MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015554	CTTAT	2	10	3360	3369	20 %	60 %	0 %	20 %	333891492
2	NC_015554	GAAAA	2	10	4644	4653	80 %	0 %	20 %	0 %	333891493
3	NC_015554	CAGAA	2	10	4704	4713	60 %	0 %	20 %	20 %	333891494
4	NC_015554	TTCTC	2	10	5699	5708	0 %	60 %	0 %	40 %	333891494
5	NC_015554	TGTTT	2	10	8292	8301	0 %	80 %	20 %	0 %	333891496
6	NC_015554	CAAAG	2	10	14344	14353	60 %	0 %	20 %	20 %	333891502
7	NC_015554	AATAA	2	10	14943	14952	80 %	20 %	0 %	0 %	333891502
8	NC_015554	CTTAC	2	10	16078	16087	20 %	40 %	0 %	40 %	333891503
9	NC_015554	TTGTA	2	10	17383	17392	20 %	60 %	20 %	0 %	333891503
10	NC_015554	ATCTG	2	10	17689	17698	20 %	40 %	20 %	20 %	333891503
11	NC_015554	ATTGT	2	10	18003	18012	20 %	60 %	20 %	0 %	333891503
12	NC_015554	TCGGC	2	10	18547	18556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015554	ACCTG	2	10	23453	23462	20 %	20 %	20 %	40 %	333891508
14	NC_015554	TGCGC	2	10	25138	25147	0 %	20 %	40 %	40 %	333891510
15	NC_015554	AAGCC	2	10	26825	26834	40 %	0 %	20 %	40 %	333891512
16	NC_015554	AAGGT	2	10	27090	27099	40 %	20 %	40 %	0 %	333891512
17	NC_015554	GTGAA	2	10	28611	28620	40 %	20 %	40 %	0 %	333891513
18	NC_015554	AGCGC	2	10	28684	28693	20 %	0 %	40 %	40 %	333891513
19	NC_015554	AACGC	2	10	33401	33410	40 %	0 %	20 %	40 %	333891520
20	NC_015554	AGACA	2	10	34672	34681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015554	TCGTG	2	10	35800	35809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015554	TAGTG	2	10	36296	36305	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015554	TTGTT	2	10	36316	36325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015554	ACTTG	2	10	36833	36842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015554	AGTCG	2	10	38374	38383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015554	CAGGG	2	10	38594	38603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015554	TGCCC	2	10	42120	42129	0 %	20 %	20 %	60 %	333891523
28	NC_015554	TAGGT	2	10	42655	42664	20 %	40 %	40 %	0 %	333891523
29	NC_015554	CTCTT	2	10	43315	43324	0 %	60 %	0 %	40 %	333891524
30	NC_015554	GTGAG	2	10	44931	44940	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015554	AGACA	2	10	45035	45044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015554	TCGTG	2	10	46164	46173	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015554	TAGTG	2	10	46660	46669	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015554	TTGTT	2	10	46680	46689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015554	ACTTG	2	10	46859	46868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015554	AGTCG	2	10	48404	48413	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015554	CAGGG	2	10	48624	48633	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015554	CAAGC	2	10	50575	50584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015554	AAAGG	2	10	52282	52291	60 %	0 %	40 %	0 %	333891527
40	NC_015554	TGAAA	2	10	52774	52783	60 %	20 %	20 %	0 %	333891528
41	NC_015554	AAAAG	2	10	54744	54753	80 %	0 %	20 %	0 %	333891530
42	NC_015554	GAAAA	2	10	55294	55303	80 %	0 %	20 %	0 %	333891530
43	NC_015554	GTTAA	2	10	58650	58659	40 %	40 %	20 %	0 %	333891534
44	NC_015554	AACTA	2	10	61765	61774	60 %	20 %	0 %	20 %	333891537
45	NC_015554	ATTGA	2	10	64311	64320	40 %	40 %	20 %	0 %	333891540
46	NC_015554	TTCAA	2	10	65921	65930	40 %	40 %	0 %	20 %	333891541
47	NC_015554	AAACC	2	10	67783	67792	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015554	GCCAA	2	10	70684	70693	40 %	0 %	20 %	40 %	333891544
49	NC_015554	AGGGC	2	10	70939	70948	20 %	0 %	60 %	20 %	333891544
50	NC_015554	CTTCT	2	10	73092	73101	0 %	60 %	0 %	40 %	333891547
