MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 13509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004842	TCA	2	6	324708	324713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416619
3502	NC_004842	CAG	2	6	324723	324728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416619
3503	NC_004842	CCA	2	6	324799	324804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416619
3504	NC_004842	AGA	3	9	324876	324884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416619
3505	NC_004842	ATA	2	6	324932	324937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416619
3506	NC_004842	GTA	2	6	324994	324999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416619
3507	NC_004842	TGA	2	6	325312	325317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416619
3508	NC_004842	CCT	2	6	325405	325410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416619
3509	NC_004842	CTC	2	6	325415	325420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416619
3510	NC_004842	CAT	2	6	325474	325479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416619
3511	NC_004842	CTG	2	6	325831	325836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3512	NC_004842	TCG	2	6	325860	325865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3513	NC_004842	TTG	2	6	325869	325874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416620
3514	NC_004842	CGC	2	6	325906	325911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416620
3515	NC_004842	ACC	2	6	325989	325994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416620
3516	NC_004842	ACC	2	6	326089	326094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416620
3517	NC_004842	TGC	2	6	326111	326116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3518	NC_004842	ACC	2	6	326203	326208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416620
3519	NC_004842	TGC	2	6	326225	326230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3520	NC_004842	CGG	2	6	326336	326341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416620
3521	NC_004842	TGC	2	6	326375	326380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3522	NC_004842	TGC	2	6	326414	326419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3523	NC_004842	TGG	2	6	326525	326530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416620
3524	NC_004842	GCA	2	6	326587	326592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3525	NC_004842	AGT	2	6	326739	326744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416620
3526	NC_004842	CGA	2	6	326746	326751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3527	NC_004842	GCA	2	6	326799	326804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3528	NC_004842	CGA	2	6	326807	326812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3529	NC_004842	TTA	2	6	326820	326825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416620
3530	NC_004842	TGC	2	6	326966	326971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3531	NC_004842	TGC	2	6	327005	327010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3532	NC_004842	TGG	2	6	327116	327121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416620
3533	NC_004842	GCA	2	6	327178	327183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3534	NC_004842	TGC	2	6	327293	327298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3535	NC_004842	AGT	2	6	327330	327335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416620
3536	NC_004842	CGA	2	6	327398	327403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3537	NC_004842	GCA	2	6	327422	327427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416620
3538	NC_004842	CAA	2	6	328791	328796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416621
3539	NC_004842	GCC	2	6	328810	328815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416621
3540	NC_004842	CCT	2	6	328905	328910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416621
3541	NC_004842	GAG	3	9	329071	329079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416621
3542	NC_004842	TTG	2	6	329110	329115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416621
3543	NC_004842	GTT	2	6	329182	329187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416621
3544	NC_004842	TGA	2	6	329237	329242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416621
3545	NC_004842	GAA	2	6	329359	329364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416621
3546	NC_004842	TGA	2	6	329394	329399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416621
3547	NC_004842	CAA	2	6	329415	329420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416621
3548	NC_004842	TAA	2	6	329499	329504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416621
3549	NC_004842	GGT	2	6	329553	329558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416621
3550	NC_004842	ATT	2	6	329659	329664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416621
3551	NC_004842	GTT	2	6	329788	329793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416621
3552	NC_004842	GTT	2	6	329911	329916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416621
3553	NC_004842	TGA	2	6	330162	330167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416621
3554	NC_004842	GTC	2	6	330205	330210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416621
3555	NC_004842	GGT	2	6	330274	330279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416621
3556	NC_004842	AGA	2	6	330306	330311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416621
3557	NC_004842	CAC	2	6	330318	330323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416621
3558	NC_004842	TTC	2	6	330361	330366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416621
3559	NC_004842	GAC	2	6	330508	330513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416621
3560	NC_004842	TGC	2	6	330815	330820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416621
3561	NC_004842	TGC	2	6	330885	330890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416621
3562	NC_004842	GTG	2	6	330899	330904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416621
3563	NC_004842	TGA	2	6	330912	330917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416621
3564	NC_004842	GAG	2	6	330934	330939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416621
3565	NC_004842	GCA	2	6	331286	331291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416621
3566	NC_004842	GAA	2	6	331294	331299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416621
