MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alcanivorax dieselolei B5 chromosome

Total Repeats: 3576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018691	GCTGT	2	10	23	32	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018691	TGGTG	2	10	3482	3491	0 %	40 %	60 %	0 %	407693847
3	NC_018691	CCCTG	2	10	5453	5462	0 %	20 %	20 %	60 %	407693848
4	NC_018691	TCAGC	2	10	6708	6717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018691	GGCCT	2	10	7264	7273	0 %	20 %	40 %	40 %	407693850
6	NC_018691	GAACA	2	10	12240	12249	60 %	0 %	20 %	20 %	407693856
7	NC_018691	CTTTG	2	10	12527	12536	0 %	60 %	20 %	20 %	407693856
8	NC_018691	GCCGG	2	10	13361	13370	0 %	0 %	60 %	40 %	407693857
9	NC_018691	GACCA	2	10	17592	17601	40 %	0 %	20 %	40 %	407693859
10	NC_018691	CCCAG	2	10	17749	17758	20 %	0 %	20 %	60 %	407693859
11	NC_018691	ATGCC	2	10	18213	18222	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018691	TTTCG	2	10	18817	18826	0 %	60 %	20 %	20 %	407693860
13	NC_018691	CAGCA	2	10	20550	20559	40 %	0 %	20 %	40 %	407693863
14	NC_018691	GCTCG	2	10	21614	21623	0 %	20 %	40 %	40 %	407693864
15	NC_018691	GGTGC	2	10	22554	22563	0 %	20 %	60 %	20 %	407693864
16	NC_018691	TGGAA	2	10	22790	22799	40 %	20 %	40 %	0 %	407693864
17	NC_018691	GTCCA	2	10	25697	25706	20 %	20 %	20 %	40 %	407693867
18	NC_018691	CTCAA	2	10	25817	25826	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018691	GCGCC	2	10	27669	27678	0 %	0 %	40 %	60 %	407693869
20	NC_018691	CGGCG	2	10	28034	28043	0 %	0 %	60 %	40 %	407693869
21	NC_018691	GTTTC	2	10	29302	29311	0 %	60 %	20 %	20 %	407693871
22	NC_018691	GGTCT	2	10	29675	29684	0 %	40 %	40 %	20 %	407693872
23	NC_018691	GTCAG	2	10	29820	29829	20 %	20 %	40 %	20 %	407693872
24	NC_018691	CCTGG	2	10	31825	31834	0 %	20 %	40 %	40 %	407693873
25	NC_018691	TGGCG	2	10	31901	31910	0 %	20 %	60 %	20 %	407693873
26	NC_018691	CAGGT	2	10	33221	33230	20 %	20 %	40 %	20 %	407693874
27	NC_018691	CTCTT	2	10	36575	36584	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018691	GTTGT	2	10	40900	40909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018691	GATTG	2	10	42491	42500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018691	GTTTG	2	10	47452	47461	0 %	60 %	40 %	0 %	407693887
31	NC_018691	CCTGG	2	10	48983	48992	0 %	20 %	40 %	40 %	407693889
32	NC_018691	CTTTC	2	10	49240	49249	0 %	60 %	0 %	40 %	407693889
33	NC_018691	CCAGT	2	10	51193	51202	20 %	20 %	20 %	40 %	407693890
34	NC_018691	CAGGT	2	10	52628	52637	20 %	20 %	40 %	20 %	407693892
35	NC_018691	GCCGA	2	10	55494	55503	20 %	0 %	40 %	40 %	407693894
36	NC_018691	TAAAT	2	10	55715	55724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018691	GCCGC	2	10	56282	56291	0 %	0 %	40 %	60 %	407693896
38	NC_018691	TCACT	2	10	57222	57231	20 %	40 %	0 %	40 %	407693898
39	NC_018691	GCGCC	2	10	59056	59065	0 %	0 %	40 %	60 %	407693899
40	NC_018691	GCCCG	2	10	60081	60090	0 %	0 %	40 %	60 %	407693901
41	NC_018691	GTGAT	2	10	63520	63529	20 %	40 %	40 %	0 %	407693904
42	NC_018691	CGCGC	2	10	63935	63944	0 %	0 %	40 %	60 %	407693904
43	NC_018691	GGCCG	2	10	64315	64324	0 %	0 %	60 %	40 %	407693905
44	NC_018691	CGCGG	2	10	64675	64684	0 %	0 %	60 %	40 %	407693906
45	NC_018691	TGCCC	2	10	66412	66421	0 %	20 %	20 %	60 %	407693907
46	NC_018691	TGGCC	2	10	70372	70381	0 %	20 %	40 %	40 %	407693907
47	NC_018691	TGGTC	2	10	73097	73106	0 %	40 %	40 %	20 %	407693909
48	NC_018691	CCATG	2	10	73211	73220	20 %	20 %	20 %	40 %	407693909
49	NC_018691	CCTGA	2	10	74340	74349	20 %	20 %	20 %	40 %	407693909
50	NC_018691	TCAGC	2	10	77852	77861	20 %	20 %	20 %	40 %	407693914
51	NC_018691	CCCGG	2	10	78026	78035	0 %	0 %	40 %	60 %	407693914
52	NC_018691	TGGCC	2	10	81204	81213	0 %	20 %	40 %	40 %	407693918
