	0 %	40 %	40 %	117618593
1051	NC_008570	AGCGC	2	10	1924946	1924955	20 %	0 %	40 %	40 %	117619948
1052	NC_008570	CTGCC	2	10	1927504	1927513	0 %	20 %	20 %	60 %	117620012
1053	NC_008570	TGAGC	2	10	1930084	1930093	20 %	20 %	40 %	20 %	117619003
1054	NC_008570	CGCGC	2	10	1930235	1930244	0 %	0 %	40 %	60 %	117619003
1055	NC_008570	AGCCG	2	10	1930797	1930806	20 %	0 %	40 %	40 %	117619003
1056	NC_008570	CGGCC	2	10	1931053	1931062	0 %	0 %	40 %	60 %	117619003
1057	NC_008570	CAGGG	2	10	1933984	1933993	20 %	0 %	60 %	20 %	117620409
1058	NC_008570	GCCCA	2	10	1935657	1935666	20 %	0 %	20 %	60 %	117619129
1059	NC_008570	CACCT	2	10	1935870	1935879	20 %	20 %	0 %	60 %	117619129
1060	NC_008570	TGCTC	2	10	1936810	1936819	0 %	40 %	20 %	40 %	117618555
1061	NC_008570	TGGGC	2	10	1937197	1937206	0 %	20 %	60 %	20 %	117618555
1062	NC_008570	AGGGC	2	10	1939526	1939535	20 %	0 %	60 %	20 %	117618096
1063	NC_008570	TCCAG	2	10	1941242	1941251	20 %	20 %	20 %	40 %	117619847
1064	NC_008570	CAGGG	2	10	1942302	1942311	20 %	0 %	60 %	20 %	117619847
1065	NC_008570	GGCTT	2	10	1943844	1943853	0 %	40 %	40 %	20 %	117618050
1066	NC_008570	CTGCT	2	10	1944808	1944817	0 %	40 %	20 %	40 %	117617484
1067	NC_008570	CGGGG	2	10	1945770	1945779	0 %	0 %	80 %	20 %	117620988
1068	NC_008570	CAGCG	2	10	1946179	1946188	20 %	0 %	40 %	40 %	117620988
1069	NC_008570	CTTCT	2	10	1946493	1946502	0 %	60 %	0 %	40 %	117620988
1070	NC_008570	CAGGG	2	10	1946766	1946775	20 %	0 %	60 %	20 %	117620988
1071	NC_008570	GCGAT	2	10	1949591	1949600	20 %	20 %	40 %	20 %	117618370
1072	NC_008570	CCTTG	2	10	1950101	1950110	0 %	40 %	20 %	40 %	117620389
1073	NC_008570	GGGGA	2	10	1951823	1951832	20 %	0 %	80 %	0 %	117619929
1074	NC_008570	GGGCA	2	10	1956705	1956714	20 %	0 %	60 %	20 %	117617609
1075	NC_008570	CGGCG	2	10	1957498	1957507	0 %	0 %	60 %	40 %	117618060
1076	NC_008570	GAGAA	2	10	1958643	1958652	60 %	0 %	40 %	0 %	117621360
1077	NC_008570	AGATC	2	10	1964467	1964476	40 %	20 %	20 %	20 %	117621044
1078	NC_008570	CCCAG	2	10	1966073	1966082	20 %	0 %	20 %	60 %	117620431
1079	NC_008570	GGCTG	2	10	1970564	1970573	0 %	20 %	60 %	20 %	117621145
1080	NC_008570	TGCGT	2	10	1972942	1972951	0 %	40 %	40 %	20 %	117620484
1081	NC_008570	CCGCT	2	10	1974239	1974248	0 %	20 %	20 %	60 %	117618596
1082	NC_008570	TGAAC	2	10	1976146	1976155	40 %	20 %	20 %	20 %	117617800
1083	NC_008570	CGGCC	2	10	1979951	1979960	0 %	0 %	40 %	60 %	117618427
1084	NC_008570	ATTTT	2	10	1983516	1983525	20 %	80 %	0 %	0 %	117618490
1085	NC_008570	GCTCG	2	10	1985698	1985707	0 %	20 %	40 %	40 %	117620019
1086	NC_008570	GCAAG	2	10	1986342	1986351	40 %	0 %	40 %	20 %	117620019
1087	NC_008570	TGCGC	2	10	1992144	1992153	0 %	20 %	40 %	40 %	117621074
1088	NC_008570	AGTCA	2	10	1994122	1994131	40 %	20 %	20 %	20 %	117619721
