MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 18462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_019942	CCA	2	6	1252054	1252059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329254
16002	NC_019942	TGG	2	6	1252216	1252221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329254
16003	NC_019942	GGA	2	6	1252263	1252268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329254
16004	NC_019942	CTG	2	6	1252324	1252329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329254
16005	NC_019942	TAT	2	6	1252384	1252389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16006	NC_019942	GAA	2	6	1252507	1252512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329254
16007	NC_019942	TTA	2	6	1252513	1252518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16008	NC_019942	AGG	2	6	1252520	1252525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329254
16009	NC_019942	GTT	2	6	1252568	1252573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329254
16010	NC_019942	GTT	2	6	1252643	1252648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329254
16011	NC_019942	TTG	2	6	1252660	1252665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329254
16012	NC_019942	TAT	2	6	1252735	1252740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16013	NC_019942	TCC	2	6	1252761	1252766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329254
16014	NC_019942	TGG	2	6	1252802	1252807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329254
16015	NC_019942	TAT	2	6	1253011	1253016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16016	NC_019942	TAT	2	6	1253111	1253116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16017	NC_019942	CGC	2	6	1253147	1253152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329254
16018	NC_019942	AGT	2	6	1253263	1253268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329254
16019	NC_019942	ATC	2	6	1253312	1253317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329254
16020	NC_019942	CAA	2	6	1253473	1253478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329254
16021	NC_019942	ACA	2	6	1253496	1253501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329254
16022	NC_019942	TGT	2	6	1253677	1253682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329254
16023	NC_019942	ACC	2	6	1253785	1253790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329254
16024	NC_019942	AGT	2	6	1254097	1254102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329254
16025	NC_019942	AAC	2	6	1254233	1254238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329254
16026	NC_019942	AAG	2	6	1254268	1254273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329254
16027	NC_019942	TAA	2	6	1254276	1254281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329254
16028	NC_019942	CTC	2	6	1254428	1254433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329254
16029	NC_019942	TTG	2	6	1254471	1254476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329254
16030	NC_019942	ATC	2	6	1254560	1254565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329254
16031	NC_019942	TAT	2	6	1254578	1254583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16032	NC_019942	TCA	3	9	1254645	1254653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329254
16033	NC_019942	GCT	2	6	1254656	1254661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329254
16034	NC_019942	TGG	2	6	1254889	1254894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329254
16035	NC_019942	GGA	2	6	1254998	1255003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329254
16036	NC_019942	ATT	2	6	1255032	1255037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329254
16037	NC_019942	CAT	2	6	1255091	1255096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329254
16038	NC_019942	CTT	2	6	1255184	1255189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329255
16039	NC_019942	AGG	2	6	1255232	1255237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329255
16040	NC_019942	TTA	2	6	1255239	1255244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329255
16041	NC_019942	TTG	2	6	1255305	1255310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329255
16042	NC_019942	TAT	2	6	1255432	1255437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329255
16043	NC_019942	TCC	2	6	1255547	1255552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329255
16044	NC_019942	TAA	2	6	1255562	1255567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329255
16045	NC_019942	TTA	2	6	1255596	1255601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329255
16046	NC_019942	ATA	2	6	1255631	1255636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329255
16047	NC_019942	ATT	2	6	1255799	1255804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329255
16048	NC_019942	GAG	2	6	1255948	1255953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329255
16049	NC_019942	GAA	2	6	1255964	1255969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329255
16050	NC_019942	TTA	2	6	1256166	1256171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_019942	GTG	2	6	1256184	1256189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329256
16052	NC_019942	TGA	2	6	1256278	1256283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329256
16053	NC_019942	AAT	2	6	1256435	1256440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329256
16054	NC_019942	GAT	2	6	1256463	1256468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329256
16055	NC_019942	TTG	2	6	1256541	1256546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329256
16056	NC_019942	TGA	2	6	1256663	1256668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329256
16057	NC_019942	AAT	2	6	1256750	1256755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329256
16058	NC_019942	GTG	2	6	1256889	1256894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329257
16059	NC_019942	GCC	2	6	1257046	1257051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329257
16060	NC_019942	TCA	2	6	1257080	1257085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329257
16061	NC_019942	TCA	2	6	1257121	1257126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329257
16062	NC_019942	TAA	2	6	1257182	1257187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329257
16063	NC_019942	TTC	2	6	1257197	1257202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329257
16064	NC_019942	AGG	2	6	1257602	1257607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_019942	GCC	2	6	1257620	1257625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329258
16066	NC_019942	GAT	2	6	1257642	1257647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329258
16067	NC_019942	TGA	2	6	1257752	1257757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329258
16068	NC_019942	TAT	2	6	1257915	1257920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329258
16069	NC_019942	ATC	2	6	1257922	1257927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329258
16070	NC_019942	TAA	2	6	1257962	1257967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329258
16071	NC_019942	AAT	2	6	1257990	1257995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329258
16072	NC_019942	CTT	2	6	1258008	1258013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329258
16073	NC_019942	CAT	2	6	1258016	1258021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329258
16074	NC_019942	AAT	2	6	1258101	1258106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329258
16075	NC_019942	GAA	3	9	1258259	1258267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329258
16076	NC_019942	GGA	2	6	1258335	1258340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329258
16077	NC_019942	ATA	2	6	1258462	1258467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329258
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16079	NC_019942	GCA	2	6	1258540	1258545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329258
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16081	NC_019942	TCG	2	6	1258592	1258597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329258
16082	NC_019942	CTA	2	6	1258635	1258640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329258
16083	NC_019942	ATA	2	6	1258696	1258701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329258
16084	NC_019942	ACA	2	6	1258702	1258707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329258
