MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 1715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003062	GCTGC	2	10	2466305	2466314	0 %	20 %	40 %	40 %	15889761
1502	NC_003062	CTCAT	2	10	2469108	2469117	20 %	40 %	0 %	40 %	15889766
1503	NC_003062	GAAAA	2	10	2470878	2470887	80 %	0 %	20 %	0 %	159185244
1504	NC_003062	CGCCC	2	10	2471695	2471704	0 %	0 %	20 %	80 %	15889768
1505	NC_003062	CGCAA	2	10	2472913	2472922	40 %	0 %	20 %	40 %	159185245
1506	NC_003062	CGTTC	2	10	2474124	2474133	0 %	40 %	20 %	40 %	15889770
1507	NC_003062	CGGCA	2	10	2475143	2475152	20 %	0 %	40 %	40 %	15889771
1508	NC_003062	CCGGC	2	10	2478480	2478489	0 %	0 %	40 %	60 %	159185247
1509	NC_003062	CGGCA	2	10	2481680	2481689	20 %	0 %	40 %	40 %	159185249
1510	NC_003062	CGCGC	2	10	2483250	2483259	0 %	0 %	40 %	60 %	159185250
1511	NC_003062	GGAAC	2	10	2488093	2488102	40 %	0 %	40 %	20 %	159185251
1512	NC_003062	TCCTG	2	10	2495119	2495128	0 %	40 %	20 %	40 %	15889788
1513	NC_003062	ATGGC	2	10	2495191	2495200	20 %	20 %	40 %	20 %	15889788
1514	NC_003062	TCAGC	2	10	2497129	2497138	20 %	20 %	20 %	40 %	15889789
1515	NC_003062	CGGAC	2	10	2500048	2500057	20 %	0 %	40 %	40 %	15889791
1516	NC_003062	GCTTC	2	10	2500080	2500089	0 %	40 %	20 %	40 %	15889791
1517	NC_003062	CGGCC	2	10	2501297	2501306	0 %	0 %	40 %	60 %	15889793
1518	NC_003062	CCTTG	2	10	2503133	2503142	0 %	40 %	20 %	40 %	15889794
1519	NC_003062	GCACG	2	10	2503362	2503371	20 %	0 %	40 %	40 %	159185254
1520	NC_003062	CCGCG	2	10	2503590	2503599	0 %	0 %	40 %	60 %	159185254
1521	NC_003062	CGCGC	2	10	2504295	2504304	0 %	0 %	40 %	60 %	159185254
1522	NC_003062	GCTCC	2	10	2506780	2506789	0 %	20 %	20 %	60 %	159185257
1523	NC_003062	GAACA	2	10	2507243	2507252	60 %	0 %	20 %	20 %	15889800
1524	NC_003062	GCGAA	2	10	2509069	2509078	40 %	0 %	40 %	20 %	159185258
1525	NC_003062	CACGG	2	10	2512015	2512024	20 %	0 %	40 %	40 %	15889803
1526	NC_003062	ACAGA	2	10	2512981	2512990	60 %	0 %	20 %	20 %	159185260
1527	NC_003062	GATCA	2	10	2516488	2516497	40 %	20 %	20 %	20 %	159185262
1528	NC_003062	CCCGA	2	10	2519445	2519454	20 %	0 %	20 %	60 %	15889807
1529	NC_003062	CGATC	2	10	2521653	2521662	20 %	20 %	20 %	40 %	159185263
1530	NC_003062	ATGCG	2	10	2522821	2522830	20 %	20 %	40 %	20 %	15889810
1531	NC_003062	ACGAC	2	10	2523256	2523265	40 %	0 %	20 %	40 %	15889810
1532	NC_003062	CGTGG	2	10	2524832	2524841	0 %	20 %	60 %	20 %	15889810
1533	NC_003062	AACAA	2	10	2525368	2525377	80 %	0 %	0 %	20 %	15889810
1534	NC_003062	CGGCG	2	10	2532206	2532215	0 %	0 %	60 %	40 %	15889817
1535	NC_003062	TCGCC	2	10	2534298	2534307	0 %	20 %	20 %	60 %	159185267
1536	NC_003062	GCATT	2	10	2534721	2534730	20 %	40 %	20 %	20 %	159185268
1537	NC_003062	CTCGC	2	10	2535899	2535908	0 %	20 %	20 %	60 %	15889821
1538	NC_003062	GAACC	2	10	2537741	2537750	40 %	0 %	20 %	40 %	159185269
1539	NC_003062	CCGCA	2	10	2538640	2538649	20 %	0 %	20 %	60 %	15889824
1540	NC_003062	GGACG	2	10	2539284	2539293	20 %	0 %	60 %	20 %	159185270
