MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 9459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013851	CCGG	2	8	393764	393771	0 %	0 %	50 %	50 %	288940081
1002	NC_013851	GGAT	2	8	393879	393886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013851	CACG	2	8	393989	393996	25 %	0 %	25 %	50 %	288940082
1004	NC_013851	CCAG	2	8	394379	394386	25 %	0 %	25 %	50 %	288940082
1005	NC_013851	GGGC	2	8	395127	395134	0 %	0 %	75 %	25 %	288940083
1006	NC_013851	GTTC	2	8	396682	396689	0 %	50 %	25 %	25 %	288940085
1007	NC_013851	CTGA	2	8	396949	396956	25 %	25 %	25 %	25 %	288940086
1008	NC_013851	ATGC	2	8	398008	398015	25 %	25 %	25 %	25 %	288940087
1009	NC_013851	TTCA	2	8	398758	398765	25 %	50 %	0 %	25 %	288940088
1010	NC_013851	TTTG	2	8	398797	398804	0 %	75 %	25 %	0 %	288940088
1011	NC_013851	ACTC	2	8	398969	398976	25 %	25 %	0 %	50 %	288940088
1012	NC_013851	AGTT	2	8	399022	399029	25 %	50 %	25 %	0 %	288940088
1013	NC_013851	GGCT	2	8	400032	400039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_013851	CACC	2	8	400160	400167	25 %	0 %	0 %	75 %	288940091
1015	NC_013851	GCCA	2	8	400260	400267	25 %	0 %	25 %	50 %	288940091
1016	NC_013851	CAGC	2	8	400295	400302	25 %	0 %	25 %	50 %	288940091
1017	NC_013851	GTCG	2	8	400885	400892	0 %	25 %	50 %	25 %	288940091
1018	NC_013851	CGGC	2	8	401425	401432	0 %	0 %	50 %	50 %	288940092
1019	NC_013851	CGTC	2	8	402267	402274	0 %	25 %	25 %	50 %	288940092
1020	NC_013851	TGGT	2	8	402344	402351	0 %	50 %	50 %	0 %	288940092
1021	NC_013851	CAGA	2	8	402469	402476	50 %	0 %	25 %	25 %	288940092
1022	NC_013851	CAGC	2	8	402715	402722	25 %	0 %	25 %	50 %	288940092
1023	NC_013851	TGAG	2	8	402918	402925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013851	ATCC	2	8	403289	403296	25 %	25 %	0 %	50 %	288940093
1025	NC_013851	GCCC	2	8	403451	403458	0 %	0 %	25 %	75 %	288940093
1026	NC_013851	CGCC	2	8	403516	403523	0 %	0 %	25 %	75 %	288940093
1027	NC_013851	TCGC	2	8	403751	403758	0 %	25 %	25 %	50 %	288940093
1028	NC_013851	CAGA	2	8	403895	403902	50 %	0 %	25 %	25 %	288940093
1029	NC_013851	TGGA	2	8	404276	404283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013851	GCTC	2	8	404620	404627	0 %	25 %	25 %	50 %	288940094
1031	NC_013851	CCGC	2	8	405133	405140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1032	NC_013851	CTCA	2	8	405226	405233	25 %	25 %	0 %	50 %	288940095
1033	NC_013851	CCGG	2	8	405331	405338	0 %	0 %	50 %	50 %	288940095
1034	NC_013851	CTGG	2	8	406623	406630	0 %	25 %	50 %	25 %	288940096
1035	NC_013851	GAGC	2	8	406644	406651	25 %	0 %	50 %	25 %	288940096
1036	NC_013851	TGCG	2	8	407015	407022	0 %	25 %	50 %	25 %	288940096
1037	NC_013851	TCGA	2	8	408454	408461	25 %	25 %	25 %	25 %	288940097
1038	NC_013851	CGAG	2	8	408563	408570	25 %	0 %	50 %	25 %	288940097
1039	NC_013851	GCGA	2	8	408876	408883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_013851	CGGG	2	8	409289	409296	0 %	0 %	75 %	25 %	288940098
1041	NC_013851	GCGG	2	8	409984	409991	0 %	0 %	75 %	25 %	288940098
1042	NC_013851	TGGC	2	8	410222	410229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_013851	GCCG	2	8	411801	411808	0 %	0 %	50 %	50 %	288940101
1044	NC_013851	GGCG	2	8	411821	411828	0 %	0 %	75 %	25 %	288940101
1045	NC_013851	TGCG	2	8	411907	411914	0 %	25 %	50 %	25 %	288940101
1046	NC_013851	TCGC	2	8	412024	412031	0 %	25 %	25 %	50 %	288940101
1047	NC_013851	CTGC	2	8	412067	412074	0 %	25 %	25 %	50 %	288940101
1048	NC_013851	GCGG	2	8	412176	412183	0 %	0 %	75 %	25 %	288940101
