MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 13509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	CAG	2	6	25	30	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
2	NC_004842	ACA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416371
3	NC_004842	CGA	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
4	NC_004842	CAT	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416371
5	NC_004842	AGG	2	6	553	558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416371
6	NC_004842	TGA	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416371
7	NC_004842	AAC	2	6	686	691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416371
8	NC_004842	GCA	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
9	NC_004842	GAC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
10	NC_004842	CGG	2	6	790	795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416371
11	NC_004842	TTG	2	6	806	811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416371
12	NC_004842	CGA	2	6	831	836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
13	NC_004842	TTG	2	6	989	994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416371
14	NC_004842	GAA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416371
15	NC_004842	TGC	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416371
16	NC_004842	AGA	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416371
17	NC_004842	AGT	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416371
18	NC_004842	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416371
19	NC_004842	CTA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416371
20	NC_004842	TGA	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416371
21	NC_004842	ATA	2	6	1423	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416371
22	NC_004842	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416371
23	NC_004842	GCA	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416371
24	NC_004842	GAA	2	6	1623	1628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416371
25	NC_004842	TGC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416372
26	NC_004842	CGG	2	6	1978	1983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416372
27	NC_004842	GCC	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416372
28	NC_004842	TAG	2	6	2014	2019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416372
29	NC_004842	ACA	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416372
30	NC_004842	GCC	2	6	2148	2153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416372
31	NC_004842	TAT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416372
32	NC_004842	TGG	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416372
33	NC_004842	TGC	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416372
34	NC_004842	CAC	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416372
35	NC_004842	CCG	2	6	2446	2451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416373
36	NC_004842	ACA	2	6	2573	2578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416373
37	NC_004842	TTG	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416373
38	NC_004842	AAT	2	6	2649	2654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416373
39	NC_004842	TCT	2	6	2672	2677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416373
40	NC_004842	TGC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416373
41	NC_004842	TTG	2	6	2884	2889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416373
42	NC_004842	AGG	2	6	2957	2962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416373
43	NC_004842	CTG	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416374
44	NC_004842	TCG	2	6	3162	3167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416374
45	NC_004842	CTC	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416374
46	NC_004842	CAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416374
47	NC_004842	GCG	2	6	3263	3268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416374
48	NC_004842	TTG	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416374
49	NC_004842	ATG	2	6	3602	3607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416374
50	NC_004842	CTG	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416374
51	NC_004842	TGC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416374
52	NC_004842	GCT	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416374
53	NC_004842	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416374
54	NC_004842	GAG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416374
55	NC_004842	TCA	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416374
56	NC_004842	GTC	2	6	4368	4373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416375
57	NC_004842	GAA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416375
58	NC_004842	AGG	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416376
59	NC_004842	GCG	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416376
60	NC_004842	GAA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416376
61	NC_004842	ATG	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416377
62	NC_004842	ACT	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416377
63	NC_004842	TTC	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416377
64	NC_004842	TTA	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416377
65	NC_004842	CTG	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416377
66	NC_004842	GTT	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416377
67	NC_004842	TGT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416377
68	NC_004842	CAA	2	6	5600	5605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416377
69	NC_004842	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416377
70	NC_004842	TCA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416377
71	NC_004842	GCT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416377
72	NC_004842	GTT	2	6	5744	5749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416377
73	NC_004842	CAA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416377
74	NC_004842	CAA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416377
75	NC_004842	TCA	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416377
76	NC_004842	CGT	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416377
77	NC_004842	TCG	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416378
78	NC_004842	TCA	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416378
79	NC_004842	TAC	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416378
80	NC_004842	CGT	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416378
81	NC_004842	TGC	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416379
82	NC_004842	TAC	2	6	6979	6984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416379
83	NC_004842	CGT	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416379
84	NC_004842	GAC	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416379
85	NC_004842	TGC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416379
86	NC_004842	GCT	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416379
87	NC_004842	GCA	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416380
88	NC_004842	GGT	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416380
89	NC_004842	TGT	2	6	7751	7756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416380
90	NC_004842	TGA	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416380
91	NC_004842	CAC	2	6	7943	7948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416380
92	NC_004842	GAG	2	6	8123	8128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416380
93	NC_004842	GTA	2	6	8258	8263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416380
94	NC_004842	GCA	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416380
95	NC_004842	TCA	2	6	8326	8331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416380
96	NC_004842	AAC	2	6	8347	8352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416380
97	NC_004842	TAT	2	6	8476	8481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416381
98	NC_004842	CGC	2	6	8638	8643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416381
99	NC_004842	TGT	2	6	8716	8721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416381
100	NC_004842	TCA	5	15	8750	8764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416381
101	NC_004842	TCT	2	6	8808	8813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416381
