MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alcanivorax dieselolei B5 chromosome

Total Repeats: 3576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018691	TCCTT	2	10	4805335	4805344	0 %	60 %	0 %	40 %	407698151
3502	NC_018691	GAAAA	2	10	4806691	4806700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_018691	GTCTT	2	10	4806927	4806936	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_018691	AGCTT	2	10	4806948	4806957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3505	NC_018691	CACCG	2	10	4811021	4811030	20 %	0 %	20 %	60 %	407698157
3506	NC_018691	GAAAC	2	10	4814472	4814481	60 %	0 %	20 %	20 %	407698162
3507	NC_018691	CACAC	2	10	4815857	4815866	40 %	0 %	0 %	60 %	407698164
3508	NC_018691	CTGGA	2	10	4817844	4817853	20 %	20 %	40 %	20 %	407698167
3509	NC_018691	GCATG	2	10	4819303	4819312	20 %	20 %	40 %	20 %	407698168
3510	NC_018691	GCCCG	2	10	4820333	4820342	0 %	0 %	40 %	60 %	407698170
3511	NC_018691	TGCCC	2	10	4821355	4821364	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3512	NC_018691	CCGGC	2	10	4827388	4827397	0 %	0 %	40 %	60 %	407698180
3513	NC_018691	ACGGA	2	10	4829735	4829744	40 %	0 %	40 %	20 %	407698182
3514	NC_018691	CGCCA	2	10	4832575	4832584	20 %	0 %	20 %	60 %	407698184
3515	NC_018691	GACCT	2	10	4832781	4832790	20 %	20 %	20 %	40 %	407698185
3516	NC_018691	TGCCC	2	10	4833653	4833662	0 %	20 %	20 %	60 %	407698185
3517	NC_018691	GCGCC	2	10	4837217	4837226	0 %	0 %	40 %	60 %	407698188
3518	NC_018691	CGCGT	2	10	4837945	4837954	0 %	20 %	40 %	40 %	407698188
3519	NC_018691	TTTCC	2	10	4838095	4838104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3520	NC_018691	CAAAA	2	10	4838126	4838135	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3521	NC_018691	GCCCA	2	10	4840137	4840146	20 %	0 %	20 %	60 %	407698189
3522	NC_018691	ATCCC	2	10	4843002	4843011	20 %	20 %	0 %	60 %	407698191
3523	NC_018691	CGGCA	2	10	4844515	4844524	20 %	0 %	40 %	40 %	407698192
3524	NC_018691	CCGGA	2	10	4846394	4846403	20 %	0 %	40 %	40 %	407698194
3525	NC_018691	CAGCC	2	10	4847175	4847184	20 %	0 %	20 %	60 %	407698194
3526	NC_018691	GCCGC	2	10	4849262	4849271	0 %	0 %	40 %	60 %	407698195
3527	NC_018691	CGACC	2	10	4851718	4851727	20 %	0 %	20 %	60 %	407698197
3528	NC_018691	CGGCG	2	10	4851786	4851795	0 %	0 %	60 %	40 %	407698197
3529	NC_018691	ATGCC	2	10	4852101	4852110	20 %	20 %	20 %	40 %	407698198
3530	NC_018691	CACCG	2	10	4852603	4852612	20 %	0 %	20 %	60 %	407698199
3531	NC_018691	TGAAC	2	10	4852695	4852704	40 %	20 %	20 %	20 %	407698199
3532	NC_018691	CGCGG	2	10	4853296	4853305	0 %	0 %	60 %	40 %	407698199
3533	NC_018691	AAATG	2	10	4853324	4853333	60 %	20 %	20 %	0 %	407698199
3534	NC_018691	CGGGG	2	10	4854459	4854468	0 %	0 %	80 %	20 %	407698201
3535	NC_018691	CGGAT	2	10	4855782	4855791	20 %	20 %	40 %	20 %	407698201
3536	NC_018691	CCTCA	2	10	4856107	4856116	20 %	20 %	0 %	60 %	407698202
3537	NC_018691	GCCCA	2	10	4856331	4856340	20 %	0 %	20 %	60 %	407698202