53	NC_018691	CGCGC	2	10	82870	82879	0 %	0 %	40 %	60 %	407693920
54	NC_018691	CGTGG	2	10	83108	83117	0 %	20 %	60 %	20 %	407693920
55	NC_018691	GCCGC	2	10	83515	83524	0 %	0 %	40 %	60 %	407693921
56	NC_018691	CAAGC	2	10	84693	84702	40 %	0 %	20 %	40 %	407693922
57	NC_018691	CTGGT	2	10	87455	87464	0 %	40 %	40 %	20 %	407693925
58	NC_018691	GACTG	2	10	89443	89452	20 %	20 %	40 %	20 %	407693927
59	NC_018691	TGCGC	2	10	89981	89990	0 %	20 %	40 %	40 %	407693928
60	NC_018691	GGACG	2	10	92218	92227	20 %	0 %	60 %	20 %	407693930
61	NC_018691	GACCT	2	10	95890	95899	20 %	20 %	20 %	40 %	407693934
62	NC_018691	CGCCC	2	10	96492	96501	0 %	0 %	20 %	80 %	407693935
63	NC_018691	GCGCC	2	10	97301	97310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_018691	ACCCC	2	10	99703	99712	20 %	0 %	0 %	80 %	407693938
65	NC_018691	CTGGC	2	10	101905	101914	0 %	20 %	40 %	40 %	407693940
66	NC_018691	CGCGG	2	10	103431	103440	0 %	0 %	60 %	40 %	407693942
67	NC_018691	CGCTG	2	10	105482	105491	0 %	20 %	40 %	40 %	407693944
68	NC_018691	AATTG	2	10	108831	108840	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018691	GCCCG	2	10	110543	110552	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_018691	GTCTG	2	10	111044	111053	0 %	40 %	40 %	20 %	407693949
71	NC_018691	CCGGT	2	10	111113	111122	0 %	20 %	40 %	40 %	407693949
72	NC_018691	TGTGC	2	10	111135	111144	0 %	40 %	40 %	20 %	407693949
73	NC_018691	CTGGC	2	10	111874	111883	0 %	20 %	40 %	40 %	407693949
74	NC_018691	GCAGC	2	10	114974	114983	20 %	0 %	40 %	40 %	407693952
75	NC_018691	GCCAG	2	10	115783	115792	20 %	0 %	40 %	40 %	407693953
76	NC_018691	GGCGG	2	10	116126	116135	0 %	0 %	80 %	20 %	407693953
77	NC_018691	GTCCG	2	10	118965	118974	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_018691	GAAAC	2	10	120846	120855	60 %	0 %	20 %	20 %	407693957
79	NC_018691	GTTCG	2	10	121875	121884	0 %	40 %	40 %	20 %	407693958
80	NC_018691	GGCCA	2	10	124126	124135	20 %	0 %	40 %	40 %	407693959
81	NC_018691	GCGCC	2	10	125062	125071	0 %	0 %	40 %	60 %	407693960
82	NC_018691	CGCCA	2	10	127844	127853	20 %	0 %	20 %	60 %	407693963
83	NC_018691	ATGGC	2	10	130273	130282	20 %	20 %	40 %	20 %	407693966
84	NC_018691	ACCGT	2	10	130440	130449	20 %	20 %	20 %	40 %	407693966
85	NC_018691	CGGCG	2	10	130681	130690	0 %	0 %	60 %	40 %	407693966
86	NC_018691	CCGGT	2	10	130770	130779	0 %	20 %	40 %	40 %	407693966
87	NC_018691	GTCCG	2	10	131890	131899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018691	CTTGC	2	10	134628	134637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018691	AGACG	2	10	135517	135526	40 %	0 %	40 %	20 %	407693971
90	NC_018691	GTTCA	2	10	135826	135835	20 %	40 %	20 %	20 %	407693971
91	NC_018691	TGGAG	2	10	136276	136285	20 %	20 %	60 %	0 %	407693971
92	NC_018691	CGTGT	2	10	136978	136987	0 %	40 %	40 %	20 %	407693971
93	NC_018691	TATCA	2	10	137213	137222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018691	CGGGC	2	10	140741	140750	0 %	0 %	60 %	40 %	407693974
95	NC_018691	GTGGC	2	10	143046	143055	0 %	20 %	60 %	20 %	407693976
96	NC_018691	GTCCG	2	10	144794	144803	0 %	20 %	40 %	40 %	407693978
97	NC_018691	GCCTG	2	10	145848	145857	0 %	20 %	40 %	40 %	407693979
98	NC_018691	GGCAC	2	10	146398	146407	20 %	0 %	40 %	40 %	407693980
99	NC_018691	AAGGA	2	10	146950	146959	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018691	GGCCC	2	10	147693	147702	0 %	0 %	40 %	60 %	407693982
101	NC_018691	AAGCG	2	10	148184	148193	40 %	0 %	40 %	20 %	407693982
102	NC_018691	GTGGC	2	10	148687	148696	0 %	20 %	60 %	20 %	407693982
103	NC_018691	GATCA	2	10	149019	149028	40 %	20 %	20 %	20 %	407693982
104	NC_018691	GCCCT	2	10	153196	153205	0 %	20 %	20 %	60 %	407693982
