MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 37324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013740	CGG	2	6	300910	300915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047629
5002	NC_013740	CCA	2	6	300973	300978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047629
5003	NC_013740	ACC	2	6	300984	300989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047629
5004	NC_013740	ACA	2	6	300997	301002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047629
5005	NC_013740	GGC	2	6	301095	301100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047629
5006	NC_013740	CTG	2	6	301122	301127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047629
5007	NC_013740	TCA	2	6	301276	301281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047629
5008	NC_013740	GCC	2	6	301437	301442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047629
5009	NC_013740	TCC	2	6	301449	301454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047629
5010	NC_013740	CAT	2	6	301535	301540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047629
5011	NC_013740	GAT	2	6	301625	301630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047629
5012	NC_013740	GAC	2	6	301695	301700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047629
5013	NC_013740	TGG	2	6	301723	301728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047629
5014	NC_013740	TGA	2	6	301759	301764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047629
5015	NC_013740	GCG	2	6	301810	301815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047629
5016	NC_013740	ATC	2	6	301851	301856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047629
5017	NC_013740	GGC	2	6	301857	301862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047629
5018	NC_013740	ATG	2	6	301863	301868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047629
5019	NC_013740	GAT	2	6	301959	301964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047629
5020	NC_013740	GAA	2	6	301974	301979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047629
5021	NC_013740	TGC	2	6	301999	302004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013740	ATA	2	6	302068	302073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013740	GAA	2	6	302180	302185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047630
5024	NC_013740	TGG	2	6	302208	302213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047630
5025	NC_013740	CTG	3	9	302219	302227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5026	NC_013740	GTG	2	6	302237	302242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047630
5027	NC_013740	TGC	2	6	302253	302258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5028	NC_013740	CCA	2	6	302320	302325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047630
5029	NC_013740	CTA	2	6	302380	302385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047630
5030	NC_013740	CAG	2	6	302390	302395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5031	NC_013740	GGC	2	6	302412	302417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047630
5032	NC_013740	CTG	2	6	302645	302650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5033	NC_013740	TGG	2	6	302745	302750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047630
5034	NC_013740	CAG	2	6	302765	302770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5035	NC_013740	ATG	2	6	302798	302803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047630
5036	NC_013740	CTG	3	9	302885	302893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5037	NC_013740	CAT	2	6	302965	302970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047630
5038	NC_013740	TGG	2	6	302982	302987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047630
5039	NC_013740	GGT	2	6	303118	303123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047630
5040	NC_013740	GAA	2	6	303143	303148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047630
5041	NC_013740	GCC	2	6	303397	303402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047630
5042	NC_013740	CGA	2	6	303496	303501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5043	NC_013740	AGC	3	9	303597	303605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5044	NC_013740	GCC	2	6	303713	303718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047630
5045	NC_013740	ACC	2	6	303731	303736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047630
5046	NC_013740	GCT	2	6	303763	303768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047630
5047	NC_013740	GTT	2	6	303878	303883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013740	TAT	2	6	303884	303889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047631
5049	NC_013740	TCC	2	6	303946	303951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047631
5050	NC_013740	TGG	2	6	303952	303957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5051	NC_013740	CCG	2	6	304036	304041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047631
5052	NC_013740	CCA	2	6	304201	304206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047631
5053	NC_013740	GAC	2	6	304248	304253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047631
5054	NC_013740	CGG	2	6	304268	304273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047631
5055	NC_013740	TAC	2	6	304281	304286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047631
5056	NC_013740	TGG	2	6	304351	304356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5057	NC_013740	GTG	2	6	304446	304451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5058	NC_013740	TGG	2	6	304462	304467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5059	NC_013740	GTG	2	6	304518	304523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5060	NC_013740	CCA	2	6	304552	304557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047631
5061	NC_013740	ATG	2	6	304615	304620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047631
5062	NC_013740	GGC	2	6	304644	304649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047631
5063	NC_013740	GGC	2	6	304742	304747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047631
5064	NC_013740	GCC	2	6	304749	304754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047631
5065	NC_013740	CGG	2	6	304768	304773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047631
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5067	NC_013740	TGG	3	9	304840	304848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5068	NC_013740	GGC	2	6	304883	304888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047631
5069	NC_013740	TCC	2	6	304906	304911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047631
5070	NC_013740	TGG	2	6	304945	304950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047631
5071	NC_013740	CAC	2	6	304970	304975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047631
5072	NC_013740	ACT	2	6	304990	304995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047631
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5084	NC_013740	CTG	2	6	306026	306031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047632
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5087	NC_013740	CGA	2	6	306209	306214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047632
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5090	NC_013740	ATG	2	6	306453	306458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047632
5091	NC_013740	CGG	2	6	306467	306472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047632
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5093	NC_013740	CGG	2	6	306545	306550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047632
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5098	NC_013740	CAA	2	6	306873	306878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047633
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5100	NC_013740	GCT	4	12	307095	307106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047633
5101	NC_013740	TGC	3	9	307181	307189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047633
5102	NC_013740	GGT	2	6	307218	307223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047633
5103	NC_013740	AGC	2	6	307295	307300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047633
5104	NC_013740	GAA	2	6	307302	307307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047633
5105	NC_013740	CGG	2	6	307500	307505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047633
5106	NC_013740	AGG	2	6	307566	307571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013740	GAA	2	6	307587	307592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047634
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5109	NC_013740	CTG	2	6	307677	307682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047634
5110	NC_013740	TGG	2	6	307729	307734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047634
5111	NC_013740	CAT	2	6	307751	307756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047634
5112	NC_013740	GAT	2	6	307766	307771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047634
5113	NC_013740	ATC	2	6	307857	307862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047634
5114	NC_013740	CTG	2	6	308004	308009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047634
5115	NC_013740	CAG	2	6	308112	308117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047634
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5117	NC_013740	TGA	2	6	308224	308229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047634
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5119	NC_013740	ACC	2	6	308278	308283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047634
5120	NC_013740	AGA	2	6	308337	308342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013740	CGG	2	6	308372	308377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_013740	GAA	2	6	308448	308453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047635
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5124	NC_013740	CTG	2	6	308538	308543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047635
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5148	NC_013740	AGA	2	6	310166	310171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5478	NC_013740	AGC	2	6	330171	330176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047658
5479	NC_013740	GGC	2	6	330178	330183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047658
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5481	NC_013740	GCA	2	6	330217	330222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5482	NC_013740	TAA	2	6	330313	330318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_013740	GAT	2	6	330419	330424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047659
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