1089	NC_008570	CTGGA	2	10	1994292	1994301	20 %	20 %	40 %	20 %	117619721
1090	NC_008570	AGTTG	2	10	1996249	1996258	20 %	40 %	40 %	0 %	117619201
1091	NC_008570	CTGCA	2	10	1996899	1996908	20 %	20 %	20 %	40 %	117618069
1092	NC_008570	ACCGC	2	10	1999960	1999969	20 %	0 %	20 %	60 %	117621313
1093	NC_008570	CGACC	2	10	1999992	2000001	20 %	0 %	20 %	60 %	117621313
1094	NC_008570	GTCGA	2	10	2005721	2005730	20 %	20 %	40 %	20 %	117618870
1095	NC_008570	GCGGG	2	10	2013490	2013499	0 %	0 %	80 %	20 %	117620760
1096	NC_008570	GTGCT	2	10	2014221	2014230	0 %	40 %	40 %	20 %	117618798
1097	NC_008570	TGGTG	2	10	2014251	2014260	0 %	40 %	60 %	0 %	117618798
1098	NC_008570	CTGGC	2	10	2014841	2014850	0 %	20 %	40 %	40 %	117618798
1099	NC_008570	ACAAG	2	10	2016319	2016328	60 %	0 %	20 %	20 %	117618798
1100	NC_008570	ATTGC	2	10	2019383	2019392	20 %	40 %	20 %	20 %	117619593
1101	NC_008570	TGCGC	2	10	2020502	2020511	0 %	20 %	40 %	40 %	117620092
1102	NC_008570	GAAGT	2	10	2022289	2022298	40 %	20 %	40 %	0 %	117620566
1103	NC_008570	GCCAG	2	10	2023476	2023485	20 %	0 %	40 %	40 %	117620566
1104	NC_008570	AAACA	2	10	2024447	2024456	80 %	0 %	0 %	20 %	117621024
1105	NC_008570	ATTCA	2	10	2024685	2024694	40 %	40 %	0 %	20 %	117621024
1106	NC_008570	TATCG	2	10	2029826	2029835	20 %	40 %	20 %	20 %	117621540
1107	NC_008570	CCGCG	2	10	2030275	2030284	0 %	0 %	40 %	60 %	117621540
1108	NC_008570	GTTGA	2	10	2031338	2031347	20 %	40 %	40 %	0 %	117621540
1109	NC_008570	ATGGC	2	10	2034110	2034119	20 %	20 %	40 %	20 %	117619488
1110	NC_008570	ACGGA	2	10	2035750	2035759	40 %	0 %	40 %	20 %	117618917
1111	NC_008570	ACCCG	2	10	2039785	2039794	20 %	0 %	20 %	60 %	117619696
1112	NC_008570	TTCCG	2	10	2043461	2043470	0 %	40 %	20 %	40 %	117619333
1113	NC_008570	GTCTT	2	10	2049984	2049993	0 %	60 %	20 %	20 %	117617866
1114	NC_008570	GCGCC	2	10	2050060	2050069	0 %	0 %	40 %	60 %	117618512
1115	NC_008570	GGATC	2	10	2058311	2058320	20 %	20 %	40 %	20 %	117619142
1116	NC_008570	GGCGC	2	10	2059950	2059959	0 %	0 %	60 %	40 %	117618278
1117	NC_008570	CGAGC	2	10	2061435	2061444	20 %	0 %	40 %	40 %	117620664
1118	NC_008570	GCAGA	2	10	2063239	2063248	40 %	0 %	40 %	20 %	117621166
1119	NC_008570	CGATC	2	10	2063559	2063568	20 %	20 %	20 %	40 %	117621166
1120	NC_008570	CCTGC	2	10	2064772	2064781	0 %	20 %	20 %	60 %	117620232
1121	NC_008570	ACCGA	2	10	2067924	2067933	40 %	0 %	20 %	40 %	117618483
1122	NC_008570	CGGCG	2	10	2068000	2068009	0 %	0 %	60 %	40 %	117618483
1123	NC_008570	GCCTG	2	10	2069399	2069408	0 %	20 %	40 %	40 %	117620567
1124	NC_008570	GCGCT	2	10	2070845	2070854	0 %	20 %	40 %	40 %	117618141
1125	NC_008570	GCGCG	2	10	2071656	2071665	0 %	0 %	60 %	40 %	117618141
1126	NC_008570	TGCAG	2	10	2072738	2072747	20 %	20 %	40 %	20 %	117619062
1127	NC_008570	GGGGT	2	10	2073223	2073232	0 %	20 %	80 %	0 %	117619062
