MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015554	CAACG	2	10	2361549	2361558	40 %	0 %	20 %	40 %	333893558
1502	NC_015554	AAATA	2	10	2362803	2362812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015554	AAGTA	2	10	2363295	2363304	60 %	20 %	20 %	0 %	333893559
1504	NC_015554	AAAAG	2	10	2363988	2363997	80 %	0 %	20 %	0 %	333893560
1505	NC_015554	CTTGT	2	10	2365437	2365446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1506	NC_015554	CAGCG	2	10	2365908	2365917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1507	NC_015554	TGTTC	2	10	2366888	2366897	0 %	60 %	20 %	20 %	333893561
1508	NC_015554	TGAAT	2	10	2367350	2367359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015554	AGAAA	2	10	2368435	2368444	80 %	0 %	20 %	0 %	333893564
1510	NC_015554	TCAAT	2	10	2369273	2369282	40 %	40 %	0 %	20 %	333893565
1511	NC_015554	ACCAA	2	10	2369439	2369448	60 %	0 %	0 %	40 %	333893565
1512	NC_015554	TGTTA	2	10	2369466	2369475	20 %	60 %	20 %	0 %	333893565
1513	NC_015554	CAAAC	2	10	2370879	2370888	60 %	0 %	0 %	40 %	333893566
1514	NC_015554	AAAAT	2	10	2371445	2371454	80 %	20 %	0 %	0 %	333893566
1515	NC_015554	TAAGT	2	10	2374513	2374522	40 %	40 %	20 %	0 %	333893570
1516	NC_015554	TTATT	2	10	2374536	2374545	20 %	80 %	0 %	0 %	333893570
1517	NC_015554	CTTCC	2	10	2375872	2375881	0 %	40 %	0 %	60 %	333893571
1518	NC_015554	TCTAA	2	10	2375890	2375899	40 %	40 %	0 %	20 %	333893571
1519	NC_015554	AAATA	2	10	2376689	2376698	80 %	20 %	0 %	0 %	333893572
1520	NC_015554	TTCTT	2	10	2377574	2377583	0 %	80 %	0 %	20 %	333893573
1521	NC_015554	AACAA	2	10	2378399	2378408	80 %	0 %	0 %	20 %	333893573
1522	NC_015554	TTGTT	2	10	2378700	2378709	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015554	TACTA	2	10	2378924	2378933	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1524	NC_015554	TCGAT	2	10	2379261	2379270	20 %	40 %	20 %	20 %	333893574
1525	NC_015554	GATTA	2	10	2380523	2380532	40 %	40 %	20 %	0 %	333893575
1526	NC_015554	ATGAA	2	10	2380735	2380744	60 %	20 %	20 %	0 %	333893575
1527	NC_015554	TTGCA	2	10	2382158	2382167	20 %	40 %	20 %	20 %	333893576
1528	NC_015554	ATAAG	2	10	2385580	2385589	60 %	20 %	20 %	0 %	333893580
1529	NC_015554	AGCGT	2	10	2387939	2387948	20 %	20 %	40 %	20 %	333893581
1530	NC_015554	AAACG	2	10	2388937	2388946	60 %	0 %	20 %	20 %	333893583
1531	NC_015554	CTAGA	2	10	2389118	2389127	40 %	20 %	20 %	20 %	333893583
1532	NC_015554	TATAC	2	10	2390296	2390305	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_015554	TTTTA	2	10	2390511	2390520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015554	CCTAC	2	10	2392764	2392773	20 %	20 %	0 %	60 %	333893585
1535	NC_015554	TACCG	2	10	2393614	2393623	20 %	20 %	20 %	40 %	333893586
1536	NC_015554	GCCAT	2	10	2400437	2400446	20 %	20 %	20 %	40 %	333893592
1537	NC_015554	AAACA	2	10	2401300	2401309	80 %	0 %	0 %	20 %	333893593
1538	NC_015554	AACCA	2	10	2403632	2403641	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1539	NC_015554	AGTAA	2	10	2403776	2403785	60 %	20 %	20 %	0 %	333893596
1540	NC_015554	CCACA	2	10	2411021	2411030	40 %	0 %	0 %	60 %	333893603
1541	NC_015554	GTTTA	2	10	2412722	2412731	20 %	60 %	20 %	0 %	333893604
1542	NC_015554	AATAA	2	10	2413744	2413753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015554	AATTT	2	10	2413798	2413807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015554	AAGAT	2	10	2415134	2415143	60 %	20 %	20 %	0 %	333893605
1545	NC_015554	TGCCC	2	10	2416631	2416640	0 %	20 %	20 %	60 %	333893606
1546	NC_015554	AAGAT	2	10	2417805	2417814	60 %	20 %	20 %	0 %	333893607
