MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022784	GCAG	2	8	235352	235359	25 %	0 %	50 %	25 %	557625465
502	NC_022784	GAGC	2	8	235415	235422	25 %	0 %	50 %	25 %	557625465
503	NC_022784	TGAG	2	8	235988	235995	25 %	25 %	50 %	0 %	557625466
504	NC_022784	TTCT	2	8	236080	236087	0 %	75 %	0 %	25 %	557625466
505	NC_022784	TTTG	2	8	236180	236187	0 %	75 %	25 %	0 %	557625467
506	NC_022784	CTGT	2	8	236334	236341	0 %	50 %	25 %	25 %	557625467
507	NC_022784	TCCA	2	8	236627	236634	25 %	25 %	0 %	50 %	557625467
508	NC_022784	TGCT	2	8	237232	237239	0 %	50 %	25 %	25 %	557625468
509	NC_022784	GGCA	2	8	237396	237403	25 %	0 %	50 %	25 %	557625468
510	NC_022784	GCGA	2	8	237438	237445	25 %	0 %	50 %	25 %	557625468
511	NC_022784	ACTG	2	8	238011	238018	25 %	25 %	25 %	25 %	557625469
512	NC_022784	ACCA	2	8	239119	239126	50 %	0 %	0 %	50 %	557625469
513	NC_022784	AATA	2	8	240092	240099	75 %	25 %	0 %	0 %	557626119
514	NC_022784	TGCG	2	8	241224	241231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_022784	GTGA	2	8	241255	241262	25 %	25 %	50 %	0 %	557625472
516	NC_022784	GCTG	2	8	241638	241645	0 %	25 %	50 %	25 %	557625472
517	NC_022784	ATGA	2	8	242093	242100	50 %	25 %	25 %	0 %	557625472
518	NC_022784	CGAC	2	8	242250	242257	25 %	0 %	25 %	50 %	557626120
519	NC_022784	TGAT	2	8	242515	242522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022784	AGTA	2	8	242807	242814	50 %	25 %	25 %	0 %	557625473
521	NC_022784	ATCA	2	8	242830	242837	50 %	25 %	0 %	25 %	557625473
522	NC_022784	ATTG	2	8	243053	243060	25 %	50 %	25 %	0 %	557625473
523	NC_022784	ACGA	2	8	243096	243103	50 %	0 %	25 %	25 %	557625473
524	NC_022784	AGGG	2	8	243569	243576	25 %	0 %	75 %	0 %	557625473
525	NC_022784	TGCA	2	8	244018	244025	25 %	25 %	25 %	25 %	557625473
526	NC_022784	GAGG	2	8	244322	244329	25 %	0 %	75 %	0 %	557625473
527	NC_022784	TACA	2	8	244455	244462	50 %	25 %	0 %	25 %	557625473
528	NC_022784	CTGG	2	8	244542	244549	0 %	25 %	50 %	25 %	557625473
529	NC_022784	TGAT	2	8	245167	245174	25 %	50 %	25 %	0 %	557625473
530	NC_022784	AGTG	2	8	245370	245377	25 %	25 %	50 %	0 %	557625473
531	NC_022784	TTCC	2	8	246693	246700	0 %	50 %	0 %	50 %	557625474
532	NC_022784	AGTT	2	8	246882	246889	25 %	50 %	25 %	0 %	557625474
533	NC_022784	TTTA	2	8	247643	247650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022784	GAAC	2	8	247749	247756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_022784	GTGA	2	8	248112	248119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022784	TTCT	2	8	249505	249512	0 %	75 %	0 %	25 %	557625475
537	NC_022784	TTTG	2	8	249779	249786	0 %	75 %	25 %	0 %	557625475
538	NC_022784	GGTT	2	8	250089	250096	0 %	50 %	50 %	0 %	557625476
539	NC_022784	CAGC	2	8	250406	250413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
540	NC_022784	CCTC	2	8	250428	250435	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
541	NC_022784	ACTT	2	8	251189	251196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_022784	TGAG	2	8	251221	251228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022784	TGGT	2	8	252019	252026	0 %	50 %	50 %	0 %	557626121
544	NC_022784	TGTT	2	8	252190	252197	0 %	75 %	25 %	0 %	557625477
545	NC_022784	CGCA	2	8	252241	252248	25 %	0 %	25 %	50 %	557625477