1128	NC_008570	TGGGC	2	10	2073425	2073434	0 %	20 %	60 %	20 %	117619062
1129	NC_008570	GCTTG	2	10	2073543	2073552	0 %	40 %	40 %	20 %	117619062
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1133	NC_008570	CTCGC	2	10	2081865	2081874	0 %	20 %	20 %	60 %	117617670
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1137	NC_008570	GAGCA	2	10	2088750	2088759	40 %	0 %	40 %	20 %	117618185
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1139	NC_008570	ACGGA	2	10	2098549	2098558	40 %	0 %	40 %	20 %	117618018
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1142	NC_008570	GCCGC	2	10	2101887	2101896	0 %	0 %	40 %	60 %	117619269
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1148	NC_008570	AGGGC	2	10	2105401	2105410	20 %	0 %	60 %	20 %	117618342
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1163	NC_008570	GCGGG	2	10	2139720	2139729	0 %	0 %	80 %	20 %	117619076
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1174	NC_008570	CGGCG	2	10	2157596	2157605	0 %	0 %	60 %	40 %	117618202
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1229	NC_008570	GGGAG	2	10	2274786	2274795	20 %	0 %	80 %	0 %	117618776
1230	NC_008570	CGGGC	2	10	2284426	2284435	0 %	0 %	60 %	40 %	117619428
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1232	NC_008570	GGATT	2	10	2292405	2292414	20 %	40 %	40 %	0 %	117618133
1233	NC_008570	GCGGG	2	10	2292643	2292652	0 %	0 %	80 %	20 %	117618133
1234	NC_008570	CGGCG	2	10	2292796	2292805	0 %	0 %	60 %	40 %	117618133
1235	NC_008570	GTGAT	2	10	2297736	2297745	20 %	40 %	40 %	0 %	117620086
1236	NC_008570	GAATT	2	10	2298528	2298537	40 %	40 %	20 %	0 %	117620086
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1239	NC_008570	CGACC	2	10	2303400	2303409	20 %	0 %	20 %	60 %	117618268
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1241	NC_008570	GGGGT	2	10	2305435	2305444	0 %	20 %	80 %	0 %	117620444
1242	NC_008570	GAGAT	2	10	2309924	2309933	40 %	20 %	40 %	0 %	117619212
1243	NC_008570	CATCA	2	10	2310664	2310673	40 %	20 %	0 %	40 %	117619212
1244	NC_008570	CGCTG	2	10	2310836	2310845	0 %	20 %	40 %	40 %	117620297
1245	NC_008570	CGGGG	2	10	2310855	2310864	0 %	0 %	80 %	20 %	117620297
1246	NC_008570	GGCGG	2	10	2311604	2311613	0 %	0 %	80 %	20 %	117620297
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1248	NC_008570	TGCGG	2	10	2319953	2319962	0 %	20 %	60 %	20 %	117619172
1249	NC_008570	CCATC	2	10	2320081	2320090	20 %	20 %	0 %	60 %	117619172
1250	NC_008570	GCCTC	2	10	2324713	2324722	0 %	20 %	20 %	60 %	117620009
1251	NC_008570	TCGCC	2	10	2325595	2325604	0 %	20 %	20 %	60 %	117621475
1252	NC_008570	TGGGT	2	10	2325735	2325744	0 %	40 %	60 %	0 %	117621475
1253	NC_008570	CCGGT	2	10	2329794	2329803	0 %	20 %	40 %	40 %	117618128
