MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013740	TCTTT	2	10	2089294	2089303	0 %	80 %	0 %	20 %	284049203
1502	NC_013740	GACCA	2	10	2089515	2089524	40 %	0 %	20 %	40 %	284049203
1503	NC_013740	TCCTG	2	10	2090493	2090502	0 %	40 %	20 %	40 %	284049204
1504	NC_013740	GGTCC	2	10	2090677	2090686	0 %	20 %	40 %	40 %	284049204
1505	NC_013740	TTGAT	2	10	2091287	2091296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013740	CCTGC	2	10	2093278	2093287	0 %	20 %	20 %	60 %	284049205
1507	NC_013740	GTCCC	2	10	2093621	2093630	0 %	20 %	20 %	60 %	284049205
1508	NC_013740	GGGCC	2	10	2093663	2093672	0 %	0 %	60 %	40 %	284049205
1509	NC_013740	GGCTG	2	10	2094088	2094097	0 %	20 %	60 %	20 %	284049205
1510	NC_013740	CCGCT	2	10	2094118	2094127	0 %	20 %	20 %	60 %	284049205
1511	NC_013740	GTCCC	2	10	2094547	2094556	0 %	20 %	20 %	60 %	284049206
1512	NC_013740	CTGGA	2	10	2094943	2094952	20 %	20 %	40 %	20 %	284049206
1513	NC_013740	CAGAT	2	10	2096067	2096076	40 %	20 %	20 %	20 %	284049207
1514	NC_013740	AGGGC	2	10	2096271	2096280	20 %	0 %	60 %	20 %	284049208
1515	NC_013740	CCTGG	2	10	2096600	2096609	0 %	20 %	40 %	40 %	284049209
1516	NC_013740	CCGGG	2	10	2096816	2096825	0 %	0 %	60 %	40 %	284049209
1517	NC_013740	CTTCA	2	10	2098139	2098148	20 %	40 %	0 %	40 %	284049209
1518	NC_013740	TCCTT	2	10	2099902	2099911	0 %	60 %	0 %	40 %	284049211
1519	NC_013740	TCCCG	2	10	2100750	2100759	0 %	20 %	20 %	60 %	284049212
1520	NC_013740	AGGGC	2	10	2102181	2102190	20 %	0 %	60 %	20 %	284049213
1521	NC_013740	CATTT	2	10	2103794	2103803	20 %	60 %	0 %	20 %	284049214
1522	NC_013740	CAGGC	2	10	2105434	2105443	20 %	0 %	40 %	40 %	284049215
1523	NC_013740	AGGGC	2	10	2105471	2105480	20 %	0 %	60 %	20 %	284049215
1524	NC_013740	CTGAC	2	10	2105659	2105668	20 %	20 %	20 %	40 %	284049215
1525	NC_013740	GATGG	2	10	2106948	2106957	20 %	20 %	60 %	0 %	284049217
1526	NC_013740	TGGAC	2	10	2108844	2108853	20 %	20 %	40 %	20 %	284049218
1527	NC_013740	CTGGG	2	10	2109713	2109722	0 %	20 %	60 %	20 %	284049219
1528	NC_013740	GGCTG	2	10	2109990	2109999	0 %	20 %	60 %	20 %	284049219
1529	NC_013740	GACCG	2	10	2110535	2110544	20 %	0 %	40 %	40 %	284049220
1530	NC_013740	GCTTT	2	10	2111930	2111939	0 %	60 %	20 %	20 %	284049221
1531	NC_013740	CCTTC	2	10	2113454	2113463	0 %	40 %	0 %	60 %	284049222
1532	NC_013740	ACCGG	2	10	2116609	2116618	20 %	0 %	40 %	40 %	284049225
1533	NC_013740	CAGAG	2	10	2122076	2122085	40 %	0 %	40 %	20 %	284049231
1534	NC_013740	GGGCA	2	10	2128538	2128547	20 %	0 %	60 %	20 %	284049245
1535	NC_013740	CTTTG	2	10	2128652	2128661	0 %	60 %	20 %	20 %	284049245
1536	NC_013740	GAACA	2	10	2130288	2130297	60 %	0 %	20 %	20 %	284049250
1537	NC_013740	TTTCT	2	10	2135359	2135368	0 %	80 %	0 %	20 %	284049259
1538	NC_013740	AATGG	2	10	2138011	2138020	40 %	20 %	40 %	0 %	284049260
1539	NC_013740	ATACG	2	10	2138606	2138615	40 %	20 %	20 %	20 %	284049261
1540	NC_013740	GCAGA	2	10	2139018	2139027	40 %	0 %	40 %	20 %	284049262
1541	NC_013740	CCCGG	2	10	2140811	2140820	0 %	0 %	40 %	60 %	284049266
1542	NC_013740	TTTTC	2	10	2142442	2142451	0 %	80 %	0 %	20 %	284049268
1543	NC_013740	CCGGT	2	10	2144770	2144779	0 %	20 %	40 %	40 %	284049269
1544	NC_013740	GGCAG	2	10	2145934	2145943	20 %	0 %	60 %	20 %	284049270
1545	NC_013740	CCAGG	2	10	2146424	2146433	20 %	0 %	40 %	40 %	284049270
1546	NC_013740	TTCAC	2	10	2146464	2146473	20 %	40 %	0 %	40 %	284049270
1547	NC_013740	GGCCA	2	10	2149246	2149255	20 %	0 %	40 %	40 %	284049273
1548	NC_013740	CTTGT	2	10	2150208	2150217	0 %	60 %	20 %	20 %	284049274