3567	NC_004842	TGA	2	6	331320	331325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416621
3568	NC_004842	AAT	2	6	331328	331333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416621
3569	NC_004842	GGA	2	6	331367	331372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416622
3570	NC_004842	ACC	2	6	331449	331454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416622
3571	NC_004842	AGA	2	6	331510	331515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416622
3572	NC_004842	ATA	2	6	331590	331595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416622
3573	NC_004842	CAA	2	6	331814	331819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416622
3574	NC_004842	GTT	2	6	331821	331826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416622
3575	NC_004842	ATT	2	6	331917	331922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416622
3576	NC_004842	GGT	2	6	332323	332328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416623
3577	NC_004842	GTT	3	9	332331	332339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416623
3578	NC_004842	TGC	2	6	332344	332349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416623
3579	NC_004842	TCG	2	6	332390	332395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416623
3580	NC_004842	GTG	2	6	332416	332421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416623
3581	NC_004842	GGA	2	6	332474	332479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416623
3582	NC_004842	TGA	2	6	332489	332494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416623
3583	NC_004842	AAG	2	6	332550	332555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416623
3584	NC_004842	GTT	2	6	332646	332651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416623
3585	NC_004842	AGG	2	6	332746	332751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416623
3586	NC_004842	TGG	2	6	332755	332760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416623
3587	NC_004842	TAT	2	6	332801	332806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416623
3588	NC_004842	AGT	2	6	332850	332855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416623
3589	NC_004842	GAG	2	6	332986	332991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416624
3590	NC_004842	TAA	2	6	333051	333056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416624
3591	NC_004842	GGA	2	6	333291	333296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416624
3592	NC_004842	TGT	3	9	333381	333389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416624
3593	NC_004842	CAA	2	6	333461	333466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416624
3594	NC_004842	ACA	2	6	333743	333748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416624
3595	NC_004842	AGC	2	6	334165	334170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3596	NC_004842	AGG	2	6	334178	334183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416624
3597	NC_004842	GTG	2	6	334321	334326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416624
3598	NC_004842	GTG	2	6	334363	334368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416624
3599	NC_004842	TGA	2	6	334443	334448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416624
3600	NC_004842	CAG	2	6	334450	334455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3601	NC_004842	AGA	2	6	334463	334468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416624
3602	NC_004842	GAC	2	6	334489	334494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3603	NC_004842	CAG	2	6	334498	334503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3604	NC_004842	CAC	2	6	334587	334592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416624
3605	NC_004842	GCA	2	6	334682	334687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3606	NC_004842	GCT	2	6	334728	334733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416624
3607	NC_004842	CAT	2	6	334806	334811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416624
3608	NC_004842	GAA	2	6	334819	334824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416624
3609	NC_004842	AAG	2	6	334882	334887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416624
3610	NC_004842	CGC	2	6	335156	335161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416625
3611	NC_004842	TTG	2	6	335179	335184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416625
3612	NC_004842	TGT	2	6	335412	335417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416625
3613	NC_004842	CCA	2	6	335439	335444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416625
3614	NC_004842	GAC	2	6	335446	335451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416625
3615	NC_004842	CCA	2	6	335491	335496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416625
3616	NC_004842	CGC	2	6	335651	335656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416626
3617	NC_004842	TTG	2	6	335674	335679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416626
3618	NC_004842	TGT	2	6	335907	335912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416626
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3620	NC_004842	GAC	2	6	335941	335946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416626
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3741	NC_004842	TGC	2	6	346076	346081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
3742	NC_004842	GCC	2	6	346103	346108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
3743	NC_004842	TCT	2	6	346150	346155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
3744	NC_004842	CTT	2	6	346210	346215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
3745	NC_004842	GCC	2	6	346268	346273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
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3850	NC_004842	ATC	2	6	358042	358047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416642
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3855	NC_004842	GCT	3	9	358789	358797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416642
3856	NC_004842	CCA	2	6	358798	358803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416642
3857	NC_004842	CCG	2	6	358892	358897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416642
3858	NC_004842	CGA	2	6	358980	358985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416642
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