MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 13509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004842	TTG	2	6	192604	192609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416522
2002	NC_004842	GCA	2	6	192656	192661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416522
2003	NC_004842	CCA	2	6	192758	192763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416522
2004	NC_004842	CCT	2	6	192797	192802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416522
2005	NC_004842	CAT	2	6	192995	193000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544993
2006	NC_004842	AGA	2	6	193068	193073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161544993
2007	NC_004842	CTT	2	6	193086	193091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161544993
2008	NC_004842	ATC	2	6	193107	193112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544993
2009	NC_004842	CTT	3	9	193191	193199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161544993
2010	NC_004842	CCT	2	6	193480	193485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416524
2011	NC_004842	GGA	2	6	193571	193576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416524
2012	NC_004842	TTC	2	6	193635	193640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416524
2013	NC_004842	AAG	2	6	193644	193649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416524
2014	NC_004842	TGC	2	6	193750	193755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416524
2015	NC_004842	CGA	2	6	193840	193845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416524
2016	NC_004842	TCA	2	6	193962	193967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416524
2017	NC_004842	CCA	2	6	194002	194007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416524
2018	NC_004842	CTT	2	6	194020	194025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416524
2019	NC_004842	CGT	2	6	194056	194061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416524
2020	NC_004842	CTG	3	9	194166	194174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416524
2021	NC_004842	AGA	2	6	194267	194272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416524
2022	NC_004842	ACC	2	6	194301	194306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416524
2023	NC_004842	CTC	2	6	194476	194481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416525
2024	NC_004842	TGA	2	6	194544	194549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416525
2025	NC_004842	CTT	2	6	194590	194595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416525
2026	NC_004842	CTT	2	6	194643	194648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416525
2027	NC_004842	GCC	2	6	194860	194865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416525
2028	NC_004842	CGC	2	6	194871	194876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416525
2029	NC_004842	GCA	2	6	195023	195028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416525
2030	NC_004842	CAG	2	6	195034	195039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416525
2031	NC_004842	AAC	2	6	195272	195277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416526
2032	NC_004842	CAT	2	6	195368	195373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416526
2033	NC_004842	CTC	2	6	195397	195402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416526
2034	NC_004842	CTT	3	9	195440	195448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416526
2035	NC_004842	TAC	2	6	195540	195545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416526
2036	NC_004842	GCT	2	6	195696	195701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416526
2037	NC_004842	GCC	2	6	195825	195830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416526
2038	NC_004842	CCT	2	6	195879	195884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416526
2039	NC_004842	GCT	2	6	196076	196081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416526
2040	NC_004842	GCC	2	6	196146	196151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416526
2041	NC_004842	ATG	2	6	196210	196215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416526
2042	NC_004842	AAG	2	6	196231	196236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416526
2043	NC_004842	TCC	2	6	196247	196252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416526
2044	NC_004842	GAT	2	6	196274	196279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416527
2045	NC_004842	TCT	2	6	196293	196298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416527
2046	NC_004842	ACA	2	6	196344	196349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416527
2047	NC_004842	GAC	2	6	196470	196475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416527
2048	NC_004842	GTG	2	6	196584	196589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416527
2049	NC_004842	AGA	2	6	196593	196598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416527
2050	NC_004842	CCA	2	6	196633	196638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416527
2051	NC_004842	CTC	2	6	196682	196687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416527
2052	NC_004842	GAA	2	6	196759	196764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416527
2053	NC_004842	TCT	2	6	197190	197195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416528
2054	NC_004842	TGG	2	6	197199	197204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416528
2055	NC_004842	GTG	2	6	197306	197311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416528
2056	NC_004842	TAC	2	6	197348	197353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416528
2057	NC_004842	CTA	2	6	197631	197636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416528
2058	NC_004842	TGC	2	6	197642	197647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416528
2059	NC_004842	CGT	2	6	197671	197676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416528
2060	NC_004842	GTG	2	6	198203	198208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416528
2061	NC_004842	GCC	2	6	198455	198460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416528
2062	NC_004842	TGG	2	6	198507	198512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416528