105	NC_018691	TTCTC	2	10	153980	153989	0 %	60 %	0 %	40 %	407693983
106	NC_018691	GCACT	2	10	154790	154799	20 %	20 %	20 %	40 %	407693985
107	NC_018691	CCCCA	2	10	155416	155425	20 %	0 %	0 %	80 %	407693986
108	NC_018691	ATGTC	2	10	155471	155480	20 %	40 %	20 %	20 %	407693986
109	NC_018691	AAAAC	2	10	156209	156218	80 %	0 %	0 %	20 %	407693986
110	NC_018691	CAGAA	2	10	156484	156493	60 %	0 %	20 %	20 %	407693986
111	NC_018691	TCGGC	2	10	156551	156560	0 %	20 %	40 %	40 %	407693986
112	NC_018691	GGTCC	2	10	157928	157937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018691	GGTTG	2	10	159380	159389	0 %	40 %	60 %	0 %	407693989
114	NC_018691	TGCGC	2	10	162988	162997	0 %	20 %	40 %	40 %	407693993
115	NC_018691	AACGG	2	10	164458	164467	40 %	0 %	40 %	20 %	407693993
116	NC_018691	CCAGA	2	10	164713	164722	40 %	0 %	20 %	40 %	407693994
117	NC_018691	TGATC	2	10	169582	169591	20 %	40 %	20 %	20 %	407693998
118	NC_018691	AGCGC	2	10	170573	170582	20 %	0 %	40 %	40 %	407693999
119	NC_018691	AAACG	2	10	171888	171897	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018691	TCCGG	2	10	175149	175158	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018691	TTCCA	2	10	178552	178561	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018691	TGGCG	2	10	179511	179520	0 %	20 %	60 %	20 %	407694008
123	NC_018691	GCGCC	2	10	182952	182961	0 %	0 %	40 %	60 %	407694011
124	NC_018691	CCAAC	2	10	184616	184625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_018691	CCGGC	2	10	186370	186379	0 %	0 %	40 %	60 %	407694014
126	NC_018691	GACCG	2	10	186466	186475	20 %	0 %	40 %	40 %	407694014
127	NC_018691	TTGGC	2	10	187213	187222	0 %	40 %	40 %	20 %	407694014
128	NC_018691	TGCCG	2	10	190380	190389	0 %	20 %	40 %	40 %	407694019
129	NC_018691	GAGCG	2	10	191511	191520	20 %	0 %	60 %	20 %	407694020
130	NC_018691	CTGGG	2	10	192332	192341	0 %	20 %	60 %	20 %	407694022
131	NC_018691	GCGGA	2	10	192653	192662	20 %	0 %	60 %	20 %	407694022
132	NC_018691	TCTGG	2	10	193693	193702	0 %	40 %	40 %	20 %	407694023
133	NC_018691	GCTTT	2	10	194432	194441	0 %	60 %	20 %	20 %	407694024
134	NC_018691	CGGCC	2	10	196043	196052	0 %	0 %	40 %	60 %	407694026
135	NC_018691	GGCAA	2	10	196341	196350	40 %	0 %	40 %	20 %	407694026
136	NC_018691	GCCGG	2	10	196823	196832	0 %	0 %	60 %	40 %	407694027
137	NC_018691	CCGGC	2	10	197912	197921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_018691	TGGCC	2	10	198525	198534	0 %	20 %	40 %	40 %	407694029
139	NC_018691	GCCCG	2	10	201151	201160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_018691	CTGGT	2	10	202101	202110	0 %	40 %	40 %	20 %	407694032
141	NC_018691	CGGGG	2	10	203759	203768	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018691	GCCCC	2	10	203801	203810	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_018691	CCGGT	2	10	204089	204098	0 %	20 %	40 %	40 %	407694035
144	NC_018691	GCCCC	2	10	204566	204575	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
145	NC_018691	AAGAG	2	10	206545	206554	60 %	0 %	40 %	0 %	407694037
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151	NC_018691	GATTG	2	10	221667	221676	20 %	40 %	40 %	0 %	407694052
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155	NC_018691	GCGGG	2	10	226941	226950	0 %	0 %	80 %	20 %	407694057
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159	NC_018691	CGGAC	2	10	232703	232712	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_018691	CTTGC	2	10	232732	232741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_018691	GCAAG	2	10	232777	232786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_018691	TGTCT	2	10	238809	238818	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018691	GCAAG	2	10	239668	239677	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_018691	ACGGA	2	10	240783	240792	40 %	0 %	40 %	20 %	407694072