1549	NC_013740	AAGTA	2	10	2150588	2150597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013740	AGAAC	2	10	2151152	2151161	60 %	0 %	20 %	20 %	284049276
1551	NC_013740	CGGGG	2	10	2151228	2151237	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_013740	TCGGT	2	10	2151452	2151461	0 %	40 %	40 %	20 %	284049277
1553	NC_013740	TAAAT	2	10	2154738	2154747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013740	ATTTC	2	10	2155834	2155843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_013740	GTCCT	2	10	2155889	2155898	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_013740	ATGGC	2	10	2156079	2156088	20 %	20 %	40 %	20 %	284049281
1557	NC_013740	AAAGG	2	10	2156429	2156438	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013740	TCCGG	2	10	2158126	2158135	0 %	20 %	40 %	40 %	284049282
1559	NC_013740	TGCCC	2	10	2159522	2159531	0 %	20 %	20 %	60 %	284049283
1560	NC_013740	CCATT	2	10	2161222	2161231	20 %	40 %	0 %	40 %	284049285
1561	NC_013740	GTCCG	2	10	2161586	2161595	0 %	20 %	40 %	40 %	284049285
1562	NC_013740	ACCCC	2	10	2163108	2163117	20 %	0 %	0 %	80 %	284049286
1563	NC_013740	GAGCG	2	10	2164065	2164074	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_013740	CCCGG	2	10	2166663	2166672	0 %	0 %	40 %	60 %	284049288
1565	NC_013740	CCGCT	2	10	2166960	2166969	0 %	20 %	20 %	60 %	284049288
1566	NC_013740	GCTCC	2	10	2168845	2168854	0 %	20 %	20 %	60 %	284049289
1567	NC_013740	CCAGC	2	10	2169463	2169472	20 %	0 %	20 %	60 %	284049289
1568	NC_013740	TTATT	2	10	2170195	2170204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013740	ACCGG	2	10	2170378	2170387	20 %	0 %	40 %	40 %	284049290
1570	NC_013740	AAGGA	2	10	2170758	2170767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013740	TCCCG	2	10	2172756	2172765	0 %	20 %	20 %	60 %	284049292
1572	NC_013740	ACCAC	2	10	2172914	2172923	40 %	0 %	0 %	60 %	284049292
1573	NC_013740	TCCGT	2	10	2175492	2175501	0 %	40 %	20 %	40 %	284049295
1574	NC_013740	CCCGG	2	10	2176207	2176216	0 %	0 %	40 %	60 %	284049295
1575	NC_013740	GTGAT	2	10	2176445	2176454	20 %	40 %	40 %	0 %	284049295
1576	NC_013740	TCCCG	2	10	2178348	2178357	0 %	20 %	20 %	60 %	284049297
1577	NC_013740	CCCTG	2	10	2180459	2180468	0 %	20 %	20 %	60 %	284049298
1578	NC_013740	GGCCT	2	10	2182175	2182184	0 %	20 %	40 %	40 %	284049299
1579	NC_013740	CCCCG	2	10	2183259	2183268	0 %	0 %	20 %	80 %	284049300
1580	NC_013740	AGGGC	2	10	2183636	2183645	20 %	0 %	60 %	20 %	284049300
1581	NC_013740	CCATA	2	10	2186605	2186614	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1582	NC_013740	TCTTT	2	10	2190640	2190649	0 %	80 %	0 %	20 %	284049305
1583	NC_013740	AGGAA	2	10	2191763	2191772	60 %	0 %	40 %	0 %	284049305
1584	NC_013740	AGGAA	2	10	2192603	2192612	60 %	0 %	40 %	0 %	284049305
1585	NC_013740	CCTGG	2	10	2195938	2195947	0 %	20 %	40 %	40 %	284049309
1586	NC_013740	CCTTT	2	10	2197248	2197257	0 %	60 %	0 %	40 %	284049310
1587	NC_013740	CAGAA	2	10	2197847	2197856	60 %	0 %	20 %	20 %	284049311
1588	NC_013740	CCGGC	2	10	2199871	2199880	0 %	0 %	40 %	60 %	284049312
1589	NC_013740	CCATT	2	10	2203650	2203659	20 %	40 %	0 %	40 %	284049315
1590	NC_013740	TTCAG	2	10	2205591	2205600	20 %	40 %	20 %	20 %	284049317
1591	NC_013740	CAGGA	2	10	2205773	2205782	40 %	0 %	40 %	20 %	284049317
1592	NC_013740	TGCCG	2	10	2207260	2207269	0 %	20 %	40 %	40 %	284049318
1593	NC_013740	GATCC	2	10	2208478	2208487	20 %	20 %	20 %	40 %	284049319
1594	NC_013740	GATGG	2	10	2209353	2209362	20 %	20 %	60 %	0 %	284049319
1595	NC_013740	GCCAT	2	10	2211352	2211361	20 %	20 %	20 %	40 %	284049321
1596	NC_013740	CCATC	2	10	2213624	2213633	20 %	20 %	0 %	60 %	284049322