1541	NC_003062	CCGGA	2	10	2539523	2539532	20 %	0 %	40 %	40 %	159185270
1542	NC_003062	TGGCA	2	10	2539806	2539815	20 %	20 %	40 %	20 %	159185270
1543	NC_003062	CGTGG	2	10	2544112	2544121	0 %	20 %	60 %	20 %	159185272
1544	NC_003062	AACGC	2	10	2550202	2550211	40 %	0 %	20 %	40 %	15889834
1545	NC_003062	GCGCT	2	10	2551472	2551481	0 %	20 %	40 %	40 %	15889834
1546	NC_003062	AGCGA	2	10	2551804	2551813	40 %	0 %	40 %	20 %	15889834
1547	NC_003062	GGTCA	2	10	2554288	2554297	20 %	20 %	40 %	20 %	159185275
1548	NC_003062	GAAGC	2	10	2555746	2555755	40 %	0 %	40 %	20 %	15889837
1549	NC_003062	AAGAG	2	10	2556243	2556252	60 %	0 %	40 %	0 %	15889837
1550	NC_003062	GCATG	2	10	2556373	2556382	20 %	20 %	40 %	20 %	159185444
1551	NC_003062	ACTTC	2	10	2563541	2563550	20 %	40 %	0 %	40 %	159185279
1552	NC_003062	CTGGA	2	10	2566837	2566846	20 %	20 %	40 %	20 %	15889846
1553	NC_003062	CTCGC	2	10	2569298	2569307	0 %	20 %	20 %	60 %	159185282
1554	NC_003062	GCCGG	2	10	2570250	2570259	0 %	0 %	60 %	40 %	159185283
1555	NC_003062	GCCCC	2	10	2571591	2571600	0 %	0 %	20 %	80 %	159185284
1556	NC_003062	GCACC	2	10	2572002	2572011	20 %	0 %	20 %	60 %	15889851
1557	NC_003062	CGAAA	2	10	2573586	2573595	60 %	0 %	20 %	20 %	15889852
1558	NC_003062	CTCCG	2	10	2574238	2574247	0 %	20 %	20 %	60 %	15889852
1559	NC_003062	TGCCA	2	10	2574761	2574770	20 %	20 %	20 %	40 %	15889853
1560	NC_003062	ACGCC	2	10	2575357	2575366	20 %	0 %	20 %	60 %	15889853
1561	NC_003062	GCCAT	2	10	2576713	2576722	20 %	20 %	20 %	40 %	159185285
1562	NC_003062	CCGGA	2	10	2576981	2576990	20 %	0 %	40 %	40 %	159185285
1563	NC_003062	TCGAC	2	10	2578989	2578998	20 %	20 %	20 %	40 %	15889857
1564	NC_003062	TTGCC	2	10	2580315	2580324	0 %	40 %	20 %	40 %	15889858
1565	NC_003062	TTTTC	2	10	2581146	2581155	0 %	80 %	0 %	20 %	15889858
1566	NC_003062	CTGCG	2	10	2583250	2583259	0 %	20 %	40 %	40 %	15889860
1567	NC_003062	GCGCG	2	10	2584055	2584064	0 %	0 %	60 %	40 %	159185287
1568	NC_003062	CCACC	2	10	2585263	2585272	20 %	0 %	0 %	80 %	15889862
1569	NC_003062	GATGA	2	10	2585276	2585285	40 %	20 %	40 %	0 %	15889862
1570	NC_003062	TCGCC	2	10	2588561	2588570	0 %	20 %	20 %	60 %	15889865
1571	NC_003062	CATGG	2	10	2589136	2589145	20 %	20 %	40 %	20 %	15889866
1572	NC_003062	CCCGT	2	10	2589604	2589613	0 %	20 %	20 %	60 %	15889866
1573	NC_003062	AAAAG	2	10	2592104	2592113	80 %	0 %	20 %	0 %	15889868
1574	NC_003062	GCTTC	2	10	2592865	2592874	0 %	40 %	20 %	40 %	426327215
1575	NC_003062	GGCTA	2	10	2596172	2596181	20 %	20 %	40 %	20 %	159185292
1576	NC_003062	CCGCA	2	10	2597975	2597984	20 %	0 %	20 %	60 %	159185292
1577	NC_003062	ACGGC	2	10	2598059	2598068	20 %	0 %	40 %	40 %	159185292
1578	NC_003062	CGACC	2	10	2599899	2599908	20 %	0 %	20 %	60 %	159185292
1579	NC_003062	AAATC	2	10	2602616	2602625	60 %	20 %	0 %	20 %	159185294
1580	NC_003062	GCCCA	2	10	2602945	2602954	20 %	0 %	20 %	60 %	159185294
1581	NC_003062	CACGA	2	10	2603518	2603527	40 %	0 %	20 %	40 %	159185295
1582	NC_003062	CGGCA	2	10	2603812	2603821	20 %	0 %	40 %	40 %	159185295