1254	NC_008570	GGTCG	2	10	2332121	2332130	0 %	20 %	60 %	20 %	117619946
1255	NC_008570	CTGCC	2	10	2333180	2333189	0 %	20 %	20 %	60 %	117618815
1256	NC_008570	CCCAG	2	10	2334837	2334846	20 %	0 %	20 %	60 %	117620004
1257	NC_008570	CGGCG	2	10	2336422	2336431	0 %	0 %	60 %	40 %	117618772
1258	NC_008570	CCTGG	2	10	2338463	2338472	0 %	20 %	40 %	40 %	117620167
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1261	NC_008570	CGGCG	3	15	2339876	2339890	0 %	0 %	60 %	40 %	117620660
1262	NC_008570	AGCTG	2	10	2341496	2341505	20 %	20 %	40 %	20 %	117621113
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1265	NC_008570	CAGCG	2	10	2345396	2345405	20 %	0 %	40 %	40 %	117621462
1266	NC_008570	AGGCC	2	10	2345481	2345490	20 %	0 %	40 %	40 %	117621462
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1268	NC_008570	TGCAT	2	10	2348597	2348606	20 %	40 %	20 %	20 %	117618313
1269	NC_008570	CGGCG	2	10	2349592	2349601	0 %	0 %	60 %	40 %	117619468
1270	NC_008570	GTTCA	2	10	2349602	2349611	20 %	40 %	20 %	20 %	117619468
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1279	NC_008570	GCTCA	2	10	2362698	2362707	20 %	20 %	20 %	40 %	117618105
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1281	NC_008570	GCTAT	2	10	2365645	2365654	20 %	40 %	20 %	20 %	117618345
1282	NC_008570	CATCG	2	10	2368314	2368323	20 %	20 %	20 %	40 %	117617656
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1286	NC_008570	ATCAC	2	10	2373421	2373430	40 %	20 %	0 %	40 %	162139472
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1293	NC_008570	CGTGA	2	10	2383519	2383528	20 %	20 %	40 %	20 %	117619188
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1311	NC_008570	CCTGT	2	10	2427931	2427940	0 %	40 %	20 %	40 %	117618484
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1314	NC_008570	GGGTC	2	10	2432159	2432168	0 %	20 %	60 %	20 %	117619741
1315	NC_008570	CTCTT	2	10	2432397	2432406	0 %	60 %	0 %	40 %	117619741
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1317	NC_008570	GGGCA	2	10	2432929	2432938	20 %	0 %	60 %	20 %	117620179
1318	NC_008570	GGGCA	2	10	2433207	2433216	20 %	0 %	60 %	20 %	117620179
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1322	NC_008570	CGCCA	2	10	2436651	2436660	20 %	0 %	20 %	60 %	117620554
1323	NC_008570	CAGGG	2	10	2438969	2438978	20 %	0 %	60 %	20 %	117617621
1324	NC_008570	GCAGA	2	10	2440267	2440276	40 %	0 %	40 %	20 %	117621410
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1333	NC_008570	AGTGA	2	10	2459723	2459732	40 %	20 %	40 %	0 %	117618016
1334	NC_008570	GGGGT	2	10	2462791	2462800	0 %	20 %	80 %	0 %	117618257
1335	NC_008570	GGGCG	2	10	2463152	2463161	0 %	0 %	80 %	20 %	117620122
1336	NC_008570	TGCCA	2	10	2463652	2463661	20 %	20 %	20 %	40 %	117620122