51	NC_015554	TGTTT	2	10	73442	73451	0 %	80 %	20 %	0 %	333891548
52	NC_015554	TTTCA	2	10	77015	77024	20 %	60 %	0 %	20 %	333891551
53	NC_015554	GTTTG	2	10	79903	79912	0 %	60 %	40 %	0 %	333891552
54	NC_015554	GGATC	2	10	83002	83011	20 %	20 %	40 %	20 %	333891554
55	NC_015554	TGGCA	2	10	83751	83760	20 %	20 %	40 %	20 %	333891554
56	NC_015554	TACCA	2	10	84472	84481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015554	TTAAA	2	10	84683	84692	60 %	40 %	0 %	0 %	333891556
58	NC_015554	ATAGT	2	10	85668	85677	40 %	40 %	20 %	0 %	333891557
59	NC_015554	CAGTA	2	10	86155	86164	40 %	20 %	20 %	20 %	333891558
60	NC_015554	GAAAA	2	10	87721	87730	80 %	0 %	20 %	0 %	333891559
61	NC_015554	TCATT	2	10	87740	87749	20 %	60 %	0 %	20 %	333891559
62	NC_015554	TCTGA	2	10	88509	88518	20 %	40 %	20 %	20 %	333891560
63	NC_015554	GCGCT	2	10	89167	89176	0 %	20 %	40 %	40 %	333891561
64	NC_015554	GGTTG	2	10	89347	89356	0 %	40 %	60 %	0 %	333891561
65	NC_015554	TCACG	2	10	93240	93249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015554	CATCG	2	10	96529	96538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015554	ATTTT	2	10	98040	98049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015554	TAGGT	2	10	98166	98175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015554	CTTTT	2	10	100687	100696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015554	AAATC	2	10	102497	102506	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015554	CGAAA	2	10	103000	103009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015554	GATGT	2	10	103198	103207	20 %	40 %	40 %	0 %	333891570
73	NC_015554	TGTAA	2	10	106406	106415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015554	CAACT	2	10	108269	108278	40 %	20 %	0 %	40 %	333891572
75	NC_015554	TAATT	2	10	109335	109344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015554	TACAT	2	10	110182	110191	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015554	AAAAG	2	10	111824	111833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015554	GTAAA	2	10	113485	113494	60 %	20 %	20 %	0 %	333891576
79	NC_015554	ATCAC	2	10	116897	116906	40 %	20 %	0 %	40 %	333891580
80	NC_015554	TGTCA	2	10	116936	116945	20 %	40 %	20 %	20 %	333891580
81	NC_015554	TAATG	2	10	118797	118806	40 %	40 %	20 %	0 %	333891581
82	NC_015554	AGGTA	2	10	119984	119993	40 %	20 %	40 %	0 %	333891583
83	NC_015554	GGCAT	2	10	122550	122559	20 %	20 %	40 %	20 %	333891587
84	NC_015554	GATGC	2	10	122880	122889	20 %	20 %	40 %	20 %	333891587
85	NC_015554	AGCCC	2	10	124139	124148	20 %	0 %	20 %	60 %	333891589
86	NC_015554	TAAAG	2	10	124250	124259	60 %	20 %	20 %	0 %	333891589
87	NC_015554	ATCAC	2	10	125826	125835	40 %	20 %	0 %	40 %	333891591
88	NC_015554	GGCTT	2	10	128110	128119	0 %	40 %	40 %	20 %	333891593
89	NC_015554	GGTGC	2	10	130031	130040	0 %	20 %	60 %	20 %	333891594
90	NC_015554	GCGAA	2	10	135465	135474	40 %	0 %	40 %	20 %	333891597
91	NC_015554	CTTTG	2	10	136493	136502	0 %	60 %	20 %	20 %	333891599
92	NC_015554	TTGGT	2	10	139683	139692	0 %	60 %	40 %	0 %	333891601
93	NC_015554	TAGAA	2	10	139994	140003	60 %	20 %	20 %	0 %	333891602
94	NC_015554	AATAG	2	10	140523	140532	60 %	20 %	20 %	0 %	333891602
95	NC_015554	TACAG	2	10	141686	141695	40 %	20 %	20 %	20 %	333891602
96	NC_015554	GCGCA	2	10	143921	143930	20 %	0 %	40 %	40 %	333891604
97	NC_015554	TATCT	2	10	144528	144537	20 %	60 %	0 %	20 %	333891604
98	NC_015554	TAAGT	2	10	145380	145389	40 %	40 %	20 %	0 %	333891604
99	NC_015554	GCGAA	2	10	148134	148143	40 %	0 %	40 %	20 %	333891607
100	NC_015554	AACAT	2	10	149521	149530	60 %	20 %	0 %	20 %	333891609
