MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 1715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003062	GCCGT	2	10	829634	829643	0 %	20 %	40 %	40 %	159184484
502	NC_003062	TGCCG	2	10	834087	834096	0 %	20 %	40 %	40 %	159184486
503	NC_003062	CTCCG	2	10	838071	838080	0 %	20 %	20 %	60 %	159184489
504	NC_003062	GAAGC	2	10	838393	838402	40 %	0 %	40 %	20 %	159184489
505	NC_003062	TGAAA	2	10	839729	839738	60 %	20 %	20 %	0 %	159184490
506	NC_003062	GCGCG	2	10	840089	840098	0 %	0 %	60 %	40 %	159184491
507	NC_003062	GTCAT	2	10	842685	842694	20 %	40 %	20 %	20 %	159184492
508	NC_003062	TGCCG	3	15	844448	844462	0 %	20 %	40 %	40 %	159184493
509	NC_003062	TGCGC	2	10	848575	848584	0 %	20 %	40 %	40 %	15888187
510	NC_003062	ATGCC	2	10	848848	848857	20 %	20 %	20 %	40 %	15888188
511	NC_003062	GCAGG	2	10	849423	849432	20 %	0 %	60 %	20 %	159184496
512	NC_003062	GGGCA	2	10	855097	855106	20 %	0 %	60 %	20 %	159184500
513	NC_003062	GTCAT	2	10	862184	862193	20 %	40 %	20 %	20 %	15888206
514	NC_003062	GGCAC	2	10	862674	862683	20 %	0 %	40 %	40 %	15888206
515	NC_003062	CCTCG	2	10	868635	868644	0 %	20 %	20 %	60 %	15888213
516	NC_003062	TCGGT	2	10	869132	869141	0 %	40 %	40 %	20 %	15888213
517	NC_003062	CCGTG	2	10	869322	869331	0 %	20 %	40 %	40 %	15888213
518	NC_003062	CGCTT	2	10	869703	869712	0 %	40 %	20 %	40 %	15888213
519	NC_003062	ACGGC	2	10	870385	870394	20 %	0 %	40 %	40 %	15888213
520	NC_003062	CCCGT	2	10	870458	870467	0 %	20 %	20 %	60 %	15888213
521	NC_003062	TGCGG	2	10	871372	871381	0 %	20 %	60 %	20 %	159184509
522	NC_003062	GATCC	2	10	873308	873317	20 %	20 %	20 %	40 %	15888217
523	NC_003062	GATCG	2	10	874353	874362	20 %	20 %	40 %	20 %	159184511
524	NC_003062	TGGCG	2	10	874568	874577	0 %	20 %	60 %	20 %	159184512
525	NC_003062	GCCGC	2	10	875838	875847	0 %	0 %	40 %	60 %	159184513
526	NC_003062	GCGAT	2	10	876965	876974	20 %	20 %	40 %	20 %	15888222
527	NC_003062	GGGCC	2	10	877255	877264	0 %	0 %	60 %	40 %	15888222
528	NC_003062	GGAGT	2	10	878939	878948	20 %	20 %	60 %	0 %	15888225
529	NC_003062	GCCTT	2	10	879010	879019	0 %	40 %	20 %	40 %	15888225
530	NC_003062	GGCGT	2	10	879801	879810	0 %	20 %	60 %	20 %	15888226
531	NC_003062	GCGCG	2	10	881710	881719	0 %	0 %	60 %	40 %	159184518
532	NC_003062	CATTG	2	10	882022	882031	20 %	40 %	20 %	20 %	159184519
533	NC_003062	ACCGC	2	10	884644	884653	20 %	0 %	20 %	60 %	159184520
534	NC_003062	CCTTG	2	10	889057	889066	0 %	40 %	20 %	40 %	15888236
535	NC_003062	CGGCG	2	10	892383	892392	0 %	0 %	60 %	40 %	15888240
536	NC_003062	CGCCA	2	10	896252	896261	20 %	0 %	20 %	60 %	159184525
537	NC_003062	ACGCG	2	10	897741	897750	20 %	0 %	40 %	40 %	15888245
538	NC_003062	GCCGG	2	10	900537	900546	0 %	0 %	60 %	40 %	15888247