1597	NC_013740	TTTCC	2	10	2214545	2214554	0 %	60 %	0 %	40 %	284049323
1598	NC_013740	ATCAT	2	10	2215979	2215988	40 %	40 %	0 %	20 %	284049324
1599	NC_013740	CGCCC	2	10	2217859	2217868	0 %	0 %	20 %	80 %	284049325
1600	NC_013740	ATCCC	2	10	2219995	2220004	20 %	20 %	0 %	60 %	284049328
1601	NC_013740	CTTTT	2	10	2221001	2221010	0 %	80 %	0 %	20 %	284049328
1602	NC_013740	GGCCA	2	10	2222647	2222656	20 %	0 %	40 %	40 %	284049330
1603	NC_013740	CCTTT	2	10	2224525	2224534	0 %	60 %	0 %	40 %	284049332
1604	NC_013740	CCGTT	2	10	2225990	2225999	0 %	40 %	20 %	40 %	284049333
1605	NC_013740	TTCCT	2	10	2227231	2227240	0 %	60 %	0 %	40 %	284049334
1606	NC_013740	GACCA	2	10	2227357	2227366	40 %	0 %	20 %	40 %	284049334
1607	NC_013740	CCGTA	2	10	2227440	2227449	20 %	20 %	20 %	40 %	284049334
1608	NC_013740	ATCAA	2	10	2227822	2227831	60 %	20 %	0 %	20 %	284049335
1609	NC_013740	GACTT	2	10	2228846	2228855	20 %	40 %	20 %	20 %	284049336
1610	NC_013740	CCTGG	2	10	2230694	2230703	0 %	20 %	40 %	40 %	284049338
1611	NC_013740	TTTTC	2	10	2232726	2232735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_013740	TGAAA	2	10	2234967	2234976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013740	TTCAG	2	10	2237885	2237894	20 %	40 %	20 %	20 %	284049344
1614	NC_013740	CCGGG	2	10	2238704	2238713	0 %	0 %	60 %	40 %	284049345
1615	NC_013740	TGAAC	2	10	2238905	2238914	40 %	20 %	20 %	20 %	284049345
1616	NC_013740	CCGGG	2	10	2239250	2239259	0 %	0 %	60 %	40 %	284049345
1617	NC_013740	CAATC	2	10	2241355	2241364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1618	NC_013740	CCTTC	2	10	2242167	2242176	0 %	40 %	0 %	60 %	284049347
1619	NC_013740	AATAA	2	10	2243069	2243078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013740	CCAAT	2	10	2244184	2244193	40 %	20 %	0 %	40 %	284049348
1621	NC_013740	TTCCT	2	10	2244481	2244490	0 %	60 %	0 %	40 %	284049348
1622	NC_013740	GATCC	2	10	2246985	2246994	20 %	20 %	20 %	40 %	284049350
1623	NC_013740	TTCTT	2	10	2247609	2247618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1624	NC_013740	TCTAG	2	10	2251067	2251076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_013740	AGGTG	2	10	2253006	2253015	20 %	20 %	60 %	0 %	284049355
1626	NC_013740	TTTCA	2	10	2253350	2253359	20 %	60 %	0 %	20 %	284049355
1627	NC_013740	ATAAA	2	10	2253882	2253891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013740	CTGCA	2	10	2253966	2253975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_013740	AATTA	2	10	2255253	2255262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013740	GGTCA	2	10	2263179	2263188	20 %	20 %	40 %	20 %	284049360
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1664	NC_013740	ATGGT	2	10	2308367	2308376	20 %	40 %	40 %	0 %	284049395
1665	NC_013740	CCCTT	2	10	2310759	2310768	0 %	40 %	0 %	60 %	284049397
1666	NC_013740	TACGG	2	10	2311274	2311283	20 %	20 %	40 %	20 %	284049397
1667	NC_013740	GTCCG	2	10	2311772	2311781	0 %	20 %	40 %	40 %	284049397
1668	NC_013740	CGGAA	2	10	2312634	2312643	40 %	0 %	40 %	20 %	284049398
1669	NC_013740	CAGTA	2	10	2312936	2312945	40 %	20 %	20 %	20 %	284049399
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1671	NC_013740	TTCCC	2	10	2317178	2317187	0 %	40 %	0 %	60 %	284049405
1672	NC_013740	ACCCC	2	10	2322347	2322356	20 %	0 %	0 %	80 %	284049409
1673	NC_013740	ATGGA	2	10	2326903	2326912	40 %	20 %	40 %	0 %	284049411
1674	NC_013740	GGGCC	2	10	2327534	2327543	0 %	0 %	60 %	40 %	284049411
1675	NC_013740	TCCCT	2	10	2329671	2329680	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.