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1342	NC_008570	GGCAG	2	10	2472488	2472497	20 %	0 %	60 %	20 %	117619748
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1344	NC_008570	TCAGT	2	10	2475036	2475045	20 %	40 %	20 %	20 %	117619748
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1351	NC_008570	GGGGC	2	10	2499712	2499721	0 %	0 %	80 %	20 %	117619773
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1353	NC_008570	GGCGC	2	10	2501059	2501068	0 %	0 %	60 %	40 %	117618848
1354	NC_008570	CAGAC	2	10	2501620	2501629	40 %	0 %	20 %	40 %	117619405
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1359	NC_008570	AGAGC	2	10	2513210	2513219	40 %	0 %	40 %	20 %	117618388
1360	NC_008570	CTGGA	2	10	2515776	2515785	20 %	20 %	40 %	20 %	117621259
1361	NC_008570	CTGGC	2	10	2515992	2516001	0 %	20 %	40 %	40 %	117621259
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1363	NC_008570	CTCCA	2	10	2525145	2525154	20 %	20 %	0 %	60 %	117620054
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1365	NC_008570	TCGGG	2	10	2527549	2527558	0 %	20 %	60 %	20 %	117617862
1366	NC_008570	GGGTC	2	10	2528318	2528327	0 %	20 %	60 %	20 %	117617862
1367	NC_008570	CGGTG	2	10	2529641	2529650	0 %	20 %	60 %	20 %	117617862
1368	NC_008570	CTGAG	2	10	2530505	2530514	20 %	20 %	40 %	20 %	117617862
1369	NC_008570	GGTGA	2	10	2530872	2530881	20 %	20 %	60 %	0 %	117617862
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1372	NC_008570	CTTCT	2	10	2536995	2537004	0 %	60 %	0 %	40 %	117620817
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1384	NC_008570	CGCGG	2	10	2554927	2554936	0 %	0 %	60 %	40 %	117618162
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1388	NC_008570	GCTCG	2	10	2559971	2559980	0 %	20 %	40 %	40 %	117620126
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1409	NC_008570	CGCGG	2	10	2605895	2605904	0 %	0 %	60 %	40 %	117618286
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1486	NC_008570	CCAGG	2	10	2746059	2746068	20 %	0 %	40 %	40 %	117617721
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1489	NC_008570	TGAGT	2	10	2748596	2748605	20 %	40 %	40 %	0 %	117617721
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1493	NC_008570	GGGCA	2	10	2754638	2754647	20 %	0 %	60 %	20 %	117620119
1494	NC_008570	TGATC	2	10	2754877	2754886	20 %	40 %	20 %	20 %	117620119
1495	NC_008570	CGCCA	2	10	2756122	2756131	20 %	0 %	20 %	60 %	117620119
1496	NC_008570	TGGCC	2	10	2757284	2757293	0 %	20 %	40 %	40 %	117619131
1497	NC_008570	CAGCG	2	10	2759543	2759552	20 %	0 %	40 %	40 %	117619594
1498	NC_008570	CCCGA	2	10	2761651	2761660	20 %	0 %	20 %	60 %	117620025
1499	NC_008570	GCGGT	2	10	2768009	2768018	0 %	20 %	60 %	20 %	117620262
1500	NC_008570	GCCGC	2	10	2775764	2775773	0 %	0 %	40 %	60 %	117618564

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