MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013740	CCTCC	2	10	660731	660740	0 %	20 %	0 %	80 %	284047936
502	NC_013740	CAGCG	2	10	661420	661429	20 %	0 %	40 %	40 %	284047937
503	NC_013740	CGTTC	2	10	662703	662712	0 %	40 %	20 %	40 %	284047938
504	NC_013740	ATCGG	2	10	664598	664607	20 %	20 %	40 %	20 %	284047940
505	NC_013740	GGCTC	2	10	665999	666008	0 %	20 %	40 %	40 %	284047941
506	NC_013740	CGGAC	2	10	667022	667031	20 %	0 %	40 %	40 %	284047942
507	NC_013740	GTTTT	2	10	667524	667533	0 %	80 %	20 %	0 %	284047943
508	NC_013740	GAAAT	2	10	667610	667619	60 %	20 %	20 %	0 %	284047943
509	NC_013740	ATTTT	2	10	670581	670590	20 %	80 %	0 %	0 %	284047946
510	NC_013740	ATTAT	2	10	670830	670839	40 %	60 %	0 %	0 %	284047946
511	NC_013740	AAAAT	2	10	671169	671178	80 %	20 %	0 %	0 %	284047946
512	NC_013740	TTATA	2	10	673072	673081	40 %	60 %	0 %	0 %	284047948
513	NC_013740	CTACA	2	10	674127	674136	40 %	20 %	0 %	40 %	284047949
514	NC_013740	GGCTG	2	10	674371	674380	0 %	20 %	60 %	20 %	284047949
515	NC_013740	AATAG	2	10	675056	675065	60 %	20 %	20 %	0 %	284047949
516	NC_013740	ATAAA	2	10	675453	675462	80 %	20 %	0 %	0 %	284047949
517	NC_013740	GGATG	2	10	676560	676569	20 %	20 %	60 %	0 %	284047950
518	NC_013740	TTTTG	2	10	677180	677189	0 %	80 %	20 %	0 %	284047950
519	NC_013740	GGGCT	2	10	677633	677642	0 %	20 %	60 %	20 %	284047951
520	NC_013740	ATGGT	2	10	681288	681297	20 %	40 %	40 %	0 %	284047955
521	NC_013740	TTGAT	2	10	682168	682177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013740	ATTTT	2	10	682193	682202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013740	TCCAA	2	10	684238	684247	40 %	20 %	0 %	40 %	284047957
524	NC_013740	AAATT	2	10	684990	684999	60 %	40 %	0 %	0 %	284047957
525	NC_013740	TATTG	2	10	685683	685692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013740	CCAGC	2	10	685847	685856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
527	NC_013740	AAATA	2	10	687545	687554	80 %	20 %	0 %	0 %	284047958
528	NC_013740	ACTTG	2	10	688271	688280	20 %	40 %	20 %	20 %	284047958
529	NC_013740	AAGTA	2	10	688382	688391	60 %	20 %	20 %	0 %	284047959
530	NC_013740	GATTC	2	10	689601	689610	20 %	40 %	20 %	20 %	284047959
531	NC_013740	TAAGG	2	10	690002	690011	40 %	20 %	40 %	0 %	284047959
532	NC_013740	GTTTT	2	10	690254	690263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013740	AATCA	2	10	691467	691476	60 %	20 %	0 %	20 %	284047961
534	NC_013740	AAAGT	2	10	692659	692668	60 %	20 %	20 %	0 %	284047962
535	NC_013740	TGCTG	2	10	693635	693644	0 %	40 %	40 %	20 %	284047963
536	NC_013740	GGGAA	2	10	696355	696364	40 %	0 %	60 %	0 %	284047964
537	NC_013740	GGGCC	2	10	696560	696569	0 %	0 %	60 %	40 %	284047964
538	NC_013740	AGGCC	2	10	697244	697253	20 %	0 %	40 %	40 %	284047965
539	NC_013740	GCCGG	2	10	697575	697584	0 %	0 %	60 %	40 %	284047965
540	NC_013740	GGCGG	2	10	697656	697665	0 %	0 %	80 %	20 %	284047965
541	NC_013740	ATGCA	2	10	698086	698095	40 %	20 %	20 %	20 %	284047966
542	NC_013740	CGGAC	2	10	698633	698642	20 %	0 %	40 %	40 %	284047966
543	NC_013740	CATTC	2	10	698916	698925	20 %	40 %	0 %	40 %	284047966
544	NC_013740	GATTT	2	10	700221	700230	20 %	60 %	20 %	0 %	284047968
545	NC_013740	GCTGT	2	10	701133	701142	0 %	40 %	40 %	20 %	284047968
546	NC_013740	AGGTC	2	10	704399	704408	20 %	20 %	40 %	20 %	284047971
547	NC_013740	GGGCA	2	10	704934	704943	20 %	0 %	60 %	20 %	284047971
548	NC_013740	CAGCT	2	10	705088	705097	20 %	20 %	20 %	40 %	284047971
549	NC_013740	ATATT	2	10	705260	705269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013740	GGACC	2	10	706761	706770	20 %	0 %	40 %	40 %	284047973
551	NC_013740	GGAAC	2	10	707104	707113	40 %	0 %	40 %	20 %	284047973
552	NC_013740	CTGGC	2	10	708314	708323	0 %	20 %	40 %	40 %	284047974
553	NC_013740	TCTGC	2	10	708913	708922	0 %	40 %	20 %	40 %	284047975
554	NC_013740	AATGA	2	10	709089	709098	60 %	20 %	20 %	0 %	284047975
555	NC_013740	ATAGA	2	10	712579	712588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013740	ACGGA	2	10	713251	713260	40 %	0 %	40 %	20 %	284047981