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174	NC_018691	TGGCC	2	10	253172	253181	0 %	20 %	40 %	40 %	407694084
175	NC_018691	CGCTG	2	10	253525	253534	0 %	20 %	40 %	40 %	407694084
176	NC_018691	CTTGC	2	10	256491	256500	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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178	NC_018691	GCGCG	2	10	257560	257569	0 %	0 %	60 %	40 %	407694087
179	NC_018691	TGGCC	2	10	259593	259602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
180	NC_018691	AAAAG	2	10	268757	268766	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_018691	CGATC	2	10	296453	296462	20 %	20 %	20 %	40 %	407694120
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223	NC_018691	GGTTT	2	10	328447	328456	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_018691	TCCCT	2	10	335613	335622	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
230	NC_018691	TGGTG	2	10	335946	335955	0 %	40 %	60 %	0 %	407694150
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233	NC_018691	CGCGG	2	10	339991	340000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
234	NC_018691	TGCCG	2	10	341071	341080	0 %	20 %	40 %	40 %	407694158
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237	NC_018691	AGGAG	2	10	346117	346126	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
238	NC_018691	AGTGA	2	10	347892	347901	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
239	NC_018691	TGATG	2	10	348643	348652	20 %	40 %	40 %	0 %	407694166
240	NC_018691	ATTGG	2	10	348734	348743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
241	NC_018691	AATGA	2	10	349799	349808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
242	NC_018691	GGCGA	2	10	350009	350018	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
243	NC_018691	TCTGA	2	10	350445	350454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
244	NC_018691	GTAAC	2	10	350756	350765	40 %	20 %	20 %	20 %	407694170
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246	NC_018691	TTTGG	2	10	351084	351093	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
247	NC_018691	CGGAC	2	10	351680	351689	20 %	0 %	40 %	40 %	407694172
248	NC_018691	GGCCG	2	10	352703	352712	0 %	0 %	60 %	40 %	407694173
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251	NC_018691	AAAGG	2	10	353898	353907	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018691	ATACC	2	10	353968	353977	40 %	20 %	0 %	40 %	407694174
253	NC_018691	GGGTT	2	10	354019	354028	0 %	40 %	60 %	0 %	407694174
254	NC_018691	TTTAA	2	10	354278	354287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018691	GGTGG	2	10	358819	358828	0 %	20 %	80 %	0 %	407694177
256	NC_018691	TTGAG	2	10	361180	361189	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018691	AGGAG	2	10	368097	368106	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018691	GCGGA	2	10	369464	369473	20 %	0 %	60 %	20 %	407694189
259	NC_018691	AAGGA	2	10	370535	370544	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018691	CGGAA	2	10	372041	372050	40 %	0 %	40 %	20 %	407694192
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262	NC_018691	ATGTC	2	10	376468	376477	20 %	40 %	20 %	20 %	407694199
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264	NC_018691	GAACA	2	10	378580	378589	60 %	0 %	20 %	20 %	407694202
265	NC_018691	TCATG	2	10	381759	381768	20 %	40 %	20 %	20 %	407694206
266	NC_018691	CGGTA	2	10	384758	384767	20 %	20 %	40 %	20 %	407694211
267	NC_018691	CGGGC	2	10	387361	387370	0 %	0 %	60 %	40 %	407694212
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