539	NC_003062	AGGGG	2	10	904519	904528	20 %	0 %	80 %	0 %	15888252
540	NC_003062	TCCAT	2	10	904707	904716	20 %	40 %	0 %	40 %	15888253
541	NC_003062	CCGGC	2	10	906786	906795	0 %	0 %	40 %	60 %	15888256
542	NC_003062	GCTGA	2	10	910759	910768	20 %	20 %	40 %	20 %	15888260
543	NC_003062	AGCCG	2	10	911022	911031	20 %	0 %	40 %	40 %	15888260
544	NC_003062	CCCGC	2	10	911678	911687	0 %	0 %	20 %	80 %	159184530
545	NC_003062	GCGTT	2	10	912275	912284	0 %	40 %	40 %	20 %	159184531
546	NC_003062	ACCGA	2	10	913559	913568	40 %	0 %	20 %	40 %	15888264
547	NC_003062	TGGGG	2	10	916592	916601	0 %	20 %	80 %	0 %	159184533
548	NC_003062	CCCAG	2	10	917646	917655	20 %	0 %	20 %	60 %	159184534
549	NC_003062	GCTGA	2	10	918776	918785	20 %	20 %	40 %	20 %	15888269
550	NC_003062	GCGCC	2	10	920712	920721	0 %	0 %	40 %	60 %	15888270
551	NC_003062	CAGGT	2	10	922254	922263	20 %	20 %	40 %	20 %	15888270
552	NC_003062	CGTCG	2	10	924689	924698	0 %	20 %	40 %	40 %	15888274
553	NC_003062	GGCCG	2	10	925283	925292	0 %	0 %	60 %	40 %	159184537
554	NC_003062	GAGAC	2	10	931986	931995	40 %	0 %	40 %	20 %	15888283
555	NC_003062	AGCTC	2	10	933217	933226	20 %	20 %	20 %	40 %	15888283
556	NC_003062	GCGCC	2	10	933698	933707	0 %	0 %	40 %	60 %	159184545
557	NC_003062	GGAAG	2	10	934841	934850	40 %	0 %	60 %	0 %	159184545
558	NC_003062	CACCC	2	10	935238	935247	20 %	0 %	0 %	80 %	15888285
559	NC_003062	GGGCA	2	10	935534	935543	20 %	0 %	60 %	20 %	15888285
560	NC_003062	AAGCG	2	10	938576	938585	40 %	0 %	40 %	20 %	159184548
561	NC_003062	CGAAT	2	10	939660	939669	40 %	20 %	20 %	20 %	159184548
562	NC_003062	ACTTG	2	10	939976	939985	20 %	40 %	20 %	20 %	159184548
563	NC_003062	CTGGA	2	10	944495	944504	20 %	20 %	40 %	20 %	15888294
564	NC_003062	GCCGA	2	10	945642	945651	20 %	0 %	40 %	40 %	15888296
565	NC_003062	GGCCG	2	10	946897	946906	0 %	0 %	60 %	40 %	15888297
566	NC_003062	CGCGG	2	10	947883	947892	0 %	0 %	60 %	40 %	159184551
567	NC_003062	GCGCG	2	10	950226	950235	0 %	0 %	60 %	40 %	159184554
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569	NC_003062	GGCTG	2	10	951910	951919	0 %	20 %	60 %	20 %	15888306
570	NC_003062	GGCGC	2	10	952558	952567	0 %	0 %	60 %	40 %	15888307
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572	NC_003062	ACCGG	2	10	953682	953691	20 %	0 %	40 %	40 %	15888308
573	NC_003062	GCCGG	2	10	954192	954201	0 %	0 %	60 %	40 %	15888309
574	NC_003062	AGGCG	2	10	954679	954688	20 %	0 %	60 %	20 %	15888310
575	NC_003062	TGATC	2	10	959460	959469	20 %	40 %	20 %	20 %	159184556
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577	NC_003062	AGCGA	2	10	960734	960743	40 %	0 %	40 %	20 %	15888314
578	NC_003062	GACCA	2	10	961313	961322	40 %	0 %	20 %	40 %	159184557