1049	NC_013851	CGGT	2	8	412266	412273	0 %	25 %	50 %	25 %	288940101
1050	NC_013851	TCCG	2	8	412372	412379	0 %	25 %	25 %	50 %	288940101
1051	NC_013851	GCCA	2	8	412429	412436	25 %	0 %	25 %	50 %	288940101
1052	NC_013851	CGGC	3	12	412447	412458	0 %	0 %	50 %	50 %	288940101
1053	NC_013851	CGGG	2	8	412742	412749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_013851	GCCA	2	8	413667	413674	25 %	0 %	25 %	50 %	288940102
1055	NC_013851	ACGC	2	8	413793	413800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_013851	GCCG	2	8	413977	413984	0 %	0 %	50 %	50 %	288940103
1057	NC_013851	AGCG	2	8	414097	414104	25 %	0 %	50 %	25 %	288940103
1058	NC_013851	CGGG	2	8	414600	414607	0 %	0 %	75 %	25 %	288940103
1059	NC_013851	TCGG	2	8	414659	414666	0 %	25 %	50 %	25 %	288940103
1060	NC_013851	CTGG	2	8	414779	414786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_013851	GATG	2	8	415371	415378	25 %	25 %	50 %	0 %	288940104
1062	NC_013851	GGGC	2	8	415381	415388	0 %	0 %	75 %	25 %	288940104
1063	NC_013851	GATC	2	8	415410	415417	25 %	25 %	25 %	25 %	288940104
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1065	NC_013851	CGGG	2	8	415963	415970	0 %	0 %	75 %	25 %	288940105
1066	NC_013851	GTCT	2	8	416143	416150	0 %	50 %	25 %	25 %	288940105
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1071	NC_013851	CGTC	2	8	417493	417500	0 %	25 %	25 %	50 %	288940106
1072	NC_013851	GCCG	2	8	417618	417625	0 %	0 %	50 %	50 %	288940106
1073	NC_013851	CGGA	2	8	417894	417901	25 %	0 %	50 %	25 %	288940106
1074	NC_013851	GCCG	2	8	418192	418199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_013851	GCCA	2	8	418291	418298	25 %	0 %	25 %	50 %	288940107
1076	NC_013851	TGAC	2	8	418426	418433	25 %	25 %	25 %	25 %	288940107
1077	NC_013851	GCTT	2	8	419042	419049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_013851	CCAT	2	8	419432	419439	25 %	25 %	0 %	50 %	288940109
1079	NC_013851	CTCG	2	8	419760	419767	0 %	25 %	25 %	50 %	288940109
1080	NC_013851	CATC	2	8	420015	420022	25 %	25 %	0 %	50 %	288940109
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1084	NC_013851	GGCC	2	8	421297	421304	0 %	0 %	50 %	50 %	288940110
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1100	NC_013851	GTCC	2	8	425771	425778	0 %	25 %	25 %	50 %	288940114
1101	NC_013851	CGAC	2	8	425861	425868	25 %	0 %	25 %	50 %	288940114
1102	NC_013851	CCGA	2	8	426211	426218	25 %	0 %	25 %	50 %	288940114
1103	NC_013851	GGCG	2	8	426315	426322	0 %	0 %	75 %	25 %	288940114
1104	NC_013851	GCAG	2	8	426423	426430	25 %	0 %	50 %	25 %	288940114
1105	NC_013851	GCCT	2	8	426610	426617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_013851	CCGA	2	8	427484	427491	25 %	0 %	25 %	50 %	288940115
1107	NC_013851	TTGT	2	8	428650	428657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_013851	GGCT	2	8	429431	429438	0 %	25 %	50 %	25 %	288940116
1110	NC_013851	GGCG	2	8	429753	429760	0 %	0 %	75 %	25 %	288940116
1111	NC_013851	GGTG	2	8	430182	430189	0 %	25 %	75 %	0 %	288940116
1112	NC_013851	CGGC	2	8	430379	430386	0 %	0 %	50 %	50 %	288940117
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1114	NC_013851	TCTA	2	8	431075	431082	25 %	50 %	0 %	25 %	288940117
1115	NC_013851	CGAG	2	8	431390	431397	25 %	0 %	50 %	25 %	288940117
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1128	NC_013851	CGCT	2	8	435792	435799	0 %	25 %	25 %	50 %	288940123
1129	NC_013851	CGAC	3	12	435845	435856	25 %	0 %	25 %	50 %	288940124
1130	NC_013851	GCCG	2	8	436157	436164	0 %	0 %	50 %	50 %	288940124
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