557	NC_013740	TACCA	2	10	714269	714278	40 %	20 %	0 %	40 %	284047982
558	NC_013740	GATGG	2	10	722199	722208	20 %	20 %	60 %	0 %	284047986
559	NC_013740	TGATC	2	10	723581	723590	20 %	40 %	20 %	20 %	284047988
560	NC_013740	CCGGG	2	10	724202	724211	0 %	0 %	60 %	40 %	284047988
561	NC_013740	GATCT	2	10	729215	729224	20 %	40 %	20 %	20 %	284047995
562	NC_013740	GAACG	2	10	730554	730563	40 %	0 %	40 %	20 %	284047996
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564	NC_013740	CCGGC	2	10	733735	733744	0 %	0 %	40 %	60 %	284047999
565	NC_013740	CCTGC	2	10	733786	733795	0 %	20 %	20 %	60 %	284047999
566	NC_013740	TCCTG	2	10	734864	734873	0 %	40 %	20 %	40 %	284048000
567	NC_013740	ATGAA	2	10	735077	735086	60 %	20 %	20 %	0 %	284048000
568	NC_013740	CGGGA	2	10	736264	736273	20 %	0 %	60 %	20 %	284048001
569	NC_013740	CCCGG	2	10	737132	737141	0 %	0 %	40 %	60 %	284048001
570	NC_013740	ACCGC	2	10	737983	737992	20 %	0 %	20 %	60 %	284048002
571	NC_013740	GCCAG	2	10	738185	738194	20 %	0 %	40 %	40 %	284048002
572	NC_013740	CCATC	2	10	739639	739648	20 %	20 %	0 %	60 %	284048004
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576	NC_013740	GTTCC	2	10	748066	748075	0 %	40 %	20 %	40 %	284048011
577	NC_013740	AAAAC	2	10	751603	751612	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_013740	CCATG	2	10	752032	752041	20 %	20 %	20 %	40 %	284048014
579	NC_013740	GGGGA	2	10	752226	752235	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013740	AAAGA	2	10	753733	753742	80 %	0 %	20 %	0 %	284048017
581	NC_013740	AGAAA	2	10	754816	754825	80 %	0 %	20 %	0 %	284048018
582	NC_013740	CTGAA	2	10	756316	756325	40 %	20 %	20 %	20 %	284048019
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587	NC_013740	CCAGC	2	10	763517	763526	20 %	0 %	20 %	60 %	284048025
588	NC_013740	GGCCC	2	10	764186	764195	0 %	0 %	40 %	60 %	284048025
589	NC_013740	GCTTC	2	10	764936	764945	0 %	40 %	20 %	40 %	284048026
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600	NC_013740	CGGGG	2	10	784577	784586	0 %	0 %	80 %	20 %	284048048
601	NC_013740	CTGGC	2	10	786149	786158	0 %	20 %	40 %	40 %	284048049
602	NC_013740	GCACG	2	10	788172	788181	20 %	0 %	40 %	40 %	284048050
603	NC_013740	GTCCA	2	10	789764	789773	20 %	20 %	20 %	40 %	284048051
604	NC_013740	TGTGG	2	10	790006	790015	0 %	40 %	60 %	0 %	284048051
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607	NC_013740	CCCAT	2	10	792538	792547	20 %	20 %	0 %	60 %	284048052
608	NC_013740	TATAC	2	10	793070	793079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_013740	ACGGA	2	10	793192	793201	40 %	0 %	40 %	20 %	284048053
610	NC_013740	GAAGT	2	10	794271	794280	40 %	20 %	40 %	0 %	284048054
611	NC_013740	TCCAT	2	10	795892	795901	20 %	40 %	0 %	40 %	284048054
612	NC_013740	GGAAG	2	10	799258	799267	40 %	0 %	60 %	0 %	284048059
613	NC_013740	GAGAA	2	10	799763	799772	60 %	0 %	40 %	0 %	284048060
614	NC_013740	CTGTA	2	10	800255	800264	20 %	40 %	20 %	20 %	284048061
615	NC_013740	AGGGA	2	10	803619	803628	40 %	0 %	60 %	0 %	284048064
616	NC_013740	CGGAT	2	10	804281	804290	20 %	20 %	40 %	20 %	284048064
617	NC_013740	TCCGT	2	10	804309	804318	0 %	40 %	20 %	40 %	284048064
618	NC_013740	CATCA	2	10	807711	807720	40 %	20 %	0 %	40 %	284048065
619	NC_013740	TTACC	2	10	808307	808316	20 %	40 %	0 %	40 %	284048065
620	NC_013740	AATTT	2	10	811379	811388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013740	ATGCC	2	10	811754	811763	20 %	20 %	20 %	40 %	284048068
622	NC_013740	GCCAT	2	10	812579	812588	20 %	20 %	20 %	40 %	284048068
623	NC_013740	AGAGA	2	10	817779	817788	60 %	0 %	40 %	0 %	284048073
624	NC_013740	CCTGA	2	10	817876	817885	20 %	20 %	20 %	40 %	284048073
625	NC_013740	CAGGG	2	10	818946	818955	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
626	NC_013740	ATGCC	2	10	821065	821074	20 %	20 %	20 %	40 %	284048075
627	NC_013740	TGGAC	2	10	821164	821173	20 %	20 %	40 %	20 %	284048075
628	NC_013740	GGGGA	2	10	821445	821454	20 %	0 %	80 %	0 %	284048075
629	NC_013740	AACAA	2	10	822682	822691	80 %	0 %	0 %	20 %	284048075
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