2063	NC_004842	TAA	3	9	198561	198569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416528
2064	NC_004842	CGC	2	6	198637	198642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416528
2065	NC_004842	TGC	2	6	198944	198949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416529
2066	NC_004842	CAG	2	6	198994	198999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416529
2067	NC_004842	CAC	2	6	199027	199032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416529
2068	NC_004842	CAC	2	6	199105	199110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416529
2069	NC_004842	TGG	2	6	199308	199313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416529
2070	NC_004842	TAT	2	6	199327	199332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416529
2071	NC_004842	ATC	3	9	199336	199344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416529
2072	NC_004842	ACC	2	6	199352	199357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416529
2073	NC_004842	CGG	2	6	199467	199472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416529
2074	NC_004842	TAA	2	6	199540	199545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416529
2075	NC_004842	ATC	2	6	199562	199567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416529
2076	NC_004842	CTC	2	6	199693	199698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416529
2077	NC_004842	TCT	2	6	199751	199756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416529
2078	NC_004842	CAG	2	6	199963	199968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416529
2079	NC_004842	GCT	2	6	200030	200035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416529
2080	NC_004842	AAG	2	6	200044	200049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416529
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2082	NC_004842	GCC	2	6	200198	200203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416529
2083	NC_004842	GAA	2	6	200212	200217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416529
2084	NC_004842	GAA	2	6	200221	200226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416529
2085	NC_004842	CTA	2	6	200331	200336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416529
2086	NC_004842	GCA	2	6	200613	200618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416530
2087	NC_004842	CAG	2	6	200754	200759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416530
2088	NC_004842	GTA	2	6	200773	200778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416530
2089	NC_004842	TAT	2	6	200859	200864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416530
2090	NC_004842	GCA	2	6	200868	200873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416530
2091	NC_004842	GTA	2	6	201218	201223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416530
2092	NC_004842	GTT	2	6	201907	201912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416531
2093	NC_004842	CCA	2	6	202016	202021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416531
2094	NC_004842	TCT	2	6	202141	202146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416531
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2096	NC_004842	TGG	2	6	202343	202348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416531
2097	NC_004842	GGC	2	6	202432	202437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416531
2098	NC_004842	GTT	2	6	202570	202575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416531
2099	NC_004842	CTG	2	6	202622	202627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416531
2100	NC_004842	TGG	2	6	202751	202756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416531
2101	NC_004842	ATG	2	6	202820	202825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416531
2102	NC_004842	CTG	2	6	202888	202893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416531
2103	NC_004842	GAG	2	6	202933	202938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416531
2104	NC_004842	TAC	2	6	202998	203003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416531
2105	NC_004842	ACT	2	6	203037	203042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416532
2106	NC_004842	GTA	2	6	203046	203051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416532
2107	NC_004842	GGA	2	6	203162	203167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416532
2108	NC_004842	CTG	2	6	203170	203175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416532
2109	NC_004842	AAG	2	6	203469	203474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
2110	NC_004842	CTC	2	6	203619	203624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416532
2111	NC_004842	GCC	2	6	203680	203685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416532
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2113	NC_004842	CTG	2	6	203885	203890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416532
2114	NC_004842	CGC	2	6	203921	203926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416532
2115	NC_004842	GAA	2	6	204218	204223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
2116	NC_004842	AGA	2	6	204348	204353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416532
2117	NC_004842	TAC	2	6	204439	204444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416533
2118	NC_004842	CAG	2	6	204520	204525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416533
2119	NC_004842	TCC	2	6	204890	204895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416533
2120	NC_004842	CAC	2	6	204940	204945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416533
2121	NC_004842	ACA	2	6	205244	205249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416533
2122	NC_004842	CGT	2	6	205443	205448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416533
2123	NC_004842	TCT	2	6	205815	205820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416533
2124	NC_004842	CAA	2	6	205896	205901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416533
2125	NC_004842	CTC	2	6	206291	206296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416534
2126	NC_004842	ACT	2	6	206340	206345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416534