16085	NC_019942	CTA	2	6	1258746	1258751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329258
16086	NC_019942	AGG	2	6	1258926	1258931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329259
16087	NC_019942	TCC	3	9	1258976	1258984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329259
16088	NC_019942	CTT	2	6	1258998	1259003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329259
16089	NC_019942	TCC	2	6	1259006	1259011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329259
16090	NC_019942	GAG	2	6	1259059	1259064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329259
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16095	NC_019942	CAA	2	6	1259364	1259369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329259
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16098	NC_019942	GCA	2	6	1259624	1259629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329259
16099	NC_019942	ACC	2	6	1259660	1259665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329260
16100	NC_019942	CTC	2	6	1259670	1259675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329260
16101	NC_019942	TCT	2	6	1259704	1259709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329260
16102	NC_019942	ATC	2	6	1259815	1259820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329260
16103	NC_019942	CAC	2	6	1259930	1259935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329260
16104	NC_019942	TCA	2	6	1259944	1259949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329260
16105	NC_019942	CAA	2	6	1260089	1260094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329260
16106	NC_019942	CAC	2	6	1260236	1260241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329260
16107	NC_019942	TGG	2	6	1260471	1260476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329260
16108	NC_019942	TGA	2	6	1260485	1260490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329260
16109	NC_019942	TCA	2	6	1260622	1260627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329260
16110	NC_019942	GTT	2	6	1260756	1260761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329260
16111	NC_019942	CTC	2	6	1260802	1260807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329260
16112	NC_019942	ATC	2	6	1260906	1260911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329260
16113	NC_019942	ACC	2	6	1260940	1260945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_019942	CAC	2	6	1261049	1261054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329261
16115	NC_019942	TCC	2	6	1261056	1261061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329261
16116	NC_019942	CTC	2	6	1261130	1261135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329261
16117	NC_019942	CAT	2	6	1261157	1261162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329261
16118	NC_019942	CTT	2	6	1261220	1261225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329261
16119	NC_019942	CCT	2	6	1261249	1261254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329261
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16124	NC_019942	CAT	2	6	1261498	1261503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329261
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16127	NC_019942	ATA	2	6	1261794	1261799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329262
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16150	NC_019942	TTA	2	6	1263156	1263161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16151	NC_019942	AAT	2	6	1263216	1263221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16152	NC_019942	CTT	2	6	1263251	1263256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16153	NC_019942	CTG	2	6	1263346	1263351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329265
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16178	NC_019942	ACC	2	6	1264797	1264802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16179	NC_019942	GAT	2	6	1264874	1264879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16208	NC_019942	ATT	2	6	1266865	1266870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329268
16209	NC_019942	CCA	2	6	1266873	1266878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329268
16210	NC_019942	TAT	2	6	1266913	1266918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329268
16211	NC_019942	TGT	2	6	1266933	1266938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329268
16212	NC_019942	ATA	2	6	1266971	1266976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329268
16213	NC_019942	TAT	2	6	1267014	1267019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16214	NC_019942	AAG	2	6	1267129	1267134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329269
16215	NC_019942	GAA	2	6	1267260	1267265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329269
16216	NC_019942	TCC	2	6	1267300	1267305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329269
16217	NC_019942	TCT	2	6	1267383	1267388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329269
16218	NC_019942	AAG	2	6	1267443	1267448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329269
16219	NC_019942	GAA	2	6	1267615	1267620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329269
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16221	NC_019942	CTT	2	6	1268125	1268130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329270
16222	NC_019942	TGA	2	6	1268172	1268177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329270
16223	NC_019942	TGG	2	6	1268478	1268483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329270
16224	NC_019942	GAG	3	9	1268581	1268589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329270
16225	NC_019942	GAA	2	6	1268598	1268603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329270
16226	NC_019942	GAT	2	6	1268640	1268645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329270
16227	NC_019942	TGA	2	6	1268687	1268692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329270
16228	NC_019942	CGG	2	6	1268717	1268722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329270
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16345	NC_019942	CCT	2	6	1278776	1278781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329280
16346	NC_019942	CCT	2	6	1278836	1278841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329280
16347	NC_019942	TCA	2	6	1278925	1278930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329280
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16351	NC_019942	CTC	2	6	1279020	1279025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329280
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16403	NC_019942	GAA	2	6	1282138	1282143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329282
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16420	NC_019942	ATT	2	6	1283616	1283621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329284
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16423	NC_019942	ATC	2	6	1283856	1283861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329284
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16425	NC_019942	CAG	2	6	1284097	1284102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16426	NC_019942	TTC	2	6	1284143	1284148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329285
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16441	NC_019942	AGC	2	6	1285298	1285303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329287
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16443	NC_019942	AGC	2	6	1285540	1285545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329288
16444	NC_019942	ATC	2	6	1285723	1285728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329288
16445	NC_019942	CTA	2	6	1285731	1285736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329288
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16455	NC_019942	GGA	2	6	1286177	1286182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329289
16456	NC_019942	TAA	2	6	1286188	1286193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329289
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16458	NC_019942	TGC	2	6	1286252	1286257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329289
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16492	NC_019942	CGG	2	6	1289125	1289130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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