1547	NC_015554	TTTGC	2	10	2419300	2419309	0 %	60 %	20 %	20 %	333893607
1548	NC_015554	ATGCT	2	10	2422919	2422928	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_015554	AGATG	2	10	2423603	2423612	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015554	GCTTC	2	10	2426437	2426446	0 %	40 %	20 %	40 %	333893613
1551	NC_015554	GTAAA	2	10	2427780	2427789	60 %	20 %	20 %	0 %	333893615
1552	NC_015554	CTGAC	2	10	2428620	2428629	20 %	20 %	20 %	40 %	333893616
1553	NC_015554	TACCT	2	10	2429625	2429634	20 %	40 %	0 %	40 %	333893616
1554	NC_015554	AAACT	2	10	2436205	2436214	60 %	20 %	0 %	20 %	333893622
1555	NC_015554	GGTGT	2	10	2436426	2436435	0 %	40 %	60 %	0 %	333893622
1556	NC_015554	TAATG	2	10	2437590	2437599	40 %	40 %	20 %	0 %	333893623
1557	NC_015554	CTACG	2	10	2438099	2438108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1558	NC_015554	AAGGT	2	10	2438207	2438216	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015554	GCAAA	2	10	2438288	2438297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_015554	TTTTA	2	10	2439837	2439846	20 %	80 %	0 %	0 %	333893624
1561	NC_015554	ATGAA	2	10	2441637	2441646	60 %	20 %	20 %	0 %	333893625
1562	NC_015554	CCAAA	2	10	2441733	2441742	60 %	0 %	0 %	40 %	333893625
1563	NC_015554	ATAGA	2	10	2442315	2442324	60 %	20 %	20 %	0 %	333893626
1564	NC_015554	AACTA	2	10	2443639	2443648	60 %	20 %	0 %	20 %	333893627
1565	NC_015554	TTATT	2	10	2447679	2447688	20 %	80 %	0 %	0 %	333893632
1566	NC_015554	GCATT	2	10	2447892	2447901	20 %	40 %	20 %	20 %	333893632
1567	NC_015554	TCCCC	2	10	2449549	2449558	0 %	20 %	0 %	80 %	333893634
1568	NC_015554	GTTTT	2	10	2450191	2450200	0 %	80 %	20 %	0 %	333893635
1569	NC_015554	TGAAA	2	10	2454693	2454702	60 %	20 %	20 %	0 %	333893645
1570	NC_015554	AGTAA	2	10	2454736	2454745	60 %	20 %	20 %	0 %	333893645
1571	NC_015554	GATTA	2	10	2455743	2455752	40 %	40 %	20 %	0 %	333893646
1572	NC_015554	GTATT	2	10	2455824	2455833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015554	CGTGG	2	10	2460288	2460297	0 %	20 %	60 %	20 %	333893649
1574	NC_015554	CAAGA	2	10	2462900	2462909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_015554	GTAAT	2	10	2465214	2465223	40 %	40 %	20 %	0 %	333893655
1576	NC_015554	TGGCG	2	10	2465803	2465812	0 %	20 %	60 %	20 %	333893656
1577	NC_015554	TATTG	2	10	2466377	2466386	20 %	60 %	20 %	0 %	333893657
1578	NC_015554	AGCAT	2	10	2470139	2470148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_015554	CGTTA	2	10	2471237	2471246	20 %	40 %	20 %	20 %	333893662
1580	NC_015554	TAATT	2	10	2472702	2472711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015554	TCGCT	2	10	2474182	2474191	0 %	40 %	20 %	40 %	333893663
1582	NC_015554	TTAAG	2	10	2474540	2474549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015554	ATACC	2	10	2474882	2474891	40 %	20 %	0 %	40 %	333893664
1584	NC_015554	TGTTT	2	10	2475226	2475235	0 %	80 %	20 %	0 %	333893664
1585	NC_015554	CTACC	2	10	2476198	2476207	20 %	20 %	0 %	60 %	333893665
1586	NC_015554	TCACT	2	10	2480845	2480854	20 %	40 %	0 %	40 %	333893669
1587	NC_015554	GTAAT	2	10	2482610	2482619	40 %	40 %	20 %	0 %	333893669
1588	NC_015554	TTAAA	2	10	2485674	2485683	60 %	40 %	0 %	0 %	333893672
1589	NC_015554	TATCA	2	10	2485753	2485762	40 %	40 %	0 %	20 %	333893672
1590	NC_015554	CCATC	2	10	2490857	2490866	20 %	20 %	0 %	60 %	333893679
1591	NC_015554	CAACC	2	10	2496197	2496206	40 %	0 %	0 %	60 %	333893683
1592	NC_015554	ACTTC	2	10	2498294	2498303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1593	NC_015554	CTTCA	2	10	2503131	2503140	20 %	40 %	0 %	40 %	333893689