3538	NC_018691	ACGTC	2	10	4857017	4857026	20 %	20 %	20 %	40 %	407698203
3539	NC_018691	CACGC	2	10	4858623	4858632	20 %	0 %	20 %	60 %	407698204
3540	NC_018691	TGGCG	2	10	4860572	4860581	0 %	20 %	60 %	20 %	407698205
3541	NC_018691	GCCCA	2	10	4863215	4863224	20 %	0 %	20 %	60 %	407698207
3542	NC_018691	TGGCC	2	10	4864630	4864639	0 %	20 %	40 %	40 %	407698208
3543	NC_018691	GGAAG	2	10	4865032	4865041	40 %	0 %	60 %	0 %	407698208
3544	NC_018691	TTCCA	2	10	4865442	4865451	20 %	40 %	0 %	40 %	407698209
3545	NC_018691	ACCTG	2	10	4866004	4866013	20 %	20 %	20 %	40 %	407698210
3546	NC_018691	GCACC	2	10	4873869	4873878	20 %	0 %	20 %	60 %	407698216
3547	NC_018691	GGCAC	2	10	4874310	4874319	20 %	0 %	40 %	40 %	407698216
3548	NC_018691	TTGAT	2	10	4875691	4875700	20 %	60 %	20 %	0 %	407698217
3549	NC_018691	CGCCA	2	10	4876966	4876975	20 %	0 %	20 %	60 %	407698218
3550	NC_018691	AATCC	2	10	4879087	4879096	40 %	20 %	0 %	40 %	407698221
3551	NC_018691	CGCGA	2	10	4880856	4880865	20 %	0 %	40 %	40 %	407698222
3552	NC_018691	ACATG	2	10	4882623	4882632	40 %	20 %	20 %	20 %	407698224
3553	NC_018691	GCGTC	2	10	4883014	4883023	0 %	20 %	40 %	40 %	407698225
3554	NC_018691	TATCC	2	10	4890341	4890350	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3555	NC_018691	TTCAC	2	10	4893797	4893806	20 %	40 %	0 %	40 %	407698233
3556	NC_018691	GGTCA	2	10	4893958	4893967	20 %	20 %	40 %	20 %	407698233
3557	NC_018691	TGGCC	2	10	4895758	4895767	0 %	20 %	40 %	40 %	407698235
3558	NC_018691	CGCTC	2	10	4897050	4897059	0 %	20 %	20 %	60 %	407698238
3559	NC_018691	GGCAG	2	10	4899633	4899642	20 %	0 %	60 %	20 %	407698241
3560	NC_018691	CGGCG	2	10	4900835	4900844	0 %	0 %	60 %	40 %	407698242
3561	NC_018691	GAAAA	2	10	4905769	4905778	80 %	0 %	20 %	0 %	407698245
3562	NC_018691	CGGAT	2	10	4908078	4908087	20 %	20 %	40 %	20 %	407698247
3563	NC_018691	CACCG	2	10	4909196	4909205	20 %	0 %	20 %	60 %	407698247
3564	NC_018691	AGGTC	2	10	4909324	4909333	20 %	20 %	40 %	20 %	407698247
3565	NC_018691	CAAGG	2	10	4910060	4910069	40 %	0 %	40 %	20 %	407698247
3566	NC_018691	AAAAG	2	10	4910072	4910081	80 %	0 %	20 %	0 %	407698247
3567	NC_018691	TGCCC	2	10	4911085	4911094	0 %	20 %	20 %	60 %	407698248
3568	NC_018691	AATCC	2	10	4914452	4914461	40 %	20 %	0 %	40 %	407698252
3569	NC_018691	TGTTC	2	10	4916223	4916232	0 %	60 %	20 %	20 %	407698253
3570	NC_018691	TGATC	2	10	4920326	4920335	20 %	40 %	20 %	20 %	407698255
3571	NC_018691	AGCAA	2	10	4923690	4923699	60 %	0 %	20 %	20 %	407698258
3572	NC_018691	TGACC	2	10	4924053	4924062	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3573	NC_018691	CCGGG	2	10	4925131	4925140	0 %	0 %	60 %	40 %	407698259
3574	NC_018691	GTCGG	2	10	4927054	4927063	0 %	20 %	60 %	20 %	407698260
3575	NC_018691	CGGCG	2	10	4927476	4927485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3576	NC_018691	CTTGC	2	10	4927922	4927931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.