546	NC_022784	GCCC	2	8	252379	252386	0 %	0 %	25 %	75 %	557625477
547	NC_022784	GTTG	2	8	252954	252961	0 %	50 %	50 %	0 %	557625477
548	NC_022784	CGAG	2	8	253847	253854	25 %	0 %	50 %	25 %	557625479
549	NC_022784	TATG	2	8	253998	254005	25 %	50 %	25 %	0 %	557625479
550	NC_022784	ACAA	2	8	254905	254912	75 %	0 %	0 %	25 %	557625479
551	NC_022784	TGCT	2	8	256157	256164	0 %	50 %	25 %	25 %	557625481
552	NC_022784	CCTT	2	8	256531	256538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_022784	TAAC	2	8	257883	257890	50 %	25 %	0 %	25 %	557625482
554	NC_022784	ATTT	2	8	258439	258446	25 %	75 %	0 %	0 %	557625483
555	NC_022784	AAAC	2	8	259559	259566	75 %	0 %	0 %	25 %	557626122
556	NC_022784	ATGG	2	8	260169	260176	25 %	25 %	50 %	0 %	557625485
557	NC_022784	TCAA	2	8	260418	260425	50 %	25 %	0 %	25 %	557625485
558	NC_022784	TTCA	2	8	260588	260595	25 %	50 %	0 %	25 %	557625485
559	NC_022784	CGAG	2	8	261031	261038	25 %	0 %	50 %	25 %	557625485
560	NC_022784	AAAG	2	8	261306	261313	75 %	0 %	25 %	0 %	557625485
561	NC_022784	GATG	2	8	262019	262026	25 %	25 %	50 %	0 %	557625486
562	NC_022784	GGGT	2	8	262182	262189	0 %	25 %	75 %	0 %	557625487
563	NC_022784	TGCT	2	8	264003	264010	0 %	50 %	25 %	25 %	557625488
564	NC_022784	GAGT	2	8	264027	264034	25 %	25 %	50 %	0 %	557625488
565	NC_022784	ACGT	2	8	264463	264470	25 %	25 %	25 %	25 %	557625488
566	NC_022784	AAGC	2	8	264505	264512	50 %	0 %	25 %	25 %	557625488
567	NC_022784	TGGT	2	8	265061	265068	0 %	50 %	50 %	0 %	557625488
568	NC_022784	AAGA	2	8	265501	265508	75 %	0 %	25 %	0 %	557625488
569	NC_022784	TGCG	2	8	266013	266020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_022784	TCCC	2	8	266533	266540	0 %	25 %	0 %	75 %	557625489
571	NC_022784	ATCA	2	8	266716	266723	50 %	25 %	0 %	25 %	557625489
572	NC_022784	TAGG	2	8	267704	267711	25 %	25 %	50 %	0 %	557625490
573	NC_022784	GGGA	2	8	267944	267951	25 %	0 %	75 %	0 %	557625490
574	NC_022784	TCGA	2	8	267983	267990	25 %	25 %	25 %	25 %	557625490
575	NC_022784	GTCT	2	8	268186	268193	0 %	50 %	25 %	25 %	557625490
576	NC_022784	GAAA	2	8	268547	268554	75 %	0 %	25 %	0 %	557625491
577	NC_022784	GTAA	2	8	269337	269344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022784	CGTG	2	8	269616	269623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_022784	AGCG	2	8	269868	269875	25 %	0 %	50 %	25 %	557625492
580	NC_022784	TATG	2	8	269973	269980	25 %	50 %	25 %	0 %	557625492
581	NC_022784	GAGC	2	8	270040	270047	25 %	0 %	50 %	25 %	557625492
582	NC_022784	GCAC	2	8	270287	270294	25 %	0 %	25 %	50 %	557625492
583	NC_022784	GCAC	2	8	270685	270692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
584	NC_022784	GGCC	2	8	270981	270988	0 %	0 %	50 %	50 %	557625493
585	NC_022784	GAAC	3	12	271701	271712	50 %	0 %	25 %	25 %	557625493
586	NC_022784	GTGG	2	8	272881	272888	0 %	25 %	75 %	0 %	557625495
587	NC_022784	CTAT	2	8	273913	273920	25 %	50 %	0 %	25 %	557625495
588	NC_022784	GGTG	2	8	274035	274042	0 %	25 %	75 %	0 %	557625495
589	NC_022784	AGAT	2	8	274394	274401	50 %	25 %	25 %	0 %	557625495
590	NC_022784	AGGG	2	8	274881	274888	25 %	0 %	75 %	0 %	557625495
591	NC_022784	TTCT	2	8	275444	275451	0 %	75 %	0 %	25 %	557625496
592	NC_022784	TGCC	2	8	275749	275756	0 %	25 %	25 %	50 %	557625496
593	NC_022784	ACGT	2	8	276519	276526	25 %	25 %	25 %	25 %	557625497