101	NC_015554	CAGTT	2	10	151471	151480	20 %	40 %	20 %	20 %	333891611
102	NC_015554	GTGCA	2	10	152933	152942	20 %	20 %	40 %	20 %	333891612
103	NC_015554	CTTCG	2	10	157163	157172	0 %	40 %	20 %	40 %	333891616
104	NC_015554	CAGGG	2	10	160014	160023	20 %	0 %	60 %	20 %	333891619
105	NC_015554	CCATT	2	10	162843	162852	20 %	40 %	0 %	40 %	333891622
106	NC_015554	TGAAC	2	10	167834	167843	40 %	20 %	20 %	20 %	333891626
107	NC_015554	CAGCA	2	10	169337	169346	40 %	0 %	20 %	40 %	333891627
108	NC_015554	TGTAA	2	10	170131	170140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015554	GAAGC	2	10	170650	170659	40 %	0 %	40 %	20 %	333891629
110	NC_015554	GGTTG	2	10	177083	177092	0 %	40 %	60 %	0 %	333891636
111	NC_015554	GTTTT	2	10	178637	178646	0 %	80 %	20 %	0 %	333891638
112	NC_015554	TTTGG	2	10	179395	179404	0 %	60 %	40 %	0 %	333891638
113	NC_015554	ATTGC	2	10	179539	179548	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015554	ACAAA	2	10	180040	180049	80 %	0 %	0 %	20 %	333891639
115	NC_015554	TCTCT	2	10	180088	180097	0 %	60 %	0 %	40 %	333891639
116	NC_015554	GGTTC	2	10	180276	180285	0 %	40 %	40 %	20 %	333891639
117	NC_015554	CTTTT	2	10	184611	184620	0 %	80 %	0 %	20 %	333891643
118	NC_015554	AAATA	2	10	185557	185566	80 %	20 %	0 %	0 %	333891643
119	NC_015554	GGGTT	2	10	186739	186748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015554	GCATC	2	10	187100	187109	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015554	GAGCA	2	10	188889	188898	40 %	0 %	40 %	20 %	333891645
122	NC_015554	TTATA	2	10	189554	189563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015554	TGAAA	2	10	190834	190843	60 %	20 %	20 %	0 %	333891646
124	NC_015554	AAACG	2	10	191886	191895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015554	AAGCA	2	10	191923	191932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015554	TCGTG	2	10	193158	193167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015554	TAGTG	2	10	193654	193663	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015554	TTGTT	2	10	193674	193683	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015554	ACTTG	2	10	194367	194376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015554	AGTCG	2	10	195912	195921	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015554	CAGGG	2	10	196132	196141	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015554	CAGTC	2	10	199512	199521	20 %	20 %	20 %	40 %	333891650
133	NC_015554	TTAAC	2	10	202965	202974	40 %	40 %	0 %	20 %	333891652
134	NC_015554	GTTTT	2	10	205186	205195	0 %	80 %	20 %	0 %	333891655
135	NC_015554	GGTTG	2	10	205798	205807	0 %	40 %	60 %	0 %	333891655
136	NC_015554	TACCA	2	10	205825	205834	40 %	20 %	0 %	40 %	333891655
137	NC_015554	ATGGG	2	10	211570	211579	20 %	20 %	60 %	0 %	333891659
138	NC_015554	GCAGG	2	10	211811	211820	20 %	0 %	60 %	20 %	333891659
139	NC_015554	AAATA	2	10	212423	212432	80 %	20 %	0 %	0 %	333891660
140	NC_015554	TTTGC	2	10	214137	214146	0 %	60 %	20 %	20 %	333891660
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152	NC_015554	AGCAA	2	10	237244	237253	60 %	0 %	20 %	20 %	333891677
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249	NC_015554	GCGGT	2	10	364089	364098	0 %	20 %	60 %	20 %	333891782
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260	NC_015554	GTTAG	2	10	378367	378376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015554	TCACT	2	10	378870	378879	20 %	40 %	0 %	40 %	333891800
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403	NC_015554	TAGCG	2	10	614684	614693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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