1594	NC_015554	GAAAT	2	10	2505897	2505906	60 %	20 %	20 %	0 %	333893692
1595	NC_015554	GAAAA	2	10	2506486	2506495	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015554	CAGTG	2	10	2508008	2508017	20 %	20 %	40 %	20 %	333893693
1597	NC_015554	CAACA	2	10	2512759	2512768	60 %	0 %	0 %	40 %	333893699
1598	NC_015554	TCTAT	2	10	2513122	2513131	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_015554	CCATT	2	10	2513522	2513531	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1600	NC_015554	AGGTT	2	10	2517895	2517904	20 %	40 %	40 %	0 %	333893703
1601	NC_015554	AGAAA	2	10	2518555	2518564	80 %	0 %	20 %	0 %	333893703
1602	NC_015554	AAAAT	2	10	2518907	2518916	80 %	20 %	0 %	0 %	333893703
1603	NC_015554	TAGAA	2	10	2519240	2519249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015554	TTTCT	2	10	2520758	2520767	0 %	80 %	0 %	20 %	333893704
1605	NC_015554	TATTC	2	10	2521881	2521890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1606	NC_015554	ACCCC	2	10	2522267	2522276	20 %	0 %	0 %	80 %	333893705
1607	NC_015554	GCCAC	2	10	2522781	2522790	20 %	0 %	20 %	60 %	333893705
1608	NC_015554	TGTCT	2	10	2523349	2523358	0 %	60 %	20 %	20 %	333893706
1609	NC_015554	CAAAA	2	10	2524190	2524199	80 %	0 %	0 %	20 %	333893706
1610	NC_015554	CTTTC	2	10	2526848	2526857	0 %	60 %	0 %	40 %	333893708
1611	NC_015554	GAGTC	2	10	2526926	2526935	20 %	20 %	40 %	20 %	333893708
1612	NC_015554	CTTCT	2	10	2527763	2527772	0 %	60 %	0 %	40 %	333893709
1613	NC_015554	CTTTG	2	10	2527958	2527967	0 %	60 %	20 %	20 %	333893709
1614	NC_015554	TTTTC	2	10	2528582	2528591	0 %	80 %	0 %	20 %	333893710
1615	NC_015554	AAGTA	2	10	2530950	2530959	60 %	20 %	20 %	0 %	333893712
1616	NC_015554	AGTTT	2	10	2531801	2531810	20 %	60 %	20 %	0 %	333893713
1617	NC_015554	AAACA	2	10	2532391	2532400	80 %	0 %	0 %	20 %	333893713
1618	NC_015554	TCGCT	2	10	2532923	2532932	0 %	40 %	20 %	40 %	333893714
1619	NC_015554	AGTAC	2	10	2533755	2533764	40 %	20 %	20 %	20 %	333893714
1620	NC_015554	TCTAC	2	10	2534683	2534692	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1621	NC_015554	AAATG	2	10	2536835	2536844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015554	CACAC	2	10	2537384	2537393	40 %	0 %	0 %	60 %	333893717
1623	NC_015554	TGTTT	2	10	2538483	2538492	0 %	80 %	20 %	0 %	333893719
1624	NC_015554	TGTGT	2	10	2539381	2539390	0 %	60 %	40 %	0 %	333893720
1625	NC_015554	AAGCA	2	10	2539598	2539607	60 %	0 %	20 %	20 %	333893720
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1866	NC_015554	CACGC	2	10	2926620	2926629	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1869	NC_015554	GTTTA	2	10	2929245	2929254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1870	NC_015554	AACAA	2	10	2931191	2931200	80 %	0 %	0 %	20 %	333894052
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1877	NC_015554	CGCCC	2	10	2938791	2938800	0 %	0 %	20 %	80 %	333894058
1878	NC_015554	AATAA	2	10	2939337	2939346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1879	NC_015554	GTTGA	2	10	2939580	2939589	20 %	40 %	40 %	0 %	333894060
1880	NC_015554	GGTTA	2	10	2940135	2940144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1881	NC_015554	TCTTT	2	10	2942777	2942786	0 %	80 %	0 %	20 %	333894062
1882	NC_015554	CTTTT	2	10	2942856	2942865	0 %	80 %	0 %	20 %	333894062
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1987	NC_015554	ATTTA	2	10	3100443	3100452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_015554	GCCCT	2	10	3114619	3114628	0 %	20 %	20 %	60 %	333894204
1999	NC_015554	AATGT	2	10	3114707	3114716	40 %	40 %	20 %	0 %	333894204
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