1583	NC_003062	CCGAA	2	10	2607410	2607419	40 %	0 %	20 %	40 %	15889879
1584	NC_003062	TTTGA	2	10	2608584	2608593	20 %	60 %	20 %	0 %	15889879
1585	NC_003062	CGCGG	2	10	2608617	2608626	0 %	0 %	60 %	40 %	15889879
1586	NC_003062	TCAGT	2	10	2608798	2608807	20 %	40 %	20 %	20 %	159185298
1587	NC_003062	TGGGC	2	10	2609623	2609632	0 %	20 %	60 %	20 %	159185299
1588	NC_003062	TCCGC	2	10	2610393	2610402	0 %	20 %	20 %	60 %	159185300
1589	NC_003062	ATGGA	2	10	2612262	2612271	40 %	20 %	40 %	0 %	15889883
1590	NC_003062	TGCGC	2	10	2613049	2613058	0 %	20 %	40 %	40 %	15889883
1591	NC_003062	GCCGC	2	10	2616203	2616212	0 %	0 %	40 %	60 %	15889887
1592	NC_003062	CAACA	2	10	2617716	2617725	60 %	0 %	0 %	40 %	159185303
1593	NC_003062	CATTC	2	10	2617994	2618003	20 %	40 %	0 %	40 %	159185303
1594	NC_003062	TCGCT	2	10	2619371	2619380	0 %	40 %	20 %	40 %	15889890
1595	NC_003062	GACGC	2	10	2627943	2627952	20 %	0 %	40 %	40 %	15889898
1596	NC_003062	GCATC	2	10	2630282	2630291	20 %	20 %	20 %	40 %	15889899
1597	NC_003062	CCTCA	2	10	2633520	2633529	20 %	20 %	0 %	60 %	15889906
1598	NC_003062	GCCGA	2	10	2633644	2633653	20 %	0 %	40 %	40 %	15889906
1599	NC_003062	GAGAC	2	10	2633836	2633845	40 %	0 %	40 %	20 %	15889906
1600	NC_003062	GCCCG	2	10	2634097	2634106	0 %	0 %	40 %	60 %	15889906
1601	NC_003062	GCGCG	2	10	2634579	2634588	0 %	0 %	60 %	40 %	159185308
1602	NC_003062	CATCC	2	10	2636711	2636720	20 %	20 %	0 %	60 %	15889909
1603	NC_003062	CATCG	2	10	2638472	2638481	20 %	20 %	20 %	40 %	159185309
1604	NC_003062	CAGGC	2	10	2638947	2638956	20 %	0 %	40 %	40 %	159185310
1605	NC_003062	GCCGT	2	10	2640403	2640412	0 %	20 %	40 %	40 %	159185310
1606	NC_003062	CACAG	2	10	2642677	2642686	40 %	0 %	20 %	40 %	159185311
1607	NC_003062	CGAGC	2	10	2644706	2644715	20 %	0 %	40 %	40 %	15889918
1608	NC_003062	ACGGA	2	10	2646451	2646460	40 %	0 %	40 %	20 %	15889919
1609	NC_003062	TCCAC	2	10	2646873	2646882	20 %	20 %	0 %	60 %	15889919
1610	NC_003062	GCATC	2	10	2647236	2647245	20 %	20 %	20 %	40 %	159185314
1611	NC_003062	ATCGG	2	10	2647538	2647547	20 %	20 %	40 %	20 %	159185314
1612	NC_003062	CACGC	2	10	2649874	2649883	20 %	0 %	20 %	60 %	15889921
1613	NC_003062	TCTGG	2	10	2654018	2654027	0 %	40 %	40 %	20 %	159185318
1614	NC_003062	AGCGA	2	10	2654841	2654850	40 %	0 %	40 %	20 %	15889926
1615	NC_003062	GGTCA	2	10	2656012	2656021	20 %	20 %	40 %	20 %	15889927
1616	NC_003062	CTGCG	2	10	2656958	2656967	0 %	20 %	40 %	40 %	159185319
1617	NC_003062	CGCGC	2	10	2658176	2658185	0 %	0 %	40 %	60 %	159185320
1618	NC_003062	CGATC	2	10	2661148	2661157	20 %	20 %	20 %	40 %	159185324
1619	NC_003062	CTTCG	2	10	2663462	2663471	0 %	40 %	20 %	40 %	15889936
1620	NC_003062	CGCTG	2	10	2665878	2665887	0 %	20 %	40 %	40 %	15889937
1621	NC_003062	TGTGA	2	10	2667932	2667941	20 %	40 %	40 %	0 %	159185326
1622	NC_003062	GATCT	2	10	2672267	2672276	20 %	40 %	20 %	20 %	15889942
1623	NC_003062	TGCGC	2	10	2674089	2674098	0 %	20 %	40 %	40 %	159185328