102	NC_004842	GAA	2	6	8843	8848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416381
103	NC_004842	AAT	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416381
104	NC_004842	TGC	2	6	8936	8941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416381
105	NC_004842	TCA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416381
106	NC_004842	GCC	2	6	8993	8998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416381
107	NC_004842	CAG	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416381
108	NC_004842	ACC	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416381
109	NC_004842	TCG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416382
110	NC_004842	CAG	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416382
111	NC_004842	TGC	2	6	9856	9861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416382
112	NC_004842	CGA	3	9	10102	10110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416383
113	NC_004842	CCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416383
114	NC_004842	TCA	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416383
115	NC_004842	GGT	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416383
116	NC_004842	TGC	2	6	10479	10484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416383
117	NC_004842	TTC	2	6	10514	10519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416383
118	NC_004842	AGG	2	6	10535	10540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416383
119	NC_004842	TGG	2	6	10674	10679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416383
120	NC_004842	TGA	2	6	10699	10704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416383
121	NC_004842	CAT	2	6	10790	10795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416383
122	NC_004842	GTT	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416383
123	NC_004842	ACG	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416383
124	NC_004842	GTT	2	6	10954	10959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416383
125	NC_004842	CTT	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416383
126	NC_004842	TGG	2	6	11007	11012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416383
127	NC_004842	GGA	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416383
128	NC_004842	ACG	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416384
129	NC_004842	GCT	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416384
130	NC_004842	GCA	2	6	11566	11571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416384
131	NC_004842	GCG	2	6	11602	11607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416384
132	NC_004842	CCA	2	6	11683	11688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416384
133	NC_004842	CTC	2	6	11729	11734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416384
134	NC_004842	TAC	2	6	11863	11868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416384
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136	NC_004842	GGC	2	6	11999	12004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416384
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139	NC_004842	GTT	2	6	12296	12301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416384
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252	NC_004842	TGG	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416391
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256	NC_004842	TTA	2	6	22871	22876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416391
257	NC_004842	AAC	2	6	22886	22891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416391
258	NC_004842	GGC	2	6	23036	23041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416392
259	NC_004842	TAC	2	6	23046	23051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416392
260	NC_004842	ACA	2	6	23239	23244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416392
261	NC_004842	ACC	3	9	23286	23294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416392
262	NC_004842	TCT	2	6	23492	23497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416393
263	NC_004842	CAC	2	6	23564	23569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416393
264	NC_004842	ATG	2	6	23707	23712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416393
265	NC_004842	ATC	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416393
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268	NC_004842	ACC	2	6	24034	24039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416394
269	NC_004842	ATG	2	6	24046	24051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416394
270	NC_004842	CAG	2	6	24113	24118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416394
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272	NC_004842	TAG	2	6	24146	24151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416394
273	NC_004842	CTG	2	6	24155	24160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416394
274	NC_004842	TGA	2	6	24161	24166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416394
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280	NC_004842	CTG	2	6	25273	25278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416395
281	NC_004842	CTT	2	6	25316	25321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416395
282	NC_004842	GAT	2	6	25395	25400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416395
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285	NC_004842	GCA	2	6	25696	25701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416395
286	NC_004842	TGT	2	6	25799	25804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416395
287	NC_004842	GCG	2	6	25895	25900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416395
288	NC_004842	TGC	2	6	25998	26003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416395
289	NC_004842	CTG	2	6	26010	26015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416395
290	NC_004842	AGT	2	6	26016	26021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416395
291	NC_004842	TAC	2	6	26116	26121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416395
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293	NC_004842	ATA	2	6	26174	26179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416395
294	NC_004842	GCA	2	6	26208	26213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416395
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340	NC_004842	TGA	2	6	31653	31658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416400
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351	NC_004842	TCC	2	6	32766	32771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416401
352	NC_004842	CGT	2	6	32783	32788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416401
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365	NC_004842	ATG	2	6	33705	33710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
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368	NC_004842	TAG	2	6	33805	33810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
369	NC_004842	CTG	2	6	33814	33819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416403
370	NC_004842	TGA	2	6	33820	33825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416403
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372	NC_004842	AAG	2	6	36780	36785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416404
373	NC_004842	TTG	2	6	36789	36794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416404
374	NC_004842	CTT	2	6	36881	36886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
375	NC_004842	ATT	2	6	36987	36992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416404
376	NC_004842	TTC	2	6	37016	37021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
377	NC_004842	ATG	2	6	37071	37076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
378	NC_004842	GAA	2	6	37115	37120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416404
379	NC_004842	CCA	2	6	37155	37160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416404
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381	NC_004842	TAG	2	6	37226	37231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
382	NC_004842	TCA	2	6	37317	37322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
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499	NC_004842	CAC	2	6	51649	51654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416417
500	NC_004842	ACA	2	6	51774	51779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416417

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