2127	NC_004842	GTT	2	6	206347	206352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416534
2128	NC_004842	TGC	2	6	206356	206361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
2129	NC_004842	GCT	2	6	206413	206418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
2130	NC_004842	GCT	2	6	206436	206441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
2131	NC_004842	TGG	2	6	206455	206460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416534
2132	NC_004842	CGA	2	6	206468	206473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416534
2133	NC_004842	TGT	2	6	206502	206507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416534
2134	NC_004842	GTC	2	6	206522	206527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
2135	NC_004842	CGT	2	6	206656	206661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416534
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2139	NC_004842	TTG	2	6	207209	207214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416535
2140	NC_004842	TGA	2	6	207369	207374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
2141	NC_004842	AGA	2	6	207423	207428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416535
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2143	NC_004842	TGA	2	6	207660	207665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
2144	NC_004842	CTC	2	6	207726	207731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416535
2145	NC_004842	CTA	2	6	207754	207759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416535
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2147	NC_004842	TTG	2	6	207857	207862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416535
2148	NC_004842	CGT	2	6	207919	207924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416535
2149	NC_004842	GAG	2	6	207932	207937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416535
2150	NC_004842	GAA	2	6	208048	208053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416535
2151	NC_004842	TGA	2	6	208152	208157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416535
2152	NC_004842	GTG	2	6	208232	208237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416535
2153	NC_004842	ACC	2	6	208320	208325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416535
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2157	NC_004842	GAA	2	6	208855	208860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416536
2158	NC_004842	TCG	3	9	208920	208928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416537
2159	NC_004842	AGG	2	6	208939	208944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416537
2160	NC_004842	TGA	2	6	209003	209008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416537
2161	NC_004842	AGA	2	6	209149	209154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416537
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2223	NC_004842	GAT	2	6	213283	213288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416541
2224	NC_004842	GCA	3	9	213335	213343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416541
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2227	NC_004842	ATG	2	6	213416	213421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416541
2228	NC_004842	TGA	2	6	213491	213496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416541
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2230	NC_004842	ATG	2	6	213692	213697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416542
2231	NC_004842	ATA	2	6	213767	213772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416542
2232	NC_004842	GAA	2	6	213816	213821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416542
2233	NC_004842	GCT	2	6	213823	213828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416542
2234	NC_004842	TCC	2	6	213844	213849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416542
2235	NC_004842	GTT	2	6	213892	213897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416542
2236	NC_004842	TGG	2	6	213959	213964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416542
2237	NC_004842	GTT	2	6	214039	214044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161544992
2238	NC_004842	GAG	2	6	214056	214061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161544992
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2240	NC_004842	TGT	2	6	214265	214270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161544992
2241	NC_004842	CAT	2	6	214451	214456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544992
2242	NC_004842	TGC	2	6	214568	214573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161544992
2243	NC_004842	CTG	2	6	214806	214811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416544
2244	NC_004842	TGT	2	6	214864	214869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416544
2245	NC_004842	GAA	2	6	214870	214875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416544
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2250	NC_004842	CAT	2	6	215097	215102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416544
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2255	NC_004842	CTG	3	9	215458	215466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416545
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2363	NC_004842	GTA	2	6	226193	226198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416549
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2481	NC_004842	CGT	2	6	238071	238076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416559
2482	NC_004842	TGT	2	6	238107	238112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416559
2483	NC_004842	CGC	2	6	238189	238194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416559
2484	NC_004842	ACA	2	6	238257	238262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416559
2485	NC_004842	AAT	2	6	238271	238276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416559
2486	NC_004842	TAC	2	6	238305	238310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416559
2487	NC_004842	CGT	2	6	238480	238485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416559
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