1624	NC_003062	GAATG	2	10	2674453	2674462	40 %	20 %	40 %	0 %	159185329
1625	NC_003062	CAGCG	2	10	2676401	2676410	20 %	0 %	40 %	40 %	159185330
1626	NC_003062	ACCGA	2	10	2678502	2678511	40 %	0 %	20 %	40 %	159185331
1627	NC_003062	GGCCG	2	10	2679691	2679700	0 %	0 %	60 %	40 %	15889949
1628	NC_003062	CGCGC	2	10	2679859	2679868	0 %	0 %	40 %	60 %	15889949
1629	NC_003062	GCCCT	2	10	2684886	2684895	0 %	20 %	20 %	60 %	159185334
1630	NC_003062	ACGAT	2	10	2691298	2691307	40 %	20 %	20 %	20 %	15889960
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1652	NC_003062	CCGGA	2	10	2728865	2728874	20 %	0 %	40 %	40 %	159185354
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1655	NC_003062	TGCCC	2	10	2731605	2731614	0 %	20 %	20 %	60 %	15889984
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1658	NC_003062	ACCTC	2	10	2738218	2738227	20 %	20 %	0 %	60 %	15889990
1659	NC_003062	TGAAG	2	10	2738537	2738546	40 %	20 %	40 %	0 %	15889990
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1663	NC_003062	CGATC	2	10	2744644	2744653	20 %	20 %	20 %	40 %	159185359
1664	NC_003062	GCCGA	2	10	2745273	2745282	20 %	0 %	40 %	40 %	15889996
1665	NC_003062	TCTTT	2	10	2745700	2745709	0 %	80 %	0 %	20 %	15889996
1666	NC_003062	CTGGA	2	10	2746463	2746472	20 %	20 %	40 %	20 %	15889997
1667	NC_003062	CGCTG	2	10	2746800	2746809	0 %	20 %	40 %	40 %	15889997
1668	NC_003062	GGGCT	2	10	2748889	2748898	0 %	20 %	60 %	20 %	159185360
1669	NC_003062	TATTC	2	10	2750880	2750889	20 %	60 %	0 %	20 %	15890001
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1671	NC_003062	TGGCT	2	10	2751383	2751392	0 %	40 %	40 %	20 %	159185362
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1675	NC_003062	GCTTC	2	10	2762236	2762245	0 %	40 %	20 %	40 %	159185367
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1683	NC_003062	AGCGA	2	10	2781936	2781945	40 %	0 %	40 %	20 %	15890025
1684	NC_003062	GCCGG	2	10	2782110	2782119	0 %	0 %	60 %	40 %	15890025
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1689	NC_003062	CATGG	2	10	2795305	2795314	20 %	20 %	40 %	20 %	15890040
1690	NC_003062	CGGCG	2	10	2795665	2795674	0 %	0 %	60 %	40 %	15890040
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1695	NC_003062	CAGAA	2	10	2807844	2807853	60 %	0 %	20 %	20 %	15890051
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1702	NC_003062	CAGCG	2	10	2819342	2819351	20 %	0 %	40 %	40 %	159185395
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1709	NC_003062	GTCAA	2	10	2830642	2830651	40 %	20 %	20 %	20 %	159185402
1710	NC_003062	CCGCG	2	10	2831608	2831617	0 %	0 %	40 %	60 %	15890072
1711	NC_003062	CGCAG	2	10	2832420	2832429	20 %	0 %	40 %	40 %	159185403
1712	NC_003062	CCGGA	2	10	2832968	2832977	20 %	0 %	40 %	40 %	159185404
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1714	NC_003062	GAATT	2	10	2836630	2836639	40 %	40 %	20 %	0 %	15890076
1715	NC_003062	GTTCG	2	10	2837571	2837580	0 %	40 %	40 %	20 %	15890077

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.