594	NC_022784	GTTC	2	8	277121	277128	0 %	50 %	25 %	25 %	557625497
595	NC_022784	AGCA	2	8	277133	277140	50 %	0 %	25 %	25 %	557625497
596	NC_022784	TGAC	2	8	277571	277578	25 %	25 %	25 %	25 %	557625497
597	NC_022784	ATCT	2	8	277751	277758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_022784	AACC	2	8	279653	279660	50 %	0 %	0 %	50 %	557625499
599	NC_022784	CCCG	2	8	279789	279796	0 %	0 %	25 %	75 %	557625499
600	NC_022784	TTCA	2	8	281986	281993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_022784	AGTT	2	8	282780	282787	25 %	50 %	25 %	0 %	557625501
602	NC_022784	GTCT	2	8	283152	283159	0 %	50 %	25 %	25 %	557625501
603	NC_022784	ATAG	2	8	283163	283170	50 %	25 %	25 %	0 %	557625501
604	NC_022784	CTTG	2	8	283507	283514	0 %	50 %	25 %	25 %	557625502
605	NC_022784	ATCC	2	8	284846	284853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_022784	CTTT	2	8	284867	284874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_022784	CAAG	2	8	285213	285220	50 %	0 %	25 %	25 %	557625503
608	NC_022784	CACG	2	8	285604	285611	25 %	0 %	25 %	50 %	557625503
609	NC_022784	CTTG	2	8	286114	286121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_022784	TCAA	2	8	286266	286273	50 %	25 %	0 %	25 %	557625504
611	NC_022784	AATT	2	8	286441	286448	50 %	50 %	0 %	0 %	557625504
612	NC_022784	CAAC	2	8	287164	287171	50 %	0 %	0 %	50 %	557625504
613	NC_022784	GATA	2	8	287654	287661	50 %	25 %	25 %	0 %	557625505
614	NC_022784	CACT	2	8	288244	288251	25 %	25 %	0 %	50 %	557625505
615	NC_022784	TTTC	2	8	288378	288385	0 %	75 %	0 %	25 %	557625505
616	NC_022784	ATGT	2	8	288898	288905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022784	AGAA	2	8	289048	289055	75 %	0 %	25 %	0 %	557625506
618	NC_022784	CTGC	2	8	289380	289387	0 %	25 %	25 %	50 %	557626124
619	NC_022784	CCTA	2	8	289823	289830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_022784	CAAC	2	8	289898	289905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_022784	TCCC	2	8	290326	290333	0 %	25 %	0 %	75 %	557625508
622	NC_022784	GCCT	2	8	290693	290700	0 %	25 %	25 %	50 %	557625508
623	NC_022784	ACTC	2	8	291054	291061	25 %	25 %	0 %	50 %	557625509
624	NC_022784	GGTT	2	8	291128	291135	0 %	50 %	50 %	0 %	557625509
625	NC_022784	TCTT	2	8	291249	291256	0 %	75 %	0 %	25 %	557625509
626	NC_022784	TGGA	2	8	291271	291278	25 %	25 %	50 %	0 %	557625509
627	NC_022784	GCCT	2	8	291433	291440	0 %	25 %	25 %	50 %	557625509
628	NC_022784	TTGC	2	8	292515	292522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_022784	ATGA	2	8	293820	293827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022784	TTGG	2	8	293933	293940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022784	TTTC	2	8	294121	294128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_022784	CAGG	2	8	294265	294272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_022784	TTGA	2	8	294575	294582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022784	GCTG	2	8	295051	295058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_022784	TTCG	2	8	295592	295599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_022784	CCCT	2	8	295623	295630	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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