579	NC_003062	GCGCG	2	10	961498	961507	0 %	0 %	60 %	40 %	159184557
580	NC_003062	CTGAT	2	10	961541	961550	20 %	40 %	20 %	20 %	159184557
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583	NC_003062	GCATT	2	10	964801	964810	20 %	40 %	20 %	20 %	15888318
584	NC_003062	TGTCG	2	10	965743	965752	0 %	40 %	40 %	20 %	159184558
585	NC_003062	ACCGC	2	10	966254	966263	20 %	0 %	20 %	60 %	15888320
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587	NC_003062	CGCGA	2	10	968189	968198	20 %	0 %	40 %	40 %	15888321
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590	NC_003062	GACGA	2	10	969523	969532	40 %	0 %	40 %	20 %	159184559
591	NC_003062	GCTGC	2	10	971496	971505	0 %	20 %	40 %	40 %	159184560
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594	NC_003062	GCGCT	2	10	982487	982496	0 %	20 %	40 %	40 %	15888330
595	NC_003062	CCGCG	2	10	984970	984979	0 %	0 %	40 %	60 %	159184564
596	NC_003062	GCCCA	2	10	986516	986525	20 %	0 %	20 %	60 %	159184565
597	NC_003062	CATGG	2	10	987158	987167	20 %	20 %	40 %	20 %	15888334
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599	NC_003062	CGATG	2	10	991862	991871	20 %	20 %	40 %	20 %	159184566
600	NC_003062	GGCGA	2	10	992037	992046	20 %	0 %	60 %	20 %	159184566
601	NC_003062	CGGCT	2	10	994461	994470	0 %	20 %	40 %	40 %	15888341
602	NC_003062	TCGGT	2	10	994483	994492	0 %	40 %	40 %	20 %	15888341
603	NC_003062	AGGGC	2	10	995033	995042	20 %	0 %	60 %	20 %	15888341
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610	NC_003062	ATGTG	2	10	1004580	1004589	20 %	40 %	40 %	0 %	159184575
611	NC_003062	GCCGG	2	10	1007810	1007819	0 %	0 %	60 %	40 %	15888356
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614	NC_003062	CGGCC	2	10	1009962	1009971	0 %	0 %	40 %	60 %	15888358
615	NC_003062	GTTGC	2	10	1011639	1011648	0 %	40 %	40 %	20 %	159184578
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617	NC_003062	GCAGT	2	10	1014812	1014821	20 %	20 %	40 %	20 %	15888364
618	NC_003062	ATCTG	2	10	1015039	1015048	20 %	40 %	20 %	20 %	15888364
619	NC_003062	TAGGG	2	10	1017169	1017178	20 %	20 %	60 %	0 %	159184580
620	NC_003062	CCCGG	2	10	1017480	1017489	0 %	0 %	40 %	60 %	159184581
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622	NC_003062	AAGGC	2	10	1018813	1018822	40 %	0 %	40 %	20 %	159184582
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625	NC_003062	GCGTG	2	10	1025669	1025678	0 %	20 %	60 %	20 %	15888374
626	NC_003062	ATTGG	2	10	1026087	1026096	20 %	40 %	40 %	0 %	15888375
627	NC_003062	CCGCG	2	10	1026212	1026221	0 %	0 %	40 %	60 %	15888375
628	NC_003062	CCGGA	2	10	1027994	1028003	20 %	0 %	40 %	40 %	159184588
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